基因總覽
RBPJL（recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region like）是蛋白質編碼基因，產物屬於 Su(H) 家族。其蛋白質名稱為 Recombining binding protein suppressor of hairless-like protein，也稱 Transcription factor RBP-L。現有資料將其描述為推定的轉錄因子，並指出它與 EBNA2 合作活化轉錄；此處的描述不代表已確立更廣泛的作用機制。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000343694 ★ | 45,306,840–45,317,824 | 12 |
| ENST00000372741 | 45,306,840–45,317,824 | 12 |
| ENST00000372743 | 45,306,851–45,316,959 | 12 |
| ENST00000464504 | 45,314,035–45,316,959 | 5 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RBPJL 被描述為推定的轉錄因子。現有資料指出，它會與 EBNA2 合作活化轉錄，支持其參與轉錄調控的角色；不過，資料未進一步說明受調控的基因、作用所需的條件，或兩者如何協同，因此不宜將此描述延伸為特定的下游機制。
這項功能註解以「推定」描述 RBPJL 的轉錄因子身分，並將轉錄活化與 EBNA2 的合作關聯在一起。可據此概述的功能範圍僅限於與 EBNA2 合作促進轉錄，不能由此推論 RBPJL 在其他生物學過程中的作用，也無法判定這種合作是否適用於所有細胞情境。
Promoter 與基因調控
>RBPJL ENST00000343694 GRCh38 chr20:45305840-45306940 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GTCGTCCCGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCGAT TCTCCGGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCTCCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTA TTTTTAGTAGAGAGCGGGTTTTGCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCCTC CCACCTCGGCCTCCCAGAATGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCTCGGCCCACAAGAGAATGGTA AATAAGAATAGATACATAGATACAAATATGCAAAATTTAAACAGAAAAAAACAGGTCTTCCTTAAATGTC AGGCACAGTGTTAAATGCTCTTCACGCATTGTGGCATTTAATCCTCTCTGCAATTGTAAGACTAAGGCTG TGATTGTCCCCCATCATACAGACAATGAAATTGAGGCTCAGAAAAGTTAAGCGCTGGTACCCAAAGTCAT TCGGCCAAAAAGTGGCTGCGGCAGGATACAATCCCACGCCTGCTAGTTTCTGTGAGCCAGCCTGGGCGTT TGGTGCCTCTCCTCCTGCCAGGCGAACCTCTGCAGACAGAAGCCCTTCCCCACCTCGGCCCACTCCCCTA CGCACACAGGCTTCTGTGTGGCTGTCTTTGCAACTCGCCAACCCCCCCAGACCCCTCCACACACACAAAC ACAGACATGCACTGCCCAACCGCAGGCGGCAGGGAGGGGCTGCGCCCTGTTGCGGGGCTGAGCGTGGTGG CGTGGCAGCGAGTGGACCAAAACCCACTGCGCACGAGAACGCGCGGCTTGGCGCCTGTTTCCCGCCTGCT CTCAGGAGCGACCGCCAGGGGGCGCCCGAGATGGCAGGGGGCGTGGGAAGCCCACATCTGCCCAGCAGGT GCGCCCACCCCGAGCAAACAGGGGGCCGGGGCCCGGGGCCTTGGAGATAAGGCCTGGACAGGATATAACC CGCGCAAGAGCCGAGGAGCAGGGGTGTGCAGGGTTCCAGCGACAGCAGCACTGGACTCGTCCAGAGGGCG GCGGGTGAGCGGCTGGGGCCCCGTGGAGCCACCATGGACCCCGCAGGGGCA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RBPJL_1 ↗ | 20:45,306,843 | 正股 | 45,306,794–45,306,853 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR20_9MZJK · promoter · 45306417–45306861 · regulatory
ENSR20_5DMPM8 · CTCF_binding_site · 45306687–45306708 · regulatory
