演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

RECKhRECK

reversion inducing cysteine rich protein with kazal motifs

RECK(reversion inducing cysteine rich protein with kazal motifs)是 RECK family 的蛋白質,參與 Wnt7 訊號選擇性反應,並可抑制多種蛋白酶活性。

Homo sapiens9p13.3UniProt O95980
OFFICIAL SYMBOL
RECK
CHROMOSOME
9
UNIPROT
O95980
PDB / ALPHAFOLD
8TZP
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

RECK 是蛋白質編碼基因,其產物為 971 個胺基酸的 RECK family 蛋白。蛋白質具有 N 端訊號胜肽、五個 Knot repeats,以及三個 Kazal-like 結構域,呈現富含半胱胺酸與 Kazal motifs 的結構特色。來源所述的主要角色包括參與 Wnt7 訊號反應,以及調節蛋白酶活性;其具體作用方式見功能說明。

Official symbol
RECK
Gene name
reversion inducing cysteine rich protein with kazal motifs
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11345
UniProt
O95980
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
hRECKST15

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 99p13.3
chr9 · 138,394,717 bp · GRCh38chr9p24.3 · 1–2200000 · gnegchr9p24.2 · 2200001–4600000 · gpos25chr9p24.1 · 4600001–9000000 · gnegchr9p23 · 9000001–14200000 · gpos75chr9p22.3 · 14200001–16600000 · gnegchr9p22.2 · 16600001–18500000 · gpos25chr9p22.1 · 18500001–19900000 · gnegchr9p21.3 · 19900001–25600000 · gpos100chr9p21.2 · 25600001–28000000 · gnegchr9p21.1 · 28000001–33200000 · gpos100chr9p13.3 · 33200001–36300000 · gnegchr9p13.2 · 36300001–37900000 · gpos25chr9p13.1 · 37900001–39000000 · gnegchr9p12 · 39000001–40000000 · gpos50chr9p11.2 · 40000001–42200000 · gnegchr9p11.1 · 42200001–43000000 · acenchr9q11 · 43000001–45500000 · acenchr9q12 · 45500001–61500000 · gvarchr9q13 · 61500001–65000000 · gnegchr9q21.11 · 65000001–69300000 · gpos25chr9q21.12 · 69300001–71300000 · gnegchr9q21.13 · 71300001–76600000 · gpos50chr9q21.2 · 76600001–78500000 · gnegchr9q21.31 · 78500001–81500000 · gpos50chr9q21.32 · 81500001–84300000 · gnegchr9q21.33 · 84300001–87800000 · gpos50chr9q22.1 · 87800001–89200000 · gnegchr9q22.2 · 89200001–91200000 · gpos25chr9q22.31 · 91200001–93900000 · gnegchr9q22.32 · 93900001–96500000 · gpos25chr9q22.33 · 96500001–99800000 · gnegchr9q31.1 · 99800001–105400000 · gpos100chr9q31.2 · 105400001–108500000 · gnegchr9q31.3 · 108500001–112100000 · gpos25chr9q32 · 112100001–114900000 · gnegchr9q33.1 · 114900001–119800000 · gpos75chr9q33.2 · 119800001–123100000 · gnegchr9q33.3 · 123100001–127500000 · gpos25chr9q34.11 · 127500001–130600000 · gnegchr9q34.12 · 130600001–131100000 · gpos25chr9q34.13 · 131100001–133100000 · gnegchr9q34.2 · 133100001–134500000 · gpos25chr9q34.3 · 134500001–138394717 · gnegRECKpq1 bp138,394,717 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr9:36,036,896–36,124,457
Gene span
87,562 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000377966 ★36,036,913–36,124,45521
ENST0000090583236,036,905–36,124,45519
ENST0000090583336,036,905–36,124,45518
ENST0000090583436,036,905–36,124,45521
ENST0000092959436,036,905–36,124,45520
ENST0000092959536,036,905–36,124,45520
ENST0000094360836,036,905–36,124,45517
ENST0000100077836,036,905–36,086,1959
ENST0000104586336,036,905–36,069,4807
ENST0000107136536,036,905–36,086,1857
ENST0000112491736,036,905–36,086,2819
ENST0000112801136,036,905–36,066,0346

