基因總覽
RIPOR2（RHO family interacting cell polarization regulator 2）是由蛋白質編碼基因 RIPOR2 產生的蛋白質，屬於 RIPOR 家族。來源所述的功能涵蓋肌母細胞、毛細胞、T 淋巴球與嗜中性球等不同細胞類型，顯示它與細胞極性及分化調節相關。其功能註解並包括對小型 GTPase RHOA 的抑制作用。蛋白質特徵資料記載其長度為 1068 個胺基酸，並標示兩段無序區；另有一段與細胞絲狀突起形成相關的區域。這些資料提供其家族歸屬、基本序列特徵與主要生物學角色的概覽。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000643898 ★ | 24,804,284–24,935,960 | 22 |
| ENST00000938271 | 24,803,362–24,935,967 | 23 |
| ENST00000259698 | 24,804,282–24,911,048 | 23 |
| ENST00000538035 | 24,804,282–24,910,711 | 22 |
| ENST00000613507 | 24,804,282–24,936,052 | 23 |
| ENST00001138443 | 24,804,282–24,935,960 | 22 |
| ENST00000378023 | 24,839,359–24,877,355 | 14 |
| ENST00000510784 | 24,839,359–25,042,018 | 14 |
| ENST00000987974 | 24,839,359–24,935,967 | 14 |
| ENST00000540914 | 24,839,373–24,877,365 | 14 |
| ENST00001022584 | 24,839,392–24,935,957 | 14 |
| ENST00000643623 | 24,839,428–24,910,703 | 14 |
顯示 12/19 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RIPOR2 可抑制小型 GTPase RHOA。研究指出，RIPOR2 的兩種異構型都能直接與 RHOA 互作，阻止 GTP 載入 RHOA；此作用與 RIPOR2 對 RHOA 活性的抑制相符。原代 T 淋巴球受到趨化因子 CCL19 刺激後，RIPOR2 與 RHOA 的互作會減少。RIPOR2 也會抑制趨化因子誘發的 T 淋巴球反應，包括細胞黏附、極化與遷移；此外，來源指出它能使初始 T 淋巴球維持靜止狀態。
在胎兒單核肌母細胞分化過程中，RIPOR2 促進絲狀突起形成及肌管形成，並參與肌母細胞分化調節。這項功能與細胞形態及分化進程相關。來源也記載 RIPOR2 參與嗜中性球極化、趨化與黏附的調節，但這些嗜中性球功能標示為相似性推論，應保留其證據限制。
在內耳，RIPOR2 對正常的內、外毛細胞靜纖毛發育不可或缺，並參與維持靜纖毛基底區的結構組織。來源將其與毛細胞的機械感受功能及正常聽力相連結；其中部分靜纖毛相關功能是相似性推論，而正常聽力所需性則有研究註記。整體而言，RIPOR2 的已述作用跨越細胞骨架形態、免疫細胞反應、肌肉分化與聽覺毛細胞功能，但不同細胞情境下的證據性質並不相同。
Promoter 與基因調控
>RIPOR2 ENST00000643898 GRCh38 chr6:24935860-24936960 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ACACTGGGAGTATCTTCAAAACCATGCAGTAAATAAAGTGCCAAAAATAAACACCTTGGGTCAACAGCTC CTCACTGTCATCTCCATTTGCATTTTCTAAGCTTCTGGCCACCTAAGAGATCTTACAACACAGTGGAGTG CTCTGGGAAACCCCGAAATGAAGTCTCAGTATTACTCAGAGAGATGTGTGTTTGTTTGTGCAGCCAGACA GAATTTGGCACACGTTGGGTAGCTCGATATGGTGATGCCAGCCAATGGTGCTCGCGTAGAAGCTCAGTGT TCACTCATCCCTTTGGGAGGACTGCTTTTTGAGTTACATTTTCTTCTTTCTCCTTTAGTGATACAGTCTG AAGTATCAAACTGAGTAAATATTGTGAAATGCAAGATGTTTGACCAAAACCAGTTATCTATTCATTGACT ATAGATTTAATCGAGCCACATAAAGCCTAGATATGGTTCAGTTTGGTTTAAATGCTGTAAAGTTTCCAAT CCTTAAATGCAAGAGGTTTGAAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAATGCAACTATTACTGAGCAAAAT AAAAGCTCTGTCCTCTAAATGCCTGCTTTGGTTTAACATAGTGGCTTGCTTTACTTTCAGATAAATTGTA ATTGAAGCAAAACCAAGATATGAGAAATATGAACTCCCTCTTTCAACAAAACCCATTGTGTTCAAATTCA TAAGCAAGAAAGTTAAGCACCCACCTTCCTCTTTAAGGAAATATGAAAGTTGTTGCTTTGAAATAGAATT CATTGCATTCAGACTTTGAGTGATATCTGTATTCATATCCAACCGGATCTGCAGCCCTCTTCAAAAAATT CTTTCTCCTCAGTGGTGAGAATTACCCCACCTGGGATTCACTCTTCACAAGGCTCAAGAAGCCTATTCAT ATGAATGAAACTGCTTTCTTCAGGGCAGATGCGGAAGCTGCCCTCCAGAGGGCTTGGGCAACCCAAGGAA AGGAAATCACCTCGGTCGGCAGTGTGACTGCTGAGACTGCCGGGGCTGCTGCCTGCTGCTTCTCGCGCCT GTCCTCTCCAAGATGCAGTTTTTTGATGCTGAGGAGCTCCTGGTCGATGAA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 4 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RIPOR2_4 ↗ | 6:24,804,545 | 負股 | 24,804,535–24,804,594 |
