基因總覽
RNASE1（ribonuclease A family member 1, pancreatic）是蛋白質編碼基因，其產物屬於 pancreatic ribonuclease family。此蛋白質為核糖核酸內切酶，具有訊號序列，並含有一段被註記為無序的區域。來源指出它可作用於單股與雙股 RNA；其具體切割方式與底物反應詳見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000397967 ★ | 20,801,228–20,802,844 | 2 |
| ENST00000340900 | 20,801,228–20,802,884 | 3 |
| ENST00000412779 | 20,801,228–20,802,413 | 2 |
| ENST00000397970 | 20,801,228–20,802,884 | 3 |
| ENST00000884084 | 20,801,228–20,802,884 | 3 |
| ENST00000884086 | 20,801,228–20,802,884 | 3 |
| ENST00000884087 | 20,801,228–20,802,884 | 3 |
| ENST00000884088 | 20,801,228–20,802,804 | 2 |
| ENST00000884089 | 20,801,228–20,802,421 | 2 |
| ENST00000960488 | 20,801,228–20,802,804 | 3 |
| ENST00000960489 | 20,801,228–20,802,496 | 2 |
| ENST00001134923 | 20,801,228–20,802,884 | 2 |
顯示 12/16 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RNASE1 的產物是核糖核酸內切酶，能切割 RNA 中嘧啶核苷酸的 3′側。這項作用可發生於單股或雙股 RNA，顯示其底物不限定於單一股鏈型態；來源未進一步指出兩種 RNA 的切割效率或偏好差異。
反應資料分別描述含 cytidine 與含 uridine 的 RNA 水解。含 cytidine 的 RNA 經反應後，形成帶有 3′-cytidine-3′-phosphate 的 RNA 片段，以及 5′-hydroxy-ribonucleotide-3′-RNA；含 uridine 的 RNA 則形成帶有 3′-uridine-3′-phosphate 的 RNA 片段，並同樣產生 5′-hydroxy-ribonucleotide-3′-RNA。這些反應說明其切割可作用於含有兩種嘧啶核苷酸的 RNA，且產物末端具有相應的磷酸基團與羥基特徵。
因此，來源所支持的功能重點是 RNASE1 對 RNA 的直接水解切割，以及對單股、雙股 RNA 和 cytidine、uridine 底物的作用。來源未提供更廣泛的細胞過程或生理影響資訊，故不延伸推論其下游功能。
Promoter 與基因調控
>RNASE1 ENST00000397967 GRCh38 chr14:20802744-20803844 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GTATGGGGGGCAGGACCCTCTCTGGAATGAGGATCTTACGACCTACAATCACACAAGGTAGGTCAGATAA TTTCACTATGGCCACTTTTTACACAGAAAGGCTGAAACAATCTGAATACACAGCACGAAGGGATATTTTG ATAATTCTTAGAGGTATCCAAATTGTTACTCAGCAAAAAAACAGGTCTCTTTCTAGGAGGGCATTCTGCT GCTAATAAATATGATATTCTTTGTATTTTTTCCCCAAAAAGAATTTGAGATTTGGGATTTAAGTTTATCT TTAGTTCCTCTACTCAATTCCGACCTACAGGGTCAGTGGTTACTGTAGATAAGAACAGCCCCATCCTCTC GATGCCCCCAGAGCAGGGGTGGAGGGTGGGTGGGAAGTGGCCAGAACTGGGTGAGCGCACCCTAGAGGCC TCCTCCTCCTCCCTATTCAGTTACTCCCCCTTTCTTCTCCAGATCTGGGAAGCCTTCCAGCTGGGGGCAG CAGGACAGCCTCCATTCCCCCCGACCCCGCCTCCCATCCCCGGGAGAGGTAGCGTTGGGAGAATGCCCTC CTAGAAAGAGACTTGGGTTTTGCTCCCTAGGAGCCCTGGAATAGCTTTGGCCAGAATTCCCTATCTCCCA TTAGAACCTCTCCTTTGCGTCCTTTGTTAACCTCCAAGTCTACTTGGTGAAAACGCCCACGAAGAAGTAA CAAGGACTTTGTTCCTAGTGTGCCAGGTTTGGGCACCAGTGCTGTAGTGGCTTTCTCTGCTGCTCCTTGT GCATCAGCAGACAGATGTGGTTCACATAGGAAGAAAGACTAACGTAGGCAAAGATTTGCTCTTTCTTCAG CAGCCCTAGAAAGACGGCGGCCTGGGTGATTCACCACTCCTTCCTCACGTCCTTGATTTTATTTGAACTG AGCTCCAGATGCTCCTCCCACCCTTTTCCTCTTGGAAGCCAAACCCCTTTGTAATCTGTATAAGGTCCAC ACCCCGGGAGCTGAGTGATTGCAGAAACTGGCCTTCCATCTCTCTCAGACACCAAGCTGCAGATCCAGGT AAGCAGCCCAAGAGGTGTTCTCAGGTGCCGCTTCTGCTTCAGGGTTGCAGA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RNASE1_2 ↗ | 14:20,802,328 | 負股 | 20,802,318–20,802,377 |
| RNASE1_1 ↗ | 14:20,802,844 | 負股 | 20,802,834–20,802,893 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR14_B65G7 · enhancer · 20799242–20799956 · regulatory
ENSR14_B65G9 · promoter · 20799957–20800471 · regulatory
ENSR14_56W4L2 · CTCF_binding_site · 20800364–20800385 · regulatory
ENSR14_56W4T6 · CTCF_binding_site · 20801903–20801924 · regulatory
ENSR14_8LHTL · enhancer · 20802665–20802833 · regulatory
