基因總覽
PRSS22 是蛋白質編碼基因,其正式名稱為 serine protease 22。對應的蛋白質屬於 peptidase S1 家族;目前提供的資料以家族分類及一項合成底物比較結果描述其特性,未提供更完整的生理功能或作用情境。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000161006 ★ | 2,852,730–2,858,170 | 6 |
| ENST00000571228 | 2,852,728–2,858,677 | 5 |
| ENST00000874724 | 2,852,728–2,858,210 | 6 |
| ENST00000874725 | 2,852,728–2,858,677 | 7 |
| ENST00001132763 | 2,852,728–2,858,677 | 6 |
| ENST00001111845 | 2,853,654–2,858,677 | 5 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
現有資料描述 PRSS22 蛋白質對合成底物的切割偏好:與 tosyl-Gly-Pro-Arg-pNA 相比,它較偏好切割 H-D-Leu-Thr-Arg-pNA。這項結果呈現的是兩種合成底物之間的相對差異,並未說明其在細胞或人體中的天然底物,也未提供切割發生的生物學情境。資料因此支持對底物偏好的有限描述,不能據此延伸為特定生理過程或功能機制。
Promoter 與基因調控
>PRSS22 ENST00000161006 GRCh38 chr16:2858070-2859170 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CAGGAATAAGCCACCCCACCCAGACACTATGGTTGTTTTTAATTCACCCCCGGCGGTAGCAAGGGCCCTG CTGGAGGCTTGTTGATCGAATGAGTGAAGGGGCGCAGGCTCCTGCCTCTTTGTAGAGGAGGAAGCCTGCC CTGCTTGGGTGGGAGTGTCCCAAGTGTGGGGCGCTGCAGGGCACTGAGTCAGGGAAGGTCTCACAGGATT CAGCCCCGGGTTGCCACTGTGGCAGCCGCTGGGGGGAAGCACCGAGAATCCACTCCCAGCCCAGGACCCG GCCCCCCACAGCCCAGCCCAGCAGCTCTTTGAATCCTGGGAGTCCCAGCCCTTCCCGGGGCCCCTCTTCT CTCAACCCCCCTGCTTGGCCGAGCCCTGGTGCCCATGGGCTCCTCCCCTTCCCAGGAGTCCAGGTGAGGT GAGTTGTCAGGTGTCTGAACCGCAGGGCAGAGCCCCGCCTCCAGGAACGACAGGAGGGCGGCCACCAGGA GGCCACCAAGGTCGCCACTCACCTGATTCACAGCTTTCGGGAAGTGGGTTAACGGGATTCCCAAGCCCGG GTTGCGCCAGGTCTCTGGGCTGAGTCACAGGGGCCTGGGGCCCTGCAGGTGGGAGCCGTTACTGAGCTTT GGGCACCCCCTTGATCCCTAAGGCCCTAGGACCACCCCCAACACCCAGTACCCCAGACTTCAGCCTCTCC AAACCCAGGCCCTCCCCAGCCCGGAACCCCTTCCTTTCAGTGCCCTGGCACCTTTCTCTGCCCCTGGACA ATTAATGTCAGGGACCTCTGGGCCCAAGCCCCCTCCCCTGCCCTTCCAGAGGCCACATCCTGGGGTCTCA GCTAGAGCCCCCCCAGAGCCCTGTAGCGGCTGGCTTCCTCCCCGCAGCCCCGCCCTCTGCCCAGGACCCA CAGCCGGGGTGGCCGCGGGAGCCACCTGGGGACTGGTCTGACGGCATTCCGCCTCCCAGGATAAAACCTG GGGCGACCTGCAGGGAACCTACACACCCTGACCCGCATCGCCCTGGGTCTCTCGAGCCTGCTGCCTGCTC CCCCGCCCCACCAGCCATGGTGGTTTCTGGAGCGCCCCCAGCCCTGGGTGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| PRSS22_3 ↗ | 16:2,857,954 | 負股 | 2,857,944–2,858,003 |
| PRSS22_1 ↗ | 16:2,858,170 | 負股 | 2,858,160–2,858,219 |
