基因總覽
RGS19(regulator of G protein signaling 19)是人類的蛋白質編碼基因。其產物參與 G protein 訊號調節,作用對象包括 G-alpha subfamily 1 的成員。來源資料指出,RGS19 對不同 G protein alpha subunits 的作用程度有所差異;其蛋白質序列另含有 RGS domain,細節見蛋白質特徵段落。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000395042 ★ | 64,073,181–64,079,518 | 6 |
| ENST00000332298 | 64,073,181–64,079,988 | 6 |
| ENST00000910389 | 64,073,181–64,079,988 | 6 |
| ENST00000910390 | 64,073,181–64,079,905 | 6 |
| ENST00000910391 | 64,073,181–64,079,642 | 5 |
| ENST00000910392 | 64,073,181–64,079,518 | 6 |
| ENST00000910393 | 64,073,181–64,079,518 | 6 |
| ENST00000910394 | 64,073,181–64,079,319 | 6 |
| ENST00000910395 | 64,073,181–64,077,262 | 6 |
| ENST00000936747 | 64,073,181–64,079,860 | 6 |
| ENST00000944526 | 64,073,181–64,079,988 | 7 |
顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RGS19 可抑制訊號傳遞,作用方式是提高 G protein alpha subunits 的 GTPase 活性,使其轉為失活的 GDP-bound form。這項調節將 G protein alpha subunits 的活性狀態與訊號傳遞的抑制相連結。
RGS19 可結合 G-alpha subfamily 1 的成員,但不同成員的作用程度並不相同。來源所列順序為 G(i)a3 高於 G(i)a1,接著是 G(o)a;對 G(z)a 與 G(i)a2 的作用則低得多。此排序描述的是來源所述的相對作用次序,不代表各成員具有相同的調節程度。
對 G(z)-alpha 的作用會受到 G protein 本身修飾狀態影響:其 phosphorylation 與 palmitoylation 會抑制 RGS19 對 G(z)-alpha 的活性。這表示 RGS19 的調節作用依作用對象而異,且在 G(z)-alpha 上會受上述修飾限制。
Promoter 與基因調控
>RGS19 ENST00000395042 GRCh38 chr20:64079418-64080518 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TCGGCATGACTCCGGATGCAAGAACCCGCACCCCCAGTTCTCCCCAGCCCCGCAGCACAGGAATCTCCCC CTTCCTTGGGAACCCCCCACAGCACAGACAGGCGGCTCTTAACCCAGTTTTACAGACGCGGCTCACGGAG GCGAGGGGTGGGCCGGGCTGGCGTACCCGCCGATCGGTCCTTTGCAGCAGCCTCCTCTTTCCCAAGCTGG GCAAGCAGCATATGGGGCCCAGCTCTCGTGCCTCCACTGTCGTGGAAGTCCCACACGGATGGCAAAGCAG GAACGGCCCCGCCGAGCAGAGTCGGGGGCCACGGCCACACCCCCATCTACTACCGTGCGGCTCCGTCCGC CCGGGAGCCAGGGCTCCACTATGAGCACCTCGACTCTCCGGGCCACCCCCAGGCGACTGTGGGGGCCGAC GCGCGGGCGGGGCGGGTGGGGTGCGGAGCCGGCCGAGCGCGGGGCGGGGCGCGGCGGGCGGGGCGGGCCC GGCGACCGCCGGCGCGAGGAAGTCCCGGCCCCTGGCTTTGGGGAAGTGCCGCCGAGGCGCCTGCGCACTG CGCCCCCGCGCCCCCTCCCCGACTGTCGGGCCGGACCTTGGAGCGCGCGGGCCGGCGGCGGCGCGAGTGG CTCGGGAGCGCGGCTGGTGAGTGCGCGCGCGCAGCGCCGGGGACAGCGGCCCTGCCCCTCCCGGCCCGGG CCCGGGGACCGTGCTGGGCGGGAGCTTCGGGAGCCGGCGCACGGGACTCGAACCCCAAGGGCTCCCGCCG CCAGGTCCACGTGGACCCTGGGCCGCAGTGGAAGTGGAGCCCGCCCCCCGCGCGTGGGGGAGGGGGCGCC GCAGCCGGGTTCCCCTTTTTCTGGAGCTCAAAGCCTGGGGAAGTGATTGCTCAAAGGTGGGGGCCGGAAG AACCCAGGTTTCCGCGTCTCCCTCCCCCTCTCAGCCCGGTGAGGAGGGGCCGGGGCGGGACACCCTGTCC GCCCCCGCCCCCACCCCGCTGGATCTGGCAGCCACTCAGCCCTTCGAGCTGTAGGGGAGGCGCTGCGCCC CCGGCCCCAGCCGATCGGGGGCTCCTGGCGCTAGCCTCCCTCCAGAGCGCC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RGS19_3 ↗ | 20:64,077,239 | 負股 | 64,077,229–64,077,288 |
| RGS19_2 ↗ | 20:64,079,509 | 負股 | 64,079,499–64,079,558 |
| RGS19_1 ↗ | 20:64,079,934 | 負股 | 64,079,924–64,079,983 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR20_5K3XB3 · CTCF_binding_site · 64077916–64077937 · regulatory
