基因總覽
RNASE2 是蛋白質編碼基因,其產物 ribonuclease A family member 2 屬於胰臟型核糖核酸酶家族。這種核酸酶偏好辨識嘧啶核苷酸,對尿嘧啶略有偏好;來源將其描述為非分泌型核糖核酸酶。除核酸酶活性外,該蛋白質也與細胞毒性、抗蠕蟲毒性及對樹突細胞的選擇性趨化作用相關。其蛋白質序列註解包含一段訊號肽,涵蓋第 1 至 27 個胺基酸。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000304625 ★ | 20,955,487–20,956,436 | 2 |
| ENST00001133415 | 20,955,345–20,956,436 | 2 |
顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RNASE2 產物可水解 RNA 中含胞嘧啶或尿嘧啶的核苷酸鍵。對含胞嘧啶的 RNA,反應產物包括帶有 3′-磷酸胞苷的 RNA 片段,以及帶有 5′-羥基的核糖核苷酸片段;含尿嘧啶的 RNA 也會產生相應的 3′-磷酸尿苷片段與 5′-羥基核糖核苷酸片段。這些反應顯示其核酸酶作用涵蓋兩種嘧啶核苷酸,而整體描述指出它對尿嘧啶略有偏好。
除了 RNA 水解作用,來源亦將 RNASE2 描述為具有細胞毒性與抗蠕蟲毒性的核糖核酸酶。這些是來源所列的生物活性,未提供更細的作用機制或適用條件,因此不宜據此延伸推論其靶標、效應途徑或生理情境。
RNASE2 也具有對樹突細胞的選擇性趨化作用,表示其活性與引導這類細胞移動相關。來源未進一步說明趨化作用的分子機制或發生條件;此外,來源以概括方式指出該蛋白質具有多種生物活性,但未逐一列明,因此功能範圍應以已明確描述的 RNA 水解、細胞毒性、抗蠕蟲毒性及樹突細胞趨化作用為限。
Promoter 與基因調控
>RNASE2 ENST00000304625 GRCh38 chr14:20954487-20955587 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TGTGTCTACAATTACTTTCCTGTATGTCTCTGAGGGCCAAGAATAAATGTATGCTTTGTGTATCAAACTG TACACTTGACCTCTATACTTTCAGGAATACAGTGCTCTGTCCTTAAATGTTCATTTGTAAATACAGAACC ATTTTCTTGTTAATATCACAAAATGAAACTTACCAGGAAGATGAATGACAACCCCAGAACACAGTGTTTT GTAGAAAATACCATAGGCTGAAAAGATCACAGGAATACCGAGTGCTAGGTTGGAATCTTTCATGACACCA AATGTTCATTCATTCTCTGCCAGACTTTACAACTGTCCTCGGTGTGTTTTTAGGTTGTGTAACTTTACAC AAAGTGGAAGCAATAATCAGGGCAAGACTTAAGAGAAAGTGGATCCAATGCAAGAGGAGTAAAGAAAAAA ATCCCTCAAGTATGTGTAGCAGATTGTTTTAATTATCTACAGAATCTTGTGCCCTAAGAAATTAATAGCT CAAGTTTCCAGCAAGAGTGGTGGATGAGATGGAGAGCATTTGTGTGAGAGAGAACCAAGGATATTACTAA AAATGAAAGGGAAGCTGGGTTTCTCCTGGGCAAACAGCCCTCAGTGGCTCTATTTGTTCTAACTACTATG CCTGCCTTCATGTACTTTGGTCATTTAGTGGCCTGCCAGAGGACAGTTATAAAATCTGTGGTCATTCTGC AGGCAGCATATAGTTTTCATCCAGAGTTTGGATCTAACCAGCAAAACTCTGTCTTACACAGGATGACTTG GAATTAGAGTCCTTATAGCAGAAAGAGCAGCAGGGCTGTCCTTGGGTATCCGTTGCTCAGCCAAGTCATC AAATAAAAAGGATGATTGCACAAGTGGACTATGTACCAATCTGTGGGTTTCTGCATGGCCAAGAGCCAGA CCCTCCCTCTGGGCTCTGCTGGCCCAACCCACCAAGGGATGCTTTATTTAAACAGTTCCAAGTAGGGGAG ACCAGCTGCCCCTGAACCCCAGAACAACCAGCTGGATCAGTTCTCACAGGAGCTACAGCGCGGAGACTGG GTAAGTCAACGATCCCCAGAGCTGGGACAGAAGGGGCAGCAATGGGGCAGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RNASE2_1 ↗ | 14:20,955,470 | 正股 | 20,955,421–20,955,480 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
· motif · 20955349–20955364 · motif
· motif · 20955349–20955364 · motif
· motif · 20955350–20955364 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:161 aa
ribonuclease A family member 2 長 161 個胺基酸,屬於胰臟型核糖核酸酶家族。序列註解標示第 1 至 27 個胺基酸為訊號肽;來源未提供其他結構域或功能區域的註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