| RIPOR2_3 ↗ | 6:24,877,270 | 負股 | 24,877,260–24,877,319 |
| RIPOR2_1 ↗ | 6:24,911,048 | 負股 | 24,911,038–24,911,097 |
| RIPOR2_2 ↗ | 6:25,042,168 | 負股 | 25,042,158–25,042,217 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR6_B6XKT · enhancer · 24930291–24931110 · regulatory
ENSR6_D38DR · enhancer · 24931245–24933598 · regulatory
ENSR6_9CW7M · promoter · 24933639–24933924 · regulatory
ENSR6_B6XLD · enhancer · 24933925–24934510 · regulatory
ENSR6_57TCDC · CTCF_binding_site · 24934026–24934047 · regulatory
ENSR6_8PRGK · promoter · 24935938–24936076 · regulatory
ENSR6_C4GRT · enhancer · 24936077–24937169 · regulatory
ENSR6_8PRK6 · enhancer · 24940417–24940655 · regulatory
· motif · 24932275–24932288 · motif
· motif · 24932275–24932288 · motif
· motif · 24932522–24932535 · motif
· motif · 24932541–24932549 · motif
· motif · 24932541–24932556 · motif
· motif · 24932541–24932558 · motif
· motif · 24933124–24933135 · motif
· motif · 24933888–24933905 · motif
· motif · 24934028–24934044 · motif
· motif · 24935472–24935494 · motif
· motif · 24935472–24935494 · motif
· motif · 24935574–24935585 · motif
· motif · 24935623–24935634 · motif
· motif · 24936012–24936023 · motif
· motif · 24936140–24936149 · motif
· motif · 24936865–24936878 · motif
· motif · 24936910–24936921 · motif
· motif · 24940058–24940070 · motif
· motif · 24940413–24940426 · motif
· motif · 24940526–24940534 · motif
RIPOR2 在胎兒單核肌母細胞、細胞滋養層及粒細胞分化期間表現上升；FOXO1 也會提高兩種異構型的表現。相對地，T 淋巴球受到 T 細胞抗原受體刺激後，兩種異構型的表現均下降。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1068 aa
RIPOR2 蛋白長 1068 個胺基酸，屬於 RIPOR 家族。序列註解標示第 45–73 與第 474–524 位胺基酸區段為無序區；第 55–113 位區段則與細胞絲狀突起形成有關。來源未提供其他結構域或功能區域註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
RIPOR2 可見於細胞質及細胞骨架相關位置。 毛細胞中，它位於內、外毛細胞靜纖毛，並與 RHOC 一同出現在靠近尖端收窄處的基底區；訊號呈斑點狀並可形成環狀分布，但未被檢測為靜纖毛膜相關蛋白。 異構型 1 定位於細胞質；異構型 2 則會依趨化因子訊號累積於極化嗜中性球的前緣。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Cell projection, filopodium；Cell projection, stereocilium；Cell projection, stereocilium membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- RHOAP61586 · UniProt INTERACTION · 4 experiments · 2 筆來源紀錄
- RHOCP08134 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
