基因總覽
regulator of G protein signaling 6（RGS6）是人類的蛋白質編碼基因，產物屬於 RGS 蛋白家族。RGS6 與 RGS7、RGS9、RGS11 同屬含有 DEP（disheveled, EGL-10, pleckstrin）及 GGL（G protein gamma subunit-like）結構域的 RGS 蛋白亞家族。其蛋白質序列註解包含 DEP、G protein gamma 與 RGS 三個結構域。RGS6 可與 GNB5 形成複合體；研究亦指出 RGS6/GNB5 複合體具有特定的生化性質。這些家族與結構特徵構成理解 RGS6 分子角色的基礎。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000553525 ★ | 71,932,429–72,566,530 | 18 |
| ENST00001127116 | 71,931,979–71,965,001 | 2 |
| ENST00001140158 | 71,932,166–72,566,530 | 18 |
| ENST00000555571 | 71,932,617–72,562,467 | 17 |
| ENST00000553530 | 71,933,103–72,566,526 | 17 |
| ENST00000556437 | 71,933,103–72,562,592 | 18 |
| ENST00001127115 | 71,933,103–71,974,212 | 3 |
| ENST00001127117 | 71,933,103–71,964,972 | 2 |
| ENST00000355512 | 71,964,792–72,537,713 | 16 |
| ENST00000404301 | 71,964,792–72,540,324 | 17 |
| ENST00000406236 | 71,964,792–72,540,324 | 17 |
| ENST00000407322 | 71,964,792–72,540,333 | 17 |
顯示 12/18 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RGS6 參與調節 G protein-coupled receptor 所引發的訊號傳遞。其作用方式是提高 G protein α 次單元的 GTPase 活性，促使該次單元將 GTP 水解並進入失活的 GDP 結合狀態，因而抑制訊號傳遞。RGS6 與 GNB5 組成的二聚體可增強 GNAO1 的 GTPase 活性；研究也將 RGS6/GNB5 複合體描述為對 Gαo 具 GTPase 活化作用的蛋白質。
在 Sf9 細胞表現的實驗中，RGS6 與 Gβ5 可形成位於細胞質的複合體，而 RGS6 並未與 Gβ1 至 Gβ4 形成相同複合體。純化後的 RGS6/β5 複合體對 Gαo 具特異性作用；它不同於典型的 Gβγ 複合體，不會與 Gαo-GDP 或 Gαq-GDP 組成異三聚體。這些結果界定了 RGS6/β5 複合體的組成選擇性與其對 Gαo 的作用範圍。
在所測試的生化條件下，RGS6/β5 複合體不會改變腺苷酸環化酶 I、II 或 V 型的活性，也不能活化 phospholipase C-β1 或 phospholipase C-β2。不過，RGS/β5 複合體可抑制由 β1γ2 介導的 phospholipase C-β2 活化。研究提出，這類複合體可能藉由與 phospholipase C 結合並刺激 Gαo 的 GTPase 活性，參與由 G(i) 與 G(o) 偶聯受體啟動之訊號的選擇性調控；此為可能的功能解釋，而非已確立的普遍機制。
Promoter 與基因調控
>RGS6 ENST00000553525 GRCh38 chr14:71931429-71932529 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TACATCCATTAATCAATGTAGAATGGCGGGAAAAGACACAATTTGGGAAGGAGACTTTACTCTTTAACTT CTGGACCCATGTGAATGAGGAGTCCAGGTCATCCATCGTTAAAGGCATTTAGGTATTTTATTTCAAGTAT TTTTCCCCTTTTCTGGTGACATACTACAATTCAGGACTAAATCTCAAATTTATTCTTGATATTGATAGCA TTGATATTGCACACAAATCCCACGGTTACCGTCCAGCACTAGTGATCTTGTCCTATTTCCACCTGCAGCT TTTTGAATCTAAGTACACATCGCATTTCAAAACTCCCACGTTAAAGAAAGGCATCAGTTCAAGTTACTTT CTCATTTTCTGTCTTCGACTTTTTTCTGCTTCCCCCAAGAATATCTGAGAGTTACTTTTCTCGAAAGTTC TTTTGTAGTGTTCCAGATAGGAATCATCCTGTAATATTCCAAATGCAGCGTGTGGTGTGCATGTTGAATA CATAAAAATGACGAGGTTAGGAACAATATCGCTGACGGTCGCGGTGTCCCGTTTTAATTTAGAGGGCGCC AGCAACACGTCAGTGAGGGAGATTCAGAAGCCGCCGGGCACCTCACCCCGGGCCGGGAATCCCTAAGAGA ACCTTGACGCCGCTGAAGTTTCCGGACCGGGCCAGTTTGGAATTGACGAAAGCAGCCTCCGCCCGGTCGA GCCAGTCTCTCGGTTTTCTCGGCGGCTTCTTGAGGATGAGGCATTTCTAGGTTTTCTCCTCCTCGAGCAA ATCACGGTCTGCGCCTTCCGCGGCTCTGGGAACAGGTGAGCCGTGCGGCGGCGCCCGCGGGACGCGCTCA GGTGCCGGTCCCCGCCCGCCGGCCCCTCCCTGCAGCACGCGGTCCGGGCCCAGGTGCCGGGGCCCAGGTG CCGGCGCCCAGGTGCGCGGGGCACGGGGCTGCAGCTCCGCTCGGCATCCGACAGCGGGCGCCGCTGCAGC AGCTCGCGGGCCGCGGAGCTGAACGGCTTCGCGAGTTGGGGCAGCTCCTCGCGCTCGGCCCTGCTCGGCG GCGAGAGCTCCGCCTGGGCGCCGCGTTCCTACAGCCGCCGGAGCCGCCAGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RGS6_4 ↗ | 14:71,932,092 | 正股 | 71,932,043–71,932,102 |
