演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

RGS9PERRS

regulator of G protein signaling 9

RGS9 編碼 regulator of G protein signaling 9,參與 G 蛋白訊號調節,並與視覺訊號傳遞的恢復階段有關。

Homo sapiens17q24.1UniProt O75916
OFFICIAL SYMBOL
RGS9
CHROMOSOME
17
UNIPROT
O75916
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

RGS9(regulator of G protein signaling 9)是蛋白質編碼基因,其產物屬於 G 蛋白訊號調節因子。RGS9 蛋白具有多個可辨識的結構區域,包括 DEP、G protein gamma 與 RGS 結構域,另有一段被註記為無序區。這些結構特色構成其分子層面的基本輪廓;來源指出它能與 GNAT1 結合,並參與視覺訊號傳遞,但相關作用的具體方式與生物學意義詳述於功能段落。

Official symbol
RGS9
Gene name
regulator of G protein signaling 9
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10004
UniProt
O75916
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
PERRSRGS9LMGC26458MGC111763

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1717q24.1
chr17 · 83,257,441 bp · GRCh38chr17p13.3 · 1–3400000 · gnegchr17p13.2 · 3400001–6500000 · gpos50chr17p13.1 · 6500001–10800000 · gnegchr17p12 · 10800001–16100000 · gpos75chr17p11.2 · 16100001–22700000 · gnegchr17p11.1 · 22700001–25100000 · acenchr17q11.1 · 25100001–27400000 · acenchr17q11.2 · 27400001–33500000 · gnegchr17q12 · 33500001–39800000 · gpos50chr17q21.1 · 39800001–40200000 · gnegchr17q21.2 · 40200001–42800000 · gpos25chr17q21.31 · 42800001–46800000 · gnegchr17q21.32 · 46800001–49300000 · gpos25chr17q21.33 · 49300001–52100000 · gnegchr17q22 · 52100001–59500000 · gpos75chr17q23.1 · 59500001–60200000 · gnegchr17q23.2 · 60200001–63100000 · gpos75chr17q23.3 · 63100001–64600000 · gnegchr17q24.1 · 64600001–66200000 · gpos50chr17q24.2 · 66200001–69100000 · gnegchr17q24.3 · 69100001–72900000 · gpos75chr17q25.1 · 72900001–76800000 · gnegchr17q25.2 · 76800001–77200000 · gpos25chr17q25.3 · 77200001–83257441 · gnegRGS9pq1 bp83,257,441 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr17:65,100,812–65,227,703
Gene span
126,892 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000262406 ★65,137,370–65,227,70319
ENST0000063583365,100,986–65,227,69019
ENST0000044358465,137,350–65,225,58818
ENST0000044999665,137,350–65,227,70319
ENST0000092963465,137,350–65,227,70320
ENST0000092963565,137,350–65,227,70320
ENST0000111293465,137,350–65,211,90517
ENST0000112574965,137,350–65,227,69619
ENST0000114008865,137,350–65,227,70319

顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

RGS9 可抑制訊號傳遞,其作用方式是提高 G protein alpha subunits 的 GTPase 活性,使這些次單元加速水解 GTP,轉為不活化的 GDP 結合型態。這種調節提供了終止或降低 G 蛋白訊號的途徑;來源未進一步說明此作用在不同細胞或刺激條件下的差異。

RGS9 也與視覺訊號傳遞有關,並被描述為視覺傳導恢復階段的重要元素。這項功能陳述標示為 By similarity,屬於相似性推論,不能視為來源明確提供了直接實驗驗證。來源同時指出 RGS9 會與 GNAT1 結合,但未詳述此結合如何影響訊號過程。