| PRSS22_2 ↗ | 16:2,858,660 | 負股 | 2,858,650–2,858,709 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR16_5N5J5 · CTCF_binding_site · 2854888–2854909 · regulatory
ENSR16_935LH · promoter · 2856179–2856513 · regulatory
ENSR16_935LK · enhancer · 2856514–2856804 · regulatory
ENSR16_935LW · promoter · 2857524–2858024 · regulatory
ENSR16_BKBJ · promoter · 2858144–2858660 · regulatory
ENSR16_935MW · enhancer · 2861119–2861447 · regulatory
· motif · 2854890–2854906 · motif
· motif · 2857908–2857922 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:317 aa
PRSS22 蛋白質長 317 個胺基酸,N 端第 1–32 位為訊號序列;第 50–290 位標註為 Peptidase S1 結構域,與其 peptidase S1 家族分類相符。
蛋白質三維結構
細胞內定位
資料將 PRSS22 標註為分泌型蛋白質;未提供定位改變的條件、異構型差異或細胞內動態資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- PPM1AP35813 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | PRSS22 對合成底物 H-D-Leu-Thr-Arg-pNA 的切割偏好高於 tosyl-Gly-Pro-Arg-pNA。此結果反映所比較的兩種合成底物之間的相對偏好;資料未指出天然底物或此偏好在生理情境中的意義。 | 含實驗來源 | 證據與來源Preferentially cleaves the synthetic substrate H-D-Leu-Thr-Arg-pNA compared to tosyl-Gly-Pro-Arg-pNA PMID 11602603 ↗ |
| 細胞定位 | Secreted | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
ACACACCCTGACCCGCATCGCCCTGGGTCTCTCGAGCCTG40CTGCCTGCTCCCCCGCCCCACCAGCCATGGTGGTTTCTGG80AGCGCCCCCAGCCCTGGGTGGGGGCTGTCTCGGCACCTTC120ACCTCCCTGCTGCTGCTGGCGTCGACAGCCATCCTCAATG160CGGCCAGGATACCTGTTCCCCCAGCCTGTGGGAAGCCCCA200GCAGCTGAACCGGGTTGTGGGCGGCGAGGACAGCACTGAC240AGCGAGTGGCCCTGGATCGTGAGCATCCAGAAGAATGGGA280CCCACCACTGCGCAGGTTCTCTGCTCACCAGCCGCTGGGT320GATCACTGCTGCCCACTGTTTCAAGGACAACCTGAACAAA360CCATACCTGTTCTCTGTGCTGCTGGGGGCCTGGCAGCTGG400GGAACCCTGGCTCTCGGTCCCAGAAGGTGGGTGTTGCCTG440GGTGGAGCCCCACCCTGTGTATTCCTGGAAGGAAGGTGCC480TGTGCAGACATTGCCCTGGTGCGTCTCGAGCGCTCCATAC520AGTTCTCAGAGCGGGTCCTGCCCATCTGCCTACCTGATGC560CTCTATCCACCTCCCTCCAAACACCCACTGCTGGATCTCA600GGCTGGGGGAGCATCCAAGATGGAGTTCCCTTGCCCCACC640CTCAGACCCTGCAGAAGCTGAAGGTTCCTATCATCGACTC680GGAAGTCTGCAGCCATCTGTACTGGCGGGGAGCAGGACAG720GGACCCATCACTGAGGACATGCTGTGTGCCGGCTACTTGG760AGGGGGAGCGGGATGCTTGTCTGGGCGACTCCGGGGGCCC800CCTCATGTGCCAGGTGGACGGCGCCTGGCTGCTGGCCGGC840ATCATCAGCTGGGGCGAGGGCTGTGCCGAGCGCAACAGGC880CCGGGGTCTACATCAGCCTCTCTGCGCACCGCTCCTGGGT920GGAGAAGATCGTGCAAGGGGTGCAGCTCCGCGGGCGCGCT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。