演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

RLFZNF292L

RLF zinc finger

RLF zinc finger 是一種 1914 個胺基酸長的蛋白質,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family;資料指出它可能參與轉錄調控。

Homo sapiens1p34.2UniProt Q13129
OFFICIAL SYMBOL
RLF
CHROMOSOME
1
UNIPROT
Q13129
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

RLF 基因是蛋白質編碼基因,其產物名稱為 RLF zinc finger。這種蛋白質長 1914 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。序列註解標示多個 C2H2-type zinc finger,並有若干被註解為無序的區域。現有資料將其主要角色概括為可能參與轉錄調控,但未提供更具體的作用方式或調控對象。

Official symbol
RLF
Gene name
RLF zinc finger
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10025
UniProt
Q13129
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
ZNF292LZn-15L

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 11p34.2
chr1 · 248,956,422 bp · GRCh38chr1p36.33 · 1–2300000 · gnegchr1p36.32 · 2300001–5300000 · gpos25chr1p36.31 · 5300001–7100000 · gnegchr1p36.23 · 7100001–9100000 · gpos25chr1p36.22 · 9100001–12500000 · gnegchr1p36.21 · 12500001–15900000 · gpos50chr1p36.13 · 15900001–20100000 · gnegchr1p36.12 · 20100001–23600000 · gpos25chr1p36.11 · 23600001–27600000 · gnegchr1p35.3 · 27600001–29900000 · gpos25chr1p35.2 · 29900001–32300000 · gnegchr1p35.1 · 32300001–34300000 · gpos25chr1p34.3 · 34300001–39600000 · gnegchr1p34.2 · 39600001–43700000 · gpos25chr1p34.1 · 43700001–46300000 · gnegchr1p33 · 46300001–50200000 · gpos75chr1p32.3 · 50200001–55600000 · gnegchr1p32.2 · 55600001–58500000 · gpos50chr1p32.1 · 58500001–60800000 · gnegchr1p31.3 · 60800001–68500000 · gpos50chr1p31.2 · 68500001–69300000 · gnegchr1p31.1 · 69300001–84400000 · gpos100chr1p22.3 · 84400001–87900000 · gnegchr1p22.2 · 87900001–91500000 · gpos75chr1p22.1 · 91500001–94300000 · gnegchr1p21.3 · 94300001–99300000 · gpos75chr1p21.2 · 99300001–101800000 · gnegchr1p21.1 · 101800001–106700000 · gpos100chr1p13.3 · 106700001–111200000 · gnegchr1p13.2 · 111200001–115500000 · gpos50chr1p13.1 · 115500001–117200000 · gnegchr1p12 · 117200001–120400000 · gpos50chr1p11.2 · 120400001–121700000 · gnegchr1p11.1 · 121700001–123400000 · acenchr1q11 · 123400001–125100000 · acenchr1q12 · 125100001–143200000 · gvarchr1q21.1 · 143200001–147500000 · gnegchr1q21.2 · 147500001–150600000 · gpos50chr1q21.3 · 150600001–155100000 · gnegchr1q22 · 155100001–156600000 · gpos50chr1q23.1 · 156600001–159100000 · gnegchr1q23.2 · 159100001–160500000 · gpos50chr1q23.3 · 160500001–165500000 · gnegchr1q24.1 · 165500001–167200000 · gpos50chr1q24.2 · 167200001–170900000 · gnegchr1q24.3 · 170900001–173000000 · gpos75chr1q25.1 · 173000001–176100000 · gnegchr1q25.2 · 176100001–180300000 · gpos50chr1q25.3 · 180300001–185800000 · gnegchr1q31.1 · 185800001–190800000 · gpos100chr1q31.2 · 190800001–193800000 · gnegchr1q31.3 · 193800001–198700000 · gpos100chr1q32.1 · 198700001–207100000 · gnegchr1q32.2 · 207100001–211300000 · gpos25chr1q32.3 · 211300001–214400000 · gnegchr1q41 · 214400001–223900000 · gpos100chr1q42.11 · 223900001–224400000 · gnegchr1q42.12 · 224400001–226800000 · gpos25chr1q42.13 · 226800001–230500000 · gnegchr1q42.2 · 230500001–234600000 · gpos50chr1q42.3 · 234600001–236400000 · gnegchr1q43 · 236400001–243500000 · gpos75chr1q44 · 243500001–248956422 · gnegRLFpq1 bp248,956,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr1:40,161,357–40,240,923
Gene span
79,567 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000372771 ★40,161,387–40,240,9218
ENST0000111851340,161,357–40,240,9217
ENST0000111851440,161,357–40,212,4636
ENST0000113015540,161,357–40,190,5803
ENST0000114552840,161,357–40,240,9218

顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

RLF zinc finger 可能參與轉錄調控。此描述保留「可能」的限定,表示現有資料僅支持其與轉錄調控的潛在關聯,並未進一步說明它在轉錄調控中的具體作用、作用方向或所涉及的基因與生物學過程。資料也沒有指出其分子作用方式,因此不能據此判定它如何影響轉錄,或將此角色延伸為已確立的調控機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 40161387 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>RLF ENST00000372771 GRCh38 chr1:40160387-40161487 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TTTTCAACTTGTTATACGGAAGTAACACATTTTAATACAGTCAAATCTAAATATTTTCCCTTATGGTTTG
TGCTTTTCCGGTCTTATTAAGAAATTCTTAGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTCTAATCCCAGCACTTTG
GGAGGCTGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCC
ATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGTATGGTGGCGCATGCATGTAATCCCAGCTGCTCCGGAAGC
TGAGGCAGGAGAATGTTTGAACCAAGGAGGCGGAGGTTGCGGTGAGCTGAGATAGCACTGTTGCACTCCA
GCCTGGGCAACAAGGGTGAGACTCCGTCTAAAAAAAAAAAAAAAAATTCTTCCCTATTTTTGACATTATA
AAGCTATTTTTATTTTCTGAAAAATGTTTGCAGGTCTTTAATCCATCTCGGCCTTATTTTTGGAAATGGT
TTGAGGTAGAAATCTAATCATTTATTTCCCTTTTGGAAAAAATGTCTCATCGCCATTTATTGAAGAGTCT
GTCCTTTCGCCCACTGACTTGTAATGCCGTCTGTATCATAAACCAAGTTCCCTTGATGTTACTCTTCATT
TCGGCCTCACAATCTTTGCTTATTTTCCTTCTACCAGGGATGCTTTTCGCTATGTTCCTTTCAGGGCTAC
CTTCCTCTTGTCCCTTCAGATCGCAGTTCAAATGTCATCCCCCTCAAATCTAGATTGCTCTACAGGCATT
TCTGGCTCCGTGATCCCATGACCTCAAAGGGGTCTAGGTGGGCATAGCCTCTAGCCAGTTGTTGCTAGGC
TGTTGTCAGGACTGGCGATGCGTAGGCCACTGAGAGCACCCGGAGTCCGAGTGACGGAATCAGGCGGGCG
CCCGCGTCGCTAAGGAGTGCGTCACAGTGCGCGGGCGGCCGGGGGCAGGGCCAGGGCTGAGTCACGTGGC
TTGGTTGCCTACGCGCTGGTGGGCCGTGGGAAGATGGCGGACGGAAAGGGAGACGCCGCCGCTGTCGCCG
GGGCTGGGGCTGAGGCTCCGGCGGTAGCGGGAGCCGGAGATGGAGTCGAGA
RLF 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
RLF_1 ↗1:40,161,387正股40,161,338–40,161,397

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR1_9KXDN · enhancer · 40160834–40161246 · regulatory

ENSR1_836TRH · promoter · 40161247–40161397 · regulatory

ENSR1_5CG3F9 · CTCF_binding_site · 40161581–40161602 · regulatory

ENSR1_5CG3JM · CTCF_binding_site · 40162303–40162324 · regulatory

· motif · 40160924–40160934 · motif

· motif · 40161110–40161123 · motif

· motif · 40161166–40161181 · motif

· motif · 40161171–40161183 · motif

· motif · 40161174–40161181 · motif

· motif · 40161353–40161361 · motif

· motif · 40161357–40161366 · motif

· motif · 40161357–40161366 · motif

· motif · 40161398–40161408 · motif

· motif · 40161418–40161431 · motif

· motif · 40161446–40161463 · motif

· motif · 40161503–40161510 · motif

· motif · 40161583–40161599 · motif

· motif · 40162305–40162321 · motif

· motif · 40163227–40163236 · motif

· motif · 40163227–40163236 · motif

· motif · 40165578–40165589 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:1914 aa

