基因總覽
RHAG 是蛋白質編碼基因,其產物 Rh associated glycoprotein 屬於銨轉運蛋白家族的 Rh subfamily。這是一種多次穿越膜的膜蛋白,蛋白質序列註解涵蓋細胞質側與細胞外側區段。RHAG 可組成同源二聚體,並與 RHCE 形成異源三聚體;在紅血球中也屬於 ankyrin-1 complex 的成員。這些分子特徵將 RHAG 定位為紅血球膜相關蛋白,其具體運輸功能與細胞膜上的角色另見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000371175 ★ | 49,605,175–49,636,839 | 10 |
| ENST00000646963 | 49,605,157–49,636,839 | 9 |
| ENST00001141459 | 49,605,157–49,636,839 | 10 |
| ENST00000646272 | 49,605,175–49,636,839 | 10 |
| ENST00000646939 | 49,605,723–49,636,839 | 9 |
顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RHAG 參與紅血球膜上的銨運輸。RHAG 與 RHCE 組成的異源三聚體可運送銨及其相關衍生物甲基銨,且底物可呈中性或帶電形式。研究在 Xenopus 卵母細胞表現 Rh 蛋白,觀察到 erythroid Rh-associated glycoprotein 介導銨跨細胞膜攝取;以放射性甲基銨作為銨的類似物測量時,表觀 EC50 為 1.6 mM,最大攝取速率為每個卵母細胞每分鐘 190 pmol。這些數值來自該異源表現系統,不應直接視為人體紅血球中的測量值。
甲基銨攝取不依賴膜電位或 Na⁺ 梯度;提高細胞外 pH 或降低細胞內 pH 會促進運輸,研究因此提出,甲基銨與銨的攝取可能和向外的 H⁺ 梯度耦聯,涉及 H⁺ 耦聯的反向運輸機制。甲基銨攝取不受 amiloride、tetramethylammonium chloride、tetraethylammonium chloride、glutamine 或 urea 添加影響,但會受到 ammonium chloride 顯著抑制;其抑制動力學與甲基銨和銨採用相似運輸方式的假說一致。來源亦指出,NH₄⁺ 運輸具有電生性,並會遮蔽 NH₃ 運輸。
除銨相關底物外,RHAG 也可能作為 CO₂ 通道;這項功能在來源中以可能性描述。在體外觀察中,RHAG 會造成單價陽離子漏通。這些運輸特性與紅血球膜離子通透性相關,但來源沒有將所有體外觀察等同於其在生理條件下的定量作用。
RHAG 也是 ankyrin-1 complex 的組成成員;該多蛋白複合體與紅血球膜的穩定性及形狀有關。在紅血球中,RHAG 可調節 RHD 的膜表現,並與 Rh 血型抗原表現相關。這些資料將其膜運輸角色與紅血球膜蛋白組織及血型抗原表現連結起來,但不表示每項關聯都已被證明由單一機制直接造成。
Promoter 與基因調控
>RHAG ENST00000371175 GRCh38 chr6:49636739-49637839 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TGGTAGTTTTGAATTGCTTAGCATCTTATTTACACTTGACTATCTATAAGGATGATAGATTAGTTATGTT CCTGTTTAAGTTTACTCTCTTCCTATTTAAGACTAAAAGATATATCACAACTCATTTGTGTATTTCCATA TTTTCACTTGCGTAAATCAGAGTAAGGAGTCAAAAACTTCATAAGTACATAAAACTGCTTACAGTCCTAT ATATTCCCCATTGCTCATGGGATAATATTTAGCATCTAGCATCCTCGGTACTGAATGTGAGGGTCTTTAC AACACAGCCACCTCCATGACAACATTATCTCTGCCACTTCCTCCTTTTCTCTTCATCTCTTTTACATTCC AGCTTTGCTTGACTGATTGCCGTTTCCAAAACATGCCATGTTCTTCCAAGATTTATATCATTCCCTCTTA TCTGTTTTACTTGAAAAACCCTATTTATGTTCTAGTTCTCACATCCATATTGTTTTATATGCTAATGTTC TTGGCCTAAGGCAAAAAGTTTCACTGCCTTATTTATGTTTTATAATACTTTTATAACCACTATTATATCA CATATTTGTTTTTATATAATCATTCACTTATATTTATGTTTTCCCAACTAGATTCTTAATTTTCTCAAGA AGTTAACAGACCAATTATATATATTGCTTTAGATTCATGCCTTCTACAAAGCCTACCACAATATTTGGTA TACAATAAGCCCTCAAGAAATGTCTACTGAATTAAGTTAAACATGATTCTAGAGGCCTGTGCAATAGATT GTTGGCATCATCCAGGTTCTCACAATTTCATTGCATATTCTTCAGATCAACATTTAGAACGACAATTAGA TTACAGAGCATAATTTTCCCCAATGGGTGGGGCATTTTAATCAGTCTTGCCCATTTTTTTTTTCTTGTGA TGTCATTGGGGTGCCTTGAACATGCAGTCAAATTCCACACACAGAGCAGTCCTTTGTTCTTATCAACATC TCACAGCCTGTGAAGCTCTCAGTGTGCCTCTGTCCTTTGCCACAAACATGAGGTTCACATTCCCTCTCAT GGCTATAGTCCTGGAAATTGCCATGATTGTTTTATTTGGATTATTTGTTGA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RHAG_1 ↗ | 6:49,636,839 | 負股 | 49,636,829–49,636,888 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:409 aa
