基因總覽
RGS5(regulator of G protein signaling 5)是蛋白質編碼基因。其產物屬於調節 G protein signaling 的蛋白質,序列含有 RGS domain。來源指出其與 G protein alpha subunits 的調節作用有關,但這項作用的描述標示為依相似性推論。蛋白質的序列特徵與各異構型的細胞定位資訊,分別見下方內容。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000313961 ★ | 163,142,299–163,202,916 | 5 |
| ENST00000367903 | 163,142,299–163,217,636 | 6 |
| ENST00000530507 | 163,142,299–163,202,903 | 5 |
| ENST00000618415 | 163,142,299–163,321,791 | 6 |
| ENST00000950224 | 163,146,260–163,202,912 | 5 |
| ENST00000527988 | 163,147,342–163,202,835 | 3 |
| ENST00001112192 | 163,148,417–163,202,914 | 5 |
| ENST00000531476 | 163,152,608–163,202,898 | 3 |
| ENST00001131304 | 163,200,255–163,202,912 | 2 |
顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RGS5 的功能描述指出,它可抑制訊號傳遞,作用方式是提高 G protein alpha subunits 的 GTPase 活性。這會促使相關次單元由活化狀態轉為不活化的 GDP 結合形式,因而降低訊號傳遞。此處描述的是其對 G protein alpha subunits 活性的調節及其後續狀態變化;來源未提供更廣泛的生物過程或作用情境。
在結合對象方面,資料指出 RGS5 可結合 G(i)-alpha 與 G(o)-alpha,但不結合 G(s)-alpha。這表示來源描述的結合具有選擇性,不能將其概括為對所有 G protein alpha subunits 均有相同結合能力。上述功能與結合特性均標示為依相似性推論,因此應保留這項證據限制,不視為此處直接驗證的結論。
Promoter 與基因調控
>RGS5 ENST00000313961 GRCh38 chr1:163202816-163203916 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AGGCATTTATTTACAGATTAACTTATCAGCACCTTGGGCCCCGACAAGATAAGACACAATTCAGGTAAAT TTTGGTAAATATTCCTTGAGTGATAGGAAGCAGGAAAAGTTTGAAGGAGAAGGAAAGACAAGCCTAGGCA AGGATGGCTATGGTGGGGAGGTACAAAGAATTACAAAGCATTAGTCATCCAAGCAAAGTATAATCAGAAG ACCACTGACAGAATTAACAGAGTTCAGAGATAATATCATTATACTCAATCCCTACTAAGATTTTGGTGTT TGGTCTCCTAGATCACTTTTTTAGTACCTTCACAGACATATGGATTCATAAAGAATATATAGTAATTATT CATATTTGTTTTGATTTATATAAACAGTAATCTTGTCTCTCAGCTCCAGAAAACCTTGCCTGGTGCTTCC TGAAGGCTCACAACATCCCAGCCCGGCCTCCATCACTTACTTATAATGTGTTTTGGGGTCTTGAGGGCAG GGAGCTTTCTCTTTCTTCTCTGAATTCCTAGCATCCAGCTGAGTGCCTGGCACTTGGTAAGTATTCACAT ACACATTCCTTGAATTCCCTAGATTTCAGTTTCCTTCACTGTGAAACAAAGTGGGCTAAACGATCTCCAG GAGCCCTTACAGTCCTAAGAATCTATGACTTTGACCGATCTGAAGTGGTCCAAGACACTTTGCTTCACAG GAAGCTCACATCTTCCTTGTGATTGGCCTGAGATTAGGAGTTCAAACAACCAATGACCTGTGCACAGTTT AGGGCCTAACCCTGCCCTGGCCGGTTAGCAAGAGAGTGTTGTGATAAGAGCAGATGAAAGCCTTATGCCA CAGTAGTGCCTGTAGCAGAGAAAGGATTCCCTCCTCCACCTCAGGGCCCACTGCTGCTGCTCTCCAGCCT GCAGTTTCCTCTAAGGCTCTGGATTGGCTGGAAGAGCAACAGAGGGCTGGGAAAGAGCTTCTATATATAC CTCAGGAGGAAAGGCATCCCAGACAGTTTTGAAGTTTTCAAAGACTGGCTCTGCTGTTAAGAAGTTGTAC TTAAAGCGGAGGAGCTAAGCCACCTGCCAAAATGTGCAAAGGACTTGCAGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RGS5_1 ↗ | 1:163,202,912 | 負股 | 163,202,902–163,202,961 |
