基因總覽
RNASE3（ribonuclease A family member 3）是蛋白質編碼基因，產物屬於 pancreatic ribonuclease family。此蛋白質長 160 個胺基酸，具細胞毒性，也具有低效率的核糖核酸酶活性；來源另指出它有多種生物活性，其中包括抗菌作用。這些基本特徵將 RNASE3 產物定位為兼具核糖核酸酶家族身分與抗菌、細胞毒性特性的蛋白質。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000304639 ★ | 20,891,385–20,892,348 | 2 |
| ENST00001091252 | 20,882,394–20,892,348 | 3 |
| ENST00001134612 | 20,891,306–20,892,348 | 2 |
| ENST00001091253 | 20,891,454–20,892,348 | 2 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RNASE3 的產物具有細胞毒性與蠕蟲毒性，但其核糖核酸酶活性效率較低。來源亦指出它具有多種生物活性；已列出的作用包括抗菌活性，以及對細菌細胞膜造成影響。這些資料支持其抗菌作用不僅與核糖核酸酶活性相關，亦涉及細菌膜的改變，但來源沒有進一步說明各種作用之間的因果順序或相對貢獻。
在受測細菌中，RNASE3 可使細胞質膜去極化；此作用較偏向革蘭氏陰性菌，但也見於革蘭氏陽性菌。對大腸桿菌（E. coli），來源描述其外膜會脫離，整體細胞形狀也會改變，並伴隨部分細胞內容物流失。這些觀察呈現出膜狀態與細胞完整性受影響的結果；來源未提供足以將這些變化推廣至其他細菌或所有條件的資訊。
蛋白質特徵資料指出，胺基酸第 28 至 72 位的區域對幾乎所有殺菌活性都不可或缺，並部分參與 LPS 結合及細菌膜去極化。因此，這段區域與抗菌功能密切相關，但其對 LPS 結合及膜去極化的作用僅被描述為部分參與，不能解讀為完全決定這些作用。來源也未說明低效率核糖核酸酶活性在上述抗菌效應中的具體作用。
綜合來源所列結果，RNASE3 的功能特色包括細胞毒性、蠕蟲毒性、低效率核糖核酸酶活性，以及對不同類型細菌的抗菌作用。抗菌效應伴隨細菌膜去極化；在大腸桿菌中，另觀察到外膜脫離、細胞形狀改變與部分細胞內容物流失。這些描述界定了已報告的活性與細胞層級變化，但未提供其在人體中的生理情境或各作用機制的完整說明。
Promoter 與基因調控
>RNASE3 ENST00000304639 GRCh38 chr14:20890385-20891485 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ACACCATGTTCACACAAATGCTATTACCTCTATCACACTGTAATACAATTATATGTCTACAAGTACTTTC CTGTGTTTCTCTGAGGGCCAAGAATAAATGTATGCTTTGTGTATCAAACTGTACACTTGACCTCTATACT TTCAGGAATACAGTGCTCTGTCCTTAAATGTTCATTTGTAAATACAGAACCATATTCTTGTTAATATCAC AAAATGAAACTTACCAGGAAGATGAATGACAACCCCAGAACACACTGTTTTGTAGAAAATACCATAGGCT GAAAAGATCACAGGAATACCGAGTGCTAGGTTGGAATCTTTCATGACACCAAATGTTCATTCATCCTCTG CCAGATTTTACAACTGTCCTCGGTGTGTTTTTAGGTTATGTAACTTTACACAAAGTGGAATCAATAATCA GGGCAAGACTTAAGAGAAAGTGGATCCAATGCAAGAGGAGTAAAGAAAAAAATTCCTCAATTGTATGGAG CAGATTGTTTTAATTATCTACAGAATCTTGTGCCCCAAGAAATTAATAGCTCAAGTTTCCAGCAAGAGTG GTGGATGAGATGGAGAGCATTTATGTGAGAGAGAACCAAGGATATTACTAAAAATGGAAGGGAAGCTGGG TTTCTCCTGGGCAAACAGCCCTCTGTGGCTCTATTTCTCCTAACTACTATGCCTGCCTTCGTGTCATTTA GTCATTTAGGGGCCTGCCAGAGGACAGTTATAAAATCTGTGGTCATTCTGCCGGCAGCGTATAGTTTTCA CCCAGAGTCCAGATCCCACCGGCAAAACTCTGTCTAACACAGGATGACTTGGAATTAGAGTCCGTATAGC AGAAAGAGCAGCAGGGCTGTCCTTGGGTATCCGTTGCTCAGCCAAGTCATCAAATAAAAAGGATGATTGC ACAAGTGGACCATGTGTCAATCTGTGGGTTTCTGCATGGCCAGACCCACCAAGGGAAGCTTTATTTAAAC AGTTCCAAGTAGGGGAGACCAGCTGCCCCTGAACCCCAGAACAACCAGCTGGATCAGTTCTCACAGGAGC CACAGCTCAGAGACTGGGTAAGTCAACAATCCCCAGAGCTGGGACAGGAGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RNASE3_1 ↗ | 14:20,891,385 | 正股 | 20,891,336–20,891,395 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：160 aa
RNASE3 產物長 160 個胺基酸，屬於 pancreatic ribonuclease family。蛋白質特徵註解將第 1 至 27 位標示為訊號區域；第 28 至 72 位則是功能區域，對幾乎所有殺菌活性都必要，並部分參與 LPS 結合及細菌膜去極化。
