基因總覽
RLN1 是蛋白質編碼基因,產物名為 relaxin 1,屬於 insulin family。來源將其描述為卵巢激素,並指出它在多種哺乳類中可與雌激素共同作用。其蛋白質序列長度為 185 個胺基酸,另有一段位於第 1 至第 22 位的訊號序列註解;來源未提供更多蛋白質結構或加工方式的說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000223862 ★ | 5,334,930–5,339,876 | 2 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
relaxin 1 被描述為卵巢激素。在多種哺乳類中,它與雌激素共同作用,促成分娩道擴張;來源並未進一步說明兩種激素各自的作用方式或其相互調節機制。
在妊娠期間,relaxin 1 可能參與結締組織重塑。來源以可能性表述這項作用,並指出它可能促進恥骨韌帶生長及子宮頸成熟。這些變化與妊娠期間分娩道相關組織的調整有關,但來源沒有提供具體的分子步驟、作用時程或調控條件。
因此,現有資料支持的功能重點,是 relaxin 1 在多種哺乳類的分娩道擴張中與雌激素協同作用,以及它可能參與妊娠期結締組織的變化;後者包括恥骨韌帶生長與子宮頸成熟。來源未提供足以詳述這些過程如何發生的資訊。
Promoter 與基因調控
>RLN1 ENST00000223862 GRCh38 chr9:5339776-5340876 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TCTCCAGTTTATCTGATGGAGCTGAACTAATCTGAGTATATTATGAACACAAGCAAGTAAGTTATTTTTA AAAATGAACCTATTTGTACTAAAAATTTACAGGTAGAAGGGTCGTCTACTAACCATATTATCTAGAACTG TGTGGATCTTTAAAATGCTAAATTAGGTGGTGGTAATAAAAAAAGAATCACCTCTAACCAGGTGCAGCAA ACACAAAATACAGTAAACAAATGAACATATCCTTGTGCTGTAATTTGTTATCAAAATATTATTTCTGGGA ATGTGGGATGTCCACTGCTTTTTTTCCCCTTCTTCTTTCTCTTCTTCTTTTCTCTCTCTCTTTCTCTCTC TCTGTGTGTGTGGTGTGTTCTCCAGTCTCCAGAGACATAGACTAGAATTTTAAATTAAAATATTTAGACA ACTAGTTACAATCAAACTTCTCCCACAGGAGTGGAAGGAAAGTCCAATGGAGAAATTGTTTTGTAAATTA AAGACATTACTGCACAAGCCTAAAATGATGTTACTGGGGATTTTAATCTTTTTACCTGGATTCAGATTAA AAGTCATCAGTTTTCCCTCTCATCAACAATTTATTCATTCATCCATTATATTTTTATGGATTGATATGCC CAACATTATACTAATTAATCCAATTTATAAGGTAATCTATAATCCTATTTAGGTTAGAAGGGTTTTTGGC AAATGTTCACTCTGGAAAACTGGGTTGTAAGAATATTGGCGATCTCAATTTTATTTCTGTGTATGTAAAA AGAAAGGCTTCATATCTAAAATAACTTTACCTAAGTATACAAAGTTGTTTCAGGGTAACAAAAGAGCGAA AAACAAAACTGTAAAAGGGCCAAGGACAGAGGAATGGGCAAATGAAGGAAGGGCGGAGAGGCAGAACAAG AGCTGAAGGAGAAAATTCTGTGGAGGGGTGTGGGAAAGGGGTGGAGCTGGCAACCTTGCCTTAAAAGCTG AGTGATAGCCCATACTAAAGACTGGTTGAGCCGGGTAGGGAAAGCAGCCTAAAGCCCGGGACAGGCACAC AGGCCCAGGTGTGTAGGCCACAGCAGCCGCAGTCCTGAAAGGCTGCAACAC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RLN1_1 ↗ | 9:5,339,854 | 負股 | 5,339,844–5,339,903 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR9_94578 · enhancer · 5336729–5336999 · regulatory
ENSR9_538WJZ · CTCF_binding_site · 5339508–5339529 · regulatory
ENSR9_7BGWG · promoter · 5339866–5339990 · regulatory
· motif · 5336909–5336924 · motif
· motif · 5339510–5339526 · motif
· motif · 5339518–5339528 · motif
