基因總覽
REXO4 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 RNA exonuclease 4。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 9q34.2。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000371942 ★ | 133,406,062–133,418,010 | 8 |
| ENST00000371935 | 133,406,059–133,418,096 | 6 |
| ENST00000903990 | 133,406,059–133,418,096 | 8 |
| ENST00000903992 | 133,406,059–133,418,096 | 7 |
| ENST00000903993 | 133,406,059–133,418,096 | 8 |
| ENST00000903994 | 133,406,059–133,418,096 | 8 |
| ENST00001021794 | 133,406,059–133,418,096 | 8 |
| ENST00001134571 | 133,406,059–133,418,096 | 8 |
| ENST00000903991 | 133,406,066–133,418,096 | 8 |
| ENST00000454825 | 133,407,006–133,417,977 | 6 |
| ENST00000445916 | 133,412,363–133,415,900 | 4 |
顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>REXO4 ENST00000371942 GRCh38 chr9:133417910-133419010 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AAATTGGCAGAGAGTGGTGGCGTGCACCTATAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCT TGAACCCAGGCGGCAGAAGTAAGGGAGGAGACCACCCCTCATATTGTCTTATGCCCAATTTCTGCTTCCA AATAAAGAAGTAAAAACTAAAAGGCAGAAATAAAATCCACAGGCAGACAGCCCGGCGCCGCGCCCTGGGC CTGGTTAAAGATCAATCCTTGACCTAACCGGTTATGTTATCTATAGATTTCAGACATTGTATGGAAAAGC ATTGTGAAAATCCCTGTCCTGTTCTGTTGCGTTCTGATTACCGGTGCATGCAGCCCCCAGTCACGTACCC CCTGCTTGCTCAATCGATCACGACCCTCTCACACAGACCCCCTTAGGGTTGTAAGCCCTTAAAAGGGACA GGAATTGCTCACTCAGAGAGCTCGGTTTTTGGAGACGTGAGTCTGCCGATGCTCCCCACTAAATAAAGCC CTTTCCTTCTACAATTCGGTGTCTGAGGGGTTCTTGTCTGCGGCTCGTCCTGCTACAGAGTGAACTGGCA GGAACTCCTCCCGGTGCCTGGGCCTCAGTTTCCCCACTGTACGTGGAAGATGAGCCGCTGTGAGGCTGAG CAAGGAGCAGCCCAAGGCGGGAAAGGCTCGAGAGTCCAGGACGCAGGCGAGCGACCTAGCCCGGCTCTCA CTAGCCCCACCGCCCAGTGCCCCCAGCTCAGCTGCCCTACCAGGTGCTACACACACAGCGGCCCCCCAGT TCCCTTCCGGCGTTCGCATCTCTCATCCCCATCCCGGATCTTGGGGAGGTCCTCGGCTTGCCCCAGTCAA ACTCGAGGTCGATGACCCCGGATGCCGCTGGCTAAGGCGGCGGCCCAAGTCCCGTGCGGGTGAACCGCCC AGGCTGCGCGGAACCAGAGGCAGGGATCCGGTTTCCAGCCGGTTGTGGAGAGACGAGCGCTTCCGGGGAC TGGAGCGTGCGTGCTGAGGTATGCGCAACGCGTGCGGGGTCTCTTCCGGAGTCTTTTCCTGGACGGGGTC CCTGCGGTGGGTGTGTTTCGGCCTGGCCTGGGCAGGCGCTTGTGCTGCCAG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| REXO4_1 ↗ | 9:133,417,983 | 負股 | 133,417,973–133,418,032 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR9_93XXRD · enhancer · 133416549–133416994 · regulatory
ENSR9_536D9S8 · CTCF_binding_site · 133417625–133417646 · regulatory
ENSR9_BZGWF · promoter · 133418000–133418586 · regulatory
ENSR9_85WWLX · enhancer · 133418699–133418831 · regulatory
ENSR9_85WWM7 · enhancer · 133419145–133419366 · regulatory
ENSR9_93XXSH · enhancer · 133420352–133420796 · regulatory
ENSR9_93XXSS · promoter · 133421543–133422010 · regulatory
· motif · 133415326–133415339 · motif
· motif · 133417235–133417250 · motif
· motif · 133417240–133417252 · motif
· motif · 133417243–133417250 · motif
· motif · 133417568–133417579 · motif