顯示 12/14 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

RECK 與 ADGRA2 協同作用,使腦內皮細胞能選擇性回應 Wnt7 訊號,包括 WNT7A 與 WNT7B。RECK 可作為 canonical Wnt signaling 的 Wnt7 特異性共活化因子:它辨識 Wnt7,並特異性結合其無序 linker 區域,藉此賦予訊號對 Wnt7 的選擇性。

在此過程中,ADGRA2 負責將與 RECK 結合的 Wnt7 傳遞至 frizzled。這涉及組成較高階的 RECK-ADGRA2-Fzd-LRP5-LRP6 複合體。此 Wnt7 特異性反應與中樞神經系統血管生成及血腦障壁調節有關;來源指出 RECK 對這些功能具有關鍵作用,但該項描述標示為 By similarity。

RECK 也具有絲胺酸蛋白酶抑制作用,並能負向調節 matrix metalloproteinase-9(MMP9):一方面抑制 MMP9 分泌,另一方面直接抑制其酵素活性。此外,RECK 也抑制 MMP2、MMP14(MT1-MMP)及 ADAM10 的金屬蛋白酶活性。來源未進一步說明這些蛋白酶調控作用與 Wnt7 訊號之間的關係。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 36036913 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>RECK ENST00000377966 GRCh38 chr9:36035913-36037013 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CCACGTAGCTGCTGGGCTGATGGGTGGGGTGGGACCCACTTCCAACTTGTCTCTTGGACAAAGTCTATAC
TTCTCAGCCGGATATTCAAGGCTTTCCACATCTAGGTATACAAGCGTTCTCCTATCCTCTTTTCCTATCA
GGAATAGGTGCTTAATAGTAACATCAAGGCCAGGCACAGTGGCTCACGCCTGCAATCCCCGTACTTTGGG
AGGAGGAGGCTGGGGGATTGCTTGAGGCGAGGAGTTCGAGACCAGCTTGAGAAATATGGTGAAACCCCTT
CTCTGCAAAAAAAATATAAAAATTAGCCAGGCGTGGTCACCTGCGCCCGTGGTCCCAGCTATTCAGGAGG
CTGAGGTGGGAGGATCGCTTGAGCCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACCC
CAGCTTGGGCGACAGAGCGACTCTTGCCTAAATAAATAAATAAATAATTTTTAAAGTACAACAAAGACAC
ATTGAGGCTATAGTGCCAAAGAGCTCTAGTGATGAACCCTTGTCAGGGGGCCGTGTCTGCGGGAGGCCGA
AGGATCCCGGGTGACATGCTTTCTTTGGGTGCGAGGCAGCGTCTCGGCAGAAAGAATATTGCGAGTATTA
CTGAGGGTACATGAAGGAGAGAAGCCCCTTTGGTTCGGCCTTGGACTAAGCCCTTGTTCTCAGGTGAACT
TGCAGTGTGATCTTGAGTAAGGTCAGTCTCCTCTCTCACCTCAGTGGCCCGAAACCTCAGGAGGTGGCAG
AGGTTTTCTAATGACTCTCCCAGCTCTGACATCCTCTGACTTCACTCTGGGAGAACGTGGGCTGGTGGAC
TCCTGGCAGAAGCCGACACACAGTTGGGCCATAACAAAGAGCCCTGGTACGGGGCACGTTCCCGCCCCCG
GGAGGTTTTGGAAACACTGTGAGGCAGGGGGCGGGGCTTGAGCGGGCCGCAGCCAGTCACCAAAGGGCCG
GGCGCTGGGGGCGGGGCCTCGCGCGAGCGGCGGCGGTAGCGGCGGCAGCGGCTGCGGCCAAGCTGGGTCC
GAGCATCCCGCGGCTCTGGAGCCGCCCGGCCCGGACATGGCGACCGTCCGG
RECK 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
RECK_1 ↗9:36,036,913正股36,036,864–36,036,923

