基因總覽
PRX 是蛋白質編碼基因，產物 periaxin 屬於 periaxin family。這是一種支架蛋白，在不同細胞中參與不同分子複合體：在 Schwann 細胞中屬於 dystroglycan complex，在眼睛晶狀體纖維細胞中則出現在含 EZR 與 AHNAK 的複合體。其蛋白質特徵包括 PDZ domain，以及一系列重複區域，構成其可供辨識的結構特色。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000324001 ★ | 40,393,768–40,413,378 | 7 |
| ENST00000903447 | 40,393,764–40,413,381 | 7 |
| ENST00000673881 | 40,393,765–40,404,288 | 3 |
| ENST00000674773 | 40,393,765–40,403,935 | 2 |
| ENST00000674005 | 40,393,765–40,414,793 | 7 |
| ENST00000903445 | 40,393,765–40,415,070 | 7 |
| ENST00000903446 | 40,393,765–40,413,393 | 7 |
| ENST00001140843 | 40,393,765–40,413,378 | 7 |
| ENST00000676316 | 40,393,766–40,398,816 | 2 |
| ENST00000676076 | 40,393,766–40,398,816 | 2 |
| ENST00000291825 | 40,393,768–40,413,364 | 6 |
| ENST00000675517 | 40,393,966–40,398,816 | 2 |
顯示 12/15 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
periaxin 在 Schwann 細胞中作為支架蛋白，參與周邊髓鞘的維持。周邊髓鞘對神經衝動的正常傳導及感覺刺激的正常感知不可或缺；periaxin 也參與髓鞘受損後的正常再髓鞘化，顯示其功能涵蓋髓鞘的維持與修復。
在髓鞘形成相關過程中，periaxin 是 MBP mRNA 從核周區域運送至旁郎飛結區域所必需的，也參與 Schwann 細胞正常延長，以及郎飛結之間節段維持正常長度。髓鞘化的郎飛結可支持神經衝動的跳躍式傳導；若節段較短，神經衝動傳導速度會降低。
periaxin 亦參與髓鞘軸突外側表面與 Schwann 細胞質膜之間貼合區的形成。這些貼合區形成後，Schwann 細胞的細胞質受限於貼合區之間；Cajal bands 與 Schmidt-Lanterman incisures 也需要 periaxin 參與形成，兩者對應髓鞘化神經中短小、充滿細胞質的區域。此外，periaxin 會招募 DRP2 至 Schwann 細胞質膜。
在眼睛晶狀體纖維細胞中，periaxin 對質膜蛋白組成及細胞形態的正常維持是必要的。這些作用與其在 Schwann 細胞中的髓鞘相關角色分屬不同細胞背景。
Promoter 與基因調控
>PRX ENST00000324001 GRCh38 chr19:40413278-40414378 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GCCGAAGTGGGAAGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGGCAACATGGTGAAACTTTGCCA TTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGATGATGCATACCTGTGGTCCCAGCTATTTGAGGGGGCTC AGTCGGGAGGATTGCTTGAGCCCAGGAGGTGGAGGCTGCAGTGAGCCATGATCACACCACTGCACTCCAG CCTGGGCAACAGAGTGAGACCTTGTCTCAAAAAAAAGGGTGGGGAGCATAAGGAGCCCATTTTACACCCT TGATTCAAAAGCAGGGCTTCAGCACTGAGCATGGTACTTAGTATGTGATAGGTGTCCCCCTAAACAGTAA CTCCATTAGACAGAGAACTGGGGGTCCCCTGTGCCCAGCCTTACTGAAAAGGGGCCAAAACCCCCCAGCA AGATGAGCCAGCCACCTAATTTGTGTGAAAAATAATACCAAATACTTATTAGTAACCCTCATTATGTGCC CGGCATTGTCTTACATTTTCAGTCTCTTTTAACTCGTTTAATCTTCACCACAGCCCCATAAGGTGGGTAC TCTTACTATCCGCAAAGAGAAGCTGTGACTGGCAGCAGGTCACCCAGCGAGGAAGTGGTCGCGCTGCGAT TTGAACCCAAGTTGACAGGGAGAGGGAGTGAAAGGAGTTTACAGTAGAGGCAGTTGGCCAGGCCCGGGTC CTGGAGCCAGGAAACAGTGGGGCTGGGGTGGGGTCCTGATTCTCCAAGTCGAGGAAGCCAACGTGCAAAT CCTTGAAGCTGAGCTCATGGCAGAGATCTCGGCCCAGGCAAGAGAGAGGCGGCTGGTGGCTGTCCCGTGG CCCCCACCCCTTGGGGATAGATGTAGCTGGAGGAGGGGGATGTTTGTTTCTCCACCACCCACCCTCTGGT GACGTCACACCCCCGCAGCCAATGGCTGGGGTCTCTCTCTCCTCCCCCCTCCCCATTCCTTTTCCCCCCC AGCCTAGGGCTAGGGCTGACAGACGGGACCAGGAGCTCTCGAGGTGTCTGGAGGCTCAGCGGTAAGAGAT CAGCCGGCCGGTCCCTTCCCTGGCCAGGCTGAGACACTGTGGGAATGAGGT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| PRX_1 ↗ | 19:40,413,378 | 負股 | 40,413,368–40,413,427 |
| PRX_2 ↗ | 19:40,414,776 | 負股 | 40,414,766–40,414,825 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR19_BB2JC · enhancer · 40409803–40410393 · regulatory
ENSR19_C629B · enhancer · 40411105–40412283 · regulatory
ENSR19_83747B · enhancer · 40413155–40413353 · regulatory