| RGS5_2 ↗ | 1:163,321,735 | 負股 | 163,321,725–163,321,784 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR1_B37DHK · promoter · 163202825–163203406 · regulatory
· motif · 163203346–163203355 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:181 aa
RGS5 蛋白質長 181 個胺基酸。其第 64 至 180 位胺基酸區段註記為 RGS domain;此結構域註解來自 PROSITE-ProRule。
蛋白質三維結構
細胞內定位
RGS5 的異構型 1 定位於細胞質與膜;異構型 2 則定位於細胞質。 資料因此顯示兩種異構型在膜定位的註記上有所不同。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- MEOX2Q6FHY5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RGS5 的功能描述為抑制訊號傳遞,方式是提升 G protein alpha subunits 的 GTPase 活性,使其轉為不活化的 GDP 結合形式。資料指出它結合 G(i)-alpha 與 G(o)-alpha,但不結合 G(s)-alpha;這些功能與結合敘述均為依相似性推論。 | 推論支持 | 證據與來源Inhibits signal transduction by increasing the GTPase activity of G protein alpha subunits thereby driving them into their inactive GDP-bound form. Binds to G(i)-alpha and G(o)-alpha, but not to G(s)-alpha (By similarity) |
| 細胞定位 | RGS5 的異構型 1 定位於細胞質與膜。此筆定位資訊針對異構型 1,並未描述其他異構型的定位,也未提供定位變化的條件或動態。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | RGS5 的異構型 2 定位於細胞質。此筆定位資訊僅描述異構型 2 位於細胞質,未列出其他位置,也未提供定位變化的條件或動態。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGACAGTTTTGAAGTTTTCAAAGACTGGCTCTGCTGTTAA40GAAGTTGTACTTAAAGCGGAGGAGCTAAGCCACCTGCCAA80AATGTGCAAAGGACTTGCAGCTTTGCCCCACTCATGCCTG120GAAAGGGCCAAGGAGATTAAGATCAAGTTGGGAATTCTCC160TCCAGAAGCCAGACTCAGTTGGTGACCTTGTCATTCCGTA200CAATGAGAAGCCAGAGAAACCAGCCAAGACCCAGAAAACC240TCGCTGGACGAGGCCCTGCAGTGGCGTGATTCCCTGGACA280AACTCCTGCAGAACAACTATGGACTTGCCAGTTTCAAAAG320TTTCCTGAAGTCTGAATTCAGTGAGGAAAACCTTGAGTTC360TGGATTGCCTGTGAGGATTACAAGAAGATCAAGTCCCCTG400CCAAGATGGCTGAGAAGGCAAAGCAAATTTATGAAGAATT440CATTCAAACGGAGGCTCCTAAAGAGGTGAATATTGACCAC480TTCACTAAGGACATCACAATGAAGAACCTGGTGGAACCTT520CCCTGAGCAGCTTTGACATGGCCCAGAAAAGAATCCATGC560CCTGATGGAAAAGGATTCTCTGCCTCGCTTTGTGCGCTCT600GAGTTTTATCAGGAGTTAATCAAGTAGTAATTTAGCCAGG640CTATGAAATCATCCTGTGAGTTATTTCCTCCATAATAACC680CTGCATTTCCCATTAATCTACATATCTTCCCACAGCAGCT720TTGCTCAGTGATACCCACATGGGAAAAATCCCAGGGGATG760TTGCTTACTCTTTTTGCCCACACTGCTTTGGATACTTATC800TACTGTCCGAAGGCCTTCTTTCCCCACTCAATTCTTCCTG840CCCTGTTATTAATTAAGATATCTTCAGCTTGTAGTCAGAC880ACAATCAGAATCACAGAAAAATCCTGCCTAAGGCAAAGAA920ATATAAGACAAGACTATGATATCAATGAATGTGGGTTAAG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。