· motif · 5339522–5339535 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:185 aa
relaxin 1 長 185 個胺基酸,屬於 insulin family。蛋白質特徵資料註記第 1 至第 22 位為訊號序列;此註記的證據標示為相似性推論。來源未列出其他功能區域或結構域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
relaxin 1 的定位註記為分泌型;來源未提供其定位變化條件或不同異構型之間的差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- GOLGA6L9A6NEM1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MID2Q9UJV3-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
relaxin 1 由一條 B chain 與一條 A chain 組成異二聚體,兩條鏈之間以兩個雙硫鍵連接。來源未提供其他結合夥伴或複合體資訊。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | relaxin 1 是卵巢激素,在多種哺乳類中可與雌激素共同作用,促成分娩道擴張。妊娠期間,它可能參與結締組織重塑,並可能促進恥骨韌帶生長及子宮頸成熟。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Relaxin is an ovarian hormone that acts with estrogen to produce dilatation of the birth canal in many mammals. May be involved in remodeling of connective tissues during pregnancy, promoting growth of pubic ligaments and ripening of the cervix |
| 交互作用 | relaxin 1 由 B chain 與 A chain 組成異二聚體,兩條鏈以兩個雙硫鍵連接。 | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | Secreted | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
ACTGGTTGAGCCGGGTAGGGAAAGCAGCCTAAAGCCCGGG40ACAGGCACACAGGCCCAGGTGTGTAGGCCACAGCAGCCGC80AGTCCTGAAAGGCTGCAACACCCAGACCTCCAGGAGAGAC120CAGGCCCAGGATGCCTCGCCTGTTCTTGTTCCACCTGCTA160GAATTCTGTTTACTACTGAACCAATTTTCCAGAGCAGTCG200CGGCCAAATGGAAGGACGATGTTATTAAATTATGCGGCCG240CGAATTAGTTCGCGCGCAGATTGCCATTTGCGGCATGAGC280ACCTGGAGCAAAAGGTCTCTGAGCCAGGAAGATGCTCCTC320AGACACCTAGACCAGTGGCAGAAATTGTACCATCCTTCAT360CAACAAAGATACAGAAACTATAATTATCATGTTGGAATTC400ATTGCTAATTTGCCACCGGAGCTGAAGGCAGCCCTATCTG440AGAGGCAACCATCATTACCAGAGCTACAGCAGTATGTACC480TGCATTAAAGGATTCCAATCTTAGCTTTGAAGAATTTAAG520AAACTTATTCGCAATAGGCAAAGTGAAGCCGCAGACAGCA560ATCCTTCAGAATTAAAATACTTAGGCTTGGATACTCATTC600TCAAAAAAAGAGACGACCCTACGTGGCACTGTTTGAGAAA640TGTTGCCTAATTGGTTGTACCAAAAGGTCTCTTGCTAAAT680ATTGCTGAGATGAAGCTAATTGTGCACATCTTGTCTAATT720TTCACACATAGTCTTGATGACATTTCACTGATGCTTCTGT760CAGGTCCCACTAATTATTAGAATATAAGAAATCTTTATTA800ATGTTTAGATTTTTCATTTGGTGTGTAAGAAAATATTCTT840TGTATGATTGTAGTTTCTGTAAATGACACTTTCTATGCTG880AAGTCTTTTTGTCTTTTTATTAACAGTATAATTGTGTTGA920TTCTTTTTAATGCTGTTAACTTAAAATTACAATAAAACCT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。