演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN NON-CODING RNA GENE

RNR5

RNA, ribosomal 45S cluster 5

RNR5 是位於人類第 22 號染色體的 45S ribosomal DNA(rDNA)群集,屬非編碼 RNA 基因位點,包含多個 45S rDNA 重複單位。

Homo sapiens22p12 not on reference assembly
OFFICIAL SYMBOL
RNR5
CHROMOSOME
22
RNA TYPE
RNA, cluster
TRANSCRIPTS
—
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

RNR5 的正式名稱為 RNA, ribosomal 45S cluster 5,屬於非編碼 RNA 位點,代表人類第 22 號染色體上的 45S ribosomal DNA(rDNA)群集。人類的 45S rDNA 群集分布於第 13、14、15、21 與 22 號染色體,分別稱為 RNR1 至 RNR5。每個群集由多個 45S rDNA 重複單位構成;重複單位數會因個體及染色體而異。此位點的基本特徵是以重複 DNA 序列形成群集,而非單一的蛋白質編碼基因。

Official symbol
RNR5
Gene name
RNA, ribosomal 45S cluster 5
Organism
Homo sapiens
Gene type
Non-coding RNA
HGNC ID
HGNC:10086
RNA type
RNA, cluster
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 2222p12 not on reference assembly
尚未取得本染色體的長度與帶型資料,完成來源同步後繪製。
Assembly 待同步 / 1-based inclusiveDirection: 待同步

帶型資料未取得,未套用其他染色體的條紋或著絲點位置。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

45S rDNA 重複單位提供產生 45S rRNA 前體的模板。該前體由 RNA polymerase I 轉錄,之後經加工形成 18S、5.8S 與 28S rRNA。RNR5 所代表的第 22 號染色體群集,是人類五個 45S rDNA 群集之一;來源將每個染色體位點描述為各自對應一個 45S rDNA 群集,以及一組 45S 前體與其產物 rRNA。

這些重複單位的數量並非固定值,會在個體與染色體之間變動;人類二倍體基因組中的總拷貝數估計介於 60 至超過 800 個重複單位。來源未進一步說明 RNR5 群集的拷貝數,也未描述其與其他群集在功能上的差異,因此不宜據此推定該位點特有的調控方式或生物學效應。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS 座標待同步
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
RNR5 的股向待同步。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 TSS 尚未取得;請在後台同步此基因來源。
目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / RNA TRANSCRIPTS

RNA 轉錄本與序列

Non-coding RNA

RNR5 依 HGNC/Ensembl 分類為 Non-coding RNA。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。

轉錄本Biotype拼接長度Exons
尚未取得轉錄本資料。

拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

RNA 細胞內定位

動物細胞結構與RNA定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

1 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 1 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能45S rDNA 群集分布於人類第 13、14、15、21 與 22 號染色體,依序稱為 RNR1 至 RNR5;各群集含有多個重複單位,其數量會因個體與染色體而異。人類二倍體基因組的總拷貝數估計為 60 至超過 800 個。重複單位由 RNA polymerase I 轉錄為 45S rRNA 前體,再加工成 18S、5.8S 與 28S rRNA。RNR5 代表第 22 號染色體上的群集。資料庫紀錄
證據與來源

45S ribosomal DNA (rDNA) arrays, or clusters, are present on human chromosomes 13, 14, 15, 21 and 22, designated RNR1 through RNR5, respectively. Each cluster consists of multiple 45S rDNA repeat units that vary in number among individuals and chromosomes, with total diploid copy number estimates ranging from 60 to >800 repeat units in a human genome. The 45S rDNA repeat unit encodes a 45S rRNA precursor, transcribed by RNA polymerase I, which is processed to form the 18S, 5.8S and 28S rRNAs. Gene and RefSeq, in collaboration with HGNC, currently describe one 45S rDNA cluster, and one set of 45S precursor and product rRNAs, for each of the five human chromosomes to which these loci are localized. This gene represents the 45S ribosomal DNA cluster on chromosome 22.

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 1 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

DNA 與 RNA 序列

完整非編碼轉錄本 · FASTA
正在取得完整參考轉錄本…

cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。

13 / DATA PROVENANCE

資料來源與研究連結