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR9_833L9S · enhancer · 36031887–36032080 · regulatory

ENSR9_9JB6W · enhancer · 36035168–36035491 · regulatory

ENSR9_9JB79 · promoter · 36036423–36036923 · regulatory

ENSR9_C5KJT · enhancer · 36036924–36038033 · regulatory

ENSR9_5BGT76 · CTCF_binding_site · 36037031–36037052 · regulatory

ENSR9_5BGTBF · CTCF_binding_site · 36037738–36037759 · regulatory

ENSR9_5BGTC6 · CTCF_binding_site · 36037901–36037922 · regulatory

ENSR9_833LGF · enhancer · 36039750–36039999 · regulatory

ENSR9_9JB8F · enhancer · 36040428–36040850 · regulatory

ENSR9_833LHF · enhancer · 36041539–36041768 · regulatory

· motif · 36034391–36034406 · motif

· motif · 36034391–36034406 · motif

· motif · 36034392–36034406 · motif

· motif · 36034393–36034406 · motif

· motif · 36034520–36034535 · motif

· motif · 36036997–36037007 · motif

· motif · 36037033–36037049 · motif

· motif · 36037189–36037204 · motif

· motif · 36037216–36037231 · motif

· motif · 36037740–36037756 · motif

· motif · 36037903–36037919 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:971 aa

1 aa971 aa結構域功能區域重複區訊號胜肽
依 O95980 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

RECK 蛋白長 971 個胺基酸,N 端第 1–22 個胺基酸為訊號胜肽。第 37–338 位包含五個 Knot repeats;第 627–673、698–752 與 753–789 位則分別註解為 Kazal-like 1、Kazal-like 2 與 Kazal-like 3。蛋白質屬於 RECK family。

訊號胜肽1–22 aa
重複區Knot 137–84 aa
重複區Knot 2104–141 aa
重複區Knot 3151–197 aa
重複區Knot 4216–263 aa
重複區Knot 5292–338 aa
結構域Kazal-like 1627–673 aa
結構域Kazal-like 2698–752 aa
結構域Kazal-like 3753–789 aa
功能區域5 X Knot repeats37–338 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 8TZP…

PDB · 8TZP

EM · 3.23 A · C=1-971

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane

RECK 定位於細胞膜,並透過 GPI-anchor 錨定。 來源未提供定位隨條件改變或異構型差異的資料。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
hRECKRECKERBB2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

RECK 透過 Knot repeats 與 WNT7A、WNT7B 的無序 linker 區域直接結合,也與 ADGRA2 直接互作;此外,RECK 與 MMP9 有互作紀錄。RECK、ADGRA2、Fzd、LRP5 與 LRP6 可組成較高階複合體,以傳遞與 RECK 結合的 Wnt7;此複合體描述不代表來源已指出其中每一組分均與 RECK 直接結合。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能RECK 與 ADGRA2 協助腦內皮細胞選擇性回應 WNT7A 或 WNT7B,並參與中樞神經系統血管生成及血腦障壁調節;後兩項作用標示為 By similarity。RECK 特異性結合 Wnt7 的無序 linker 區域,作為 canonical Wnt signaling 的 Wnt7 特異性共活化因子;ADGRA2 再協助將 RECK 結合的 Wnt7 傳至 frizzled,並組成 RECK-ADGRA2-Fzd-LRP5-LRP6 複合體。RECK 也抑制 MMP9 分泌及其酵素活性,並抑制 MMP2、MMP14(MT1-MMP)與 ADAM10 的金屬蛋白酶活性。含實驗來源
證據與來源