蛋白質三維結構
細胞內定位
RNASE3 會被分泌，並位於嗜酸性球大型特異性顆粒的基質中。 這些顆粒會在免疫刺激活化後釋放；來源未提供其他定位變化或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
RNASE3 可與細菌脂多醣（LPS）及脂磷壁酸（LTA）互作。體外試驗中，它也會與由 dioleoyl phosphatidylcholine 和 dioleoyl phosphatidylglycerol 組成的脂質雙層互作並插入其中。另在體外 pH 3 條件下，RNASE3 傾向形成類澱粉聚集體；pH 5 或 pH 7 時則未見此傾向。這些結果描述的是互作、插入與特定酸鹼條件下的聚集，未據此推定體內複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RNASE3 具有細胞毒性與蠕蟲毒性，核糖核酸酶活性效率較低，並具有多種生物活性。其抗菌作用包括使細菌細胞質膜去極化，作用較偏向革蘭氏陰性菌，但也影響革蘭氏陽性菌；在大腸桿菌中，還會促進外膜脫離、改變細胞形狀，並造成部分細胞內容物流失。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytotoxin and helminthotoxin with low-efficiency ribonuclease activity. Possesses a wide variety of biological activities. Exhibits antibacterial activity, including cytoplasmic membrane depolarization of preferentially Gram-negative, but also Gram-positive strains. Promotes E.coli outer membrane detachment, alteration of the overall cell shape and partial loss of cell content PMID 19450231 ↗ · PMID 2501794 ↗ |
| 交互作用 | RNASE3 可與細菌脂多醣（LPS）及脂磷壁酸（LTA）互作。體外試驗中，它也會與由 dioleoyl phosphatidylcholine 和 dioleoyl phosphatidylglycerol 組成的脂質雙層互作並插入其中；在 pH 3 時傾向形成類澱粉聚集體，但在 pH 5 或 pH 7 時沒有此傾向。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with bacterial lipopolysaccharide (LPS) and lipoteichoic acid (LTA). In vitro interacts with and insert into lipid bilayers composed of dioleoyl phosphatidylcholine and dioleoyl phosphatidylglycerol. In vitro, tends to form amyloid-like aggregates at pH 3, but not at pH 5, nor 7 PMID 19450231 ↗ |
| 細胞定位 | RNASE3 會被分泌，並位於嗜酸性球大型特異性顆粒的基質中；這些顆粒會在免疫刺激活化後釋放。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Secreted; Located in the matrix of eosinophil large specific granule, which are released following activation by an immune stimulus |
核酸與蛋白質序列
AGCTGCCCCTGAACCCCAGAACAACCAGCTGGATCAGTTC40TCACAGGAGCCACAGCTCAGAGACTGGGAAACATGGTTCC80AAAACTGTTCACTTCCCAAATTTGTCTGCTTCTTCTGTTG120GGGCTTATGGGTGTGGAGGGCTCACTCCATGCCAGACCCC160CACAGTTTACGAGGGCTCAGTGGTTTGCCATCCAGCACAT200CAGTCTGAACCCCCCTCGATGCACCATTGCAATGCGGGCA240ATTAACAATTATCGATGGCGTTGCAAAAACCAAAATACTT280TTCTTCGTACAACTTTTGCTAATGTAGTTAATGTTTGTGG320TAACCAAAGTATACGCTGCCCTCATAACAGAACTCTCAAC360AATTGTCATCGGAGTAGATTCCGGGTGCCTTTACTCCACT400GTGACCTCATAAATCCAGGTGCACAGAATATTTCAAACTG440CACGTATGCAGACAGACCAGGAAGGAGGTTCTATGTAGTT480GCATGTGACAACAGAGATCCACGGGATTCTCCACGGTATC520CTGTGGTTCCAGTTCACCTGGATACCACCATCTAAGCTCC560TGTATCAGCAGTCCTCATCATCACTCATCTGCCAAGCTCC600TCAATCATAGCCAAGATCCCATCCCTCCATGTACTCTGGG640TATCAGCAACTGTCCTCATCAGTCTCCATACCCCTTCAGC680TTTCCTGAGCTGAAGTCCCTTGTGAACCCTGCAATAAACT720GCTTTGCAAATTCA734cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。