演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

RAB26

RAB26, member RAS oncogene family

RAB26 是 Rab 小型 GTPase,參與膜運輸,並與分泌顆粒成熟及特定分泌作用相關。

Homo sapiens16p13.3UniProt Q9ULW5
OFFICIAL SYMBOL
RAB26
CHROMOSOME
16
UNIPROT
Q9ULW5
PDB / ALPHAFOLD
2G6B
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

RAB26, member RAS oncogene family 是由 RAB26 基因編碼的蛋白質,屬於小型 GTPase 超家族中的 Rab 家族。Rab 蛋白質參與細胞內膜運輸;RAB26 的來源註解則涵蓋高基氏體至細胞膜的運輸,以及分泌顆粒相關作用。其蛋白質長度為 256 個胺基酸,序列包含標註為無序的區域,以及 Switch 1 和 Switch 2 基序。這些特徵提供其家族與序列層面的基本資訊;特定運輸及分泌作用的描述見功能段落。

Official symbol
RAB26
Gene name
RAB26, member RAS oncogene family
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14259
UniProt
Q9ULW5
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1616p13.3
chr16 · 90,338,345 bp · GRCh38chr16p13.3 · 1–7800000 · gnegchr16p13.2 · 7800001–10400000 · gpos50chr16p13.13 · 10400001–12500000 · gnegchr16p13.12 · 12500001–14700000 · gpos50chr16p13.11 · 14700001–16700000 · gnegchr16p12.3 · 16700001–21200000 · gpos50chr16p12.2 · 21200001–24200000 · gnegchr16p12.1 · 24200001–28500000 · gpos50chr16p11.2 · 28500001–35300000 · gnegchr16p11.1 · 35300001–36800000 · acenchr16q11.1 · 36800001–38400000 · acenchr16q11.2 · 38400001–47000000 · gvarchr16q12.1 · 47000001–52600000 · gnegchr16q12.2 · 52600001–56000000 · gpos50chr16q13 · 56000001–57300000 · gnegchr16q21 · 57300001–66600000 · gpos100chr16q22.1 · 66600001–70800000 · gnegchr16q22.2 · 70800001–72800000 · gpos50chr16q22.3 · 72800001–74100000 · gnegchr16q23.1 · 74100001–79200000 · gpos75chr16q23.2 · 79200001–81600000 · gnegchr16q23.3 · 81600001–84100000 · gpos50chr16q24.1 · 84100001–87000000 · gnegchr16q24.2 · 87000001–88700000 · gpos25chr16q24.3 · 88700001–90338345 · gnegRAB26pq1 bp90,338,345 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr16:2,140,803–2,154,165
Gene span
13,363 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000210187 ★2,148,625–2,154,1659
ENST000005414512,148,144–2,153,42110
ENST000008800622,148,604–2,154,1399
ENST000008800632,148,604–2,154,1418
ENST000008800642,148,604–2,154,1379
ENST000009272072,148,604–2,154,1398
ENST000009746502,148,604–2,154,1419
ENST000009746522,148,604–2,154,1399
ENST000009746532,148,604–2,154,1399
ENST000011173272,148,604–2,154,1399
ENST000011231842,148,604–2,154,1419
ENST000011381022,148,604–2,154,1659

顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

Rab 小型 GTPase 參與細胞內膜運輸,作用範圍從運輸囊泡形成延伸至囊泡與膜融合。Rab 蛋白在結合 GDP 的非活化形式與結合 GTP 的活化形式之間循環;活化形式可招募不同的下游效應蛋白至膜上,這些效應蛋白直接參與囊泡形成、移動、繫留與融合。此循環及其下游作用為 Rab 家族的相似性註解,來源未將所有細節限定為 RAB26 的個別實驗結果。

RAB26 參與 ADRA2A 與 ADRA2B 從高基氏體運送至細胞膜。此功能描述的是運輸作用,不代表來源指出 RAB26 與兩者都存在直接結合;互作資料另列於交互作用段落。

