演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

RNASE2EDN

ribonuclease A family member 2

RNASE2 編碼 ribonuclease A family member 2,屬於胰臟型核糖核酸酶家族,是具嘧啶核苷酸偏好的核酸酶,也具有細胞毒性及對樹突細胞的選擇性趨化活性。

Homo sapiens14q11.2UniProt P10153
OFFICIAL SYMBOL
RNASE2
CHROMOSOME
14
UNIPROT
P10153
PDB / ALPHAFOLD
5E13
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

RNASE2 是蛋白質編碼基因,其產物 ribonuclease A family member 2 屬於胰臟型核糖核酸酶家族。這種核酸酶偏好辨識嘧啶核苷酸,對尿嘧啶略有偏好;來源將其描述為非分泌型核糖核酸酶。除核酸酶活性外,該蛋白質也與細胞毒性、抗蠕蟲毒性及對樹突細胞的選擇性趨化作用相關。其蛋白質序列註解包含一段訊號肽,涵蓋第 1 至 27 個胺基酸。

Official symbol
RNASE2
Gene name
ribonuclease A family member 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10045
UniProt
P10153
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
EDNRAF3RNS2

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1414q11.2
chr14 · 107,043,718 bp · GRCh38chr14p13 · 1–3600000 · gvarchr14p12 · 3600001–8000000 · stalkchr14p11.2 · 8000001–16100000 · gvarchr14p11.1 · 16100001–17200000 · acenchr14q11.1 · 17200001–18200000 · acenchr14q11.2 · 18200001–24100000 · gnegchr14q12 · 24100001–32900000 · gpos100chr14q13.1 · 32900001–34800000 · gnegchr14q13.2 · 34800001–36100000 · gpos50chr14q13.3 · 36100001–37400000 · gnegchr14q21.1 · 37400001–43000000 · gpos100chr14q21.2 · 43000001–46700000 · gnegchr14q21.3 · 46700001–50400000 · gpos100chr14q22.1 · 50400001–53600000 · gnegchr14q22.2 · 53600001–55000000 · gpos25chr14q22.3 · 55000001–57600000 · gnegchr14q23.1 · 57600001–61600000 · gpos75chr14q23.2 · 61600001–64300000 · gnegchr14q23.3 · 64300001–67400000 · gpos50chr14q24.1 · 67400001–69800000 · gnegchr14q24.2 · 69800001–73300000 · gpos50chr14q24.3 · 73300001–78800000 · gnegchr14q31.1 · 78800001–83100000 · gpos100chr14q31.2 · 83100001–84400000 · gnegchr14q31.3 · 84400001–89300000 · gpos100chr14q32.11 · 89300001–91400000 · gnegchr14q32.12 · 91400001–94200000 · gpos25chr14q32.13 · 94200001–95800000 · gnegchr14q32.2 · 95800001–100900000 · gpos50chr14q32.31 · 100900001–102700000 · gnegchr14q32.32 · 102700001–103500000 · gpos50chr14q32.33 · 103500001–107043718 · gnegRNASE2pq1 bp107,043,718 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr14:20,955,345–20,956,436
Gene span
1,092 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000304625 ★20,955,487–20,956,4362
ENST0000113341520,955,345–20,956,4362

顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

RNASE2 產物可水解 RNA 中含胞嘧啶或尿嘧啶的核苷酸鍵。對含胞嘧啶的 RNA,反應產物包括帶有 3′-磷酸胞苷的 RNA 片段,以及帶有 5′-羥基的核糖核苷酸片段;含尿嘧啶的 RNA 也會產生相應的 3′-磷酸尿苷片段與 5′-羥基核糖核苷酸片段。這些反應顯示其核酸酶作用涵蓋兩種嘧啶核苷酸,而整體描述指出它對尿嘧啶略有偏好。

除了 RNA 水解作用,來源亦將 RNASE2 描述為具有細胞毒性與抗蠕蟲毒性的核糖核酸酶。這些是來源所列的生物活性,未提供更細的作用機制或適用條件,因此不宜據此延伸推論其靶標、效應途徑或生理情境。

