基因總覽
RASSF7（Ras association domain family member 7）是位於人類第 11 號染色體 11p15.5 區域的蛋白質編碼基因，所產生的蛋白質長 373 個胺基酸，屬於 Ras association domain family。其序列包含 Ras-associating 結構域，並有兩段被註記為無序區域。來源資料描述 RASSF7 具有與細胞壓力反應及有絲分裂相關的功能，並指出它與 MAP2K7 及 GTP-bound NRAS 有交互作用。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000397583 ★ | 560,970–564,025 | 6 |
| ENST00000431809 | 560,207–563,993 | 4 |
| ENST00000886265 | 560,207–564,067 | 6 |
| ENST00000989531 | 560,207–564,067 | 5 |
| ENST00000397582 | 560,922–564,012 | 4 |
| ENST00000886266 | 560,922–564,067 | 6 |
| ENST00000971581 | 560,922–564,067 | 6 |
| ENST00000989532 | 560,922–564,067 | 5 |
| ENST00001096344 | 560,922–564,067 | 5 |
| ENST00000454668 | 560,959–564,067 | 5 |
| ENST00001121181 | 560,959–564,067 | 5 |
| ENST00001140546 | 560,959–564,067 | 6 |
顯示 12/19 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RASSF7 參與調節壓力誘發的 JNK 活化與細胞凋亡。在此過程中，它促進 MAP2K7 磷酸化，同時抑制 MAP2K7 活化 JNK 的能力，因此對壓力誘發的 JNK 訊號具有負向調節作用，並呈現抗凋亡效果。
這項抗凋亡作用會隨壓力持續時間而改變。壓力延長後，RASSF7 蛋白質經由 ubiquitin-proteasome pathway 降解，其抗凋亡效果也隨之停止。來源所述的調節結果因此具有時間條件，並非在延長壓力下持續維持。
RASSF7 也參與有絲分裂期間的 AURKB 活化與染色體排列。它會刺激微管聚合，並且對 AURKB 活化及染色體 congression 為必要；這些作用將 RASSF7 的功能連結至有絲分裂中的染色體排列過程。來源並未進一步說明這些作用如何與其壓力反應功能相互協調。
Promoter 與基因調控
>RASSF7 ENST00000397583 GRCh38 chr11:559970-561070 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TGACCCCCAAACTGAAGCCTCACTTTTCCCAGCCGTGTCCACACCCTCTGGGCTACCCCATTACCATGAC AAGTATTCCCTCTGCTCCAGGAGAAAAGCCAGGTCCCAGACCTGACCCATTAAAACCCAATCATTCCAGC TTTCACCCTTCATCTCTGCAACTTTCGGCTATGTAAGGGCTCCCTGGGGGAGCACAGGAGACAGGCGGGC AGGAGGCCCACGCCCACAACTCTTTCTGAGCTGGGCAGAACAATCAATGGCCCACACAGCTGACCGCGAG GCTGCGGGGCCCTGGGCGGGACAGTAGGGTAGGGGGTGAAGGAGCGGCTTCCAGCCAGCTTCACTGTGTG CATGGCCTGGCACTGGGTCCAAAAGGGGCAGGAAGGTGTCGGAGAAGAGCCTCAGCTAGAGTCCGGGCCT TCTGAGCGGGCACCTCCCGCACCAGGACTCTGCGCCCGCCAGCTCCGCAGGGCTCCACCTCCCTCGCCGG GACTGGTGACCCTGCGACCCCGCGACCCCTGCGCGTCCAGACTACTGCAGCTGCGGTAGGCCCCAAAGGC TGGCCCGGGAAGCGAGGGGAGGGGCTGGCCCCGCTGCCCCTGGACGCAGGCGGGGGTTGCGGGATCTCAA GCCAGAGACCCTTCCTGGGCGGGAACCCGCCACACTAGAAGGCTGCTGAGGAAGTCGGCCCAGGAGCGGG GCCAGACACCTACCCCGACGCCTGCCCGCGGGCCGCAGCCACCGCATTTCCGCGTTTTTCGCGGTAGGCG GGAGGTGGGGGCGGGGACTGCGGCTCGGCGCCCCCCTCCGACCCGCCCACACCTGTAGTCTCGGGGGGGG CGGGGCGCGGCGACGAGCCAATGGGTCGGGGAGGGGCGTGACAGAGGCAGCCAATGGGCGCGGGGAGGGG GCGGAACGCCCGCGCTGAGCAGCCAATAGGGGTGCTAGGGGCGGGGCGTGCGGACCGCGGGCCAATGGGG GCGCGGGGCCCGGGTGCGCCGCGGCGCTGGGGGCGGCAGGTTGCGGCGGCGCCGGAGCGGGTCTCCAGGC TGGCGAGCGCCCAGGTGAGCCGCGCCGGGTCCCCGGTACTTGGGAGCGCGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 4 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RASSF7_3 ↗ | 11:555,285 | 正股 | 555,236–555,295 |