Functions together with ADGRA2 to enable brain endothelial cells to selectively respond to Wnt7 signals (WNT7A or WNT7B). Plays a key role in Wnt7-specific responses: required for central nervous system (CNS) angiogenesis and blood-brain barrier regulation (By similarity). Acts as a Wnt7-specific coactivator of canonical Wnt signaling by decoding Wnt ligands: acts by interacting specifically with the disordered linker region of Wnt7, thereby conferring ligand selectivity for Wnt7. ADGRA2 is then required to deliver RECK-bound Wnt7 to frizzled by assembling a higher-order RECK-ADGRA2-Fzd-LRP5-LRP6 complex. Also acts as a serine protease inhibitor: negatively regulates matrix metalloproteinase-9 (MMP9) by suppressing MMP9 secretion and by direct inhibition of its enzymatic activity. Also inhibits metalloproteinase activity of MMP2, MMP14 (MT1-MMP) and ADAM10

PMID 18194466 ↗ · PMID 28289266 ↗ · PMID 30026314 ↗ · PMID 33731436 ↗ · PMID 9789069 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用RECK 透過 Knot repeats 與 WNT7A、WNT7B 的無序 linker 區域直接互作,也與 ADGRA2 直接互作;此外,RECK 與 MMP9 有互作紀錄。含實驗來源
證據與來源

Interacts (via knot repeats) with WNT7A (via disordered linker region); the interaction is direct. Interacts (via knot repeats) with WNT7B (via disordered linker region); the interaction is direct. Interacts with ADGRA2; the interaction is direct. Interacts with MMP9

PMID 30026314 ↗ · PMID 9789069 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位RECK 位於細胞膜,並以脂質錨定方式定位;其錨定類型為 GPI-anchor。含實驗來源
證據與來源

Cell membrane / Lipid-anchor, GPI-anchor

PMID 30026314 ↗ · PMID 33731436 ↗ · PMID 9789069 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000377966 · 4,412 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCGCGAGCGGCGGCGGTAGCGGCGGCAGCGGCTGCGGCCA40
41AGCTGGGTCCGAGCATCCCGCGGCTCTGGAGCCGCCCGGC80
81CCGGACATGGCGACCGTCCGGGCCTCTCTGCGAGGTGCGC120
121TGCTCCTTCTGCTGGCCGTGGCGGGGGTCGCGGAGGTGGC160
161AGGGGGCCTGGCTCCGGGCAGTGCGGGTGCATTGTGTTGT200
201AATCATTCAAAGGATAACCAAATGTGCCGTGATGTATGTG240
241AACAGATTTTCTCCTCAAAAAGTGAATCCCGACTAAAACA280
281TCTGTTGCAGCGAGCCCCAGATTATTGCCCAGAGACAATG320
321GTTGAAATTTGGAATTGTATGAATTCATCTTTGCCAGGTG360
361TGTTTAAGAAGTCTGATGGCTGGGTTGGCTTAGGCTGCTG400
401TGAACTGGCTATTGCCTTGGAGTGTCGACAGGCATGCAAG440
441CAGGCATCTTCAAAGAATGATATTTCCAAAGTTTGCAGAA480
481AAGAATATGAGAATGCTCTTTTCAGTTGCATTAGCAGAAA520
521TGAAATGGGCTCGGTTTGTTGCAGTTATGCAGGTCATCAC560
561ACAAACTGCCGAGAATACTGTCAAGCCATTTTTCGAACAG600
601ACTCTTCTCCTGGTCCATCTCAGATAAAAGCAGTGGAAAA640
641TTATTGCGCCTCTATTAGTCCACAATTAATACATTGTGTG680
681AACAATTATACTCAATCTTATCCAATGAGGAACCCAACGG720
721ATAGTTTATATTGCTGTGACAGAGCTGAAGACCATGCTTG760
761CCAAAATGCCTGCAAGAGAATCCTGATGTCCAAGAAAACG800
801GAAATGGAGATTGTTGATGGTCTCATCGAGGGTTGTAAGA840
841CCCAGCCCTTGCCTCAAGATCCTCTTTGGCAATGTTTTCT880
881TGAAAGCTCACAATCTGTTCACCCTGGAGTCACTGTACAC920
921CCTCCTCCCTCTACAGGCCTCGATGGGGCTAAATTGCATT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。