ENSR19_BB2JT · promoter · 40413354–40413868 · regulatory
ENSR19_9L356 · enhancer · 40414969–40415228 · regulatory
ENSR19_BB2KF · enhancer · 40416873–40417870 · regulatory
· motif · 40409690–40409705 · motif
· motif · 40409695–40409707 · motif
· motif · 40409698–40409705 · motif
· motif · 40409761–40409770 · motif
· motif · 40410497–40410514 · motif
· motif · 40411102–40411109 · motif
· motif · 40411144–40411157 · motif
· motif · 40411286–40411298 · motif
· motif · 40411374–40411386 · motif
· motif · 40411376–40411391 · motif
· motif · 40411623–40411634 · motif
· motif · 40411665–40411678 · motif
· motif · 40413459–40413472 · motif
· motif · 40413459–40413472 · motif
· motif · 40414178–40414189 · motif
· motif · 40415097–40415106 · motif
· motif · 40415100–40415111 · motif
· motif · 40415720–40415732 · motif
· motif · 40416157–40416172 · motif
· motif · 40416158–40416171 · motif
· motif · 40416163–40416175 · motif
· motif · 40416165–40416172 · motif
· motif · 40416334–40416341 · motif
· motif · 40416435–40416450 · motif
· motif · 40416784–40416797 · motif
· motif · 40416924–40416935 · motif
· motif · 40416972–40416987 · motif
· motif · 40416977–40416989 · motif
· motif · 40416980–40416987 · motif
· motif · 40417020–40417028 · motif
· motif · 40417043–40417052 · motif
· motif · 40417163–40417183 · motif
· motif · 40417187–40417207 · motif
· motif · 40417293–40417310 · motif
· motif · 40418049–40418069 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1461 aa
periaxin 長 1461 個胺基酸，具有位於第 16–99 位的 PDZ domain。序列註解另列出 39 個重複區域，分布於第 431–679 位之間；此蛋白質屬於 periaxin family。
蛋白質三維結構
細胞內定位
Isoform 1 在髓鞘形成開始前可見於 Schwann 細胞核，髓鞘形成期間與細胞膜相關，並位於軸突周圍的髓鞘膜；另有細胞質定位記錄。 Isoform 2 則記錄於細胞質。 在眼睛晶狀體纖維細胞之間的三細胞交界，periaxin 與 ACTB 共定位。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Cell junction。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- NCK1P16333 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- TERF2IPQ9NYB0 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
periaxin 可透過 PDZ domain 形成同源二聚體，並與 SCN10A、DRP2 互作；與 SCN10A 的複合體關係標示為 By similarity。它也被記錄於多種複合體：包含 PRX、DRP2、UTRN、DMD 與 DAG1 的 dystroglycan complex；至少由 EZR、AHNAK、PPL 與 PRX 組成的複合體；以及含 EZR、AHNAK、BFSP1、BFSP2、ANK2、PLEC、VIM 和 spectrin 的複合體。後述複合體資料標示為 By similarity。
疾病與遺傳關聯
影響 PRX 的變異與 Dejerine-Sottas syndrome 及 Charcot-Marie-Tooth disease, demyelinating, type 4F（CMT4F）相關。Dejerine-Sottas syndrome 是嚴重的脫髓鞘性神經病變，可為常染色體顯性或隱性，通常在兩歲前發病。CMT4F 為隱性脫髓鞘型，發病年齡可從兒童期至成年；其特徵包括遠端感覺受損，以及下肢較上肢明顯的遠端肌肉無力與萎縮。嬰兒期發病時，表型可歸為 Dejerine-Sottas syndrome。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 7 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | periaxin 是支架蛋白，在 Schwann 細胞中屬於 dystroglycan complex，在眼睛晶狀體纖維細胞中則參與含 EZR 與 AHNAK 的複合體。它對周邊髓鞘維持、髓鞘受損後再髓鞘化、MBP mRNA 運送、Schwann 細胞延長及郎飛結間節段的正常長度皆為必要；並參與髓鞘與細胞膜貼合區、Cajal bands 與 Schmidt-Lanterman incisures 的形成，以及招募 DRP2 至細胞膜。它也有助於維持晶狀體纖維細胞質膜的正常蛋白組成及細胞形態。 | 推論支持 | 證據與來源Scaffolding protein that functions as part of a dystroglycan complex in Schwann cells, and as part of EZR and AHNAK-containing complexes in eye lens fiber cells. Required for the maintenance of the peripheral myelin sheath that is essential for normal transmission of nerve impulses and normal perception of sensory stimuli. Required for normal transport of MBP mRNA from the perinuclear to the paranodal regions. Required for normal remyelination after nerve injury. Required for normal elongation of Schwann cells and normal length of the internodes between the nodes of Ranvier. The demyelinated nodes of Ranvier permit saltatory transmission of nerve impulses; shorter internodes cause slower transmission of nerve impulses. Required for the formation of appositions between the abaxonal surface of the myelin sheath and the Schwann cell plasma membrane; the Schwann cell cytoplasm is restricted to regions between these appositions. Required for the formation of Cajal bands and of Schmidt-Lanterman incisures that correspond to short, cytoplasm-filled regions on myelinated nerves. Recruits DRP2 to the Schwann cell plasma membrane. Required for normal protein composition of the eye lens fiber cell plasma membrane and normal eye lens fiber cell morphology |
| 交互作用 | periaxin 可透過 PDZ domain 形成同源二聚體，並與 SCN10A、DRP2 互作；與 SCN10A 的複合體記錄標示為 By similarity。它出現在包含 PRX、DRP2、UTRN、DMD、DAG1 的 dystroglycan complex，也出現在含 EZR、AHNAK、PPL 的複合體，以及含 EZR、AHNAK、BFSP1、BFSP2、ANK2、PLEC、VIM 和 spectrin 的複合體；這些複合體資料標示為 By similarity。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer (via PDZ domain). Interacts with SCN10A. Found in a complex with SCN10A (By similarity). Interacts with DRP2. Identified in a dystroglycan complex that contains at least PRX, DRP2, UTRN, DMD and DAG1 (By similarity). Detected in a complex composed of at least EZR, AHNAK, PPL and PRX (By similarity). Identified in a complex with EZR, AHNAK, BFSP1, BFSP2, ANK2, PLEC, VIM and spectrin (By similarity) PMID 24675079 ↗ |
| 細胞定位 | Isoform 1 的定位包括細胞膜細胞質側的周邊膜蛋白、細胞核及細胞質。髓鞘形成開始前可在 Schwann 細胞核中檢出；在 Schwann 細胞中也見於軸突周圍的髓鞘膜，並於髓鞘形成期間與細胞膜相關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Isoform 1; Cell membrane / Peripheral membrane protein / Cytoplasmic side; Nucleus; Cytoplasm; Detected in the Schwann cell nucleus prior to the onset of myelination. Detected in Schwann cells at periaxonal myelin membranes. Associated with the cell membrane during myelination PMID 24633211 ↗ |
| 細胞定位 | Isoform 2 記錄定位於細胞質。 | 推論支持 | |
| 細胞定位 | periaxin 記錄於細胞膜及細胞連結，並與 ACTB 共定位於眼睛晶狀體纖維細胞之間的三細胞交界。 | 推論支持 | 證據與來源Cell membrane; Cell junction; Colocalizes with ACTB at tricellular junctions between eye lens fiber cells |
| 疾病關聯 | Dejerine-Sottas syndrome 是嚴重的退化性脫髓鞘神經病變，屬於 Charcot-Marie-Tooth disease 類別，通常在兩歲前發病。其表現包括運動與感覺神經病變、神經傳導速度非常緩慢、腦脊髓液蛋白濃度增加、神經肥厚、開始行走的年齡延後及反射消失；此病有常染色體顯性與隱性形式。影響 PRX 的變異與此病相關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Dejerine-Sottas syndrome DSS A severe degenerating neuropathy of the demyelinating Charcot-Marie-Tooth disease category, with onset by age 2 years. Characterized by motor and sensory neuropathy with very slow nerve conduction velocities, increased cerebrospinal fluid protein concentrations, hypertrophic nerve changes, delayed age of walking as well as areflexia. There are both autosomal dominant and autosomal recessive forms of Dejerine-Sottas syndrome. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 145900 PMID 11133365 ↗ |