因此,來源支持的功能重點,是 RGS9 透過促進 G protein alpha subunits 失活來抑制訊號傳遞,並與視覺訊號從活化狀態恢復的過程相關。對於其在光轉導中的具體作用環節、調控條件或其他生理功能,現有資訊未提供更多細節。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 65137370 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>RGS9 ENST00000262406 GRCh38 chr17:65136370-65137470 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CAAACCAGCCAGCTGCAGTGGCTCACTCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTAGATCGA
TTGAGCCCAGGAGTTTGTGAAACTCCCTCTCCACAAACAATTTTTGTAAAAATTAGCGGGGTGTGGTGGC
ACGTGCCTGTAGCCCCAGCTACTGGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCCTGGGAGGTTGTAGCT
GCAATGAGCCATGATTACGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAAAA
GTTAAACAACAACAAACCCAACAACCAACTAACCGAAACACTAAGAATCAGAGAAGTAAAATATAATTCG
CTTCATCCAGACAGCTAGCCCGGTGAGGACTACAACCTTCCTCTCTTCCTTCTTCACTTCTTTGCTCTCT
CTTTTTAAACCCACATCTTAGCAATTCCTCTGCTATTGGGTCATTAAATCGCCACCTCTAATTTTTTTTT
CTAAGCATTTATTGAGGGCCAAGCACTGTGTTACACATCTCCTCATTAAAATGGTATAGCAACCTTTTCT
GGTCGATATTATGATCCCATTTTTCAATTTTTACTTTTGAGTGAAGGACATTGATTCTTAGAGATTGTAA
GGAACTTGCCCAAGGCTGCCGGCTGGTTAGTGGCAGAGCTGGGATGGGAAAGTCCGTATTTTCCACCGCG
CTGTATTAGTGAGGGCTCTTTGTGTCACTTCTGTGCATAACTCCGCCCCAAGTTAAAAGGCTCGCTGCTC
TCGACAGGTCCTCCTCCTCCTCCCGCTAGGTCCTCCTCCTCCTCCCGCCAGGTCCTCCTCCTCCTTCTCC
TCCCGGGGCCCTGCCCTGCGGGTCTCACCTGCTGCTCCGCGGGGTCCCGGCGGGGGCCGGATAGCGCCCC
CTGGCGGCAGGTGGGCGCCCGCGCAGCGCATGCTAATGAGCCCGCGGCGCCGCTCGCGGATTGGCTGGCG
CGGATTCCAGCTGCTTTCCAAGTCAGCGGCGCCTAGTGAGAGTCAGGGGGGCCCGGCCCGCGCCCTCCCC
GCCCAGCCGCCTCCCCGTCGACGCCCAGGGCTGGGGCGAGCCAGGCTGCCT
RGS9 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
RGS9_1 ↗17:65,137,436正股65,137,387–65,137,446

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR17_9XT25 · enhancer · 65131954–65132432 · regulatory

ENSR17_BGX2R · promoter · 65136880–65137479 · regulatory

ENSR17_5KBMXH · CTCF_binding_site · 65137270–65137291 · regulatory

ENSR17_BGX2T · enhancer · 65137480–65138129 · regulatory

· motif · 65134311–65134325 · motif

· motif · 65137272–65137288 · motif

· motif · 65137285–65137294 · motif

· motif · 65137306–65137319 · motif

· motif · 65142031–65142046 · motif

· motif · 65142039–65142054 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:674 aa

1 aa674 aa結構域功能區域
依 O75916 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

RGS9 蛋白長 674 個胺基酸。序列註解標示 DEP 結構域位於第 30–105 位、G protein gamma 結構域位於第 219–280 位,RGS 結構域位於第 298–413 位;第 533–573 位則被註記為無序區。

結構域DEP30–105 aa
結構域G protein gamma219–280 aa
結構域RGS298–413 aa
功能區域Disordered533–573 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · O75916…

AlphaFold · O75916

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Membrane

定位資料針對 Isoform 3:此異構型透過與 RGS9BP 互作而被導向膜,並被註記為膜周邊蛋白。 此定位描述不應延伸為其他異構型的定位結論。

未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
PERRSRGS9GNB5
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

RGS9 與 GNB5 形成異源二聚體,並與 RGS9BP、PDE6G 及 GNAT1 互作。RGS9、GNB5 與 RGS9BP 共同構成 RGS9-1-Gbeta5 複合體;RGS9BP 與該異源二聚體的次細胞定位調節有關。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

RGS9 基因變異與 Prolonged electroretinal response suppression 1(PERRS1)相關。PERRS1 是 bradyopsia 的一種形式,屬常染色體隱性疾病,於兒童期發病;其特徵包括視網膜電反應抑制延長、難以適應亮度變化、視力正常至低於正常,以及畏光。來源將疾病描述為由影響 RGS9 的變異所致。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能RGS9 可藉由提高 G protein alpha subunits 的 GTPase 活性抑制訊號傳遞,促使其轉成不活化的 GDP 結合型態。它會與 GNAT1 結合,並參與光轉導;依相似性推論,RGS9 是視覺訊號傳導恢復階段的重要元素。推論支持
證據與來源

