基因總覽
RASSF3 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 Ras association domain family member 3。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 12q14.2。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000542104 ★ | 64,610,495–64,697,564 | 5 |
| ENST00000637125 | 64,507,001–64,694,912 | 6 |
| ENST00000636333 | 64,533,268–64,541,705 | 2 |
| ENST00000899845 | 64,610,439–64,697,566 | 6 |
| ENST00000951679 | 64,610,439–64,697,566 | 5 |
| ENST00000951680 | 64,610,439–64,697,566 | 2 |
| ENST00001135107 | 64,610,439–64,697,566 | 5 |
顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>RASSF3 ENST00000542104 GRCh38 chr12:64609495-64610595 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGCTTCAAAAAAACCTTTCAGTCAAGATCTTGAAATTAGTATTATTTAAATCAGTGCAGTAACACCAAGG TGTAAAAGACTGTTACCCACTGGTGGCTTTAAGAGGATTAGCTGACTGAAGAGTTTTAGAAAACATGGAA ACTTTTTTTGTACGTGGATGGATGGAATTCCCTGATCTCCTTATCCCCACCACTTAAACCATGCCTTGTG GGTGACCGTGGAAGGCTGATTGTGGCGGGGACATTTACAAAGCACATTTAATTGATAAGCACTCGATTGT TCTGTAACTATAGAACTAGTTCACCTTTCAGTTGCACTGAGTGCGCCTAAGATAACGATCTTATTTGGAA GTGAGCCCTCGCTAGAAAGAAGGGGAAAAGGGTAAGACCGAAGCTCAAATGAATGACCAGAAAGGATGTT TTCATTCGAATAAACTCAACCCAGTTTTTGACCTCCCCACCCATCTCTGCCAACTTGAAATCCTCCTGGA GGGGCGAGCTGCTGGGGTTCAGGACTGGGCGTTGCGGCTGCAGGAAGCCGTGGGACCTGGGGGGTCCCTC GGCCGGGCAACCCCCACCCACCCCTACAGGACCCTGGTGCGGGGGCGAGCAGGGAGTGGACGCAGAGAAA GTTCCCCGCTCTGCTCCCGCCCTCTCCGAAACTCGAGCCAGCGAGGCTGGGGGCGGGCGGACGGCTCGCA GAGGAATTTGCAGTTTCCGGGAGGTTGAGGAAGCGACCCGAGCACAGCCCCAGCAGACGCAGCCCTAGCG CCCGGCTTTCCGGGTTCCGCGACGCTGTCGGGAGAAACCCGCGCGCCTGGAAGGGGCGGGCCGGGCTCCC CCCACCTGCGGGCGGGCGGGGAGGGTCGCGGCCGCGCGGGGTGGGGCTCGGCCGGTCGCCCGTCCGGGGC GGGGCCCAGGGAGGCGGGGTCGCGGGCGCACCGGGGCCGAGCCGCGCCTGGAGCCTGGCGGGGAGGCGGC AGGAGGGGCCGGGAGAGCCTGATTGAGCGGCGGCCGCAGCTGCATAAGGACTGCCCGGGGCTGCGCGCCG GGAACCTCGCGGGGCTGGCGGGCGCCGCACCCCCTCCCTGGCCGCCTGCGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RASSF3_1 ↗ | 12:64,610,495 | 正股 | 64,610,446–64,610,505 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR12_C8F4M · enhancer · 64608070–64609448 · regulatory
ENSR12_9XMDX · promoter · 64609449–64609949 · regulatory
ENSR12_9XMF4 · promoter · 64610005–64610505 · regulatory
ENSR12_C8F4T · enhancer · 64610506–64612456 · regulatory
ENSR12_5K7BN5 · CTCF_binding_site · 64610803–64610824 · regulatory
ENSR12_5K7BRQ · CTCF_binding_site · 64611582–64611603 · regulatory
· motif · 64609005–64609014 · motif
· motif · 64609005–64609014 · motif
· motif · 64609561–64609573 · motif
· motif · 64610009–64610024 · motif
· motif · 64610067–64610080 · motif
· motif · 64610090–64610103 · motif
· motif · 64610269–64610280 · motif
· motif · 64610335–64610344 · motif
· motif · 64610389–64610405 · motif
· motif · 64610682–64610699 · motif
· motif · 64610741–64610757 · motif
· motif · 64610741–64610757 · motif
· motif · 64610805–64610821 · motif
· motif · 64610818–64610827 · motif
· motif · 64610818–64610827 · motif
· motif · 64611017–64611032 · motif
· motif · 64611207–64611214 · motif