| RGS6_2 ↗ | 14:71,932,580 | 正股 | 71,932,531–71,932,590 |
| RGS6_1 ↗ | 14:71,933,222 | 正股 | 71,933,173–71,933,232 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR14_C95PG · promoter · 71931939–71933242 · regulatory
ENSR14_5LWS2F · CTCF_binding_site · 71931970–71931991 · regulatory
ENSR14_5LWS6B · CTCF_binding_site · 71932808–71932829 · regulatory
ENSR14_933JW3 · enhancer · 71933243–71933629 · regulatory
ENSR14_5LWS9N · CTCF_binding_site · 71933536–71933557 · regulatory
· motif · 71930363–71930374 · motif
· motif · 71931972–71931988 · motif
· motif · 71932061–71932083 · motif
· motif · 71932061–71932083 · motif
· motif · 71932345–71932354 · motif
· motif · 71932510–71932527 · motif
· motif · 71932810–71932826 · motif
· motif · 71933355–71933377 · motif
· motif · 71933355–71933377 · motif
· motif · 71933365–71933373 · motif
· motif · 71933538–71933554 · motif
· motif · 71933940–71933952 · motif
· motif · 71934055–71934066 · motif
· motif · 71935651–71935666 · motif
· motif · 71935652–71935665 · motif
· motif · 71935657–71935669 · motif
· motif · 71935675–71935686 · motif
· motif · 71935856–71935863 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：472 aa
RGS6 蛋白質長 472 個胺基酸。序列註解包含 DEP 結構域（第 40–115 位）、G protein gamma 結構域（第 261–330 位）及 RGS 結構域（第 336–441 位）。
蛋白質三維結構
細胞內定位
RGS6 可見於細胞質、胞質溶膠、細胞膜及細胞核，也有周邊膜蛋白的定位註解。 與 GNB5 互作會促使 RGS6 轉位至細胞核。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- GNB5O14775 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- HSP90AB1P08238 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
RGS6 與 GNB5 有互作，並可形成 RGS6/GNB5 二聚體。RGS6 也與 GNAI1 互作。依序列相似性推論，RGS6 與 RGS7BP 的互作會調節其與 GNB5 所形成異二聚體的亞細胞位置；此定位調節關係屬 By similarity 的推論。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RGS6 調節 G protein-coupled receptor 訊號級聯反應，並藉由提高 G protein α 次單元的 GTPase 活性，促使其轉為失活的 GDP 結合狀態，從而抑制訊號傳遞。RGS6/GNB5 二聚體可增強 GNAO1 的 GTPase 活性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Regulates G protein-coupled receptor signaling cascades. Inhibits signal transduction by increasing the GTPase activity of G protein alpha subunits, thereby driving them into their inactive GDP-bound form. The RGS6/GNB5 dimer enhances GNAO1 GTPase activity PMID 10521509 ↗ |
| 交互作用 | RGS6 與 GNB5 及 GNAI1 有互作。依序列相似性推論，RGS6 也與 RGS7BP 互作，並藉此調節其與 GNB5 形成的異二聚體之亞細胞位置。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with GNB5. Interacts with RGS7BP, leading to regulate the subcellular location of the heterodimer formed with GNB5 (By similarity). Interacts with GNAI1 PMID 10339615 ↗ · PMID 10521509 ↗ · PMID 12761221 ↗ · PMID 18434541 ↗ |
| 細胞定位 | RGS6 的定位註解包括細胞質、胞質溶膠、周邊膜、細胞膜與細胞核；與 GNB5 互作會介導其轉位至細胞核。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm; Cytoplasm, cytosol; Membrane / Peripheral membrane protein; Nucleus; Cell membrane; Interaction with GNB5 mediates translocation to the nucleus PMID 12761221 ↗ · PMID 10521509 ↗ |
