基因總覽
ROBO3（roundabout guidance receptor 3）是由蛋白質編碼基因 ROBO3 產生的受體，屬於免疫球蛋白超家族及 ROBO 家族。它是單次跨膜的第一型膜蛋白，具有大型細胞外區域與細胞質區域：細胞外部分包含五個 Ig-like C2-type 結構域及三個 Fibronectin type-III 結構域，並由一段跨膜區連接細胞質端。這些結構特色構成其受體架構；其參與軸突導引的作用與發育過程相關。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000397801 ★ | 124,865,432–124,881,471 | 28 |
| ENST00001139608 | 124,865,413–124,881,471 | 28 |
| ENST00000538940 | 124,868,468–124,881,471 | 27 |
| ENST00000543966 | 124,877,388–124,881,471 | 8 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ROBO3 是發育期間軸突導引的受體，參與調節軸突尋路，使其能整合方向相反或不同的導引訊號。來源描述其具有多重調節作用：可介導 NELL2 引發的排斥、抑制 SLIT 引發的排斥，並促進軸突受到 Netrin-1（NTN1）吸引。這些作用使 ROBO3 不只是單一方向訊號的傳遞者，也參與調整軸突對環境線索的反應。
在脊髓發育中，ROBO3 協助導引連合軸突。來源指出，可能的作用方式是避免軸突過早對 Slit 蛋白產生敏感性，因而抑制 Slit 經由 ROBO1／ROBO2 傳遞的訊號。此處對時序調控的描述帶有推論性，顯示 ROBO3 的作用與限制排斥訊號在發育過程中的適當啟動有關。
NELL2 與 ROBO3 結合後會促進 ROBO3 寡聚化，並導致位於中線的連合軸突受到排斥。另一方面，ROBO3 也能間接增強軸突對 NTN1 的吸引；來源特別指出，ROBO3 本身不與 NTN1 互相作用。因此，對 NTN1 吸引的促進屬間接作用，而非 ROBO3 直接結合該導引分子。
Promoter 與基因調控
>ROBO3 ENST00000397801 GRCh38 chr11:124864432-124865532 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CCAAAGCCATCTCCTGTCTAGGAAAGTGAGTTTGTCGAGGTGGGTCTTCAGGTAGAAAGAACTCCAGAAA AGTCAGAAGCAGACCGCGACTGGAAGTGGGAGGTGGGAGTAGGGGCCCATGGTTTTCTTTTCGCCCCCCC CAGGAAGGACGACTGCTATCCGATTTGAACAGATTTGCACTAATTTTGCAGCAATCCCACATGCCTTTAC AAAAATAATATTATCTTTGTTTTTGTCCTAGAATCCTTGGTTCCATTTCAGTCTCCTCAAAAACGTAAAA CAATTTAATAAAAAATGTCAAAGCAGGGTAATGTAAAAGGATTCAAATAAATGACAGTTGCCTGGGTTTC CCTGGCTTTCAGTCTCCTACAGGAACTCCTAGATTAGGGCGTTTGGAGCAGGACTCCCGGGTCAGGGCGC GCCGCTCCATCCTCTGGCCTCCTGGCTGCAGACCAAAGGACCAGAGGGCAGAGAGGTGGACCTGTCTTGG AATTCTCTGCCTACTCCCAACTCTTGCTGCAAACCACCCCAGTCTCCTGCCCTTCCGTCGCCAAACCCCT AGACTTGGGAGGGAATGGAAACCAGAACTTTGGCAGCAAGGAGCATTGCTTGCGCTTTGCCTCAGTTTCC AAAAGGTTCGGGAAAAGAGAGGACAGATTCCTGTTCTAAAGTTGGGCAGAAGGGCAGAGTCCGACAGAGC CTCGTCCCTCATCTTGGGTGCTTTGAGACAGGGAAAATCTCTCGCCGCGTCCAGAACGGAACGCTGGGCT TGGGGTGCGGGGCGGGGACTCCAACTCGCGCGCTACGCTACTCGTGTCTCCTGCTCGGATAGTGACTGTA GAGGTAAGGGTGGGAGGGTGGAGGGAGGCGGATTAATCCCTTAATTACGCCGTGATCGGCGTGGCACCTG CTTTCCGCCTGCCCAGCTCCCAGGGGACTCCGGCACTAGGGGGTGGAGAGAAGGACGAGGGAAGGAGGAG GGCACGAAGAGGCACCGACCGTACCCAGGCGCACCGGCAGGAGAGCGGCACCGTGGCTGCCGCAGCGCGC AGAGGCTGTGGAGGGGCTTACGGCTCCCAGCCCACGGGTCTCAGACCCAGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 4 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ROBO3_3 ↗ | 11:124,865,432 | 正股 | 124,865,383–124,865,442 |
| ROBO3_2 ↗ | 11:124,876,454 | 正股 | 124,876,405–124,876,464 |
| ROBO3_1 ↗ | 11:124,876,826 | 正股 | 124,876,777–124,876,836 |
| ROBO3_4 ↗ | 11:124,877,394 | 正股 | 124,877,345–124,877,404 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1386 aa
ROBO3 蛋白質長 1,386 個胺基酸。其細胞外區域含五個 Ig-like C2-type 結構域及三個 Fibronectin type-III 結構域，之後接一段跨膜螺旋；其餘部分位於細胞質。資料亦註記多段無序區域，包括細胞質端的較長區段。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ROBO3 被註記為膜上的單次跨膜第一型膜蛋白；來源未提供定位隨條件或異構型改變的資訊。
未繪示構造：Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- NELL2Q99435-1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
ROBO3 可由其 Fibronectin type-III 1 結構域與 NELL2 的 EGF domains 互相作用，兩者以 3:3 化學計量比結合。此互作會促進 ROBO3 寡聚化，並與中線連合軸突排斥相關。來源另將 ROBO3 描述為單體；未提供其他複合體資訊。
疾病與遺傳關聯
