演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

RASGRP3KIAA0846

RAS guanyl releasing protein 3

RASGRP3(RAS guanyl releasing protein 3)是蛋白質編碼基因,其產物屬於 RASGRP 家族,具備促進 Ras 與 Rap1 進行鳥嘌呤核苷酸交換的功能。

Homo sapiens2p22.3UniProt Q8IV61
OFFICIAL SYMBOL
RASGRP3
CHROMOSOME
2
UNIPROT
Q8IV61
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

RASGRP3(RAS guanyl releasing protein 3)是蛋白質編碼基因,所屬蛋白質家族為 RASGRP。來源將其產物描述為 Ras 與 Rap1 的鳥嘌呤核苷酸交換因子(GEF),顯示其基本分子角色與這兩種小型 GTPase 的核苷酸交換有關。可用資料未提供其他蛋白質基本性質或家族特徵,因此不進一步推述。

Official symbol
RASGRP3
Gene name
RAS guanyl releasing protein 3
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14545
UniProt
Q8IV61
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
KIAA0846GRP3CalDAG-GEFIII

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 22p22.3
chr2 · 242,193,529 bp · GRCh38chr2p25.3 · 1–4400000 · gnegchr2p25.2 · 4400001–6900000 · gpos50chr2p25.1 · 6900001–12000000 · gnegchr2p24.3 · 12000001–16500000 · gpos75chr2p24.2 · 16500001–19000000 · gnegchr2p24.1 · 19000001–23800000 · gpos75chr2p23.3 · 23800001–27700000 · gnegchr2p23.2 · 27700001–29800000 · gpos25chr2p23.1 · 29800001–31800000 · gnegchr2p22.3 · 31800001–36300000 · gpos75chr2p22.2 · 36300001–38300000 · gnegchr2p22.1 · 38300001–41500000 · gpos50chr2p21 · 41500001–47500000 · gnegchr2p16.3 · 47500001–52600000 · gpos100chr2p16.2 · 52600001–54700000 · gnegchr2p16.1 · 54700001–61000000 · gpos100chr2p15 · 61000001–63900000 · gnegchr2p14 · 63900001–68400000 · gpos50chr2p13.3 · 68400001–71300000 · gnegchr2p13.2 · 71300001–73300000 · gpos50chr2p13.1 · 73300001–74800000 · gnegchr2p12 · 74800001–83100000 · gpos100chr2p11.2 · 83100001–91800000 · gnegchr2p11.1 · 91800001–93900000 · acenchr2q11.1 · 93900001–96000000 · acenchr2q11.2 · 96000001–102100000 · gnegchr2q12.1 · 102100001–105300000 · gpos50chr2q12.2 · 105300001–106700000 · gnegchr2q12.3 · 106700001–108700000 · gpos25chr2q13 · 108700001–112200000 · gnegchr2q14.1 · 112200001–118100000 · gpos50chr2q14.2 · 118100001–121600000 · gnegchr2q14.3 · 121600001–129100000 · gpos50chr2q21.1 · 129100001–131700000 · gnegchr2q21.2 · 131700001–134300000 · gpos25chr2q21.3 · 134300001–136100000 · gnegchr2q22.1 · 136100001–141500000 · gpos100chr2q22.2 · 141500001–143400000 · gnegchr2q22.3 · 143400001–147900000 · gpos100chr2q23.1 · 147900001–149000000 · gnegchr2q23.2 · 149000001–149600000 · gpos25chr2q23.3 · 149600001–154000000 · gnegchr2q24.1 · 154000001–158900000 · gpos75chr2q24.2 · 158900001–162900000 · gnegchr2q24.3 · 162900001–168900000 · gpos75chr2q31.1 · 168900001–177100000 · gnegchr2q31.2 · 177100001–179700000 · gpos50chr2q31.3 · 179700001–182100000 · gnegchr2q32.1 · 182100001–188500000 · gpos75chr2q32.2 · 188500001–191100000 · gnegchr2q32.3 · 191100001–196600000 · gpos75chr2q33.1 · 196600001–202500000 · gnegchr2q33.2 · 202500001–204100000 · gpos50chr2q33.3 · 204100001–208200000 · gnegchr2q34 · 208200001–214500000 · gpos100chr2q35 · 214500001–220700000 · gnegchr2q36.1 · 220700001–224300000 · gpos75chr2q36.2 · 224300001–225200000 · gnegchr2q36.3 · 225200001–230100000 · gpos100chr2q37.1 · 230100001–234700000 · gnegchr2q37.2 · 234700001–236400000 · gpos50chr2q37.3 · 236400001–242193529 · gnegRASGRP3pq1 bp242,193,529 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr2:33,436,267–33,586,669
Gene span
150,403 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000403687 ★33,476,649–33,564,73118
ENST0000040253833,436,267–33,566,34919
ENST0000088467533,436,267–33,567,23219
ENST0000088467633,436,267–33,564,60321
ENST0000088467733,436,267–33,563,69020
ENST0000096727533,436,267–33,564,58920
ENST0000096727633,436,267–33,564,58719
ENST0000096727733,436,267–33,564,59819
ENST0000096727833,436,267–33,563,05719
ENST0000088467833,447,868–33,564,59917
ENST0000088467933,457,776–33,566,02318
ENST0000096727933,458,035–33,564,71819