· motif · 64611248–64611261 · motif
· motif · 64611584–64611600 · motif
· motif · 64611961–64611969 · motif
· motif · 64612219–64612232 · motif
· motif · 64612366–64612381 · motif
· motif · 64612539–64612554 · motif
· motif · 64612991–64613013 · motif
· motif · 64612991–64613013 · motif
· motif · 64613384–64613396 · motif
· motif · 64615173–64615184 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：238 aa
RASSF3 蛋白質長 238 個胺基酸，含有 Ras-associating domain（第 79–186 位）及 SARAH domain（第 187–234 位）。第 26–48 位另註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
RASSF3 定位於細胞質及細胞骨架；在血管內皮細胞中，另有定位於微管的註記。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 15 個夥伴
- CBX8Q9HC52 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DAXXQ9UER7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FAM110AQ9BQ89 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ITPRIPQ8IWB1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KDM1AO60341 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KYNUQ16719-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LITAFQ99732 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- PARD6BQ9BYG5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RPRD1BQ9NQG5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- STK3Q13188 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- STK4Q13043 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- TENT5DQ8NEK8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TFRCP02786 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRIM59Q8IWR1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF410Q86VK4-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 細胞定位 | RASSF3 被註記位於細胞質與細胞骨架；在血管內皮細胞中，另有定位於微管的記錄。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm; Cytoplasm, cytoskeleton; Localized to microtubules in vascular endothelial cells PMID 15569673 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GATTGAGCGGCGGCCGCAGCTGCATAAGGACTGCCCGGGG40CTGCGCGCCGGGAACCTCGCGGGGCTGGCGGGCGCCGCAC80CCCCTCCCTGGCCGCCTGCGCCCCGGGGAGGCCGCCCGCG120CGCGACGGGACCGGCAGCATGAGCAGCGGCTACAGCAGCC160TGGAGGAGGACGCCGAGGACTTCTTCTTCACCGCCAGGAC200CTCCTTCTTCAGGAGAGCGCCCCAGGGCAAGCCCCGCTCC240GGCCAACAAGATGTTGAGAAAGAGAAGGAAACCCACAGTT280ACCTCAGCAAAGAGGAGATCAAAGAGAAAGTTCATAAATA320CAACTTAGCAGTCACAGACAAGTTGAAGATGACCTTGAAT360TCAAATGGGATTTACACTGGCTTCATTAAAGTACAGATGG400AACTCTGCAAACCTCCACAGACTTCTCCAAATTCTGGAAA440ACTCTCTCCCAGTAGCAATGGCTGTATGAATACACTTCAT480ATCAGCAGCACAAACACTGTCGGGGAAGTGATCGAGGCCC520TGCTCAAAAAGTTTCTCGTGACTGAGAGCCCTGCCAAGTT560TGCACTTTATAAGCGTTGTCACAGGGAAGACCAAGTCTAC600GCCTGCAAGCTCTCAGACCGGGAACATCCACTCTACCTGC640GTTTGGTAGCAGGGCCCAGAACAGACACACTTAGTTTTGT680TCTTCGTGAACATGAAATTGGAGAGTGGGAAGCCTTCAGC720CTTCCAGAACTACAGAATTTCTTGCGCATCTTGGACAAGG760AAGAAGATGAACAGCTGCAGAACCTGAAGAGGCGCTACAC800AGCCTACAGGCAGAAGCTGGAAGAAGCCCTCCGTGAGGTG840TGGAAGCCTGATTAAAGCGGGGCTCCCTGCCCGTGAGGCC880CGGTGCAGGACCGATGTACAAAACAGCAGCAAGTGCCTCT920CTTCTCAGAGGGCTGCTGTCTTGCCCCACTATGCTAGGGT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。