| RASSF7_4 ↗ | 11:559,475 | 正股 | 559,426–559,485 |
| RASSF7_2 ↗ | 11:560,235 | 正股 | 560,186–560,245 |
| RASSF7_1 ↗ | 11:560,987 | 正股 | 560,938–560,997 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR11_97Z9 · promoter · 557105–557605 · regulatory
ENSR11_97ZM · promoter · 558402–558902 · regulatory
ENSR11_9824 · promoter · 559914–560414 · regulatory
ENSR11_55K48 · CTCF_binding_site · 560344–560365 · regulatory
ENSR11_B526 · promoter · 560728–561460 · regulatory
ENSR11_55K66 · CTCF_binding_site · 560764–560785 · regulatory
ENSR11_55K8W · CTCF_binding_site · 561350–561371 · regulatory
ENSR11_B52L · enhancer · 563776–564523 · regulatory
ENSR11_B52W · enhancer · 565753–566563 · regulatory
· motif · 556653–556660 · motif
· motif · 556698–556710 · motif
· motif · 556796–556809 · motif
· motif · 556909–556922 · motif
· motif · 560346–560362 · motif
· motif · 560462–560474 · motif
· motif · 560465–560480 · motif
· motif · 560473–560488 · motif
· motif · 560692–560707 · motif
· motif · 560699–560716 · motif
· motif · 560714–560725 · motif
· motif · 560714–560725 · motif
· motif · 560719–560736 · motif
· motif · 560740–560750 · motif
· motif · 560741–560754 · motif
· motif · 560746–560756 · motif
· motif · 560766–560782 · motif
· motif · 560779–560789 · motif
· motif · 560781–560794 · motif
· motif · 560800–560813 · motif
· motif · 560805–560815 · motif
· motif · 560836–560846 · motif
· motif · 560841–560851 · motif
· motif · 560871–560884 · motif
· motif · 560916–560926 · motif
· motif · 560946–560956 · motif
· motif · 560948–560958 · motif
· motif · 560989–561002 · motif
· motif · 560997–561013 · motif
· motif · 561136–561149 · motif
· motif · 561152–561161 · motif
· motif · 561352–561368 · motif
· motif · 561856–561867 · motif
· motif · 561858–561867 · motif
· motif · 561905–561912 · motif
· motif · 562918–562930 · motif
· motif · 562920–562927 · motif
· motif · 562920–562935 · motif
· motif · 563004–563016 · motif
· motif · 563006–563013 · motif
· motif · 563006–563021 · motif
· motif · 563090–563102 · motif
· motif · 563092–563099 · motif
· motif · 563092–563105 · motif
· motif · 563092–563107 · motif
· motif · 564514–564526 · motif
· motif · 564516–564531 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：373 aa