Inhibits signal transduction by increasing the GTPase activity of G protein alpha subunits thereby driving them into their inactive GDP-bound form. Binds to GNAT1. Involved in phototransduction; key element in the recovery phase of visual transduction (By similarity)

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用RGS9 與 GNB5 形成異源二聚體,並與 RGS7BP、PDE6G 和 GNAT1 互作。RGS9、GNB5 與 RGS9BP 組成 RGS9-1-Gbeta5 複合體;RGS7BP 的互作與由 GNB5 形成之異源二聚體的次細胞定位調節有關。推論支持
證據與來源

Heterodimer with GNB5. Interacts with RGS7BP, leading to regulate the subcellular location of the heterodimer formed with GNB5. Component of the RGS9-1-Gbeta5 complex composed of RGS9 (RGS9-1), Gbeta5 (GNB5) and RGS9BP. Interacts with PDE6G and GNAT1

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位定位資訊適用於 Isoform 3。此異構型是膜周邊蛋白,並透過與 RGS9BP 的互作被導向膜;來源未提供其他異構型的定位資訊。資料庫紀錄
證據與來源

Isoform 3; Membrane / Peripheral membrane protein; Isoform 3 is targeted to the membrane via its interaction with RGS9BP

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯影響 RGS9 的基因變異與 Prolonged electroretinal response suppression 1(PERRS1)相關。此病是 bradyopsia 的一種常染色體隱性形式,兒童期發病,表現包括視網膜電反應抑制延長、難以適應亮度變化、視力正常至低於正常及畏光。含實驗來源
證據與來源

Prolonged electroretinal response suppression 1 PERRS1 A form of bradyopsia, an ocular disorder characterized by prolonged electroretinal response suppression leading to difficulties adjusting to changes in luminance, normal to subnormal acuity and photophobia. PERRS1 is an autosomal recessive form with onset in childhood. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 608415

PMID 14702087 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000262406 · 2,492 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGTCAGCGGCGCCTAGTGAGAGTCAGGGGGGCCCGGCCCG40
41CGCCCTCCCCGCCCAGCCGCCTCCCCGTCGACGCCCAGGG80
81CTGGGGCGAGCCAGGCTGCCTTTCGAACTTGGGGGGCTTC120
121TCCTCTTGTCTCCCACTGGTGCTCTGGCTGTGAATCCATC160
161CAGGGGCCAGGATGACAATCCGACACCAAGGCCAGCAGTA200
201CAGGCCGAGGATGGCATTTCTCCAAAAGATTGAAGCGCTC240
241GTGAAGGACATGCAGAACCCAGAGACAGGGGTCCGAATGC280
281AGAACCAGAGGGTCCTGGTCACCAGCGTTCCTCATGCCAT320
321GACAGGAAGTGATGTTCTGCAATGGATCGTCCAGCGGCTT360
361TGGATCTCCAGTCTGGAGGCACAGAACTTGGGCAACTTTA400
401TTGTCAGGTATGGCTACATTTACCCCCTGCAAGACCCCAA440
441GAATCTCATTCTCAAGCCTGATGGCAGCCTCTACAGATTT480
481CAGACACCGTATTTCTGGCCCACCCAGCAGTGGCCAGCTG520
521AAGATACCGATTACGCCATCTATCTGGCCAAGCGAAATAT560
561CAAAAAGAAAGGGATTTTGGAAGAATATGAAAAGGAAAAT600
601TACAATTTCTTGAACCAAAAAATGAACTATAAGTGGGACT640
641TTGTCATTATGCAGGCCAAAGAGCAGTACAGGGCTGGAAA680
681GGAGAGGAACAAAGCAGACAGATATGCCCTGGACTGCCAG720
721GAGAAGGCATACTGGCTGGTGCACCGATGCCCTCCTGGAA760
761TGGACAATGTGCTGGACTACGGCCTGGACCGAGTGACCAA800
801TCCGAATGAAGTCAAGGTAAACCAGAAACAAACAGTCGTT840
841GCTGTCAAAAAAGAGATCATGTATTACCAACAGGCCTTGA880
881TGAGGTCCACAGTGAAGTCTTCTGTGTCCCTGGGAGGGAT920
921TGTGAAATACAGTGAGCAGTTCTCATCCAACGATGCCATC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。