| 功能 | RGS6 屬於含 DEP 與 GGL 結構域的 RGS 蛋白亞家族，該亞家族也包括 RGS7、RGS9 與 RGS11。Sf9 細胞表現的 RGS6/β5 複合體位於細胞質，且不與 Gβ1–4 形成該複合體；純化後可特異性促進 Gαo 的 GTPase 活性，但不與 Gαo-GDP 或 Gαq-GDP 組成異三聚體。它不改變腺苷酸環化酶 I、II、V 的活性，也不活化 phospholipase C-β1 或 -β2，卻可抑制 β1γ2 介導的 phospholipase C-β2 活化。研究提出此複合體可能藉由結合 phospholipase C 並刺激 Gαo 活性，參與 G(i)、G(o) 偶聯受體訊號的選擇性。 | 文獻摘要 | 證據與來源Regulators of G protein signaling (RGS) proteins that contain DEP (disheveled, EGL-10, pleckstrin) and GGL (G protein gamma subunit-like) domains form a subfamily that includes the mammalian RGS proteins RGS6, RGS7, RGS9, and RGS11. We describe the cloning of RGS6 cDNA, the specificity of interaction of RGS6 and RGS7 with G protein beta subunits, and certain biochemical properties of RGS6/beta5 and RGS7/beta5 complexes. After expression in Sf9 cells, complexes of both RGS6 and RGS7 with the Gbeta5 subunit (but not Gbetas 1-4) are found in the cytosol. When purified, these complexes are similar to RGS11/beta5 in that they act as GTPase-activating proteins specifically toward Galpha(o). Unlike conventional G(betagamma) complexes, RGS6/beta5 and RGS7/beta5 do not form heterotrimeric complexes with either Galpha(o)-GDP or Galpha(q)-GDP. Neither RGS6/beta5 nor RGS7/beta5 altered the activity of adenylyl cyclases types I, II, or V, nor were they able to activate either phospholipase C-beta1 or -beta2. However, the RGS/beta5 complexes inhibited beta(1)gamma(2)-mediated activation of phospholipase C-beta2. RGS/beta5 complexes may contribute to the selectivity of signal transduction initiated by receptors coupled to G(i) and G(o) by binding to phospholipase C and stimulating the GTPase activity of Galpha(o). PMID 10521509 ↗Regulators of G protein signaling 6 and 7. Purification of complexes with gbeta5 and assessment of their effects on g protein-mediated signaling pathways. · cc by |
核酸與蛋白質序列
GAACGGCTTCGCGAGTTGGGGCAGCTCCTCGCGCTCGGCC40CTGCTCGGCGGCGAGAGCTCCGCCTGGGCGCCGCGTTCCT80ACAGCCGCCGGAGCCGCCAGGCGCCGAGGGAACGGACAGA120CCTCCGCGCACCCTTGCCGACCGGGGCGGGCAGAGGCGGG160CAAGCGGCGAACGCCTGGGAGCGCGGAGAGCCAGGCCAGC200CCGGAGCGCGCCGGGGACACCCTGTGCGCCCCGAGTCCCG240GCACCATGCGACCCGCCGCGCGTCCTCGCGGGCCCGGGGC280TTCGCTCTTCGCTCGCTGAGCCCCTGCGCTCGCCACCACG320GAAACTCGGAAAGAGGAGGCGAGGCTGTGGGGAGCGGCGC360GGAGACGGACTAGACTTCCCCTCCGCCCCCAAGAGGCTGC400CGGTCCCCGGTTCCCTGGGCTTCTCCAGCTTTATCATGAA440CCTGGCGCAAGGTTGGCTTTAGGAAAAATTCTGGAGCCAG480AGGGAGAGTCAAGGCAATTCTTTGGTTGCTAAGTGTGAGT520GAAGACACTCAGGATGGCTCAAGGATCCGGGGATCAAAGA560GCAGTGGGGGTTGCTGACCCAGAGGAGAGTTCTCCAAACA600TGATCGTTTACTGCAAAATTGAAGACATCATTACAAAGAT640GCAAGATGACAAGACAGGGGGTGTGCCCATCAGAACAGTC680AAGAGCTTTCTCTCCAAAATCCCCAGTGTCGTCACAGGTA720CTGACATTGTGCAGTGGCTTATGAAGAACCTTTCCATTGA760GGACCCAGTTGAAGCAATACACTTGGGGAGCCTTATCGCT800GCCCAGGGCTACATCTTTCCAATCTCAGACCATGTTCTCA840CCATGAAGGATGATGGCACCTTTTATCGTTTCCAGGCTCC880GTACTTCTGGCCTTCGAACTGCTGGGAACCTGAAAACACT920GACTATGCCATCTATCTCTGTAAGAGGACAATGCAAAATA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。