· motif · 133417627–133417643 · motif
· motif · 133417951–133417968 · motif
· motif · 133418018–133418029 · motif
· motif · 133418032–133418043 · motif
· motif · 133418034–133418043 · motif
· motif · 133418152–133418159 · motif
· motif · 133418152–133418165 · motif
· motif · 133418230–133418239 · motif
· motif · 133418263–133418272 · motif
· motif · 133419306–133419318 · motif
· motif · 133419308–133419330 · motif
· motif · 133419308–133419330 · motif
· motif · 133420259–133420274 · motif
· motif · 133420264–133420276 · motif
· motif · 133420267–133420274 · motif
· motif · 133420267–133420282 · motif
· motif · 133420334–133420349 · motif
· motif · 133420516–133420529 · motif
· motif · 133420522–133420535 · motif
· motif · 133420697–133420709 · motif
· motif · 133420807–133420819 · motif
· motif · 133421384–133421399 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：422 aa
REXO4 蛋白質長 422 個胺基酸，屬於 REXO4 family。其第 243–394 位胺基酸區段註解為 Exonuclease domain；第 1–194 位則預測為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
- DNM2P50570-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HSF2BPO75031 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HTTP42858 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NOS3P29474 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
REXO4 可與 ESR1 和 ESR2 結合。雌激素會消除這些互作，而 tamoxifen 處理會增強互作；來源未提供相關複合體或功能關係的資訊。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 交互作用 | REXO4 可與 ESR1 和 ESR2 結合；雌激素會使這些互作消失，而 tamoxifen 處理則會增強互作。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Can bind ESR1 and ESR2. This interaction is abrogated by estrogen and augmented by tamoxifen treatment |
| 細胞定位 | REXO4 定位於細胞核與核仁。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
ATGCGCAACGCGTGCGGGGTCTCTTCCGGAGTCTTTTCCT40GGACGGGGTCCCTGCGGTGGGTGTGTTTCGGCCTGGCCTG80GGCAGGCGCTTGTGCTGCCAGGGCGCCGGGCCCGGGGAGG120CCGGGGTCTCGGGTGGCCGCCGGCCCAGGCGCTGGACGGC160AGCAGGATGGGGAAGGCGAAGGTCCCCGCCTCCAAGCGCG200CCCCGAGCAGCCCCGTGGCTAAGCCGGGTCCTGTCAAGAC240GCTCACTCGGAAGAAAAACAAGAAGAAAAAAAGGTTTTGG280AAAAGCAAGGCGCGGGAAGTAAGCAAGAAGCCAGCAAGCG320GCCCCGGTGCTGTGGTGCGACCTCCAAAGGCACCAGAAGA360CTTTTCTCAAAACTGGAAGGCGCTGCAAGAGTGGCTGCTG400AAACAAAAATCTCAGGCCCCAGAAAAGCCTCTTGTCATCT440CTCAGATGGGTTCCAAAAAGAAGCCCAAAATTATCCAGCA480AAACAAAAAAGAGACCTCGCCTCAAGTGAAGGGAGAGGAG520ATGCCGGCAGGAAAAGACCAGGAGGCCAGCAGGGGCTCTG560TTCCTTCAGGTTCCAAGATGGACAGGAGGGCGCCAGTACC600TCGCACCAAGGCCAGTGGAACAGAGCACAATAAGAAAGGA640ACCAAGGAAAGGACAAATGGTGATATTGTTCCAGAACGAG680GGGACATCGAGCATAAGAAGCGGAAAGCTAAGGAGGCAGC720CCCAGCCCCACCCACCGAGGAAGACATCTGGTTTGACGAC760GTGGACCCAGCGGATATCGAAGCTGCCATAGGTCCAGAGG800CGGCCAAGATAGCGAGGAAACAGTTGGGTCAGAGCGAGGG840CAGCGTCAGCCTCAGCCTCGTGAAAGAGCAGGCCTTCGGC880GGCCTGACAAGAGCCTTAGCCTTGGACTGTGAGATGGTGG920GCGTGGGCCCTAAGGGGGAGGAGAGCATGGCCGCCCGTGT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。