Rh associated glycoprotein 長 409 個胺基酸,屬於 ammonium transporter(TC 2.A.49)家族的 Rh subfamily。序列註解預測其含有 12 段螺旋跨膜區,並在細胞質側與細胞外側交替形成短拓撲區段;此處為序列特徵註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
RHAG 是多次穿越膜的蛋白質,定位於質膜;其在質膜的定位受 ANK1 調節。 來源未提供其他定位改變條件或異構型差異。
未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
- CREB3L3Q68CJ9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ERGIC3Q9Y282 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FAM209AQ5JX71 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TEX29Q8N6K0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UNC93AQ86WB7-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
RHAG 可形成同源二聚體,並與一個 RHCE 單體組成異源三聚體。它也是紅血球 ankyrin-1 complex 的成員,該複合體包含 ANK1、RHCE、RHAG、SLC4A1、EPB42、GYPA、GYPB 與 AQP1。RHAG 透過 N 端與 GYPB 互作;此互作連接 RHAG–RHCE 異源三聚體與由 GYPA 結合的 SLC4A1 Band 3 I 二聚體複合體。
疾病與遺傳關聯
影響 RHAG 的變異可造成 Rh-null hemolytic anemia。此慢性溶血性貧血可伴隨紅血球口形及球形形態、滲透脆性增加、離子運輸系統改變與膜磷脂組織異常。
影響 RHAG 的變異也與 overhydrated hereditary stomatocytosis 有關。此常染色體顯性疾病涉及紅血球膜對單價陽離子的通透性,表現可包括程度波動的大球性溶血性貧血及紅血球陽離子漏通,造成細胞內鈉增加、鉀減少;亦可伴有脾腫大或肝脾腫大、膽結石及明顯的鐵過載傾向。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 9 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RHAG 是 ankyrin-1 complex 的成員,該複合體與紅血球膜穩定性及形狀有關。RHAG 與 RHCE 形成異源三聚體,運輸中性或帶電形式的銨及甲基銨;NH₄⁺ 運輸具有電生性並遮蔽 NH₃ 運輸。RHAG 也可能作為 CO₂ 通道,且在體外可造成單價陽離子漏通;在紅血球中另調節 RHD 膜表現,並與 Rh 血型抗原表現相關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the ankyrin-1 complex, a multiprotein complex involved in the stability and shape of the erythrocyte membrane. Heterotrimer with RHCE (RHAG)2(RHCE), that transports ammonium and its related derivative methylammonium, in both neutral and ionic forms, across the erythrocyte membrane. The transport of NH4(+) is electrogenic and masks the NH3 transport. Also, may act as a CO2 channel. In vitro, leaks monovalent cations. Moreover in erythrocyte, regulates RHD membrane expression and is associated with rhesus blood group antigen expression PMID 11062476 ↗ · PMID 11861637 ↗ · PMID 12130520 ↗ · PMID 15572441 ↗ · PMID 15856280 ↗ · PMID 17712059 ↗ · PMID 18931342 ↗ · PMID 19273840 ↗ · PMID 19744193 ↗ · PMID 21849667 ↗ · PMID 22012326 ↗ · PMID 24077989 ↗ · PMID 26354748 ↗ · PMID 35835865 ↗ |
| 分子活性 | methylamine(out) = methylamine(in) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | NH4(+)(in) = NH4(+)(out) | 含實驗來源 | 證據與來源NH4(+)(in) = NH4(+)(out) PMID 15856280 ↗ · PMID 19273840 ↗ · PMID 21849667 ↗ · PMID 24077989 ↗ · PMID 26354748 ↗ |
