基因總覽
RNASE4 是蛋白質編碼基因，其產物名稱為 ribonuclease A family member 4，亦稱 Ribonuclease 4。此蛋白質屬於 pancreatic ribonuclease family，長度為 147 個胺基酸；其序列包含位於第 1 至 28 個胺基酸的訊號胜肽。這些資訊界定了 RNASE4 產物的家族歸屬與基本結構特徵。其已知作用包括特定的核酸切割偏好及抗菌活性，相關作用與對泌尿道致病性大腸桿菌的抑制有關。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000555835 ★ | 20,684,560–20,701,216 | 2 |
| ENST00001117072 | 20,681,073–20,701,216 | 2 |
| ENST00000885367 | 20,682,598–20,701,216 | 3 |
| ENST00000885368 | 20,682,598–20,701,216 | 2 |
| ENST00000971275 | 20,682,598–20,701,216 | 3 |
| ENST00000885369 | 20,682,866–20,701,216 | 2 |
| ENST00000885366 | 20,682,870–20,701,216 | 2 |
| ENST00000885370 | 20,684,177–20,701,216 | 3 |
| ENST00000885371 | 20,684,177–20,701,216 | 3 |
| ENST00000885372 | 20,684,177–20,701,216 | 3 |
| ENST00000885375 | 20,684,177–20,701,216 | 3 |
| ENST00000885376 | 20,684,177–20,701,216 | 3 |
顯示 12/29 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RNASE4 的核酸切割具有序列偏好：它較常在 uridine 鹼基之後進行切割。這項特性描述的是其切割位點偏好；來源未提供其他底物序列偏好或切割機制細節，因此不宜延伸為更廣泛的核酸辨識模式。
除核酸切割外，RNASE4 也具有對抗泌尿道致病性大腸桿菌（uropathogenic E. coli，UPEC）的抗菌活性。這項觀察將其作用與泌尿道中的細菌防禦聯繫起來，但現有資料並未說明抗菌作用的具體分子機制，也未指出其是否透過核酸切割直接造成細菌受抑制。
RNASE4 可能有助於維持泌尿道無菌狀態。這一角色以「可能」描述，表示其對泌尿道無菌性的貢獻仍應保留推論性質；來源支持其具備抗 UPEC 活性並可能參與該生物學結果，但不足以將其寫成維持泌尿道無菌的唯一因素，或推定特定的體內作用途徑。
Promoter 與基因調控
>RNASE4 ENST00000555835 GRCh38 chr14:20683560-20684660 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GGGAAGGCACTGTTGTCTTACCGAAGTGTGTTATATTTTGGCTTCTACGTTAAGTCCAAAGGCCGGCAGA TATATACGTATCGCGCGTCTGTCCTGGGGCTCAGTACCCTACAGCCTTGCAACCGAGCTCAGCTCTGGCC CTCGATCTCTATTTCAGCCCCCTCCAGGTTCCCTCCAGGCCCTAGCGGGCTTAAATCGCTCCCCGGGCTC AGTGAGACACAAGCATGTGACCTAAAGTCTAAAAAGCTGCCTTCCTTCACCCCATCCTGCATCTGGATCG AGGAGAATAAGCCAGAGAATAAGCCACACTTGAAACTTGGTGAAGATGGAAGGAATAACTAAATAAGGCC TAAGGGAAATGTCACAACAGAGGAAAAGAAACAAAACAAAAAACCTTCAGAACAGCAGGCGGAAAAGAGA AATTCAGAGTGATAGGAAGCACCACTCAGCTACAGTGGCTCGTTGGTCTAGGGGTATGATTCTCGCTTTG GGTGCGAGAGGTCCCGGGTTCAAATCCCGGACGAGCCCTCGTGGCTACTGTTTTTCCACCCCCTTTTGTC AACTACTGAAAAAAAGTCTCCGTTAAATTTGAAACACAAACTGTCTCGCGATGGGCTGTCCTGCCAAAGA AAGCAGCAGCGAATAAGTACGTGGCAGATGGTGCTGTCGACCAGTGTCAAGACCAAGTTTCATGGGTTCC TGGACGCTCAGCCAGGGGTAGTCTCTGAAGGGCCGCCTGGCAATTGGGAGCAGAAGCCAGTTTCCCGCCA TCTGCTCTCCGTGGAGGCAGTGCTCTCGCGGCTGCTGCCCGTTGGGGTCCAGCTGAGGAAGGAGCGCGGA TCCCAGGCTCGTTCTTTGCCTGGGCTGCCCCTGCGGCCCCTGGGGCGGGTGCTGCTGCGGCGCCAGCTCC AAGGGCGGATCCAGGCGGGAGGGGCCTCCTCGGAGAAGCGGGGCGCGGTCCCAACTACGCAGAGGCTGGC ACGCCGACCCTCCACACCTCACCACGCCCCCATCTCCGTCCGTGTACACACACTCACACAAGGACGCCAA CCCCACCTAGATGCAAAGCAGGATTCAAAAGAACATCTTTGCGTTTTCTAC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RNASE4_2 ↗ | 14:20,682,862 | 正股 | 20,682,813–20,682,872 |
| RNASE4_1 ↗ | 14:20,684,560 | 正股 | 20,684,511–20,684,570 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR14_56TC8Q · CTCF_binding_site · 20681722–20681743 · regulatory
ENSR14_B64SH · promoter · 20683687–20684597 · regulatory
ENSR14_56TCMR · CTCF_binding_site · 20684102–20684123 · regulatory
ENSR14_B64SM · enhancer · 20684598–20685572 · regulatory
ENSR14_B64SS · enhancer · 20686016–20686736 · regulatory
ENSR14_9B7NZ · enhancer · 20687450–20687719 · regulatory
· motif · 20680895–20680910 · motif
· motif · 20681056–20681068 · motif
· motif · 20681312–20681327 · motif
