基因總覽
RNA, ribosomal 45S cluster 3(RNR3)是人類第 15 號染色體上的 45S ribosomal DNA(rDNA)群集,屬於非編碼 RNA 位點,而非蛋白質編碼基因。人類的 45S rDNA 群集分布於第 13、14、15、21 與 22 號染色體,分別稱為 RNR1 至 RNR5;RNR3 對應第 15 號染色體上的群集。每個群集由多個 45S rDNA 重複單位組成,重複單位數會因個體及染色體而異。來源所述的全基因組二倍體總拷貝數估計範圍為 60 至超過 800 個重複單位。資料庫目前為這五個染色體位點各描述一個 45S rDNA 群集,以及相應的一組 45S 前體與產物 rRNA。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
帶型資料未取得,未套用其他染色體的條紋或著絲點位置。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RNR3 所代表的 45S rDNA 重複單位提供轉錄模板,產生 45S rRNA 前體。此轉錄由 RNA polymerase I 執行,之後前體會經加工形成 18S、5.8S 與 28S rRNA。因此,這個位點的來源描述聚焦於核糖體 RNA 前體及其加工產物,而非蛋白質產物。
45S rDNA 重複單位的數量並非固定值:不同個體與染色體之間都可能不同;在人類二倍體基因組中,所有相關重複單位的總數估計介於 60 至超過 800 個。這項數量差異描述的是 45S rDNA 重複序列的拷貝數,不代表每個群集只含單一轉錄單位。資料庫則以每個所在染色體各一個群集及一組 45S 前體與產物 rRNA 的方式整理這些位點。
RNR3 的具體身分是第 15 號染色體上的 45S rDNA 群集;在人類五個相關染色體位點的命名中,RNR3 對應第 15 號染色體。來源支持的功能範圍為重複單位轉錄出 45S rRNA 前體,並經加工形成三種成熟 rRNA;未提供更細的加工機制或其他生物學作用,因此不延伸推論。
Promoter 與基因調控
RNA 轉錄本與序列
RNR3 依 HGNC/Ensembl 分類為 Non-coding RNA。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| 尚未取得轉錄本資料。 | |||
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
RNA 細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | 人類 45S ribosomal DNA(rDNA)群集位於第 13、14、15、21 與 22 號染色體,依序命名為 RNR1 至 RNR5。各群集包含數量可因個體及染色體而異的重複單位;二倍體基因組總數估計為 60 至超過 800 個。重複單位由 RNA polymerase I 轉錄成 45S rRNA 前體,再加工為 18S、5.8S 與 28S rRNA;RNR3 對應第 15 號染色體群集。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源45S ribosomal DNA (rDNA) arrays, or clusters, are present on human chromosomes 13, 14, 15, 21 and 22, designated RNR1 through RNR5, respectively. Each cluster consists of multiple 45S rDNA repeat units that vary in number among individuals and chromosomes, with total diploid copy number estimates ranging from 60 to >800 repeat units in a human genome. The 45S rDNA repeat unit encodes a 45S rRNA precursor, transcribed by RNA polymerase I, which is processed to form the 18S, 5.8S and 28S rRNAs. Gene and RefSeq, in collaboration with HGNC, currently describe one 45S rDNA cluster, and one set of 45S precursor and product rRNAs, for each of the five human chromosomes to which these loci are localized. This gene represents the 45S ribosomal DNA cluster on chromosome 15. |
DNA 與 RNA 序列
cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。