RIPOR2 可形成同寡聚體，且其寡聚化受 RHOC 調節；N、C 端彼此關聯並形成串聯結構的描述屬相似性推論。RIPOR2 也與 14-3-3 proteins、HDAC6、DYSF、MYOF 及 RHOC 互作；肌源性分化期間的互作包括 14-3-3 proteins、HDAC6 與 DYSF。早期肌源性分化時，RIPOR2 與 HDAC6 的互作可避免 HDAC6 去乙醯化 tubulin。兩種異構型均直接結合 RHOA；磷酸化的異構型 2 可與 HDAC6 及 14-3-3 proteins 互作，並與 T 細胞增殖停滯相關。異構型 2 與 YWHAB 的互作依趨化因子而變，且不會競爭其與 RHOA 的結合，也不會阻斷 RIPOR2 對 RHOA 活性的抑制。
疾病與遺傳關聯
RIPOR2 基因變異與兩種非症候群感音神經性聽力損失相關。Deafness, autosomal recessive, 104（DFNB104）為常染色體隱性疾病。Deafness, autosomal dominant, 21（DFNA21）為常染色體顯性、漸進性疾病，外顯率不完全，發病年齡可從嬰兒期至成年晚期。這些資料描述基因變異與疾病的關聯，不應據此推定所有變異具有相同影響。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 9 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RIPOR2 抑制小型 GTPase RHOA，並參與肌母細胞與毛細胞分化、T 淋巴球增殖及嗜中性球極化的調節。它抑制趨化因子誘發的 T 淋巴球黏附、極化與遷移，也參與嗜中性球趨化和黏附調控。部分嗜中性球及毛細胞功能屬相似性推論；內耳靜纖毛正常發育、基底區結構維持、機械感受功能及正常聽力亦有相關註記。 | 含實驗來源 | 證據與來源Acts as an inhibitor of the small GTPase RHOA and plays several roles in the regulation of myoblast and hair cell differentiation, lymphocyte T proliferation and neutrophil polarization. Inhibits chemokine-induced T lymphocyte responses, such as cell adhesion, polarization and migration. Involved also in the regulation of neutrophil polarization, chemotaxis and adhesion (By similarity). Required for normal development of inner and outer hair cell stereocilia within the cochlea of the inner ear (By similarity). Plays a role for maintaining the structural organization of the basal domain of stereocilia (By similarity). Involved in mechanosensory hair cell function (By similarity). Required for normal hearing PMID 17150207 ↗ · PMID 23241886 ↗ · PMID 24687993 ↗ · PMID 24958875 ↗ · PMID 27556504 ↗ |
| 功能 | RIPOR2 可抑制小型 GTPase RHOA。在胎兒單核肌母細胞分化時，它促進絲狀突起及肌管形成；此外，RIPOR2 有助於使初始 T 淋巴球維持靜止狀態。 | 含實驗來源 | 證據與來源Acts as an inhibitor of the small GTPase RHOA. Plays a role in fetal mononuclear myoblast differentiation by promoting filopodia and myotube formation. Maintains naive T lymphocytes in a quiescent state PMID 17150207 ↗ · PMID 25588844 ↗ · PMID 27556504 ↗ |
| 交互作用 | RIPOR2 可形成同寡聚體，其寡聚化受 RHOC 調節，並可經 N、C 端關聯形成串聯結構（相似性推論）。它與 14-3-3 proteins、HDAC6、DYSF、MYOF、RHOC 及 RHOA 互作；與 HDAC6 的早期肌源性分化互作可阻止 tubulin 去乙醯化。兩異構型直接結合 RHOA，磷酸化異構型 2 與 HDAC6、14-3-3 proteins 的互作和 T 細胞增殖停滯相關；其與 YWHAB 的互作依趨化因子而變，不影響 RHOA 結合或抑制。