ENSR20_5DMPWB · CTCF_binding_site · 45308214–45308235 · regulatory
ENSR20_9MZK4 · promoter · 45308287–45308701 · regulatory
ENSR20_5DMQHN · CTCF_binding_site · 45311752–45311773 · regulatory
· motif · 45304742–45304755 · motif
· motif · 45304784–45304797 · motif
· motif · 45306689–45306705 · motif
· motif · 45306734–45306750 · motif
· motif · 45308216–45308232 · motif
· motif · 45310242–45310256 · motif
· motif · 45311308–45311318 · motif
· motif · 45311754–45311770 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：517 aa
RBPJL 蛋白質長 517 個胺基酸，屬於 Su(H) family。註解標示第 387–512 位為 IPT/TIG domain；第 26–48 位為無序區。第 78–88、193–198 與 220–225 位另標示為 DNA-binding 區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
RBPJL 的細胞定位註解為細胞核。 資料未提供定位變化的條件、動態或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- MEOX2Q6FHY5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
RBPJL 與 EBNA2 的交互作用較弱。另依序列相似性推論，RBPJL 不與任何 Notch 蛋白交互作用；此項描述屬於 By similarity，並非直接證據。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RBPJL 被描述為推定的轉錄因子，並與 EBNA2 合作活化轉錄；資料未進一步界定此合作的條件或下游標的。 | 推論支持 | |
| 交互作用 | RBPJL 與 EBNA2 的交互作用較弱；依序列相似性推論，RBPJL 不與任何 Notch 蛋白交互作用。 | 推論支持 | 證據與來源Interacts weakly with EBNA2. Does not interact with any Notch proteins (By similarity) |
| 細胞定位 | RBPJL 的定位註解為細胞核。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
GGGGTGTGCAGGGTTCCAGCGACAGCAGCACTGGACTCGT40CCAGAGGGCGGCGGGTGAGCGGCTGGGGCCCCGTGGAGCC80ACCATGGACCCCGCAGGGGCAGCAGACCCCTCAGTGCCTC120CCAATCCTTTGACTCACCTGAGCCTGCAGGACAGATCAGA160GATGCAGCTGCAGAGCGAAGCCGACAGGCGGAGCCTCCCG200GGCACTTGGACCAGGTCATCCCCAGAGCACACCACCATTC240TGAGGGGAGGCGTGCGCAGGTGCCTGCAGCAACAGTGTGA280ACAGACTGTGCGGATCCTGCATGCCAAGGTGGCCCAGAAA320TCATACGGAAATGAGAAGCGGTTCTTCTGCCCCCCGCCCT360GTGTCTACCTCTCGGGGCCTGGCTGGAGGGTGAAGCCAGG400GCAGGATCAAGCTCACCAGGCGGGGGAAACGGGGCCCACG440GTCTGCGGTTACATGGGACTGGACAGCGCGTCCGGCAGCG480CCACTGAGACGCAGAAGCTGAATTTCGAGCAGCAGCCGGA520CTCCAGGGAATTCGGCTGCGCCAAGACCCTGTACATCTCA560GATGCAGACAAGAGGAAGCACTTTCGGCTGGTGCTGCGGC600TGGTGCTGCGCGGGGGCCGGGAGCTGGGTACCTTCCACAG640CCGCCTTATCAAGGTCATCTCGAAGCCCTCGCAGAAGAAG680CAGTCGCTGAAAAACACCGATCTGTGCATATCCTCCGGCT720CAAAGGTCTCCCTCTTCAACCGCCTGCGCTCTCAGACGGT760CTCCACACGCTACCTCTCTGTGGAGGATGGGGCCTTTGTG800GCCAGTGCACGACAGTGGGCTGCCTTCACGCTCCACCTGG840CTGATGGGCACTCTGCCCAAGGAGACTTCCCACCGCGAGA880GGGCTACGTTCGCTATGGCTCCCTGGTGCAGCTCGTCTGC920ACGGTCACCGGCATCACACTACCTCCCATGATCATCCGTA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。