RNASE2 也具有對樹突細胞的選擇性趨化作用,表示其活性與引導這類細胞移動相關。來源未進一步說明趨化作用的分子機制或發生條件;此外,來源以概括方式指出該蛋白質具有多種生物活性,但未逐一列明,因此功能範圍應以已明確描述的 RNA 水解、細胞毒性、抗蠕蟲毒性及樹突細胞趨化作用為限。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 20955487 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>RNASE2 ENST00000304625 GRCh38 chr14:20954487-20955587 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TGTGTCTACAATTACTTTCCTGTATGTCTCTGAGGGCCAAGAATAAATGTATGCTTTGTGTATCAAACTG
TACACTTGACCTCTATACTTTCAGGAATACAGTGCTCTGTCCTTAAATGTTCATTTGTAAATACAGAACC
ATTTTCTTGTTAATATCACAAAATGAAACTTACCAGGAAGATGAATGACAACCCCAGAACACAGTGTTTT
GTAGAAAATACCATAGGCTGAAAAGATCACAGGAATACCGAGTGCTAGGTTGGAATCTTTCATGACACCA
AATGTTCATTCATTCTCTGCCAGACTTTACAACTGTCCTCGGTGTGTTTTTAGGTTGTGTAACTTTACAC
AAAGTGGAAGCAATAATCAGGGCAAGACTTAAGAGAAAGTGGATCCAATGCAAGAGGAGTAAAGAAAAAA
ATCCCTCAAGTATGTGTAGCAGATTGTTTTAATTATCTACAGAATCTTGTGCCCTAAGAAATTAATAGCT
CAAGTTTCCAGCAAGAGTGGTGGATGAGATGGAGAGCATTTGTGTGAGAGAGAACCAAGGATATTACTAA
AAATGAAAGGGAAGCTGGGTTTCTCCTGGGCAAACAGCCCTCAGTGGCTCTATTTGTTCTAACTACTATG
CCTGCCTTCATGTACTTTGGTCATTTAGTGGCCTGCCAGAGGACAGTTATAAAATCTGTGGTCATTCTGC
AGGCAGCATATAGTTTTCATCCAGAGTTTGGATCTAACCAGCAAAACTCTGTCTTACACAGGATGACTTG
GAATTAGAGTCCTTATAGCAGAAAGAGCAGCAGGGCTGTCCTTGGGTATCCGTTGCTCAGCCAAGTCATC
AAATAAAAAGGATGATTGCACAAGTGGACTATGTACCAATCTGTGGGTTTCTGCATGGCCAAGAGCCAGA
CCCTCCCTCTGGGCTCTGCTGGCCCAACCCACCAAGGGATGCTTTATTTAAACAGTTCCAAGTAGGGGAG
ACCAGCTGCCCCTGAACCCCAGAACAACCAGCTGGATCAGTTCTCACAGGAGCTACAGCGCGGAGACTGG
GTAAGTCAACGATCCCCAGAGCTGGGACAGAAGGGGCAGCAATGGGGCAGC
RNASE2 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
RNASE2_1 ↗14:20,955,470正股20,955,421–20,955,480

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

· motif · 20955349–20955364 · motif

· motif · 20955349–20955364 · motif

· motif · 20955350–20955364 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:161 aa

1 aa161 aa訊號胜肽
依 P10153 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ribonuclease A family member 2 長 161 個胺基酸,屬於胰臟型核糖核酸酶家族。序列註解標示第 1 至 27 個胺基酸為訊號肽;來源未提供其他結構域或功能區域的註解。

訊號胜肽1–27 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 5E13…

PDB · 5E13

X-ray · 1.34 A · A=1-161

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Lysosome;Cytoplasmic granule

RNASE2 註記於溶酶體、細胞質顆粒,以及嗜酸性球大型特異性顆粒的基質。 來源未提供不同位置間的轉移條件、定位動態或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Cytoplasmic granule。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
EDNRNASE2DLG2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

