基因總覽
RNASE6 是蛋白質編碼基因，其產物 ribonuclease A family member 6 屬於 pancreatic ribonuclease family。來源描述此蛋白具有核糖核酸酶活性，並指出它對 RNA 中的嘧啶核苷酸 uridine 與 cytosine 有偏好。除此之外，RNASE6 也與抗菌作用相關；具體作用方式及其對細菌的影響見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000304677 ★ | 20,781,268–20,782,467 | 2 |
| ENST00000905521 | 20,781,031–20,782,465 | 2 |
| ENST00001137456 | 20,781,031–20,783,793 | 2 |
| ENST00000916164 | 20,781,345–20,783,793 | 2 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RNASE6 的產物是一種核糖核酸酶，對嘧啶核苷酸 uridine 與 cytosine 有偏好。除了這項酵素特性，來源也描述其具有強效抗菌活性，作用對象涵蓋革蘭氏陽性菌與革蘭氏陰性菌，包括 P. aeruginosa、A. baumannii、M. luteus、S. aureus、E. faecalis、E. faecium、S. saprophyticus 與 E. coli。
其抗菌作用與細菌膜完整性受損有關，並可促進革蘭氏陰性菌凝集。這些觀察指出，RNASE6 對細菌的影響不只涉及其核糖核酸酶特性；來源明確指出，殺菌活性不依賴 RNase 活性。因此，不宜將其抗菌效應簡化為 RNA 水解作用，也不應把核糖核酸酶活性視為殺菌所必需的條件。
RNASE6 可能有助於維持尿路無菌狀態，但此項生理角色在來源中以推測方式提出，並非確定結論。其抗菌活性的描述涉及多種革蘭氏陽性與陰性菌，而尿路相關的功能意義則仍應保留「可能」的限定。
Promoter 與基因調控
>RNASE6 ENST00000304677 GRCh38 chr14:20780268-20781368 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AAATATCCTAAATTCGGCCTTCTTCTTCAGGCTTACAGGTCTTTTCATACACAATTCTGTCTTTGGGAGG CGCTTAACACTCTCTTCACCTAACTTCTAATTATTCCTCAAAATTCAGTTCAGGTGTTGTGCCCTCCAAC AATCCTTCCCCTCTACTATCTTCCCGTAGCCTCCTGCAGTGTCCTCCATCACACTGTAAGTGCTATTTAT ATTAATATAATCTACTTGTCTATATACTTACCTGCCTGTCTCTAATCTCTTTCATTAAATCATGAGCTCC TGGCAGATCACGAGGTCAGGAGATAGAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAA TACAAAAAAATTAGCTGGGCGTGATGGCAGGCACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAG AATGGCATGAACCCAGGAGGTGGAGCTTGCAGTGAGCAAAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCGA CAGAGCAAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTCATGAGCTCCTGAATTTGTGTAGCCTAGT ACCTGGCCCAATAAGTATATGCATAAATGAATAATGTATTCACTTCTGTTGTAGGAACTTACAACATTAC CAAGTATGTGGCAGGCATTATATCATATTTATGTGACATATTTTCTCTTAAGAAACAGGAATCATAAAGC TTCAAAAAAAAACACTGAAGCCTCAGATGAGGCAGGAAGCACTCATTCCATATCAGGAAGTGATCAGTTC CTCAAAACTGTGAGTTTTCAGTCATGTTGTTTCTTTAAGTTGGTTTAGCCTTCCTGTATACATGTGATAA TGATACTGTTTTAAAGAACAGGTGTGAAAGTCTAAGAGTTTAATCCAGACTCTGCACAAGAAGTTAATCT GCCAAACCCTAGGATTCTCCTTCTGAAAGCTCAGAATATTTCTTCCCCTTCCCTATACACACAGGGCTCG AAGGGTTAGAGAAGAAAGGCAGACAACAGCTTCTGAGCTTTGGACTAATCACAGCCTCTGTTCTCAGCAG GAGCCCCAACACTGAGACCAGGTAAGAAAGAAAGCCTCAGGGCTGGAGCGA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RNASE6_1 ↗ | 14:20,781,070 | 正股 | 20,781,021–20,781,080 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR14_9B8P2 · promoter · 20780778–20781278 · regulatory
ENSR14_8LHF9 · enhancer · 20781279–20781513 · regulatory
· motif · 20781012–20781027 · motif
· motif · 20781016–20781029 · motif
· motif · 20781018–20781029 · motif
· motif · 20781018–20781029 · motif
· motif · 20781124–20781133 · motif
· motif · 20781126–20781138 · motif
· motif · 20781452–20781465 · motif
