基因總覽
RNR5 的正式名稱為 RNA, ribosomal 45S cluster 5,屬於非編碼 RNA 位點,代表人類第 22 號染色體上的 45S ribosomal DNA(rDNA)群集。人類的 45S rDNA 群集分布於第 13、14、15、21 與 22 號染色體,分別稱為 RNR1 至 RNR5。每個群集由多個 45S rDNA 重複單位構成;重複單位數會因個體及染色體而異。此位點的基本特徵是以重複 DNA 序列形成群集,而非單一的蛋白質編碼基因。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
帶型資料未取得,未套用其他染色體的條紋或著絲點位置。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
45S rDNA 重複單位提供產生 45S rRNA 前體的模板。該前體由 RNA polymerase I 轉錄,之後經加工形成 18S、5.8S 與 28S rRNA。RNR5 所代表的第 22 號染色體群集,是人類五個 45S rDNA 群集之一;來源將每個染色體位點描述為各自對應一個 45S rDNA 群集,以及一組 45S 前體與其產物 rRNA。
這些重複單位的數量並非固定值,會在個體與染色體之間變動;人類二倍體基因組中的總拷貝數估計介於 60 至超過 800 個重複單位。來源未進一步說明 RNR5 群集的拷貝數,也未描述其與其他群集在功能上的差異,因此不宜據此推定該位點特有的調控方式或生物學效應。
Promoter 與基因調控
RNA 轉錄本與序列
RNR5 依 HGNC/Ensembl 分類為 Non-coding RNA。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| 尚未取得轉錄本資料。 | |||
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
RNA 細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | 45S rDNA 群集分布於人類第 13、14、15、21 與 22 號染色體,依序稱為 RNR1 至 RNR5;各群集含有多個重複單位,其數量會因個體與染色體而異。人類二倍體基因組的總拷貝數估計為 60 至超過 800 個。重複單位由 RNA polymerase I 轉錄為 45S rRNA 前體,再加工成 18S、5.8S 與 28S rRNA。RNR5 代表第 22 號染色體上的群集。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源45S ribosomal DNA (rDNA) arrays, or clusters, are present on human chromosomes 13, 14, 15, 21 and 22, designated RNR1 through RNR5, respectively. Each cluster consists of multiple 45S rDNA repeat units that vary in number among individuals and chromosomes, with total diploid copy number estimates ranging from 60 to >800 repeat units in a human genome. The 45S rDNA repeat unit encodes a 45S rRNA precursor, transcribed by RNA polymerase I, which is processed to form the 18S, 5.8S and 28S rRNAs. Gene and RefSeq, in collaboration with HGNC, currently describe one 45S rDNA cluster, and one set of 45S precursor and product rRNAs, for each of the five human chromosomes to which these loci are localized. This gene represents the 45S ribosomal DNA cluster on chromosome 22. |
DNA 與 RNA 序列
cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。