基因總覽
RGS17(regulator of G protein signaling 17)是蛋白質編碼基因,產物屬於 G protein signaling regulator。現有資料指出,RGS17 參與 G protein-coupled receptor 訊號級聯的調節,涉及 muscarinic acetylcholine receptor CHRM2 與 dopamine receptor DRD2 等受體。來源未提供更完整的家族分類或蛋白質整體結構描述。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000206262 ★ | 153,004,459–153,131,282 | 5 |
| ENST00001071512 | 153,004,449–153,131,306 | 5 |
| ENST00000367225 | 153,004,459–153,044,043 | 4 |
| ENST00001141767 | 153,004,459–153,131,306 | 5 |
| ENST00000914255 | 153,010,598–153,131,306 | 4 |
| ENST00001126128 | 153,024,990–153,131,306 | 4 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RGS17 調節 G protein-coupled receptor 訊號級聯,已列出的相關受體包括 muscarinic acetylcholine receptor CHRM2 與 dopamine receptor DRD2。它對訊號傳遞具有抑制作用,方式是提高 G protein alpha subunits 的 GTPase 活性,使其由 GTP 結合狀態轉為失活的 GDP 結合狀態,進而抑制訊號傳遞。此作用說明 RGS17 可藉由調整 G protein 的活化狀態,影響受體所引發的訊號活動。
RGS17 對 GNAZ 與 GNAI2 具有選擇性結合,並可加速這兩種次單元的 GTPase 活性、調節其訊號活動。來源也指出,RGS17 會負向調節 mu-opioid receptor 所介導的 G protein 活化;這項敘述標示為相似性推論,並非在此來源中明確列為直接實驗證實。關於 CHRM2、DRD2 的訊號調節,資料未進一步說明各受體情境下的具體作用差異。
Promoter 與基因調控
>RGS17 ENST00000206262 GRCh38 chr6:153131182-153132282 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GGAACTCACACAGATTTACAAGTAATCTGTTTTAATTAGGTGTAAGAAAAAAAAGCCCATTCACTCCTGC AGGAACTCCCTCCTCTTCCCACAGATGTGGTATCTGAAGAGCAAGACACTGCTTCTCCACTTCCTCCGCA CAAACACTTTAGTCTAATCATTGGAGATGCAATCTAGCGCTCGGGTTGCATTAAGTATCCCAAGCTCCTT CCCTACCAAGCTGGGCTCCACTTGGGCACAGAACGATTATCAGACCTGGTAACTACCAAGCTGTCCCCTA AGGATGCTCTAGGCCCCAAGCATCAGCACCTCCGTTAATAATTCTCCACTCTTGCCTTGTCATCGGCTTT TCTCACTCAAAACTCTGCTCCAGCGAGTGGTCCGGGCGCCTGAGGCAGCTGGCATGGGCTAGGCCAGAGA GCACCTGCACTGATTCTTAGGAGAAAAGGTCCTCTTTCTGGGCGAGGAAGTCAATAAAGTAAAGGACGCT TCATAAAGTCCTTCGGGAAGCAAAACTTGCTTAACTTCACACTTCCTTGAACCCCCACGCAGGGAATGCT TCCTCCGGGACCCGGAGCAGGCAGGCTGCTGTGCCTGGCAGGCCGGCTCCTGGGTGCAAGGCTCCCGCGC AGCCCAGGACAGCAGCGCGCGGGCTACGGGCGAGTGGAGTTGCAGGGGCCCGGGCGGAGAGCCGCTGTCA CCCAGGGAAGCTCTCGGGACTCCGGGCCTCCCGCGAAGCTCCGGACGGGCGTCACCGAAGCCGAGAGTCC CGGCCGAGCCCCTCCGCACGGTGGGCGCCGCGCCCAGGCGAGCGCGCGAGGTCGGGCGGGGCCGGGGGCC GCCCGGGGAGGGGGCGGGGCCGGGACTCTCGCGGCCGCGCGCAGGGGCTGGGAAGCTGCCCCTCCGGCCG CGCCGGGCGAGGGGCTGCGCCGGCCCGCGAGGCGCATGCGCGCTGCCGAGCGGCTCTCGCTCCCTCCCCG CCCACCGCTCCCTCCTCCCCCTCCCCCTCCTCTGCATCCTCGCCGCTCTCCCTCTCTCCTCGCCCGCTGG GTGCTGAAGTTGGGCGGATGGCAGCAAACCGGCTCCGCTAGAGGACCGAGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RGS17_1 ↗ | 6:153,131,241 | 負股 | 153,131,231–153,131,290 |
| RGS17_2 ↗ | 6:153,131,644 | 負股 | 153,131,634–153,131,693 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR6_CK796 · enhancer · 153129833–153131271 · regulatory
ENSR6_53C2GZG · CTCF_binding_site · 153130700–153130721 · regulatory
ENSR6_948R3W · promoter · 153131272–153131772 · regulatory
· motif · 153129810–153129822 · motif
· motif · 153129820–153129832 · motif
· motif · 153129822–153129829 · motif
· motif · 153129847–153129859 · motif
· motif · 153129849–153129856 · motif
· motif · 153130702–153130718 · motif
· motif · 153131331–153131342 · motif
· motif · 153131331–153131342 · motif
· motif · 153131394–153131405 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:210 aa
RGS17 蛋白長 210 個胺基酸。其第 84 至 200 位胺基酸區段註記為 RGS domain;第 1 至 21 位則被註記為無序區域。這些區段註解描述了序列特徵,來源未提供其他結構資訊。
蛋白質三維結構
細胞內定位
RGS17 被註記於膜、突觸體、細胞核與細胞質。 來源未說明這些位置是否隨細胞狀態或條件改變,也未提供不同異構型之間的定位差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
未繪示構造:Membrane;Synapse, synaptosome。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 41 個夥伴