ROBO3 變異與常染色體隱性遺傳疾病「Gaze palsy, familial horizontal, with progressive scoliosis, 1」（HGPPS1）相關。此疾病可自出生時出現眼球運動異常，並有兒童期開始的進行性脊柱側彎、特徵性腦幹畸形，以及部分腦幹神經通路交叉缺陷。來源將致病原因描述為影響 ROBO3 基因的變異。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ROBO3 是參與發育期軸突導引的受體，可同時介導 NELL2 排斥、抑制 SLIT 排斥並促進 Netrin-1／NTN1 吸引。在脊髓發育中，它可能藉由避免軸突過早對 Slit 蛋白敏感，抑制 Slit 經 ROBO1／ROBO2 傳訊；NELL2 結合可促進 ROBO3 寡聚化並排斥中線連合軸突。ROBO3 間接增強 NTN1 吸引，但不直接與 NTN1 互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Receptor involved in axon guidance during development. Acts as a multifunctional regulator of pathfinding that simultaneously mediates NELL2 repulsion, inhibits SLIT repulsion, and facilitates Netrin-1/NTN1 attraction. In spinal cord development plays a role in guiding commissural axons probably by preventing premature sensitivity to Slit proteins thus inhibiting Slit signaling through ROBO1/ROBO2. Binding OF NELL2 to the receptor ROBO3 promotes oligomerization of ROBO3, resulting in the repulsion of commissural axons in the midline. ROBO3 also indirectly boosts axon attraction to NTN1 without interacting with NTN1 itself (By similarity) PMID 15105459 ↗ |
| 交互作用 | ROBO3 可呈單體形式，並透過 Fibronectin type-III 1 結構域與 NELL2 的 EGF domains 互作，兩者的化學計量比為 3:3。這項結合促進 ROBO3 寡聚化，並導致中線連合軸突受到排斥。 | 含實驗來源 | 證據與來源Monomer. Interacts (via Fibronectin type-III 1 domain) with NELL2 (via the EGF domains) with a 3:3 stoichiometry; this interaction promotes oligomerization of ROBO3 resulting in the repulsion of commissural axons in the midline PMID 32198364 ↗ |
| 細胞定位 | ROBO3 位於膜上，屬於單次跨膜的第一型膜蛋白。 | 推論支持 | |
| 疾病關聯 | Gaze palsy, familial horizontal, with progressive scoliosis, 1（HGPPS1）是常染色體隱性神經疾病，特徵包括出生時已有眼球運動異常、兒童期開始的進行性脊柱側彎、特徵性腦幹畸形，以及部分腦幹神經通路交叉缺陷。來源指出，影響 ROBO3 基因的變異會造成此病。 | 含實驗來源 | 證據與來源Gaze palsy, familial horizontal, with progressive scoliosis, 1 HGPPS1 An autosomal recessive neurologic disorder characterized by eye movement abnormalities apparent from birth, childhood-onset progressive scoliosis, distinctive brainstem malformation and defective crossing of some brainstem neuronal pathways. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 607313 PMID 15105459 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GTACCCAGGCGCACCGGCAGGAGAGCGGCACCGTGGCTGC40CGCAGCGCGCAGAGGCTGTGGAGGGGCTTACGGCTCCCAG80CCCACGGGTCTCAGACCCAGGGGCTGGGCCCCCAGCCCCC120AGTCCCGATCCCAGCTGGGTCGAGCCATGCTGCGCTACCT160GCTGAAAACGCTGCTGCAGATGAACTTGTTCGCGGACTCT200CTGGCCGGGGACATCTCCAACTCCAGCGAGCTGCTCTTGG240GCTTCAACTCCTCGCTGGCGGCGCTCAACCACACCCTGCT280GCCTCCCGGCGATCCCTCTCTCAACGGGTCAAGGGTAGGA320CCGGAGGACGCTATGCCCCGCATCGTGGAGCAGCCGCCAG360ATCTGCTGGTCTCCCGAGGCGAGCCCGCCACGTTGCCCTG400CCGCGCTGAAGGCCGACCCCGACCCAACATTGAGTGGTAC440AAGAACGGGGCGCGTGTGGCCACTGTGCGGGAGGATCCGC480GTGCGCACCGCCTGCTGCTGCCCAGCGGCGCCCTCTTCTT520CCCGCGCATCGTGCACGGGCGCCGCGCGCGGCCGGACGAA560GGTGTCTACACTTGCGTGGCTCGCAACTACCTGGGGGCAG600CAGCGAGCAGAAACGCCTCGCTGGAAGTGGCAGTCCTCCG640TGATGATTTCCGGCAGTCTCCTGGAAACGTGGTGGTGGCA680GTGGGGGAGCCAGCAGTACTGGAATGCGTGCCCCCCCGCG720GCCACCCGGAGCCTTCCGTGTCCTGGAGGAAGGACGGTGC760AAGACTCAAGGAAGAGGAAGGAAGGATCACGATCCGTGGA800GGGAAGCTGATGATGTCACATACACTCAAGAGCGATGCAG840GCATGTATGTGTGCGTAGCCTCCAACATGGCGGGAGAACG880GGAGAGTGCGGCAGCTGAAGTCATGGTACTGGAGCGTCCC920TCATTCCTGCGCAGACCAGTGAATCAGGTGGTCCTGGCTG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。