基因總覽
RAB18, member RAS oncogene family 是一個蛋白質編碼基因，其產物 Ras-related protein Rab-18 屬於小型 GTPase 超家族中的 Rab 家族。Rab 蛋白是細胞內膜運輸的重要調節者；RAB18 的來源資料也將其與細胞器膜、脂滴及膜運輸相關過程相聯繫。其蛋白質長 206 個胺基酸，具有 Switch 1 與 Switch 2 基序，這些是來源註記的序列特徵。這些基本資訊說明 RAB18 的家族歸屬與蛋白質性質；其核苷酸狀態如何關聯下游作用，則在功能部分說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000356940 ★ | 27,504,304–27,542,239 | 7 |
| ENST00000535776 | 27,504,234–27,539,829 | 8 |
| ENST00000621805 | 27,504,234–27,545,117 | 8 |
| ENST00000684501 | 27,504,234–27,545,117 | 6 |
| ENST00000682389 | 27,504,234–27,545,117 | 5 |
| ENST00000683755 | 27,504,234–27,539,185 | 7 |
| ENST00000375802 | 27,504,234–27,545,117 | 5 |
| ENST00000964579 | 27,504,234–27,545,117 | 3 |
| ENST00000997603 | 27,504,234–27,516,557 | 3 |
| ENST00001046916 | 27,504,234–27,540,160 | 7 |
| ENST00001095959 | 27,504,234–27,531,663 | 4 |
| ENST00001128229 | 27,504,234–27,511,254 | 2 |
顯示 12/21 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Rab 小型 GTPase 透過 GDP 與 GTP 結合狀態的循環調節膜運輸：非活化的 GDP 結合型轉為活化的 GTP 結合型後，可募集不同的下游效應因子，直接參與運輸囊泡形成、移動、繫留及與膜融合。RAB18 屬於這類調節蛋白，來源指出它參與細胞內膜運輸的多個環節。
在脂滴相關作用中，RAB18 是 ZFYVE1 定位至脂滴所必需的，也支持 ZFYVE1 促進內質網與脂滴接觸形成的功能。除此之外，RAB18 亦是維持內質網結構所需的因子。這些作用將 RAB18 與內質網及脂滴之間的組織連結起來，但來源並未提供更細的分子步驟。
來源另指出，RAB18 參與頂端內吞與回收；此項功能標示為依序列相似性推定。它也參與固醇恆定及膽固醇酯動員。這些不同面向顯示 RAB18 的作用不只涉及膜運輸，也涵蓋脂質相關調節。
RAB18 對眼與腦的發育具有重要作用，並與神經退化相關。這些描述呈現其細胞層級功能與器官及生物學過程的關聯；來源未將所有相關性都界定為直接因果機制。
Promoter 與基因調控
>RAB18 ENST00000356940 GRCh38 chr10:27503304-27504404 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ACCTGAAGGAGGAGAAGCCATTGGGATATCTTTTGAAAGGGCTTTTCCAGCTATTTAACAAATTAATTTC TTAACATTTGAAATTTTATTTATATGTAGTCTTTAATCAAATATCCATTGTATATGACATTAGCTGCAGG TATAAGGAAATAAGACAAGAGAACTGAGGTTTATTGAGTGCCTGCCATGTACCAGGCACTGTGCTAAGTA TTATGAATGAGGTTTGGTACCTTCACTAAGATTTACAACTTAATGCAGGAGGCAAGGTGTAGACATACAC TTCCTGCAGTATGGGTGTAGCAGTTCTTATGAGGAAGGAGAGTTGACTTGAAGTTGCACCGCCAGAAGTA ATGCACCTGACCTACCTGAAGTCTACGCCTCCCTTTCAAGATGAATTAGGGTGCAGAGGGTGCTCTCCAC TATAACAGAGGGGAAGCCAGCAAGATAATACCTGATCACACCTTTTATAGAGCACTTTGGTTAACAACAT GTCTTCACAAATTAACTCACTTAACCTTCATAACAATAAGAAGCAGATGTTCTAAGAAGTGTTACTGTGT CTCTCAGAGATGGAGAAAGGCTAAGAAAGCTGGGTAGTATGACAAGGCAGTTATAAGGTAGAGCTGGACC TAAATTTAAGATAATCTGCTTCAAGCACAGTGCTTTTCCCACCGCAGTGCAGCTGTTATGAGCAGCTGCC GAAATAAAACAGCTTGATATTCTCCTGACTGAGTCCTCCCACTGACTCAAAAGGAGGGTTAGGTTGAGGC TGGGGCGGAGCTAGACCTCAAGAAGAAGCCAACAAAGTCACACACAGCGCTCCCCACCTGCGCTTGCGCA GGGGAGGAACACGCAGTCCGGAAAAACGCCGGGGATTCTGGGTCGCGCAGCCGTGGAGCTACCTCAAGGC GGAACTGGGGAGTCCAGGGCTTCGGCAGCCTGAACACCCGGTGTGAAAGGAAGGTGGCAGACGTGGAGCG GCGCGCATGCGCAGCAGCTCACTCTGCTGAAGGGCTGAGAGGCGCACCCGGGCGGCCAGCTGGGCTCGGA GCGGAACGGGGTCAGGATGGACGAGGACGTGCTAACCACCCTGAAGATCCT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RAB18_1 ↗ | 10:27,504,304 | 正股 | 27,504,255–27,504,314 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR10_B7GD6 · promoter · 27503744–27504338 · regulatory
ENSR10_58GN4B · CTCF_binding_site · 27504201–27504222 · regulatory
ENSR10_58GN4K · CTCF_binding_site · 27504256–27504277 · regulatory