1 aa1914 aa功能區域鋅指
依 Q13129 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

RLF zinc finger 長 1914 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。序列註解標示 14 個 C2H2-type zinc finger,分布於蛋白質不同區段;另有 7 個區域被註解為無序。這些註解描述序列特徵,未提供各區域的具體功能。

鋅指C2H2-type 1582–604 aa
鋅指C2H2-type 2671–696 aa
鋅指C2H2-type 3714–736 aa
鋅指C2H2-type 4742–766 aa
鋅指C2H2-type 5771–795 aa
鋅指C2H2-type 6801–825 aa
鋅指C2H2-type 7954–979 aa
鋅指C2H2-type 81127–1152 aa
鋅指C2H2-type 91172–1195 aa
鋅指C2H2-type 101310–1335 aa
鋅指C2H2-type 111362–1387 aa
鋅指C2H2-type 121407–1432 aa
鋅指C2H2-type 131444–1469 aa
鋅指C2H2-type 141549–1574 aa
功能區域Disordered521–541 aa
功能區域Disordered882–907 aa
功能區域Disordered993–1028 aa
功能區域Disordered1231–1290 aa
功能區域Disordered1620–1654 aa
功能區域Disordered1725–1757 aa
功能區域Disordered1783–1807 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q13129…

AlphaFold · Q13129

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

資料將 RLF zinc finger 的定位標示為細胞核;未提供定位變化的條件或不同異構型之間的差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 3 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ZNF292LRLFRIT1Rit2Q99IB8
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

資料指出 RLF zinc finger 與 RIT1 及 RIT2 有交互作用,但未進一步說明這些關係是否為直接實體結合、是否涉及特定複合體,或其功能後果。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能RLF zinc finger 可能參與轉錄調控;此敘述表示其參與具有不確定性,未指出具體調控方式、方向或對象。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用RLF zinc finger 與 RIT1 及 RIT2 有交互作用;資料未進一步說明交互作用的性質或功能結果。推論支持
證據與來源

Interacts with RIT1 and RIT2

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位RLF zinc finger 的細胞定位標示為細胞核;此項資訊未提供其他定位條件或動態變化。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000372771 · 6,232 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GGGCCGTGGGAAGATGGCGGACGGAAAGGGAGACGCCGCC40
41GCTGTCGCCGGGGCTGGGGCTGAGGCTCCGGCGGTAGCGG80
81GAGCCGGAGATGGAGTCGAGACTGAGTCCATGGTTCGGGG120
121TCATCGCCCCGTATCTCCAGCGCCGGGAGCCTCGGGACTG160
161CGGCCGTGTCTGTGGCAGCTGGAGACAGAGCTGAGGGAGC200
201AAGAGGTGTCGGAGGTCTCATCTTTGAACTACTGCCGGAG240
241CTTCTGCCAGACCTTATTGCAATATGCAAGCAACAAGAAT280
281GCATCAGAACATATTGTGTATCTTCTGGAGGTATATCGAC320
321TTGCCATCCAAAGCTTTGCCAGTGCACGTCCATACTTAAC360
361TACTGAATGTGAAGATGTCCTCTTAGTGCTTGGCAGATTA400
401GTACTGAGTTGTTTCGAATTACTGCTTTCAGTGTCTGAAA440
441GTGAACTGCCATGTGAAGTCTGGCTACCATTCCTTCAGTC480
481TCTACAGGAGTCACATGATGCATTATTGGAATTTGGGAAT520
521AATAACCTACAAATATTGGTTCATGTTACCAAGGAAGGGG560
561TGTGGAAAAACCCAGTTCTTCTTAAAATTCTGTCTCAACA600
601GCCAGTAGAAACGGAGGAAGTCAATAAATTGATTGCACAA640
641GAAGGACCTTCCTTTCTGCAAATGCGAATAAAACATTTGT680
681TGAAATCTAACTGCATCCCCCAGGCTACTGCTTTATCAAA720
721ACTATGTGCAGAATCTAAAGAAATTTCAAATGTGTCATCT760
761TTTCAGCAAGCCTATATCACATGTTTATGTTCTATGCTCC800
801CTAATGAAGATGCTATTAAGGAGATTGCAAAGGTCGACTG840
841CAAGGAAGTACTAGACATCATTTGTAATCTGGAATCTGAG880
881GGGCAGGATAACACAGCATTTGTTCTTTGTACGACTTACC920
921TTACCCAGCAGCTCCAAACTGCAAGTGTATATTGTTCTTG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。