基因總覽
RNA, ribosomal 45S cluster 1（RNR1）是人類第 13 號染色體上的非編碼 RNA 基因座，屬於 45S ribosomal DNA（rDNA）群集。人類的 45S rDNA 群集分布於第 13、14、15、21 與 22 號染色體，分別稱為 RNR1 至 RNR5。每個群集由多個 45S rDNA 重複單位組成；重複單位數會因個體與染色體而異。RNR1 的基本特徵是以重複排列的 rDNA 作為轉錄模板，產生 45S rRNA 前驅物；其後續加工可形成多種成熟 rRNA。此基因座代表人類五個染色體特定 45S rDNA 群集之一。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
帶型資料未取得，未套用其他染色體的條紋或著絲點位置。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RNR1 所代表的 45S rDNA 群集包含多個重複單位，每個單位提供轉錄生成 45S rRNA 前驅物的模板。這項轉錄由 RNA polymerase I 執行；因此，RNR1 的功能與核糖體 RNA 的生成相連，而非直接產生蛋白質。不同個體及不同染色體上的重複單位數量並不固定，人類二倍體基因組的總數估計約為 60 至超過 800 個，顯示此類基因座的拷貝數具有相當變異。
生成的 45S rRNA 前驅物會經加工，形成 18S、5.8S 與 28S rRNAs。這些產物來自同一前驅物的處理，而非由 RNR1 分別直接轉錄成三種成熟 rRNA。RNR1 因而參與提供這些 rRNA 的前驅物來源；資料所述的是轉錄與加工的產物關係，未進一步界定各成熟 rRNA 的具體分子作用機制。
人類第 13、14、15、21 與 22 號染色體各有對應的 45S rDNA 群集，RefSeq 與 HGNC 目前分別描述這些群集及其前驅物、產物 rRNA。RNR1 對應其中第 13 號染色體上的群集。由於群集由數目可變的重複單位構成，所述基因座是染色體上的重複性 rDNA 組織，而不是單一拷貝的典型蛋白質編碼基因。
Promoter 與基因調控
RNA 轉錄本與序列
RNR1 依 HGNC／Ensembl 分類為 Non-coding RNA。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| 尚未取得轉錄本資料。 | |||
拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
RNA 細胞內定位
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | 人類 45S rDNA 群集位於第 13、14、15、21 與 22 號染色體，依序稱為 RNR1 至 RNR5；各群集含有數目可變的重複單位，人類二倍體基因組總數估計約 60 至超過 800 個。重複單位經 RNA polymerase I 轉錄成 45S rRNA 前驅物，再加工形成 18S、5.8S 與 28S rRNAs；RNR1 對應第 13 號染色體上的群集。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源45S ribosomal DNA (rDNA) arrays, or clusters, are present on human chromosomes 13, 14, 15, 21 and 22, designated RNR1 through RNR5, respectively. Each cluster consists of multiple 45S rDNA repeat units that vary in number among individuals and chromosomes, with total diploid copy number estimates ranging from 60 to >800 repeat units in a human genome. The 45S rDNA repeat unit encodes a 45S rRNA precursor, transcribed by RNA polymerase I, which is processed to form the 18S, 5.8S and 28S rRNAs. Gene and RefSeq, in collaboration with HGNC, currently describe one 45S rDNA cluster, and one set of 45S precursor and product rRNAs, for each of the five human chromosomes to which these loci are localized. This gene represents the 45S ribosomal DNA cluster on chromosome 13. |
DNA 與 RNA 序列
cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。