ENSR10_58GN4T · CTCF_binding_site · 27504322–27504343 · regulatory
ENSR10_C4PNM · enhancer · 27504339–27505383 · regulatory
ENSR10_58GN6X · CTCF_binding_site · 27504769–27504790 · regulatory
· motif · 27503755–27503767 · motif
· motif · 27504126–27504135 · motif
· motif · 27504132–27504143 · motif
· motif · 27504132–27504143 · motif
· motif · 27504203–27504219 · motif
· motif · 27504209–27504220 · motif
· motif · 27504258–27504274 · motif
· motif · 27504285–27504296 · motif
· motif · 27504285–27504296 · motif
· motif · 27504324–27504340 · motif
· motif · 27504361–27504368 · motif
· motif · 27504444–27504453 · motif
· motif · 27504771–27504787 · motif
· motif · 27505778–27505793 · motif
· motif · 27505783–27505795 · motif
· motif · 27505786–27505793 · motif
· motif · 27505786–27505801 · motif
· motif · 27505794–27505809 · motif
· motif · 27507272–27507286 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：206 aa
Ras-related protein Rab-18 長 206 個胺基酸，屬於小型 GTPase 超家族的 Rab 家族。序列註記包含 Switch 1（31–45 位）與 Switch 2（63–80 位）兩個基序；這些位置與長度依來源所列。
蛋白質三維結構
細胞內定位
RAB18 位於內質網膜、高基氏體順面網絡膜、脂滴及細胞頂端膜；在纖維母細胞中，資料特別記載其位於內質網膜及順面高基氏體。 來源未指出這些定位是否隨條件或異構型而改變。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Lipid droplet。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
- AQP6Q13520 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ELOVL4Q9GZR5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TAX1BP1Q86VP1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- Q99IB8Q99IB8 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
GTP 結合型 RAB18 與 ZFYVE1 互作；它也與 ZW10 互作，而 ZFYVE1 存在時，RAB18 與 ZW10 的互作會增強。另有 RAB18 與 BSCL2 互作的記載。RAB3GAP1 依賴性地參與 RAB18 與 INPP5B、TMCO4 及 SEC22A 的互作。感染情境下，RAB18 與 Hepatitis C virus 的非結構蛋白 5A 互作；此互作可能促進 NS5A 及其他病毒複製酶組分與脂滴的關聯。
疾病與遺傳關聯
RAB18 相關變異被指出會造成 Warburg micro syndrome 3（WARBM3）。這種罕見症候群的特徵包括小頭症、小眼球、小角膜、先天性白內障、視神經萎縮、皮質發育不全（尤其是胼胝體發育不全）、嚴重智能障礙、痙攣性雙癱及性腺功能低下。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 6 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | Rab 小型 GTPase 是細胞內膜運輸的關鍵調節者，參與運輸囊泡形成至與膜融合；其在 GDP 結合的非活化型與 GTP 結合的活化型間循環，後者可募集參與囊泡形成、移動、繫留及融合的效應因子。RAB18 對 ZFYVE1 定位至脂滴及其介導內質網－脂滴接觸形成的功能皆為必要，也有助維持內質網結構。依序列相似性推定，RAB18 參與頂端內吞與回收；此外與眼、腦發育、神經退化、固醇恆定及膽固醇酯動員相關。 | 含實驗來源 | 證據與來源The small GTPases Rab are key regulators of intracellular membrane trafficking, from the formation of transport vesicles to their fusion with membranes. Rabs cycle between an inactive GDP-bound form and an active GTP-bound form that is able to recruit to membranes different sets of downstream effectors directly responsible for vesicle formation, movement, tethering and fusion. RAB18 is required for the localization of ZFYVE1 to lipid droplets and for its function in mediating the formation of endoplasmic reticulum-lipid droplets (ER-LD) contacts. Also required for maintaining endoplasmic reticulum structure. Plays a role in apical endocytosis/recycling (By similarity). Plays a key role in eye and brain development and neurodegeneration. Involved in sterol homeostasis and cholesteryl ester mobilization PMID 21473985 ↗ · PMID 24891604 ↗ · PMID 30970241 ↗ · PMID 37774976 ↗ |