| 分子活性 | CO2(out) = CO2(in) | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | RHAG 可形成同源二聚體,並與 RHCE 單體組成異源三聚體;它也是由 ANK1、RHCE、RHAG、SLC4A1、EPB42、GYPA、GYPB 與 AQP1 組成的紅血球 ankyrin-1 complex 成員。RHAG 透過 N 端與 GYPB 互作,連接 RHAG–RHCE 異源三聚體及由 GYPA 結合的 SLC4A1 Band 3 I 二聚體複合體。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer. Heterotrimer; a RHCE monomer interacts with a RHAG homodimer. Component of the ankyrin-1 complex in the erythrocyte, composed of ANK1, RHCE, RHAG, SLC4A1, EPB42, GYPA, GYPB and AQP1. Interacts with GYPB (via the N-terminal); this interaction bridges the (RHAG)2(RHCE) heterotrimer with the SLC4A1 Band 3 I dimer complexed with GYPA PMID 35835865 ↗ |
| 細胞定位 | RHAG 是多次穿越膜的蛋白質,定位於質膜;其在質膜的定位受 ANK1 調節。 | 含實驗來源 | 證據與來源Membrane / Multi-pass membrane protein; Localization at the plasma membrane is regulated by ANK1 PMID 15856280 ↗ · PMID 18931342 ↗ · PMID 22012326 ↗ · PMID 27247322 ↗ |
| 疾病關聯 | 影響 RHAG 的變異可造成 Rh-null hemolytic anemia,這是一種慢性溶血性貧血。患者紅血球可呈口形及球形形態,並有滲透脆性增加、離子運輸系統改變及膜磷脂組織異常。 | 含實驗來源 | 證據與來源Regulator type Rh-null hemolytic anemia RHN Form of chronic hemolytic anemia in which the red blood cells have a stomatocytosis and spherocytosis morphology, an increased osmotic fragility, an altered ion transport system, and abnormal membrane phospholipid organization. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 268150 PMID 10467273 ↗ · PMID 8563755 ↗ · PMID 9454778 ↗ · PMID 9716608 ↗ |
| 疾病關聯 | 影響 RHAG 的變異可造成常染色體顯性疾病 overhydrated hereditary stomatocytosis。其特徵包括程度波動的大球性溶血性貧血、紅血球單價陽離子漏通,以及細胞鈉增加、鉀減少;患者亦可有脾腫大或肝脾腫大、膽結石與明顯鐵過載傾向。 | 含實驗來源 | 證據與來源Overhydrated hereditary stomatocytosis OHST An autosomal dominant disorder of red cell membrane permeability to monovalent cations, characterized by macrocytic hemolytic anemia of fluctuating severity, circulating erythrocytes with slit-like lucencies (stomata) evident on fixed, stained peripheral blood smears. OHST red cells exhibit cation leak, resulting in elevated cell sodium content with reduced potassium content. The disease is marked by splenomegaly or hepatosplenomegaly, cholelithiasis and a strong tendency for iron overload. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 185000 PMID 18931342 ↗ · PMID 21849667 ↗ · PMID 22012326 ↗ |
