基因總覽
RLN2 是蛋白質編碼基因,產物 relaxin 2 屬於胰島素家族,並具有荷爾蒙角色。現有資料指出,relaxin 2 是卵巢荷爾蒙;其鏈組成與二硫鍵連結方式見蛋白質特徵及交互作用說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000381627 ★ | 5,299,864–5,304,716 | 2 |
| ENST00001134606 | 5,298,698–5,304,716 | 2 |
| ENST00000416837 | 5,299,876–5,304,432 | 3 |
顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
relaxin 2 是卵巢荷爾蒙。在許多哺乳類中,它與雌激素共同作用,促進產道擴張;這項描述限定於多種哺乳類,並指出兩種荷爾蒙共同參與,未將產道擴張歸因於 relaxin 2 單獨作用。
妊娠期間,relaxin 2 可能參與結締組織重塑。資料進一步列出兩項可能相關的變化:恥骨韌帶生長,以及子宮頸成熟。這些作用以「可能參與」描述,因此不宜視為已確立的必然結果;資料也未提供其分子作用機制或更細的條件。
Promoter 與基因調控
>RLN2 ENST00000381627 GRCh38 chr9:5304616-5305716 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CTGATGGAGCTGAACTAATCTGAGTATATTATGAACACAAGCAAGTAAGTTATTTTAAAAAATGAACCTA CTTGTACTAAAAATTTACAGGTAGAAGGGTTGTCTACTAACCATATTACCTAGAACAGTGTGGATCTTTA GAAAGTTAAATTAAATGATGGTAAAAAATCACCTCTTACCAGGTGCAGCAAACACAAAATACAGTAAACA AACAAACATATCTTTGTGCTGTAATTTGTTACCAAAATATTCTTTGTGGGATTGTGGGATTTCCACTGCT TTTTTTTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT GTGTGTGGTATGTTCTCCAGTCTCCAGAGATGTAGATTAGAATTTTAAATTAAAATGTTCAGATAACTAG TTACAATCAAATTTATCCCCAAGAGTGGAAGGAAAGTGCAATGGAGAAATTGTTTTGTAAATTAAAGACA TTACTGCACAAGCCTAACATGATGTTACTGGGGATTTTAATGTTTTTACCTGCATTCAGATTAAAAGTCA TCAGTTTTCCCTGTCATCAACAATTTATTTATTCATCCATTCTATTTTTATATTTTTATGGATTGATATA CCCAACACTATACTAATTAACCCAATTTACAAGATAATCTATAATCTTATTTAGGTTAGAAGGGTTTTTT GGCAAATGTTCACTCTAGAAAACTGAGTTGTAAGAATATGGGTGATCTCAAATTTGTTTCTGTGTGTGTA AAAGGAAAGGCTTCATATCTAAAATGACTTTACCTCAGTATACTAAATTGTTTGAGGGTAATGAATGAGA AGAACACAACTGTAAAAGGGCCAAGGACAGAGGGATGGGCAAATGAAGGAAAGGCAGAGAGGGAGACCAA GAGCTGAGGGGGAAAATTCTGTGGAGGGGTGTGGGAAAGGGGTGGAGCTGGCACCCTTGCCTTAAAAGCT GAGTGATAGCCCAAGGGATACAAAAGACCGCTTGAGCCGGGTAGGGAAAGCAGCCTAAAGCCCGGGACAG GCACACAGGCCCAGGTGTGTAGGCCACAGCAGCTGCAGTCCTGAAAGGCTG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR9_944SM · promoter · 5303483–5303983 · regulatory
ENSR9_538NJ7 · CTCF_binding_site · 5304342–5304363 · regulatory
ENSR9_7BFDQ · promoter · 5304706–5304807 · regulatory
· motif · 5304344–5304360 · motif
· motif · 5304352–5304362 · motif
· motif · 5304356–5304369 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:185 aa
relaxin 2 全長為 185 個胺基酸,N 端第 1 至 24 位標註為訊號肽。它屬於胰島素家族;來源未提供其他結構域或功能區域的說明。
蛋白質三維結構
細胞內定位
relaxin 2 被標註為分泌型蛋白質。 資料未說明其定位隨條件或異構型而改變。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
relaxin 2 由 B 鏈與 A 鏈組成異源二聚體,兩條鏈之間以兩個二硫鍵相連。來源未提供其他結合夥伴或複合體資訊。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | relaxin 2 是卵巢荷爾蒙,在許多哺乳類中與雌激素共同促進產道擴張。妊娠期間,它可能參與結締組織重塑,並與恥骨韌帶生長及子宮頸成熟相關;這些妊娠相關作用以可能性描述。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Relaxin is an ovarian hormone that acts with estrogen to produce dilatation of the birth canal in many mammals. May be involved in remodeling of connective tissues during pregnancy, promoting growth of pubic ligaments and ripening of the cervix |
| 交互作用 | relaxin 2 的 B 鏈與 A 鏈形成異源二聚體,兩條鏈由兩個二硫鍵連接。 | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | Secreted | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
CAAAAGACCGCTTGAGCCGGGTAGGGAAAGCAGCCTAAAG40CCCGGGACAGGCACACAGGCCCAGGTGTGTAGGCCACAGC80AGCTGCAGTCCTGAAAGGCTGCAACGTCCCGACCTCCAGG120AGAGACCAGGCCCAGGATGCCTCGCCTGTTTTTTTTCCAC160CTGCTAGGAGTCTGTTTACTACTGAACCAATTTTCCAGAG200CAGTCGCGGACTCATGGATGGAGGAAGTTATTAAATTATG240CGGCCGCGAATTAGTTCGCGCGCAGATTGCCATTTGCGGC280ATGAGCACCTGGAGCAAAAGGTCTCTGAGCCAGGAAGATG320CTCCTCAGACACCTAGACCAGTGGCAGAAATTGTGCCATC360CTTCATCAACAAAGATACAGAAACCATAAATATGATGTCA400GAATTTGTTGCTAATTTGCCACAGGAGCTGAAGTTAACCC440TGTCTGAGATGCAGCCAGCATTACCACAGCTACAACAACA480TGTACCTGTATTAAAAGATTCCAGTCTTCTCTTTGAAGAA520TTTAAGAAACTTATTCGCAATAGACAAAGTGAAGCCGCAG560ACAGCAGTCCTTCAGAATTAAAATACTTAGGCTTGGATAC600TCATTCTCGAAAAAAGAGACAACTCTACAGTGCATTGGCT640AATAAATGTTGCCATGTTGGTTGTACCAAAAGATCTCTTG680CTAGATTTTGCTGAGATGAAGCTAATTGTGCACATCTCGT720ATAATATTCACACATATTCTTAATGACATTTCACTGATGC760TTCTATCAGGTCCCATCAATTCTTAGAATATCTAAGAATC800TTTGTTAGATATTAGGTCCCATCAATTCTTAGAATATCTA840AACATCTTTGTTGATGTTTAGATTTTTTTATTTGATGTGT880AAGAAAATGTTCTTTGTGTGATTAAATGACACATTTTTTT920GCTGAAAA928cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。