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homooligomer; homooligomerization is regulated by RHOC and leads to the formation of concatemers through the association of N- and C-termini (By similarity). Interacts with 14-3-3 proteins; these interactions occur during myogenic cell differentiation. Interacts with HDAC6; this interaction occurs during early myogenic differentiation and prevents HDAC6 to deacetylate tubulin. Interacts with DYSF; this interaction occurs during early myogenic differentiation. Interacts with MYOF. Interacts with RHOC (By similarity). Isoform 1 and isoform 2 interact (via active GTP- or inactive GDP-bound forms) with RHOA; these interactions are direct, block the loading of GTP to RHOA and decrease upon chemokine CCL19 stimulation in primary T lymphocytes. Isoform 2 interacts (phosphorylated form) with HDAC6; this interaction induces T cell proliferation arrest. Isoform 2 interacts (phosphorylated form) with 14-3-3 proteins; these interactions induces T cell proliferation arrest. Isoform 2 interacts with 14-3-3 proteins. Isoform 2 interacts (via phosphorylated form) with YWHAB; this interaction occurs in a chemokine-dependent manner and does not compete for binding of RIPOR2 with RHOA nor blocks inhibition of RIPOR2-mediated RHOA activity. Isoform 2 interacts with YWHAE. Isoform 2 interacts with YWHAQ PMID 23241886 ↗ · PMID 24687993 ↗ · PMID 25588844 ↗ · PMID 27556504 ↗ |
| 細胞定位 | RIPOR2 出現在細胞質、細胞骨架、絲狀突起與靜纖毛等位置；有絲分裂中的細胞可見細胞質定位，且曾與 F-actin 共定位。毛細胞中，它與 RHOC 位於靜纖毛基底區、靠近尖端收窄處，呈斑點狀環繞基底，亦位於內、外毛細胞頂端靜纖毛；來源未檢出其為靜纖毛膜相關蛋白。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm; Cytoplasm, cytoskeleton; Cell projection, filopodium; Cell projection, stereocilium; Cell projection, stereocilium membrane; Apical cell membrane; Localized in the cytoplasm in cells undergoing mitosis. Colocalized with F-actin. Localized with RHOC within the basal domain of hair cell stereocilia, near the taper region (By similarity). Detected in punctate pattern forming a circumferential ring at the stereocilia base (By similarity). Localized to the apical stereocilia of inner and outer hair cells (By similarity). Not detected as a membrane-associated protein in stereocilia (By similarity) PMID 17150207 ↗ · PMID 23241886 ↗ |
| 細胞定位 | RIPOR2 異構型 1 定位於細胞質。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | RIPOR2 異構型 2 位於細胞質；在趨化因子依賴的條件下，會累積於已極化嗜中性球的前緣。 | 含實驗來源 | 證據與來源Isoform 2; Cytoplasm; Accumulates at the leading edge of polarized neutrophils in a chemokine-dependent manner PMID 25588844 ↗ |
| 調控 | RIPOR2 在胎兒單核肌母細胞、細胞滋養層與粒細胞分化期間表現上升。FOXO1 會提高異構型 1 與異構型 2 的表現；T 淋巴球接受 T 細胞抗原受體刺激後，這兩種異構型的表現則下降。 | 含實驗來源 | 證據與來源Up-regulated during fetal mononuclear myoblast differentiation. Up-regulated during cytotrophoblast differentiation. Up-regulated during granulocyte differentiation. Isoform 1 and isoform 2 are down-regulated in T lymphocytes upon T-cell antigen receptor (TCR) stimulation. Isoform 1 and isoform 2 are up-regulated by FOXO1 PMID 17150207 ↗ · PMID 23241886 ↗ · PMID 24687993 ↗ · PMID 27556504 ↗ · PMID 9055809 ↗ |