RNASE2 與 RNH1 互作,並形成緊密的 1:1 複合體。來源另指出,兩個此類複合體可能進一步二聚化;這項二聚化描述具有可能性,並非確定必然發生。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

5 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 5 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能RNASE2 是非分泌型核糖核酸酶,屬於偏好嘧啶核苷酸的核酸酶,且對尿嘧啶略有偏好。來源亦將其描述為具有細胞毒性與抗蠕蟲毒性,並能選擇性趨化樹突細胞;此外,還概括指出它具有多種生物活性,但未列明其他活性的內容。含實驗來源
證據與來源

This is a non-secretory ribonuclease. It is a pyrimidine specific nuclease with a slight preference for U. Cytotoxin and helminthotoxin. Selectively chemotactic for dendritic cells. Possesses a wide variety of biological activities

PMID 12578357 ↗ · PMID 3458170 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性an [RNA] containing cytidine + H2O = an [RNA]-3'-cytidine-3'-phosphate + a 5'-hydroxy-ribonucleotide-3'-[RNA].推論支持
證據與來源

an [RNA] containing cytidine + H2O = an [RNA]-3'-cytidine-3'-phosphate + a 5'-hydroxy-ribonucleotide-3'-[RNA].

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性an [RNA] containing uridine + H2O = an [RNA]-3'-uridine-3'-phosphate + a 5'-hydroxy-ribonucleotide-3'-[RNA].推論支持
證據與來源

an [RNA] containing uridine + H2O = an [RNA]-3'-uridine-3'-phosphate + a 5'-hydroxy-ribonucleotide-3'-[RNA].

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用RNASE2 與 RNH1 互作並形成緊密的 1:1 複合體。來源並指出,兩個此類複合體可能發生二聚化;此處以可能性描述該組裝狀態。含實驗來源
證據與來源

Interacts with and forms a tight 1:1 complex with RNH1. Dimerization of two such complexes may occur

PMID 12578357 ↗ · PMID 15755456 ↗ · PMID 16401072 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位RNASE2 的定位註記包括溶酶體、細胞質顆粒,以及嗜酸性球大型特異性顆粒的基質。推論支持
證據與來源

Lysosome; Cytoplasmic granule; Matrix of eosinophil's large specific granule

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 5 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000304625 · 720 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGAACAACCAGCTGGATCAGTTCTCACAGGAGCTACAGCG40
41CGGAGACTGGGAAACATGGTTCCAAAACTGTTCACTTCCC80
81AAATTTGTCTGCTTCTTCTGTTGGGGCTTCTGGCTGTGGA120
121GGGCTCACTCCATGTCAAACCTCCACAGTTTACCTGGGCT160
161CAATGGTTTGAAACCCAGCACATCAATATGACCTCCCAGC200
201AATGCACCAATGCAATGCAGGTCATTAACAATTATCAACG240
241GCGATGCAAAAACCAAAATACTTTCCTTCTTACAACTTTT280
281GCTAACGTAGTTAATGTTTGTGGTAACCCAAATATGACCT320
321GTCCTAGTAACAAAACTCGCAAAAATTGTCACCACAGTGG360
361AAGCCAGGTGCCTTTAATCCACTGTAACCTCACAACTCCA400
401AGTCCACAGAATATTTCAAACTGCAGGTATGCGCAGACAC440
441CAGCAAACATGTTCTATATAGTTGCATGTGACAACAGAGA480
481TCAACGACGAGACCCTCCACAGTATCCGGTGGTTCCAGTT520
521CACCTGGATAGAATCATCTAAGCTCCTGTATCAGCACTCC560
561TCATCATCACTCATCTGCCAAGCTCCTCAATCATAGCCAA600
601GATCCCATCTCTCCATATACTTTGGGTATCAGCATCTGTC640
641CTCATCAGTCTCCATACCCCTTCAGCTTTCCTGAGCTGAA680
681GTGCCTTGTGAACCCTGCAATAAACTGCTTTGCAAATTCA720

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。