ENSR20_BGPCR · promoter · 64079508–64080206 · regulatory
ENSR20_C8CNH · enhancer · 64080207–64081813 · regulatory
ENSR20_5K3Z7D · CTCF_binding_site · 64083169–64083190 · regulatory
ENSR20_BGPDH · promoter · 64084349–64085026 · regulatory
· motif · 64074829–64074844 · motif
· motif · 64074988–64075001 · motif
· motif · 64074988–64075001 · motif
· motif · 64075066–64075078 · motif
· motif · 64075092–64075105 · motif
· motif · 64075092–64075105 · motif
· motif · 64075122–64075135 · motif
· motif · 64075122–64075135 · motif
· motif · 64075152–64075165 · motif
· motif · 64075152–64075165 · motif
· motif · 64075227–64075239 · motif
· motif · 64075229–64075236 · motif
· motif · 64075342–64075355 · motif
· motif · 64075342–64075355 · motif
· motif · 64076052–64076063 · motif
· motif · 64076471–64076486 · motif
· motif · 64076714–64076727 · motif
· motif · 64076714–64076727 · motif
· motif · 64076741–64076753 · motif
· motif · 64076818–64076831 · motif
· motif · 64076818–64076831 · motif
· motif · 64077240–64077254 · motif
· motif · 64077243–64077254 · motif
· motif · 64077243–64077254 · motif
· motif · 64077245–64077254 · motif
· motif · 64077256–64077269 · motif
· motif · 64077271–64077285 · motif
· motif · 64077391–64077402 · motif
· motif · 64077542–64077553 · motif
· motif · 64077575–64077586 · motif
· motif · 64077912–64077921 · motif
· motif · 64077918–64077934 · motif
· motif · 64078243–64078256 · motif
· motif · 64078243–64078256 · motif
· motif · 64078362–64078374 · motif
· motif · 64078364–64078371 · motif
· motif · 64078697–64078709 · motif
· motif · 64078878–64078891 · motif
· motif · 64078878–64078891 · motif
· motif · 64078895–64078908 · motif
· motif · 64078895–64078908 · motif
· motif · 64079522–64079535 · motif
· motif · 64079528–64079541 · motif
· motif · 64079659–64079672 · motif
· motif · 64079856–64079867 · motif
· motif · 64079856–64079867 · motif
· motif · 64079947–64079960 · motif
· motif · 64079962–64079973 · motif
· motif · 64079962–64079973 · motif
· motif · 64080547–64080559 · motif
· motif · 64080863–64080875 · motif
· motif · 64081146–64081158 · motif
· motif · 64081148–64081155 · motif
· motif · 64081148–64081161 · motif
· motif · 64081153–64081165 · motif
· motif · 64081155–64081162 · motif
· motif · 64081155–64081168 · motif
· motif · 64081155–64081170 · motif
· motif · 64081332–64081339 · motif
· motif · 64081392–64081399 · motif
· motif · 64081455–64081468 · motif
· motif · 64081640–64081655 · motif
· motif · 64081929–64081942 · motif
· motif · 64082306–64082319 · motif
· motif · 64083171–64083187 · motif
· motif · 64083222–64083234 · motif
· motif · 64083794–64083807 · motif
· motif · 64084032–64084042 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:217 aa
RGS19 蛋白質長 217 個胺基酸。其 RGS domain 位於第 90 至 206 個胺基酸;第 1 至 29 位被註記為無序區域。第 207 至 217 位則標示為與 GIPC 互作的區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