| 疾病關聯 | CMT4F 是 Charcot-Marie-Tooth disease 的隱性脫髓鞘型，影響周邊神經系統，表現為進行性無力與萎縮，先影響腓骨肌，之後影響手臂遠端肌肉。其典型特徵包括遠端感覺受損，以及下肢較上肢明顯的遠端肌肉無力與萎縮；發病年齡從兒童期到成年期不等，嬰兒期發病時表型稱為 Dejerine-Sottas syndrome。影響 PRX 的變異與此病相關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Charcot-Marie-Tooth disease, demyelinating, type 4F CMT4F A recessive demyelinating form of Charcot-Marie-Tooth disease, a disorder of the peripheral nervous system, characterized by progressive weakness and atrophy, initially of the peroneal muscles and later of the distal muscles of the arms. Charcot-Marie-Tooth disease is classified in two main groups on the basis of electrophysiologic properties and histopathology: primary peripheral demyelinating neuropathies (designated CMT1 when they are dominantly inherited) and primary peripheral axonal neuropathies (CMT2). Demyelinating neuropathies are characterized by severely reduced nerve conduction velocities (less than 38 m/sec), segmental demyelination and remyelination with onion bulb formations on nerve biopsy, slowly progressive distal muscle atrophy and weakness, absent deep tendon reflexes, and hollow feet. By convention autosomal recessive forms of demyelinating Charcot-Marie-Tooth disease are designated CMT4. CMT4F is characterized by distal sensory impairment and distal muscle weakness and atrophy affecting the lower more than the upper limbs. The age at onset is variable and can range from childhood to adult years. When the onset is in infancy, the phenotype is characterized as Dejerine-Sottas syndrome. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 614895 PMID 22847150 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGACGGGACCAGGAGCTCTCGAGGTGTCTGGAGGCTCAGC40GAGCGCCGGACCCAGGAGGCCCAAGGAGCTGGAGGTGACC80CTCAGGCAGCAAGAACCCCACGGAAGGGCGTGAGCCCTGC120AGACAGCTGTGCGGCACCTCGGGCTGGGCTCCTGTTAGGA160GGAAGTGCCTGCACCCAGGCAGCGGCTCAGAGGCAGCTGC200TCCATGCAGAACTGAAGCTGGTTCTGCAGCAGAAAGGGGA240GAGGACACAGGAGCCTGGGGTGCAGGTGCCTCCCAGCAAC280GCCATGGAGGCCAGGAGCCGGAGTGCCGAGGAGCTGAGGC320GGGCGGAGTTGGTGGAAATTATCGTGGAGACGGAGGCGCA360GACCGGGGTCAGCGGCATCAACGTAGCGGGCGGCGGCAAA400GAGGGAATCTTCGTTCGGGAGCTGCGCGAGGACTCACCCG440CCGCCAGGAGCCTCAGCCTGCAGGAAGGGGACCAGCTGCT480GAGTGCCCGAGTGTTCTTCGAGAACTTCAAGTACGAGGAC520GCACTACGCCTGCTGCAATGCGCCGAGCCTTACAAAGTCT560CCTTCTGCCTGAAGCGCACTGTGCCCACCGGGGACCTGGC600TCTGCGGCCCGGGACCGTGTCTGGCTACGAGATCAAGGGC640CCGCGGGCCAAGGTGGCCAAGCTGAACATCCAGAGTCTGT680CCCCTGTGAAGAAGAAGAAGATGGTGCCTGGGGCTCTGGG720GGTCCCCGCTGACCTGGCCCCTGTTGACGTCGAGTTCTCC760TTTCCCAAGTTCTCCCGCCTGCGTCGGGGCCTCAAAGCCG800AGGCTGTCAAGGGTCCTGTCCCGGCTGCCCCTGCCCGCCG840GCGCCTCCAGCTGCCTCGGCTGCGTGTACGAGAAGTGGCC880GAAGAGGCTCAGGCAGCCCGGCTGGCCGCCGCCGCTCCTC920CCCCCAGGAAAGCCAAGGTGGAGGCTGAGGTGGCTGCAGG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。