· motif · 20781452–20781465 · motif
· motif · 20782448–20782457 · motif
· motif · 20782448–20782459 · motif
· motif · 20782651–20782664 · motif
· motif · 20782713–20782728 · motif
在 uropathogenic E. coli 菌株 CFT073 刺激下，CD14+ 單核球中的 RNASE6 表現上升。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：150 aa
RNASE6 蛋白長 150 個胺基酸，屬於 pancreatic ribonuclease family。蛋白質特徵資料將第 1 至 23 個胺基酸標註為訊號序列；此註解依序列相似性推定。
蛋白質三維結構
細胞內定位
RNASE6 被標註為可分泌，並見於溶酶體與細胞質顆粒。 來源未提供這些定位之間的轉換條件或動態資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
未繪示構造：Cytoplasmic granule。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
RNASE6 可透過 N 端與細菌脂多醣（LPS）互作。來源描述的是與 LPS 的互作，未指出此項關係代表特定複合體形成。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RNASE6 是對 uridine 與 cytosine 有偏好的核糖核酸酶，也具有作用於多種革蘭氏陽性菌及陰性菌的強效抗菌活性。它會破壞細菌膜完整性，並促進革蘭氏陰性菌凝集；殺菌作用不依賴 RNase 活性。其對維持尿路無菌狀態的貢獻仍屬可能。 | 含實驗來源 | 證據與來源Ribonuclease which shows a preference for the pyrimidines uridine and cytosine. Has potent antibacterial activity against a range of Gram-positive and Gram-negative bacteria, including P.aeruginosa, A.baumanii, M.luteus, S.aureus, E.faecalis, E.faecium, S.saprophyticus and E.coli. Causes loss of bacterial membrane integrity, and also promotes agglutination of Gram-negative bacteria. Probably contributes to urinary tract sterility. Bactericidal activity is independent of RNase activity PMID 25075772 ↗ · PMID 27013146 ↗ · PMID 27089320 ↗ · PMID 8836175 ↗ |
| 交互作用 | RNASE6 透過 N 端與細菌脂多醣（LPS）互作。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | RNASE6 被標註為可分泌，並位於溶酶體及細胞質顆粒；此項定位資料未提供其他條件或動態差異。 | 含實驗來源 | |
| 調控 | 在 uropathogenic E. coli 菌株 CFT073 刺激時，CD14+ 單核球中的 RNASE6 表現上升。 | 含實驗來源 | 證據與來源Up-regulated in CD14+ monocytes in response to the uropathogenic E.coli strain CFT073 PMID 25075772 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGACAACAGCTTCTGAGCTTTGGACTAATCACAGCCTCTG40TTCTCAGCAGGAGCCCCAACACTGAGACCAGAAAAGATGG80TGCTATGCTTTCCTCTTCTTTTACTGCTGCTGGTTCTATG120GGGACCAGTGTGTCCACTTCATGCTTGGCCTAAGCGTCTC160ACCAAGGCTCACTGGTTTGAAATTCAGCATATACAGCCAA200GTCCTCTCCAATGCAACAGGGCAATGAGTGGCATCAACAA240TTATACCCAGCACTGTAAGCATCAAAATACCTTTCTGCAT280GACTCTTTCCAGAATGTGGCTGCTGTCTGTGATTTGCTCA320GCATTGTCTGCAAAAATCGTCGGCACAACTGCCACCAGAG360CTCAAAGCCTGTCAACATGACTGACTGCAGACTCACTTCA400GGAAAGTATCCCCAGTGCCGCTATAGTGCTGCTGCCCAGT440ACAAATTCTTCATTGTTGCCTGTGACCCCCCTCAGAAGAG480CGATCCCCCCTACAAGTTGGTTCCTGTACACTTAGATAGT520ATTCTCTAAGGCATCCACTGCATTTCCTTTCATTTGACAT560AGCTTCTGTTACAATTGCATCCATGTTTTCTTTTCTTTTG600TTGATTTTCTTGTTCCCGTAGAAGAAAGAAGAAAGGTGTT640TGGAGAATTCGAGTGCCTAGGATGCCAGACCAGAGTTGAG680ACAAAAAGAAATAAGATTATTTTCTGCTTTGTAGTTCTGT720ACTTTTCGAGAGAAGGGAATAGGGAAGACAGCAAAGAAAG760ATTCAGATTTCTAACCCTGCAACTTTTGCCAAGCTTTATT800GCCCTGTGTTCACAGCAATAAAACCACTTCCTGCTGCATT840CTAA844cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。