RGS19 的定位註記為膜與 lipid-anchor。 來源未提供定位改變的條件或異構型差異。
未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 11 個夥伴
- ALPPP05187 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CATSPER1Q8NEC5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HOXA1P49639 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP5-6Q6L8G9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LCE4AQ5TA78 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NUFIP2Q7Z417 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- OTX1P32242 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- POU4F2Q12837 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PSMA1P25786 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- VASNQ6EMK4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- Gnai3P08753 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
RGS19 與 GIPC 的 PDZ domain 互作,也與 GNAO1 互作。來源未進一步說明這些互作是否構成複合體,或其功能關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RGS19 透過提高 G protein alpha subunits 的 GTPase 活性抑制訊號傳遞,促使其轉為失活的 GDP-bound form。它與 G-alpha subfamily 1 成員作用的順序為 G(i)a3、G(i)a1、G(o)a,之後遠低於 G(z)a 與 G(i)a2;G protein 的 phosphorylation 與 palmitoylation 會抑制其對 G(z)-alpha 的作用。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Inhibits signal transduction by increasing the GTPase activity of G protein alpha subunits thereby driving them into their inactive GDP-bound form. Binds to G-alpha subfamily 1 members, with the order G(i)a3 > G(i)a1 > G(o)a >> G(z)a/G(i)a2. Activity on G(z)-alpha is inhibited by phosphorylation and palmitoylation of the G protein |
| 交互作用 | RGS19 與 GIPC 的 PDZ domain 互作,也與 GNAO1 互作。來源未在這筆敘述中提供互作發生的條件或其功能後果。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | Membrane / Lipid-anchor | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
GGATCTGGCAGCCACTCAGCCCTTCGAGCTGTAGGGGAGG40CGCTGCGCCCCCGGCCCCAGCCGATCGGGGGCTCCTGGCG80CTAGCCTCCCTCCAGAGCGCCGCAGGAGTCCCTCCTGCCG120TCTGACTTGAGTCCCTGCTGCTGCAGTGCACGCCCCTTCG160GCAGCCAGGGTGGGGCCCAGACCCAACCTGGCCCCTCCTG200CCCCCACCCCGCCTTTGGGTCGCTGACCCCCAGGCTGTGG240TGAGGGTCTGAGAGCTGGTACCACGGAGCCTGGGCAACCT280CCTCCGCCCACCCATGCCCACCCCGCATGAGGCTGAGAAG320CAGATCACAGGGCCAGAGGAGGCGGACCGGCCCCCTTCAA360TGTCCAGTCATGATACAGCCTCTCCAGCGGCCCCCAGCCG400CAACCCCTGCTGCCTGTGCTGGTGCTGCTGCTGTAGCTGC440TCCTGGAACCAAGAGCGGCGGCGCGCGTGGCAGGCCTCCC480GGGAGAGCAAGCTGCAGCCCCTCCCCAGCTGTGAAGTATG520TGCCACGCCAAGTCCTGAGGAGGTGCAGAGCTGGGCGCAG560TCTTTTGACAAGCTGATGCACAGCCCAGCGGGACGCAGCG600TGTTCCGGGCGTTCCTGCGGACAGAGTACAGCGAGGAGAA640CATGCTCTTCTGGTTGGCCTGCGAGGAGCTGAAGGCCGAG680GCCAACCAGCATGTGGTAGACGAGAAGGCGAGGCTCATCT720ACGAGGACTACGTATCCATCCTGTCCCCCAAGGAGGTGAG760CCTGGACTCCCGTGTGCGGGAGGGCATCAACAAGAAGATG800CAGGAGCCGTCCGCACACACGTTCGACGACGCGCAGCTGC840AGATCTACACGCTCATGCACCGGGACTCCTACCCCCGCTT880CCTCAGCTCTCCCACCTACCGTGCCCTGCTGCTGCAGGGG920CCATCACAGTCCTCCTCCGAGGCCTAGGCCGCCCCCAGCA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。