顯示 12/47 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

RASGRP3 的產物是 Ras 與 Rap1 的鳥嘌呤核苷酸交換因子(GEF)。這項功能將其與兩種小型 GTPase 的核苷酸交換相連,說明其分子角色是協助 Ras 和 Rap1 進行此類交換。現有資料未進一步說明交換過程的具體步驟、調控條件或下游效應,因此不據此延伸描述更詳細的作用機制或生物學結果。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 33476649 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>RASGRP3 ENST00000403687 GRCh38 chr2:33475649-33476749 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TCCAAGGTCAGACACTACGTAAAGTCAGATACTTCAAGGGCTTTCCTTGGAAGGGAGGATGAAAAGGGAA
GGGTGGGAACATCAGCTCAGGTGAGACATATGAATTCAACAAAACATCAGGGATGGTTTGCCACGTTTGC
GAGCAGCACAGAAAACGGCAGTTTGCTCCAAGTTCCCAGCACACCAAAGGGGGCAGTAGTGCGTCTGTAA
AGCGCGTTGTCAACTTGGTGATAATTTCTGTTTGCATTCACACTCGCCGGCTGATAATCTCAGCTGCTCG
ATGCAATTCAACAGATAACAATGCGGAAGTTTGGTCTAAAGCTACCTGAAATCACTTCCAAGAGCTCTTC
AGATAAAGCTGCCTTTGATAGTCTTCATTAACCCCTCCCATATTTGCCCCTCAGCGTCCCTTGGCTTAGC
AGCCCCGGCCTTTGAAGTCCAACCTAAGCATTCTTAGATGGTGAGTGAGGGTCTGCCTTCCCCAGCACCA
GCCACCTAGTCAGGCTTGTGGCTCGTCTAACAAACTGGAGCCTGAGATTCTGAGAAAACGAAACCAAACA
GTTGTACTCCGGGGTTAACACAGAGCAACTTCCACCTGCTGTGCGAGTTGGTGATCCTCTCTCTTGCCGT
TCGAGAGCCCCAGTGAAACTTGAGTGAGATGAGAGAGCATGGAGCCTGCCAGTCTCCCCCTCTGCGCACA
CACACACGCAAACACATTTAACTTTCCACTTGCAGTGACCTGCCCTTCAGTGTGACTTATCAGCTGTTTG
GCTTTTGTCACTAAAGGAAAACAAATTGTGGAATATCCCGCTCTGCATGCTCATGAGATGGCTGAGCCAA
CTCAGGGGTTATGAGGTGGTTTGCGAGTGAGGAGAAGAATGATCTTCAGTTTCTGACCTCCTGGCACGGT
GGCGGGCGGTATTTATCAGGAGGTACATGTGACTGGTTAAGACTCAGAGCCCCAGCTTGAAGGAAACAGC
TGCTCTCGGCGTGCTCCGGCACTTGGCAGCTGGACAGGCAGAGTGCTGATGTGAAAAATACCACGACAAA
ACCACCCTAGTAAGTAACTGGAGAACTTTCCTCTCTCTCTCTCTCTTTCAT
RASGRP3 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 4 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
RASGRP3_4 ↗2:33,436,272正股33,436,223–33,436,282
RASGRP3_2 ↗2:33,436,373正股33,436,324–33,436,383
RASGRP3_3 ↗2:33,476,251正股33,476,202–33,476,261
RASGRP3_1 ↗2:33,476,649正股33,476,600–33,476,659

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR2_59TKS7 · CTCF_binding_site · 33474635–33474656 · regulatory