在胃部,RAB26 參與酶原顆粒成熟及胃蛋白酶原分泌。這些描述將其作用連結至分泌顆粒成熟與分泌過程,但來源未進一步說明其分子步驟。

此外,RAB26 被註記為參與腮腺腺泡顆粒中的澱粉酶分泌;此項為相似性推定。來源亦記載其 GTP 水解反應為 GTP 與水生成 GDP、磷酸根及氫離子。現有資料支持 RAB26 涉及膜運輸與多種分泌相關過程,但各項作用的證據性質並不相同。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 2148625 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>RAB26 ENST00000210187 GRCh38 chr16:2147625-2148725 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CCCAAGGTCCTGGTGACAGCTGTCAGGTCTCCGGGGACAGCTGGGTCATCTCTCCAGCTCCCAAAGAAAC
ACCAAGAAGCCCCTGCATGCCAAGGACACCACCCCTCTGGACCACTGTGCCCCAGCTCTGACCACTGCAG
TCCCATCTTCTCTGTGAGAGGGGGTGACAGAGCTCCAGTGCAGCCCAGGTTGGGGAGGTGGGTCTGCCAG
GGACCAGCTTAGGATTTGGAGAATCGGCCCTGGCCACCTGAAGGTCCGAACCTGGAGGAGAAGGACAAGG
GGCCAGCCACACAGCCTGGGCAGGGGCCTCTGCTTTCCACCTTTCAGACCCTGAGGGCAGAGTCCCGTGG
GAGGGGACCCTCAGGGGGCCGGGGGCTGGCTGCCACAGCGACTTCCTCCTTCCCGCAGATCCCCAGGCGT
GCACAGCAGGCAGAAGCTGTGGGGGAGATCGCAGCGCCCGCTGTGTCCTCCCGGTGACCAGCTGTCACCT
GAGCCCAGGGCGCCTGCCCCAGCAGCCTGGTGTGTTTGCCAAGCCAGGGCTGGAGCTTCCTGGACCCGCC
TACCCTGGAGGGGATGGAGCAGTGAAGGGCACCGGGCCAAGCGCTAGGCATCTGGGGCTAAGGAGACAGA
AGCCCGCGGTGCCCGTCCATGCGGGCCCTCTGCCCCAGCACCCACATCTCAGGACACCCCTTCCTCCCAG
GTCTGGCGGTCCAGTTTGGGGGTCACCGAGCTGGGGTGGTGTGCAGCCAGCAGAGGGGATTCAGGATCCC
GGGGTGACTCCTGGCCCAGGCCTGTCACCCCACAGCTGGCTCCTGGCCCCAAGGCAGCCACGGGCAGGGG
TCGTGATCGGGGGCGGGACGGGGCCCGGACCTCCTGACCGCCCCCCACCCCCCGCCGAGCGGGGGTGTAT
TTGCATGTCCCCGCCCCACGCACGGCATTGGCGGCGGCGGCGGGAGGCCGGGCCTGAGTGGCTGCGCGCC
CGTGGAGCGGCGGGGGCGGGGCGCGAGCCGGGCGCCCGGGATGATGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCG
CCGCCGCCAGGGGAAGGGTTCGGGTCCGGGTCGGGCTCGGCGGGCGCGGGG
RAB26 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
RAB26_2 ↗16:2,148,227正股2,148,178–2,148,237
RAB26_1 ↗16:2,148,607正股2,148,558–2,148,617

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR16_BFH5 · enhancer · 2143257–2143889 · regulatory

ENSR16_5HM89 · CTCF_binding_site · 2147522–2147543 · regulatory

ENSR16_BFHR · promoter · 2147654–2148635 · regulatory

ENSR16_5HMH5 · CTCF_binding_site · 2149005–2149026 · regulatory

· motif · 2147524–2147540 · motif

· motif · 2148343–2148350 · motif

· motif · 2148468–2148481 · motif

· motif · 2148490–2148505 · motif

· motif · 2148520–2148533 · motif

· motif · 2148562–2148575 · motif

· motif · 2148611–2148624 · motif

· motif · 2149007–2149023 · motif

· motif · 2150043–2150052 · motif

· motif · 2150043–2150054 · motif

· motif · 2150043–2150054 · motif

· motif · 2150529–2150542 · motif

· motif · 2151033–2151050 · motif

· motif · 2151035–2151050 · motif

· motif · 2151042–2151050 · motif

· motif · 2151328–2151340 · motif

· motif · 2151330–2151337 · motif

· motif · 2151330–2151345 · motif

· motif · 2151422–2151429 · motif

· motif · 2151587–2151598 · motif

· motif · 2151924–2151935 · motif

· motif · 2152751–2152764 · motif

· motif · 2152751–2152765 · motif

· motif · 2152751–2152766 · motif

· motif · 2152764–2152777 · motif

· motif · 2152927–2152940 · motif

· motif · 2152988–2153003 · motif

· motif · 2153359–2153368 · motif

· motif · 2153359–2153370 · motif

· motif · 2153359–2153370 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:256 aa

1 aa256 aa功能區域基序
依 Q9ULW5 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

RAB26 長 256 個胺基酸,屬於小型 GTPase 超家族的 Rab 家族。序列第 1–51 位標註為無序區域;第 86–101 位與第 119–136 位分別標註為 Switch 1 和 Switch 2 基序。

功能區域Disordered1–51 aa
基序Switch 186–101 aa
基序Switch 2119–136 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 2G6B…

PDB · 2G6B

X-ray · 2.00 A · A=56-233

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Golgi apparatus membrane;Cytoplasmic vesicle, secretory vesicle membrane

RAB26 定位於高基氏體膜及細胞質囊泡、分泌囊泡膜的細胞質側,並以脂質錨定。 來源指出它不定位於細胞膜,此項為相似性註解。 抑制 S-geranylgeranyl cysteine 形成會使其膜定位消失。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 5 個夥伴 · 最多顯示 50 個
RAB26RAB26ADRA2BFHL5KRT33BOIP5UNKL
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