| 疾病關聯 | RIPOR2 基因變異與 Deafness, autosomal recessive, 104（DFNB104）相關。此病是非症候群感音神經性聽力損失的一種，疾病描述指出其與內耳神經受器、通往腦部的神經路徑，或接收聲音資訊的腦區受損有關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Deafness, autosomal recessive, 104 DFNB104 A form of non-syndromic sensorineural hearing loss. Sensorineural deafness results from damage to the neural receptors of the inner ear, the nerve pathways to the brain, or the area of the brain that receives sound information. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 616515 PMID 24958875 ↗ |
| 疾病關聯 | RIPOR2 基因變異與 Deafness, autosomal dominant, 21（DFNA21）相關。此非症候群感音神經性聽力損失為常染色體顯性、漸進性且外顯率不完全的疾病；發病年齡範圍從嬰兒期至成年晚期。疾病描述亦提及內耳神經受器、神經路徑或接收聲音資訊的腦區受損。 | 含實驗來源 | 證據與來源Deafness, autosomal dominant, 21 DFNA21 A form of non-syndromic sensorineural hearing loss. Sensorineural deafness results from damage to the neural receptors of the inner ear, the nerve pathways to the brain, or the area of the brain that receives sound information. DFNA21 is an autosomal dominant, progressive form with incomplete penetrance. Age at onset ranges from infancy to late adulthood. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 607017 PMID 32631815 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGTGTGACTGCTGAGACTGCCGGGGCTGCTGCCTGCTGCT40TCTCGCGCCTGTCCTCTCCAAGATGCAGTTTTTTGATGCT80GAGGAGCTCCTGGTCGATGAAGAGGATGATGTTTTTGGTG120AAGGACTACCGACCAGACTCCCGGAAATCATGTTGGTAGG160ATCCCAGTCTTTTTCGCCTGGAGGGCCCAATGGGATCATT200AGAAGCCAGTCCTTTGCGGGTTTCAGCGGCCTCCAGGAAA240GGCGATCCAGGTGTAACTCCTTCATTGAAAATTCCTCCGC280TCTCAAGAAGCCTCAGGCCAAACTGAAGAAAATGCACAAT320TTAGGCCACAAAAACAACAATCCCCCCAAAGAGCCTCAGC360CTAAAAGGGTGGAAGAAGTCTACAGGGCCTTGAAAAATGG400ACTTGATGAATATCTGGAGGTTCACCAGACGGAGCTGGAC440AAGTTGACAGCTCAGTTAAAAGATATGAAAAGAAACTCTC480GCCTGGGTGTACTGTATGACCTAGACAAGCAAATTAAAAC520AATTGAAAGATACATGAGACGCCTGGAGTTTCATATAAGT560AAGGTAGATGAACTCTATGAAGCTTATTGTATCCAGCGAC600GCCTCCAGGATGGTGCCAGCAAAATGAAGCAAGCCTTCGC640AACATCCCCTGCCAGCAAAGCTGCCCGGGAGAGTCTGACA680GAGATCAATCGGAGCTTCAAGGAGTACACAGAGAATATGT720GCACCATTGAAGTGGAGCTAGAGAATCTGCTGGGAGAATT760CTCCATCAAGATGAAAGGTCTGGCTGGCTTTGCACGCCTC800TGTCCTGGAGATCAATATGAAATTTTCATGAAGTATGGCC840GGCAGCGGTGGAAACTGAAAGGCAAAATAGAAGTAAATGG880CAAGCAGAGCTGGGATGGAGAAGAAACAGTTTTTCTGCCC920CTGATAGTTGGGTTCATCTCCATCAAGGTCACGGAGCTCA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。