ENSR2_9H9QG · promoter · 33476156–33476659 · regulatory

ENSR2_C5BNN · enhancer · 33476660–33478494 · regulatory

ENSR2_B8MDN · enhancer · 33479108–33479993 · regulatory

· motif · 33474637–33474653 · motif

· motif · 33475196–33475207 · motif

· motif · 33475200–33475214 · motif

· motif · 33475407–33475418 · motif

· motif · 33475456–33475468 · motif

· motif · 33475507–33475520 · motif

· motif · 33475507–33475520 · motif

· motif · 33475508–33475521 · motif

· motif · 33475508–33475521 · motif

· motif · 33475887–33475902 · motif

· motif · 33475948–33475959 · motif

· motif · 33475948–33475959 · motif

· motif · 33476239–33476248 · motif

· motif · 33476397–33476412 · motif

· motif · 33476397–33476412 · motif

· motif · 33476493–33476508 · motif

· motif · 33476541–33476548 · motif

· motif · 33476541–33476556 · motif

· motif · 33477751–33477764 · motif

· motif · 33477751–33477764 · motif

· motif · 33477815–33477828 · motif

· motif · 33477997–33478010 · motif

· motif · 33478053–33478068 · motif

· motif · 33478137–33478154 · motif

· motif · 33478324–33478339 · motif

· motif · 33478349–33478364 · motif

· motif · 33478703–33478718 · motif

· motif · 33479141–33479163 · motif

· motif · 33479141–33479163 · motif

· motif · 33479838–33479850 · motif

· motif · 33480019–33480030 · motif

· motif · 33480019–33480030 · motif

· motif · 33480136–33480148 · motif

· motif · 33480424–33480432 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:690 aa

1 aa690 aa結構域功能區域鋅指
依 Q8IV61 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

RASGRP3 蛋白長 690 個胺基酸,屬於 RASGRP 家族。其序列註解包含兩個 Ras-GEF 相關結構域、兩個 EF-hand、Phorbol-ester/DAG-type zinc finger,以及位於胺基酸 667–690 的無序區域。N-terminal Ras-GEF 位於胺基酸 3–125,另一個 Ras-GEF 結構域位於 152–383。

結構域N-terminal Ras-GEF3–125 aa
結構域Ras-GEF152–383 aa
結構域EF-hand 1420–455 aa
結構域EF-hand 2458–484 aa
鋅指Phorbol-ester/DAG-type494–544 aa
功能區域Disordered667–690 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q8IV61…

AlphaFold · Q8IV61

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 3 個夥伴 · 最多顯示 50 個
KIAA0846RASGRP3DYNLL2GET1HSD17B11
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

1 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 1 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能RASGRP3 產物是 Ras 與 Rap1 的鳥嘌呤核苷酸交換因子(GEF);此描述指出其分子功能涉及這兩種蛋白質的核苷酸交換,但未提供具體作用條件或下游結果。含實驗來源
證據與來源

Guanine nucleotide exchange factor (GEF) for Ras and Rap1

PMID 10934204 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 1 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000403687 · 4,386 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACTTGGCAGCTGGACAGGCAGAGTGCTGATGTGAAAAATA40
41CCACGACAAAACCACCCTAGTTCTCCAAAATACTTATCAT80
81TCAGGTTGAATAAACCAGTTCTACAGACTGCTTCTTCCAT120
121GCATTTCCCAATGATGCTAGCTGCCCTTAAAATTCTTTCA160
161GATTTGGAACTGTATCTGTATGGAAACAACAGAGTTTTCT200
201TGAAGTACAACTAAGGACAGGTCACCACTAGGCACTAACA240
241TCGCTGACTTGCATGATTATGGAGATGGTCTATCTGATGC280
281TGAAAATGTCTCTAGTTTTTTGACAACGGCTAAATAACCA320
321TGGGATCAAGTGGCCTTGGGAAAGCAGCAACATTAGATGA360
361ACTGCTGTGCACTTGCATTGAGATGTTTGATGACAATGGA400
401GAGCTGGATAATAGTTATTTGCCAAGAATAGTTCTACTGA440
441TGCACCGATGGTATTTATCTTCCACTGAATTGGCAGAAAA480
481ACTTCTCTGCATGTATCGAAATGCCACTGGAGAAAGCTGC520
521AATGAATTTCGATTAAAGATCTGCTACTTCATGAGGTACT560
561GGATTCTGAAGTTTCCTGCAGAGTTTAATTTGGATCTTGG600
601TTTGATTCGTATGACTGAGGAATTTCGGGAAGTAGCTAGT640
641CAACTAGGATATGAAAAACACGTCAGCCTCATCGACATAT680
681CCAGCATTCCTTCCTATGACTGGATGAGAAGAGTCACACA720
721GAGGAAAAAAGTATCCAAGAAGGGAAAAGCCTGTCTGCTG760
761TTTGACCATCTGGAGCCCATTGAATTGGCTGAGCACCTCA800
801CTTTTCTGGAGCATAAATCTTTTAGAAGGATCTCATTCAC840
841TGATTACCAAAGCTATGTCATCCATGGCTGCCTGGAGAAT880
881AATCCAACCTTGGAAAGATCGATTGCTTTATTTAATGGAA920
921TCTCTAAGTGGGTCCAGTTGATGGTTCTTAGCAAACCAAC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。