RAB26 與 RIMS1 的互作為相似性註解,並有與 ADRA2B 互作的記載。另有資料描述 RAB26 參與 ADRA2A 與 ADRA2B 的運輸;這是功能關係,不能據此推定兩者均與 RAB26 直接結合。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能Rab 小型 GTPase 調控細胞內膜運輸,涵蓋運輸囊泡形成至其與膜融合;它們在 GDP 結合的非活化型與 GTP 結合的活化型之間循環,活化型可招募參與囊泡形成、移動、繫留與融合的不同效應蛋白。RAB26 參與 ADRA2A、ADRA2B 從高基氏體運至細胞膜,也參與胃部酶原顆粒成熟和胃蛋白酶原分泌;腮腺腺泡顆粒的澱粉酶分泌則屬相似性推定。含實驗來源
證據與來源

The small GTPases Rab are key regulators of intracellular membrane trafficking, from the formation of transport vesicles to their fusion with membranes. Rabs cycle between an inactive GDP-bound form and an active GTP-bound form that is able to recruit to membranes different set of downstream effectors directly responsible for vesicle formation, movement, tethering and fusion (By similarity). RAB26 mediates transport of ADRA2A and ADRA2B from the Golgi to the cell membrane. Plays a role in the maturation of zymogenic granules and in pepsinogen secretion in the stomach. Plays a role in the secretion of amylase from acinar granules in the parotid gland (By similarity)

PMID 20038531 ↗ · PMID 23105096 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性GTP + H2O = GDP + phosphate + H(+)推論支持
證據與來源

GTP + H2O = GDP + phosphate + H(+)

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用RAB26 與 RIMS1 有互作記載,但此關係標為相似性推定;此外,來源記載 RAB26 與 ADRA2B 互作。這些互作資訊不代表來源也記載 RAB26 與 ADRA2A 直接結合。含實驗來源
證據與來源

Interacts with RIMS1 (By similarity). Interacts with ADRA2B

PMID 23105096 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位RAB26 以脂質錨定於高基氏體膜及細胞質囊泡、分泌囊泡膜的細胞質側;其不定位於細胞膜的敘述屬相似性註解。抑制 S-geranylgeranyl cysteine 形成會消除 RAB26 的膜定位。含實驗來源
證據與來源

Golgi apparatus membrane / Lipid-anchor / Cytoplasmic side; Cytoplasmic vesicle, secretory vesicle membrane / Lipid-anchor / Cytoplasmic side; Not localized at the plasma membrane (By similarity). Inhibition of S-geranylgeranyl cysteine formation abolishes membrane location

PMID 23105096 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000210187 · 1,674 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1GCGCGAGCCGGGCGCCCGGGATGATGCCGCCGCCGCCGCC40
41GCCGCCGCCGCCGCCGCCAGGGGAAGGGTTCGGGTCCGGG80
81TCGGGCTCGGCGGGCGCGGGGTGCGGGACGGCCCAGGGCA120
121CGGCGGCTGCAGCGGGAGCACACTGAGCGCCCGCCCGCCA160
161TGTCCAGGAAGAAGACCCCCAAGAGCAAAGGGGCCAGCAC200
201CCCCGCTGCCTCCACGCTGCCCACCGCCAACGGGGCCCGA240
241CCGGCGCGCTCCGGGACTGCGCTTTCCGGCCCCGACGCGC280
281CGCCCAACGGGCCCTTGCAGCCCGGCCGGCCCTCGCTTGG320
321CGGCGGTGTCGACTTCTACGACGTCGCCTTCAAGGTCATG360
361CTGGTGGGGGACTCGGGTGTGGGGAAGACCTGTCTGCTGG400
401TGCGATTCAAGGATGGTGCTTTCCTGGCGGGGACCTTCAT440
441CTCCACCGTAGGCATTGACTTCCGGAACAAAGTTCTGGAC480
481GTGGATGGTGTGAAGGTGAAGCTGCAGATGTGGGACACAG520
521CTGGTCAGGAGCGGTTCCGCAGTGTTACCCATGCCTACTA560
561CCGGGATGCTCATGCTCTGCTGCTGCTCTACGATGTCACC600
601AACAAGGCCTCCTTTGACAACATCCAGGCCTGGCTGACCG640
641AGATCCACGAGTACGCCCAGCACGACGTGGCGCTCATGCT680
681GCTGGGGAACAAGGTGGACTCTGCCCATGAGCGTGTGGTG720
721AAGAGGGAGGACGGGGAGAAGCTGGCCAAGGAGTATGGAC760
761TGCCCTTCATGGAGACCAGCGCCAAGACGGGCCTCAACGT800
801GGACTTGGCCTTCACAGCCATAGCAAAGGAGTTGAAGCAG840
841CGCTCCATGAAGGCTCCCAGCGAGCCGCGCTTCCGGCTGC880
881ATGATTACGTTAAGAGGGAGGGTCGAGGGGCCTCCTGCTG920
921CCGCCCTTGAACCTGGCTGAGCTCAGTCCTCTGGAGGAAG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。