| 功能 | 研究在 Xenopus 卵母細胞表現 Rh 蛋白,觀察到 erythroid Rh-associated glycoprotein 介導銨跨膜攝取;以放射性甲基銨作為類似物時,表觀 EC50 為 1.6 mM,最大攝取速率為每個卵母細胞每分鐘 190 pmol。攝取不依賴膜電位或 Na⁺ 梯度;提高細胞外 pH 或降低細胞內 pH 會促進甲基銨運輸。甲基銨攝取不受若干添加物影響,但受 ammonium chloride 抑制,結果符合銨與甲基銨可能採取 H⁺ 梯度耦聯反向運輸的假說。 | 文獻摘要 | 證據與來源The Rh blood group proteins are well known as the erythrocyte targets of the potent antibody response that causes hemolytic disease of the newborn. These proteins have been described in molecular detail; however, little is known about their function. A transport function is suggested by their predicted structure and from phylogenetic analysis. To obtain evidence for a role in solute transport, we expressed Rh proteins in Xenopus oocytes and now demonstrate that the erythroid Rh-associated glycoprotein mediates uptake of ammonium across cell membranes. Rh-associated glycoprotein carrier-mediated uptake, characterized with the radioactive analog of ammonium [(14)C]methylamine (MA), had an apparent EC(50) of 1.6 mm and a maximum uptake rate (V(max)) of 190 pmol/oocyte/min. Uptake was independent of the membrane potential and the Na(+) gradient. MA transport was stimulated by raising extracellular pH or by lowering intracellular pH, suggesting that uptake was coupled to an outwardly directed H(+) gradient. MA uptake was insensitive to additions of amiloride, amine-containing compounds tetramethyl- and tetraethylammonium chloride, glutamine, and urea. However, MA uptake was significantly antagonized by ammonium chloride with inhibition kinetics (IC(50) = 1.14 mm) consistent with the hypothesis that the uptake of MA and ammonium involves a similar H(+)-coupled counter-transport mechanism. PMID 11861637 ↗Identification of the erythrocyte Rh blood group glycoprotein as a mammalian ammonium transporter. · cc by |
核酸與蛋白質序列
AGTGTGCCTCTGTCCTTTGCCACAAACATGAGGTTCACAT40TCCCTCTCATGGCTATAGTCCTGGAAATTGCCATGATTGT80TTTATTTGGATTATTTGTTGAGTATGAAACGGACCAGACT120GTTCTCGAGCAGCTCAACATCACCAAGCCAACAGACATGG160GCATATTCTTTGAGTTATATCCTCTGTTCCAAGATGTACA200TGTTATGATATTTGTTGGGTTTGGCTTCCTCATGACCTTC240CTGAAGAAATATGGCTTCAGCAGTGTGGGTATCAACCTAC280TCGTTGCTGCTTTGGGCCTCCAGTGGGGCACTATTGTACA320GGGAATCCTGCAAAGCCAGGGACAGAAATTTAACATTGGA360ATCAAAAACATGATAAATGCAGACTTCAGTGCAGCCACAG400TTCTGATATCTTTTGGAGCTGTCCTGGGAAAAACGAGCCC440CACCCAAATGCTGATCATGACAATTTTAGAAATTGTTTTC480TTTGCCCACAATGAATACCTGGTTAGTGAAATATTTAAGG520CCTCTGACATTGGAGCATCAATGACGATCCATGCCTTTGG560GGCCTACTTTGGCTTGGCTGTAGCAGGCATCTTGTATCGA600TCTGGACTGAGAAAGGGGCATGAAAATGAAGAGTCCGCAT640ACTACTCAGACTTGTTTGCAATGATTGGGACTCTCTTTCT680GTGGATGTTTTGGCCCAGCTTTAACTCGGCCATTGCTGAA720CCTGGAGACAAACAGTGCAGGGCCATTGTAAACACGTACT760TCTCTCTCGCTGCCTGTGTGCTCACAGCCTTTGCCTTCTC800CAGCCTAGTGGAGCACCGAGGCAAGCTCAACATGGTTCAC840ATTCAGAATGCCACCCTTGCTGGAGGAGTTGCTGTGGGCA880CTTGTGCGGATATGGCAATTCACCCATTTGGTTCTATGAT920TATTGGGAGCATTGCAGGAATGGTCTCTGTGCTTGGATAC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。