演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

RNF24G1L

ring finger protein 24

RNF24(ring finger protein 24)是蛋白質編碼基因,產物為單次穿膜蛋白,帶有 RING-type 鋅指區域,可能參與 TRPC 蛋白的細胞內運輸。

Homo sapiens20p13UniProt Q9Y225
OFFICIAL SYMBOL
RNF24
CHROMOSOME
20
UNIPROT
Q9Y225
PDB / ALPHAFOLD
2EP4
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

RNF24(ring finger protein 24)是位於人類 20 號染色體 20p13 的蛋白質編碼基因。其產物為 148 個胺基酸的蛋白質,具有單次穿膜特徵,並含有 RING-type 鋅指區域。現有資料將其與 TRPC 蛋白的細胞內運輸可能相關聯;這項描述指出可能的角色,未提供更細的作用機制或其他生理功能。

Official symbol
RNF24
Gene name
ring finger protein 24
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13779
UniProt
Q9Y225
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
G1L

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 2020p13
chr20 · 64,444,167 bp · GRCh38chr20p13 · 1–5100000 · gnegchr20p12.3 · 5100001–9200000 · gpos75chr20p12.2 · 9200001–12000000 · gnegchr20p12.1 · 12000001–17900000 · gpos75chr20p11.23 · 17900001–21300000 · gnegchr20p11.22 · 21300001–22300000 · gpos25chr20p11.21 · 22300001–25700000 · gnegchr20p11.1 · 25700001–28100000 · acenchr20q11.1 · 28100001–30400000 · acenchr20q11.21 · 30400001–33500000 · gnegchr20q11.22 · 33500001–35800000 · gpos25chr20q11.23 · 35800001–39000000 · gnegchr20q12 · 39000001–43100000 · gpos75chr20q13.11 · 43100001–43500000 · gnegchr20q13.12 · 43500001–47800000 · gpos25chr20q13.13 · 47800001–51200000 · gnegchr20q13.2 · 51200001–56400000 · gpos75chr20q13.31 · 56400001–57800000 · gnegchr20q13.32 · 57800001–59700000 · gpos50chr20q13.33 · 59700001–64444167 · gnegRNF24pq1 bp64,444,167 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr20:3,927,309–4,015,598
Gene span
88,290 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000358395 ★3,927,311–4,015,5586
ENST000003360953,927,309–4,015,3896
ENST000005456163,927,309–4,015,5987
ENST000009057303,927,309–4,015,5916
ENST000009057313,927,309–4,015,5737
ENST000009057323,927,309–4,015,5455
ENST000011325323,927,309–4,015,5586
ENST000004322613,931,424–3,974,3876
ENST000009804293,933,064–4,015,5888
ENST000010228503,933,064–4,015,5917
ENST000010228513,933,064–4,015,5876
ENST000010228533,933,064–4,015,5557

顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

RNF24 的功能資料指出,它可能參與 TRPCs 的細胞內運輸。此說法屬於可能性描述,來源未進一步說明 RNF24 在運輸過程中的具體步驟、作用方式,或其影響方向,因此不宜據此推定它促進或抑制 TRPC 蛋白的移動。

TRPCs 是該功能描述所指涉的蛋白群,但資料沒有交代此運輸角色是否適用於所有 TRPC 成員,也未指出特定細胞或實驗條件。因而目前可整理的功能重點,是 RNF24 與 TRPCs 的細胞內運輸可能存在關聯;至於運輸如何受調節、是否涉及其他分子,以及這項關聯對細胞活動的後續影響,來源均未提供足夠資訊。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 4015558 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>RNF24 ENST00000358395 GRCh38 chr20:4015458-4016558 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AACCAATGGGCACCACGTGACCATTCTTGTGTCTCTGGGGACTGTCAATCTGCATGCTAGGAAAGGGGTG
GCATTCCAATCTTTCATTTTTTTGTGTGTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATG
GTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCTCCCCGGGTTCAAGAGATTTTCCTGCCTTAGCCTCCCGAGT
AGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCCAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGAGTTTCTCT
ATGTTGGTCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGTTGG
GATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCCCATGCTTTCACTTTTAAAAATGCTTGTAGGGCACGCAAA
AATACTAAACGGTCGATGGAGAAGGTCTGTCTGGAGTAGTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGT
CTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGTGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCAGGTT
CAGGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACACCCGGCTAAT
TTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCATCGCGTTAGCCAAGATGGTCTCGATCTCCTGACC
TCGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCTCGCCCGGCCTGTC
TGGCGTAGTTCTAACCAGGAACAGAGCCAGCGGCCAGGGCCGCACCAGGCCTGGCCAGGGAGCGCCGCGC
CTGCGCACTGCAGACTCTGAAGCCGCCGAGCCCTCCGCCGAGGTGGGTGGGGAAACTGCCCGGGCATCCG
GGTCCCTCACCCCGCCCCCGCTGCATGAATGAGAGGCGCGGCGCCCGCCCCTCCCCCGGCGGGCCCGCCC
CTCGCGAGGGGCCGCCGGGCGCAGTCAGCCGCCGCCACCTCCGCCGCGCTCTGTCCGGACGGACGCTCGC
CGCCCGCAGCCTGCCGCCCGCCGCAGGGCGCTGACGGTCCCGCACGTCTGC
RNF24 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
RNF24_1 ↗20:4,015,552負股4,015,542–4,015,601

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR20_93L25 · enhancer · 4012637–4013032 · regulatory