· motif · 20681342–20681355 · motif
· motif · 20681344–20681355 · motif
· motif · 20681353–20681364 · motif
· motif · 20681367–20681380 · motif
· motif · 20681429–20681439 · motif
· motif · 20681724–20681740 · motif
· motif · 20681732–20681747 · motif
· motif · 20681740–20681754 · motif
· motif · 20681937–20681946 · motif
· motif · 20681987–20682000 · motif
· motif · 20682689–20682700 · motif
· motif · 20682776–20682787 · motif
· motif · 20682807–20682816 · motif
· motif · 20683183–20683194 · motif
· motif · 20683374–20683389 · motif
· motif · 20683814–20683825 · motif
· motif · 20684057–20684072 · motif
· motif · 20684104–20684120 · motif
· motif · 20684226–20684239 · motif
· motif · 20684320–20684331 · motif
· motif · 20684322–20684332 · motif
· motif · 20684696–20684711 · motif
· motif · 20685220–20685229 · motif
· motif · 20685220–20685229 · motif
· motif · 20686184–20686194 · motif
· motif · 20686664–20686679 · motif
· motif · 20686664–20686679 · motif
· motif · 20687596–20687609 · motif
· motif · 20687596–20687610 · motif
· motif · 20687596–20687611 · motif
· motif · 20687596–20687611 · motif
· motif · 20688006–20688021 · motif
· motif · 20688007–20688021 · motif
· motif · 20688008–20688021 · motif
RNASE4 的表現會在胰島素反應下受到誘導。現有資料未提供誘導的細胞或組織條件、調控幅度或分子機制，因此此處僅描述其與胰島素反應相關的表現變化。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：147 aa
RNASE4 蛋白質長 147 個胺基酸，屬於 pancreatic ribonuclease family。序列第 1 至 28 個胺基酸被註記為訊號胜肽，符合其作為分泌蛋白質的特徵；來源未提供其他結構域或功能區域註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
RNASE4 為分泌型蛋白質，並可在尿液中檢測到。 來源未提供其他定位條件或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RNASE4 優先在 uridine 鹼基之後切割核酸，並具有對抗泌尿道致病性大腸桿菌（UPEC）的抗菌活性；它可能有助於維持泌尿道無菌狀態。此處對泌尿道無菌性的作用保留「可能」的推論程度。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cleaves preferentially after uridine bases. Has antimicrobial activity against uropathogenic E.coli (UPEC). Probably contributes to urinary tract sterility PMID 33818125 ↗ · PMID 3467790 ↗ |
| 細胞定位 | RNASE4 是分泌型蛋白質，並可在尿液中檢測到。 | 含實驗來源 | |
| 調控 | RNASE4 的表現會在胰島素反應下受到誘導。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
ACCACGCCCCCATCTCCGTCCGTGTACACACACTCACACA40AGGACGCCAACCCCACCTAGATGCAAAGCAGGATTCAAAA80GAACATCTTTGCGTTTTCTACCGGCTCCCCATCATCGTAC120TAGGGAGGAAGAAGCGGGTGAGAAACAAAACTTCTTTCCA160TTGTCCTGCCCGTTTCTGCGGACTTGTTCTGAGGCCGAGG200CACCTCTAAGATACTGATGGCTCTGCAGAGGACCCATTCA240TTGCTTCTGCTTTTGCTGCTGACCCTGCTGGGGCTGGGGC280TGGTCCAGCCCTCCTATGGCCAGGATGGCATGTACCAGCG320ATTCCTGCGGCAACACGTGCACCCTGAGGAGACAGGTGGC360AGTGATCGCTACTGCAACTTGATGATGCAAAGACGGAAGA400TGACTTTGTATCACTGCAAGCGCTTCAACACCTTCATCCA440TGAAGATATCTGGAACATTCGTAGTATCTGCAGCACCACC480AATATCCAATGCAAGAACGGCAAGATGAACTGCCATGAGG520GTGTAGTGAAGGTCACAGATTGCAGGGACACAGGAAGTTC560CAGGGCACCCAACTGCAGATATCGGGCCATAGCGAGCACT600AGACGTGTTGTCATTGCCTGTGAGGGTAACCCACAGGTGC640CTGTGCACTTTGACGGTTAGATGCCACCATGTAGGGATTA680TCGCGAGTGGTTGACCTTACACTTACTCCTTAAATAGCAG720TGAGTAATGCATTTGAGCTGTCCCAGGCTCTGTCTCCTCA760GCTCATTTCCTACTCTTTTTCTCTATATAACTCATTCTAT800TAAATACATTGCACCAAAGAGATATGGAGACATAAACCTG840TAATGAATGAGGCTGGGCTTTTCTGTAATAAGCTTCCTTT880TATAATACTGGTCAGCTTAGCTCTCTCAGATCCTATCCTG920TGGAATTTAGTTATTATGTGTATTTATGTAGTATTTCAAA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。