ENSR14_56W4ZZ · CTCF_binding_site · 20802732–20802753 · regulatory
ENSR14_9B8XD · promoter · 20802834–20803127 · regulatory
ENSR14_9B8XH · enhancer · 20803167–20803522 · regulatory
ENSR14_56W557 · CTCF_binding_site · 20803423–20803444 · regulatory
· motif · 20799604–20799610 · motif
· motif · 20800366–20800382 · motif
· motif · 20800502–20800515 · motif
· motif · 20801905–20801921 · motif
· motif · 20802734–20802750 · motif
· motif · 20803425–20803441 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：156 aa
RNASE1 產物長 156 個胺基酸，屬於 pancreatic ribonuclease family。蛋白質特徵註記包含第 1–28 位的訊號序列，以及第 33–53 位被預測為無序的區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
來源將 RNASE1 標示為分泌型；未提供其他定位或定位改變條件。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- RNH1P13489 · UniProt INTERACTION · 10 experiments
- TRIM7Q9C029 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
RNASE1 以單體形式存在，並與 RNH1 作用形成緊密的 1:1 複合體；兩個此類複合體可能進一步二聚化。RNASE1 與 RNH1 的交互作用會抑制 RNASE1。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RNASE1 產物是核糖核酸內切酶，可切割 RNA 中嘧啶核苷酸的 3′側；其作用底物包括單股 RNA 與雙股 RNA。來源未指出兩種股鏈型態之間是否存在切割偏好或效率差異。 | 含實驗來源 | 證據與來源Endonuclease that catalyzes the cleavage of RNA on the 3' side of pyrimidine nucleotides. Acts on single-stranded and double-stranded RNA PMID 17350650 ↗ |
| 分子活性 | an [RNA] containing cytidine + H2O = an [RNA]-3'-cytidine-3'-phosphate + a 5'-hydroxy-ribonucleotide-3'-[RNA]. | 資料庫紀錄 | 證據與來源an [RNA] containing cytidine + H2O = an [RNA]-3'-cytidine-3'-phosphate + a 5'-hydroxy-ribonucleotide-3'-[RNA]. |
| 分子活性 | an [RNA] containing uridine + H2O = an [RNA]-3'-uridine-3'-phosphate + a 5'-hydroxy-ribonucleotide-3'-[RNA]. | 資料庫紀錄 | 證據與來源an [RNA] containing uridine + H2O = an [RNA]-3'-uridine-3'-phosphate + a 5'-hydroxy-ribonucleotide-3'-[RNA]. |
| 交互作用 | RNASE1 可作為單體存在，並與 RNH1 形成緊密的 1:1 複合體。兩個此類複合體可能發生二聚化；RNASE1 與 RNH1 的交互作用會抑制 RNASE1。 | 含實驗來源 | 證據與來源Monomer. Interacts with and forms tight 1:1 complexes with RNH1. Dimerization of two such complexes may occur. Interaction with RNH1 inhibits this protein PMID 17350650 ↗ |
| 細胞定位 | Secreted | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
GCAGAAACTGGCCTTCCATCTCTCTCAGACACCAAGCTGC40AGATCCAGGCTTTTCTGGGAAAGTGAGGCCACCATGGCTC80TGGAGAAGTCTCTTGTCCGGCTCCTTCTGCTTGTCCTGAT120ACTGCTGGTGCTGGGCTGGGTCCAGCCTTCCCTGGGCAAG160GAATCCCGGGCCAAGAAATTCCAGCGGCAGCATATGGACT200CAGACAGTTCCCCCAGCAGCAGCTCCACCTACTGTAACCA240AATGATGAGGCGCCGGAATATGACACAGGGGCGGTGCAAA280CCAGTGAACACCTTTGTGCACGAGCCCCTGGTAGATGTCC320AGAATGTCTGTTTCCAGGAAAAGGTCACCTGCAAGAACGG360GCAGGGCAACTGCTACAAGAGCAACTCCAGCATGCACATC400ACAGACTGCCGCCTGACAAACGGCTCCAGGTACCCCAACT440GTGCATACCGGACCAGCCCGAAGGAGAGACACATCATTGT480GGCCTGTGAAGGGAGCCCATATGTGCCAGTCCACTTTGAT520GCTTCTGTGGAGGACTCTACCTAAGGTCAGAGCAGCGAGA560TACCCCACCTCCCTCAACCTCATCCTCTCCACAGCTGCCT600CTTCCCTCTTCCTTCCCTGCTGTGAAAGAAGTAACTACAG640TTAGGGCTCCTATTCAACACACACATGCTTCCCTTTCCTG680AGTCCCATCCCTGCGTGATTTTGGGGGTGAAGAGTGGGTT720GTGAGGTGGGCCCCATGTTAACCCCTCCACTCTTTCTTTC760AATAAAACGCAGTTGCAAACACCTGATTTCTGAAGCGGTT800CTGTCTAGGTACTGTTTCTGGCATTGCCTTCCAGCAAGGG840GTAAGAACTGTAAATCTGATTCACTTTGGAGAACGGTGAA880TGGAGTAATTAAATGCCTTCCCTTCTGACTTGGA914cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。