| 分子活性 | GTP + H2O = GDP + phosphate + H(+) | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | GTP 結合型 RAB18 與 ZFYVE1 互作；RAB18 也與 ZW10 互作，且 ZFYVE1 存在時這項互作會增強。另記載 RAB18 與 BSCL2 互作。RAB18 與 INPP5B、TMCO4 及 SEC22A 的互作具有 RAB3GAP1 依賴性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts (in GTP-bound form) with ZFYVE1. Interacts with ZW10 and this interaction is enhanced in the presence of ZFYVE1. Interacts with BSCL2. Interacts with INPP5B, TMCO4 and SEC22A in a RAB3GAP1-dependent manner PMID 30970241 ↗ · PMID 31293035 ↗ · PMID 37774976 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染情境下，RAB18 與 Hepatitis C virus（HCV）非結構蛋白 5A 互作；此互作可能促進 NS5A 及其他病毒複製酶組分與脂滴的關聯，來源以可能性描述此作用。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Interacts with Hepatitis C virus (HCV) non-structural protein 5A; this interaction may promote the association of NS5A and other viral replicase components with lipid droplets PMID 23935497 ↗ |
| 細胞定位 | RAB18 的定位包括內質網膜、高基氏體順面網絡膜、脂滴及細胞頂端膜。纖維母細胞中另有其位於內質網膜及順面高基氏體的記載。 | 含實驗來源 | 證據與來源Endoplasmic reticulum membrane; Golgi apparatus, cis-Golgi network membrane; Lipid droplet; Apical cell membrane; Localized to the ER membrane as well as to the cis-Golgi in fibroblasts PMID 24891604 ↗ · PMID 26063829 ↗ · PMID 37774976 ↗ · PMID 23935497 ↗ · PMID 30970241 ↗ |
| 疾病關聯 | Warburg micro syndrome 3（WARBM3）是一種罕見症候群，特徵包括小頭症、小眼球、小角膜、先天性白內障、視神經萎縮、皮質發育不全，尤其是胼胝體發育不全，以及嚴重智能障礙、痙攣性雙癱與性腺功能低下。來源指出，影響該基因的變異會造成此病。 | 含實驗來源 | 證據與來源Warburg micro syndrome 3 WARBM3 A rare syndrome characterized by microcephaly, microphthalmia, microcornia, congenital cataracts, optic atrophy, cortical dysplasia, in particular corpus callosum hypoplasia, severe intellectual disability, spastic diplegia, and hypogonadism. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 614222 PMID 21473985 ↗ · PMID 23420520 ↗ |
核酸與蛋白質序列
ACTCTGCTGAAGGGCTGAGAGGCGCACCCGGGCGGCCAGC40TGGGCTCGGAGCGGAACGGGGTCAGGATGGACGAGGACGT80GCTAACCACCCTGAAGATCCTCATCATCGGCGAGAGTGGG120GTGGGCAAGTCCAGCCTGCTCTTGAGGTTCACAGATGATA160CGTTTGATCCAGAACTTGCAGCAACAATAGGTGTTGACTT200TAAGGTGAAAACAATTTCAGTGGATGGAAATAAGGCTAAA240CTTGCAATATGGGATACTGCTGGTCAAGAGAGGTTTAGAA280CATTAACTCCCAGCTATTATAGAGGTGCACAGGGTGTTAT320ATTAGTTTATGATGTCACAAGAAGAGATACATTTGTTAAA360CTGGATAATTGGTTAAATGAATTGGAAACATACTGTACAA400GAAATGACATAGTAAACATGCTAGTTGGAAATAAAATCGA440TAAGGAAAATCGTGAAGTCGATAGAAATGAAGGCCTGAAA480TTTGCACGAAAGCATTCCATGTTATTTATAGAGGCAAGTG520CAAAAACCTGTGATGGTGTACAATGTGCCTTTGAAGAACT560TGTTGAAAAGATCATTCAGACCCCTGGACTGTGGGAAAGT600GAGAACCAGAATAAAGGAGTCAAACTGTCACACAGGGAAG640AAGGCCAAGGAGGAGGAGCCTGTGGTGGTTATTGCTCTGT680GTTATAAACTCTGGGAAATTCCATCTCTTGCATATTTGAT720CAGATAGTGACATCTTTCTGTATATAAACTCTTTAACTGC760TATTTTAGGGACCTTGCAGTTTGCACATAATTGTTTTATA800TCATAGCAGTAAATATTTGCAAGAAATCCCACTCATCGAC840CCCGGGTAAAATGTTATGGTAAGCATGCACAGTTTGCAGT880CTACAGTTTTTTTATGTAGCACAAAATAGGTGTACCTTTA920TAAGTACATTCAATTTTATGATTTACATTTATCATGTAAT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。