- AQP1P29972 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- BOLA2-SMG1P6A0A087WZT3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CHRDQ9H2X0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CRCT1Q9UGL9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CREB5Q02930-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DMWDG5E9A7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GLE1Q53GS7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GNAI1P63096 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GNAI3P08754 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HOXA1P49639 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- HSD3B7Q9H2F3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KLF11O14901 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP4-11Q9BYQ6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP5-11Q6L8G4 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- KRTAP5-3Q6L8H2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP5-4Q6L8H1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP5-6Q6L8G9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LCE1AQ5T7P2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LCE1BQ5T7P3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LCE1DQ5T752 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- LCE1EQ5T753 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LCE2AQ5TA79 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LCE2BO14633 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LCE2CQ5TA81 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LCE3AQ5TA76 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
RGS17 與 GNAI1、GNAQ、GNAZ、GNAI2、OPRM1 及 HINT1 有互作紀錄。相似性資料指出,RGS17 可與 mu-opioid receptors 及 G(alpha)z/i2 次單元(包括 GNAZ、GNAI2)形成複合體;該複合體的形成與 mu-opioid receptor 去敏化相關。來源未將所有互作都描述為複合體成員。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RGS17 調節包括 CHRM2 與 DRD2 在內的 G protein-coupled receptor 訊號級聯,並透過提高 G protein alpha subunits 的 GTPase 活性,使其轉為失活的 GDP 結合狀態而抑制訊號。它選擇性結合 GNAZ、GNAI2 並加速其 GTPase 活性;對 mu-opioid receptor 介導的 G protein 活化則為負向調節,此項標示為相似性推論。 | 含實驗來源 | 證據與來源Regulates G protein-coupled receptor signaling cascades, including signaling via muscarinic acetylcholine receptor CHRM2 and dopamine receptor DRD2. Inhibits signal transduction by increasing the GTPase activity of G protein alpha subunits, thereby driving them into their inactive GDP-bound form. Binds selectively to GNAZ and GNAI2 subunits, accelerates their GTPase activity and regulates their signaling activities. Negatively regulates mu-opioid receptor-mediated activation of the G proteins (By similarity) PMID 15096504 ↗ |
| 交互作用 | RGS17 與 GNAI1、GNAQ、GNAZ、GNAI2、OPRM1 及 HINT1 有互作紀錄。相似性資料另指出,它可與 mu-opioid receptors 及 G(alpha)z/i2 次單元形成複合體;複合體形成與 mu-opioid receptor 去敏化相關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with GNAI1 and GNAQ. Interacts with GNAZ and GNAI2. Interacts with OPRM1. Forms a complex with mu-opioid receptors and G(alpha)z/i2 subunits, including GNAZ and GNAI2; the formation of this complex results in mu-opioid receptor desensitization (By similarity). Interacts with HINT1 (By similarity) PMID 18434541 ↗ |
| 細胞定位 | RGS17 的定位註記包括膜、突觸體、細胞核與細胞質;此資料未提供定位改變的條件或異構型差異。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
CTCCCCCTCCTCTGCATCCTCGCCGCTCTCCCTCTCTCCT40CGCCCGCTGGGTGCTGAAGTTGGGCGGATGGCAGCAAACC80GGCTCCGCTAGAGGACCGAGCCGCCCAGCCCCGCTCCCCC120GGACCCATCGGCGCGCTGCCCACACCTCCAGGCGACCGGC160CAACTGGGTCCTGAAGTAGCTGAAATGCGAAAAAGGCAGC200AGTCCCAAAATGAAGGAACACCTGCCGTGTCTCAAGCTCC240TGGAAACCAGAGGCCCAACAACACCTGTTGCTTTTGTTGG280TGCTGTTGTTGCAGCTGCTCCTGCCTCACTGTGAGGAATG320AAGAAAGAGGGGAAAATGCGGGAAGACCCACACACACTAC360AAAAATGGAGAGTATCCAGGTCCTAGAGGAATGCCAAAAC400CCCACTGCAGAGGAAGTCTTGTCCTGGTCTCAAAATTTTG440ACAAGATGATGAAGGCCCCAGCAGGAAGAAACCTTTTCAG480AGAGTTCCTCCGAACAGAATACAGTGAAGAGAACCTACTT520TTCTGGCTTGCTTGTGAAGACTTAAAGAAGGAGCAGAACA560AAAAAGTAATTGAAGAAAAGGCTAGGATGATATATGAAGA600TTACATTTCTATACTATCACCAAAAGAGGTCAGTCTTGAT640TCTCGAGTTAGAGAGGTGATCAATAGAAATCTGTTGGATC680CCAATCCTCACATGTATGAAGATGCCCAACTTCAGATATA720TACTTTAATGCACAGAGATTCTTTTCCAAGGTTTTTGAAC760TCTCAAATTTATAAGTCATTTGTTGAAAGTACTGCTGGCT800CTTCTTCTGAATCTTAATGTTCATTTAAAAACAATCATTT840TGGAGGGCTGAGATGGGAAATAAAAGTAGTTAAATAACAT880CAGAAACTGAGTTCCTGGAGAACTACAGTTTAGCATTCCT920CAGGCTACTGTGAAAACACAACCGTTATGGTCTTTGTCTC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。