基因總覽
RGS18(regulator of G protein signaling 18)是由蛋白質編碼基因產生的調節蛋白,屬於 regulator of G protein signaling 家族。其蛋白質含有 RGS domain;來源所述的功能涉及 G protein alpha subunits,並列出可結合的亞型。這些基本特徵界定了 RGS18 與 G protein 訊號調節的關聯。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000367460 ★ | 192,158,462–192,185,815 | 5 |
| ENST00001092794 | 192,158,344–192,187,172 | 6 |
| ENST00001145087 | 192,158,449–192,187,172 | 5 |
顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RGS18 可抑制訊號傳遞,其作用方式是提高 G protein alpha subunits 的 GTPase 活性。這會促使相關次單元將 GTP 水解,轉為不活化的 GDP 結合形式,因而降低訊號傳遞。來源明確列出的結合對象包括 G(i) alpha-1、G(i) alpha-2、G(i) alpha-3 與 G(q) alpha。
這項調節建立在 G protein alpha subunits 的核苷酸狀態轉換上:RGS18 促進 GTPase 活性,使其較快進入 GDP 結合的非活化狀態。其結果是訊號傳遞受到抑制;來源並未進一步說明此效應所涉及的特定細胞反應或生理情境,因此不宜延伸至未記載的下游結果。
Promoter 與基因調控
>RGS18 ENST00000367460 GRCh38 chr1:192157462-192158562 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TTTTAATAAAGGCATTAAAATATAAAAACTACCATCTCTACTTAATCCATGTCATTATAAAGAACATTTT TACATTATAAAGAACATTTTAACAACAAAAGAGTCAGGAGAGCAAATTCAAAATAGCAAGTCCTTTATAT CAAAGGAATTAAAATAAAGCTTTAAGAAAAAAAACTTTTCATATTTTTTTCCATTTCATCACAGACTGAT AAAAATTTCAAAAATGTCTAAAATCATTCTATAGATATGTGCTTAAAACTTTATTTATTTATTTGAGACA GAGTCTTGCTCCGTTGCCCAGGCTGAAGTGAAGTAGCCGGCATGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGACT CCCAGGTTCAAGGGATTCTCCTGGCTCTGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGTAGGTGCACACCACCGTGCC TGGGTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTCTCACCATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTG AGCTCAGGTAATCTGCCCACCTTAGCCTCCAGATTACAGGCATGAGTTACTGTGCCCAGCCCAAAACTGT TAAATTAAATGCTTTCTACAATCTTTTTTTAACCATAAAATTCTGATCTATTGTCTTATTTTGTTACAAT ATGTTAAGCCAATGTAATTAACATTACATAATCTTATGTCAGTTAAATGTGATTTACTTAACTCATGTAA TAACAATAAGAAAAATACTTTTTTAAGAACTGGAGAAAATATCTCCTAATGTTTGATATAATACTTTGCC ATAACACATTTTAACACACAGTCCACACATTTAAAAACTTTTTGAAAAGTTCCTGTGGGAAATGACAGTG TTATTTGAGTCTATTAAAGCATCATTCTGGTTGCGCAAACTTGAACGAGAAGTTGCACTGTGGTAAGACT AGTCTTTATCTTAGAGACCAAGAGTCATTTTGCAAATTTGTGGTATCATTTCCCTAAACAACTTAGGACC AAATTGTACTTCATTTCCTCAGTTCTGCATTTCTGCAGAGACAGAAAGAAACGCAGCTCTTGACTTCTTT TTTGTAAACATTACTGTAAGAGTTGTGATAACTTTTTATTCTACTATGTAT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RGS18_1 ↗ | 1:192,158,462 | 正股 | 192,158,413–192,158,472 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR1_87MJHW · enhancer · 192153338–192153568 · regulatory
ENSR1_94S9BC · promoter · 192158105–192158472 · regulatory
ENSR1_87MJLT · enhancer · 192158473–192158628 · regulatory
· motif · 192158331–192158340 · motif
· motif · 192158461–192158474 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:235 aa
RGS18 蛋白質長 235 個胺基酸,具有一段 RGS domain,位於第 86 至 202 個胺基酸。此區域的註解依據 PROSITE-ProRule 的特徵規則。
蛋白質三維結構
細胞內定位
RGS18 的細胞內定位註記為細胞質。 來源未提供定位改變的條件或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- Gnao1P59215 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RGS18 透過提高 G protein alpha subunits 的 GTPase 活性抑制訊號傳遞,促使其轉為不活化的 GDP 結合形式;列出的結合對象包括 G(i) alpha-1、G(i) alpha-2、G(i) alpha-3 與 G(q) alpha。 | 含實驗來源 | 證據與來源Inhibits signal transduction by increasing the GTPase activity of G protein alpha subunits thereby driving them into their inactive GDP-bound form. Binds to G(i) alpha-1, G(i) alpha-2, G(i) alpha-3 and G(q) alpha PMID 11042171 ↗ · PMID 11955952 ↗ |
| 細胞定位 | RGS18 定位於細胞質。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
AGTTCTGCATTTCTGCAGAGACAGAAAGAAACGCAGCTCT40TGACTTCTTTTTTGTAAACATTACTGTAAGAGTTGTGATA80ACTTTTTATTCTACTATGTATATGTATGGAATAGTATTAA120TAAATGAACTAGGGAAGGATGTAATAAATTAGACATCTCT160TCATTTTAGAGAGAAGATGGAAACAACATTGCTTTTCTTT200TCTCAAATAAATATGTGTGAATCAAAAGAAAAAACTTTTT240TCAAGTTAATACATGGTTCAGGAAAAGAAGAAACAAGCAA280AGAAGCCAAAATCAGAGCTAAGGAAAAAAGAAATAGACTA320AGTCTTCTTGTGCAGAAACCTGAGTTTCATGAAGACACCC360GCTCCAGTAGATCTGGGCACTTGGCCAAAGAAACAAGAGT400CTCCCCTGAAGAGGCAGTGAAATGGGGTGAATCATTTGAC440AAACTGCTTTCCCATAGAGATGGACTAGAGGCTTTTACCA480GATTTCTTAAAACTGAATTCAGTGAAGAAAATATTGAATT520TTGGATAGCCTGTGAAGATTTCAAGAAAAGCAAGGGACCT560CAACAAATTCACCTTAAAGCAAAAGCAATATATGAGAAAT600TTATACAGACTGATGCCCCAAAAGAGGTTAACCTTGATTT640TCACACAAAAGAAGTCATTACAAACAGCATCACTCAACCT680ACCCTCCACAGTTTTGATGCTGCACAAAGCAGAGTGTATC720AGCTCATGGAACAAGACAGTTATACACGTTTTCTGAAATC760TGACATCTATTTAGACTTGATGGAAGGAAGACCTCAGAGA800CCAACAAATCTTAGGAGACGATCACGCTCATTTACCTGCA840ATGAATTCCAAGATGTACAATCAGATGTTGCCATTTGGTT880ATAAAGAAAATTGATTTTGCTCATTTTTATGACAAACTTA920TACATCTGCTTCTAACATATCGCATGTTTATGTTAAGATT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。