基因總覽
RNR4 的正式名稱為 RNA, ribosomal 45S cluster 4，屬於非編碼 RNA 位點，代表人類第 21 號染色體上的 45S ribosomal DNA（rDNA）cluster。人類共有五個此類 cluster，分別位於第 13、14、15、21 與 22 號染色體，稱為 RNR1 至 RNR5。每個 cluster 含有多個 45S rDNA 重複單元，其數目會因個體及染色體而異；估計人類二倍體基因組中的總拷貝數約為 60 至超過 800 個。這個位點所代表的是重複 DNA 序列群集及其核糖體 RNA 前驅物，不應視為蛋白質編碼基因。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
帶型資料未取得，未套用其他染色體的條紋或著絲點位置。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
45S rDNA 重複單元提供轉錄模板，由 RNA polymerase I 轉錄形成 45S rRNA 前驅物。該前驅物經加工後產生 18S、5.8S 與 28S rRNAs，因此 RNR4 所代表的基因組區域參與提供這三種成熟 rRNA 的前體來源。
此功能描述適用於第 21 號染色體上的 45S rDNA cluster。資料將每條承載此類位點的人類染色體各自描述為一個 cluster，並列出一組 45S 前驅物及其產物 rRNAs；此記載是對位點與 RNA 產物的整理，不表示每個重複單元的數量固定。不同個體及染色體間的重複單元數目會變動，因而無法從單一固定拷貝數概括此 cluster。
Promoter 與基因調控
RNA 轉錄本與序列
RNR4 依 HGNC／Ensembl 分類為 Non-coding RNA。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| 尚未取得轉錄本資料。 | |||
拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
RNA 細胞內定位
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | 人類第 13、14、15、21 與 22 號染色體上各有 45S rDNA cluster，依序稱為 RNR1 至 RNR5；各 cluster 含有數目可因個體及染色體而異的重複單元，人類二倍體基因組總數估計為 60 至超過 800 個。重複單元經 RNA polymerase I 轉錄形成 45S rRNA 前驅物，再加工成 18S、5.8S 與 28S rRNAs；RNR4 對應第 21 號染色體的 cluster。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源45S ribosomal DNA (rDNA) arrays, or clusters, are present on human chromosomes 13, 14, 15, 21 and 22, designated RNR1 through RNR5, respectively. Each cluster consists of multiple 45S rDNA repeat units that vary in number among individuals and chromosomes, with total diploid copy number estimates ranging from 60 to >800 repeat units in a human genome. The 45S rDNA repeat unit encodes a 45S rRNA precursor, transcribed by RNA polymerase I, which is processed to form the 18S, 5.8S and 28S rRNAs. Gene and RefSeq, in collaboration with HGNC, currently describe one 45S rDNA cluster, and one set of 45S precursor and product rRNAs, for each of the five human chromosomes to which these loci are localized. This gene represents the 45S ribosomal DNA cluster on chromosome 21. |
DNA 與 RNA 序列
cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。