RASSF7 蛋白質長 373 個胺基酸。其第 6 至 89 位胺基酸含 Ras-associating 結構域；第 122 至 150 位及第 300 至 356 位則被註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
RASSF7 被註記位於細胞質、細胞骨架、微管組織中心及中心體，並與 gamma-tubulin 共定位。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- NCK2O43639 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- SNAP29O95721 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
RASSF7 與 MAP2K7 及 GTP-bound NRAS 有交互作用。來源未進一步說明這些交互作用是否構成特定複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RASSF7 負向調節壓力誘發的 JNK 活化與細胞凋亡：它促進 MAP2K7 磷酸化，並抑制 MAP2K7 活化 JNK 的能力。壓力持續較久後，RASSF7 會經由 ubiquitin-proteasome pathway 降解，抗凋亡作用因而停止。此外，RASSF7 促進微管聚合，且對有絲分裂期間的 AURKB 活化與染色體排列為必要。 | 含實驗來源 | 證據與來源Negatively regulates stress-induced JNK activation and apoptosis by promoting MAP2K7 phosphorylation and inhibiting its ability to activate JNK. Following prolonged stress, anti-apoptotic effect stops because of degradation of RASSF7 protein via the ubiquitin-proteasome pathway. Required for the activation of AURKB and chromosomal congression during mitosis where it stimulates microtubule polymerization PMID 20629633 ↗ · PMID 21278800 ↗ |
| 交互作用 | RASSF7 與 MAP2K7 及 GTP-bound NRAS 有交互作用。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | RASSF7 位於細胞質、細胞骨架、微管組織中心及中心體，並與 gamma-tubulin 共定位。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center, centrosome; Colocalizes with gamma-tubulin PMID 20629633 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GCGGCGCTGGGGGCGGCAGGTTGCGGCGGCGCCGGAGCGG40GTCTCCAGGCTGGCGAGCGCCCAGGTGAGCCGCGCCGGGT80CCCCGGTACTTGGGAGCGCGGGGCGCGCCTCGAGCCGGCC120GGACGCCGACTCCAACTGGGGAGAGTTTTCCGCGATGCCC160GGACGGAGAGCGGGGGCGGCGCCGCACCTGCGCCCGCCCT200GCGGAACGGGGACGCCCTGGCTCCCGCCAGGCTGGGGTCG240CGGCGCGGGCTTCGGTGCCCGCGGCGGGGACCGGGACTTT280CGGGGCGAGCGCAGCGATTAGGCGGCAGCGGCGGGGCTCC320CCGGGCTGGCGGGGGCTGCTCAGACCCGGAGTCTGCTCCA360TCTGCAGGGTCGAGGTCTGGGTTGCGACCCCGAGCGCCTC400TGCGGCCTGAGCAGGTCGGGGTGGGGCGTTCCCATGCCGG440CGGCCGCGGGGCCTGGCGTGCGGGCGCCTCCGCGCCGCCC480GGGGAGGGGGCAGTGTCCTCCGAGCCAGGACAGGCATGTT520GTTGGGACTGGCGGCCATGGAGCTGAAGGTGTGGGTGGAT560GGCATCCAGCGTGTGGTCTGTGGGGTCTCAGAGCAGACCA600CCTGCCAGGAAGTGGTCATCGCACTAGCCCAAGCAATAGG640CCAGACTGGCCGCTTTGTGCTTGTGCAGCGGCTTCGGGAG680AAGGAGCGGCAGTTGCTGCCACAAGAGTGTCCAGTGGGCG720CCCAGGCCACCTGCGGACAGTTTGCCAGCGATGTCCAGTT760TGTCCTGAGGCGCACAGGGCCCAGCCTAGCTGGGAGGCCC800TCCTCAGACAGCTGTCCACCCCCGGAACGCTGCCTAATTC840GTGCCAGCCTCCCTGTAAAGCCACGGGCTGCGCTGGGCTG880TGAGCCCCGCAAAACACTGACCCCCGAGCCAGCCCCCAGC920CTCTCACGCCCTGGGCCTGCGGCCCCTGTGACACCCACAC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。