RNASE2 註記於溶酶體、細胞質顆粒,以及嗜酸性球大型特異性顆粒的基質。 來源未提供不同位置間的轉移條件、定位動態或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
未繪示構造:Cytoplasmic granule。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- DLG2Q15700 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
RNASE2 與 RNH1 互作,並形成緊密的 1:1 複合體。來源另指出,兩個此類複合體可能進一步二聚化;這項二聚化描述具有可能性,並非確定必然發生。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RNASE2 是非分泌型核糖核酸酶,屬於偏好嘧啶核苷酸的核酸酶,且對尿嘧啶略有偏好。來源亦將其描述為具有細胞毒性與抗蠕蟲毒性,並能選擇性趨化樹突細胞;此外,還概括指出它具有多種生物活性,但未列明其他活性的內容。 | 含實驗來源 | 證據與來源This is a non-secretory ribonuclease. It is a pyrimidine specific nuclease with a slight preference for U. Cytotoxin and helminthotoxin. Selectively chemotactic for dendritic cells. Possesses a wide variety of biological activities PMID 12578357 ↗ · PMID 3458170 ↗ |
| 分子活性 | an [RNA] containing cytidine + H2O = an [RNA]-3'-cytidine-3'-phosphate + a 5'-hydroxy-ribonucleotide-3'-[RNA]. | 推論支持 | 證據與來源an [RNA] containing cytidine + H2O = an [RNA]-3'-cytidine-3'-phosphate + a 5'-hydroxy-ribonucleotide-3'-[RNA]. |
| 分子活性 | an [RNA] containing uridine + H2O = an [RNA]-3'-uridine-3'-phosphate + a 5'-hydroxy-ribonucleotide-3'-[RNA]. | 推論支持 | 證據與來源an [RNA] containing uridine + H2O = an [RNA]-3'-uridine-3'-phosphate + a 5'-hydroxy-ribonucleotide-3'-[RNA]. |
| 交互作用 | RNASE2 與 RNH1 互作並形成緊密的 1:1 複合體。來源並指出,兩個此類複合體可能發生二聚化;此處以可能性描述該組裝狀態。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with and forms a tight 1:1 complex with RNH1. Dimerization of two such complexes may occur PMID 12578357 ↗ · PMID 15755456 ↗ · PMID 16401072 ↗ |
| 細胞定位 | RNASE2 的定位註記包括溶酶體、細胞質顆粒,以及嗜酸性球大型特異性顆粒的基質。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
AGAACAACCAGCTGGATCAGTTCTCACAGGAGCTACAGCG40CGGAGACTGGGAAACATGGTTCCAAAACTGTTCACTTCCC80AAATTTGTCTGCTTCTTCTGTTGGGGCTTCTGGCTGTGGA120GGGCTCACTCCATGTCAAACCTCCACAGTTTACCTGGGCT160CAATGGTTTGAAACCCAGCACATCAATATGACCTCCCAGC200AATGCACCAATGCAATGCAGGTCATTAACAATTATCAACG240GCGATGCAAAAACCAAAATACTTTCCTTCTTACAACTTTT280GCTAACGTAGTTAATGTTTGTGGTAACCCAAATATGACCT320GTCCTAGTAACAAAACTCGCAAAAATTGTCACCACAGTGG360AAGCCAGGTGCCTTTAATCCACTGTAACCTCACAACTCCA400AGTCCACAGAATATTTCAAACTGCAGGTATGCGCAGACAC440CAGCAAACATGTTCTATATAGTTGCATGTGACAACAGAGA480TCAACGACGAGACCCTCCACAGTATCCGGTGGTTCCAGTT520CACCTGGATAGAATCATCTAAGCTCCTGTATCAGCACTCC560TCATCATCACTCATCTGCCAAGCTCCTCAATCATAGCCAA600GATCCCATCTCTCCATATACTTTGGGTATCAGCATCTGTC640CTCATCAGTCTCCATACCCCTTCAGCTTTCCTGAGCTGAA680GTGCCTTGTGAACCCTGCAATAAACTGCTTTGCAAATTCA720cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。