ENSR20_5XH82 · CTCF_binding_site · 4013708–4013729 · regulatory

ENSR20_CDQD · enhancer · 4013798–4015378 · regulatory

ENSR20_BRHZ · promoter · 4015379–4016048 · regulatory

ENSR20_93L3D · enhancer · 4017015–4017410 · regulatory

ENSR20_85752 · enhancer · 4017512–4017693 · regulatory

ENSR20_8575D · enhancer · 4018142–4018362 · regulatory

ENSR20_93L3R · promoter · 4018363–4018863 · regulatory

· motif · 4013061–4013067 · motif

· motif · 4013710–4013726 · motif

· motif · 4014642–4014654 · motif

· motif · 4015024–4015037 · motif

· motif · 4015080–4015093 · motif

· motif · 4015126–4015139 · motif

· motif · 4015132–4015145 · motif

· motif · 4015226–4015239 · motif

· motif · 4015312–4015325 · motif

· motif · 4015388–4015401 · motif

· motif · 4015414–4015427 · motif

· motif · 4015625–4015638 · motif

· motif · 4015712–4015723 · motif

· motif · 4015712–4015723 · motif

· motif · 4016033–4016048 · motif

· motif · 4016161–4016175 · motif

· motif · 4018592–4018606 · motif

· motif · 4018592–4018606 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:148 aa

1 aa148 aa鋅指跨膜區
依 Q9Y225 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

RNF24 蛋白質長 148 個胺基酸。其第 24–44 位胺基酸區段為螺旋型跨膜區;第 78–119 位則註解為 RING-type 鋅指區域。

跨膜區Helical24–44 aa
鋅指RING-type78–119 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 2EP4…

PDB · 2EP4

NMR · - · A=68-128

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Golgi apparatus membrane

RNF24 被註解為單次穿膜蛋白,定位於 Golgi apparatus 膜。 資料未提供定位變化的條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 16 個夥伴 · 最多顯示 50 個
G1LRNF24UQCRHABHD5ARMC1BNIP3CNIH1GOLT1ALHFPL3MFSD14BNKG7NRSN1NT5EPLP1SLC10A6TIMMDC1TMX2VAMP1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 16 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

RNF24 與 TRPC1、TRPC3、TRPC4、TRPC5、TRPC6 及 TRPC7 有互作註解。資料未進一步說明這些關係是否代表直接結合、共同組成複合體,或僅為功能性互作。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能RNF24 可能參與 TRPCs 的細胞內運輸。來源以可能性描述此功能,未說明具體運輸步驟、作用方向或發生條件。含實驗來源
證據與來源

May play a role in TRPCs intracellular trafficking

PMID 17850865 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用RNF24 與 TRPC1、TRPC3、TRPC4、TRPC5、TRPC6 及 TRPC7 有互作註解;資料未界定這些互作是否為直接結合或複合體關係。含實驗來源
證據與來源

Interacts with TRPC1, TRPC3, TRPC4, TRPC5, TRPC6 and TRPC7

PMID 17850865 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位RNF24 被註解為單次穿膜蛋白,定位於 Golgi apparatus 膜;此筆資料未提供定位改變的條件或異構型差異。含實驗來源
證據與來源

Golgi apparatus membrane / Single-pass membrane protein

PMID 17850865 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000358395 · 7,328 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1GCAGTCAGCCGCCGCCACCTCCGCCGCGCTCTGTCCGGAC40
41GGACGCTCGCCGCCCGCAGCCTGCCGCCCGCCGCAGGGCG80
81CTGACGGTCCCGCACGTCTGCCGCTGCCACCGGCGCGCCC120
121GATTCATCCATGAGCTCGGATTTCCCACATTACAACTTCA160
161GGATGCCTAATATTGGATTCCAGAATCTGCCTCTCAACAT200
201ATATATTGTGGTTTTTGGTACTGCTATATTTGTCTTCATC240
241CTTAGTTTACTCTTCTGTTGCTACTTGATTAGGCTAAGAC280
281ATCAAGCACACAAAGAATTTTATGCCTACAAACAGGTTAT320
321ATTAAAAGAGAAAGTAAAAGAATTGAATTTACATGAGCTC360
361TGTGCAGTGTGCCTAGAAGACTTCAAGCCTCGAGATGAGT400
401TGGGGATTTGCCCATGTAAGCACGCCTTCCACAGAAAGTG440
441CCTTATTAAGTGGCTGGAGGTTCGTAAAGTGTGTCCCCTG480
481TGCAACATGCCAGTTCTACAGCTGGCCCAGTTGCACAGTA520
521AGCAGGACCGTGGACCCCCTCAGGGGCCCCTTCCTGGGGC560
561AGAGAACATTGTATAGCTTACCGCAAGGATCAGACTGTTG600
601CTGGACACGACGTCTGTGTGGAGCCAGGAGGAACACATGT640
641GGTGTCTGTATGGCTGCTCTCTACCTAGGACACCAGCTGC680
681CACTTCTTTTGCCTCATGAAGAACTCTTGGGCCAGCCAAA720
721CTGGGAACCTAGGTGTCTGGGTCTTGTGACAACCAAAGCA760
761CTTTGACACTACCCCCTGCCGAGAGAAGAGGAGTGGATGA800
801GCCTGCGGGTTTGCCTCAAGAAACTTCATGAGGGTCTCTT840
841ACTAACTCCATTACACTCTCTCTCCTGGAGCCTCATCTCC880
881ATGTCAAGCAGGAGGGTAAAGAAGGGAACTAAGAGCAGGT920
921CTTTCAAGCCACACCCCCACCTGCGGATGGATGGGTTTCT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。