基因總覽
PRRC2A（proline rich coiled-coil 2A）是由蛋白質編碼基因 PRRC2A 產生的蛋白質，屬於 PRRC2 family。其序列長 2,157 個胺基酸，包含多組重複區域，並有多段被註解為無序的區域；這些結構特徵構成蛋白質的基本組成。來源描述 PRRC2A 可辨識並結合含 N6-methyladenosine（m6A）的 mRNA，並指出其與 RNA 調控及轉譯相關功能有關。多項生物學角色及部分作用依據標示為相似性推論，因此其證據性質並非全然相同。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000376033 ★ | 31,620,715–31,637,771 | 31 |
| ENST00000376007 | 31,620,675–31,637,771 | 31 |
| ENST00001138608 | 31,620,675–31,637,771 | 31 |
顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
PRRC2A 可辨識並結合含 N6-methyladenosine（m6A）的 mRNA；此項描述標示為依相似性推論。來源亦指出它參與少突膠質細胞譜系指定與髓鞘形成：PRRC2A 結合少突膠質細胞轉錄因子 OLIG2 的 mRNA，並促進該 mRNA 穩定性。這些作用同樣屬於相似性推論。
在小膠質細胞中，PRRC2A 被描述為小膠質細胞成熟與增殖所必需。其方式是結合並穩定小膠質細胞發育與功能所需的轉錄本；來源將這項功能標示為相似性推論，並未在此提供其他作用條件或實驗細節。
PRRC2A 也能促進 leaky scanning。當 mRNA 含有位於上游的開放閱讀框（ORF）時，核糖體可略過這些上游 ORF 的轉譯起始密碼子，使下游主要 ORF 得以較有效率地進行轉譯。此功能由來源列出的研究支持。
在精子生成期間，PRRC2A 透過促進目標基因的轉譯，對完成減數分裂 I 為必需；這項描述依相似性推論。此外，來源指出 PRRC2A 可能參與前體 mRNA 剪接調控，但僅表述為可能具有此作用。以上資料涵蓋 RNA 穩定性、轉譯與剪接等層面的功能，不應將推論性描述視為同等程度的直接證據。
Promoter 與基因調控
>PRRC2A ENST00000376033 GRCh38 chr6:31619715-31620815 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AATGATCTGTTGAATGGGTATAACTCTGATGGGAGCAGAGAGTTCTAGAATCGGGTAGTAAGAGACAAAG GAGGGTAACAGTACTGCATTTCACAAAATGAAACCCATTGTTAAGAAATTACAAATTCCCAATAATTTCA AATATAAAAATTTATTCATGAAAATTATAGGTTATAAAATTAAATGTCCGTCTTAGTCGATGGTTGCCCA TATTTTGATGAACGAGTCATTCCTAGCCTATCTTTGTTCAAATGATTTGCATACATTATGCAAATAGGTA GAACTGCCCGAAGAATGCCTACGCTGCGTGGTGCGGACGAAACGCTTCCCGGGGCCTTTGGATTGGTCTG TCTAGCCACCTCATTTGCATGACGTAATATAATAACTGGAAGGCCCCGCCCCTCTGGTGCATTTCCCCGC TCCAACCACCTCCTCAAACTCACGGCAAAGGGATGCGAGAGCTGGAACTCTTACCAGGCCTGCGGAAACT CAGCCCTCCGGCAGCTAATCCCGCCCGCCAGCCCCCGTCCTCTCTCTCTTTCTCCCTAGCTGAAGGCGCC ACGGGCCGTGTGTCGTTGCCTTCCACTTTTGGCGTCCCAACGTCTCTCCGCTCCCATCTTTCTACTAACG TCCGACGCACGCTCCGCCTCTTTCTCCCACATTCGTCGTGTAAATTCTGCGTCCCAACCGCCCAGCCGAC CTGCACCGCATTCCCGCCCCCTCAACACGGCTCAACGGCCGACGCTGGGGGCCCGCCTCCTTAGCCAATC GGGGTCCTAGTGCCCTTAAGTCCCTCCTCTTTATGCAAATAACCTCCGCATGCTCCGCGCGCCCGGCCCT TTTTTTTTTTTTTTTAAACTAAAGACAGCCCTGGAAGTAGAGGGTTAGGGTAGAAAGTGCCCCGCCCTTT ATGCAAATTAAGGGGCGTGTCTAGGCGCGGAGGGAGGTGGGAGGTGGGAGGGGGTGCTCCCGGGGGCGGC GGTTGCCCGGATGGGCCGTTAGTCGGGGCTCAGCCGCGGAGTGAGCGAGGGAGACGGGAGGAGCCGAACC CGGCGCCATCCGCCGCCATCCTCCCCCGCCCCACCGCCATCCCGTCCCGGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| PRRC2A_1 ↗ | 6:31,620,715 | 正股 | 31,620,666–31,620,725 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR6_9GJS4 · promoter · 31615501–31616001 · regulatory
ENSR6_9GJT9 · promoter · 31619630–31620130 · regulatory
ENSR6_8X4PQ · enhancer · 31620131–31620329 · regulatory
ENSR6_9GJTG · promoter · 31620330–31620730 · regulatory
ENSR6_9GJTJ · enhancer · 31620731–31620987 · regulatory
ENSR6_59FRXG · CTCF_binding_site · 31620764–31620785 · regulatory
ENSR6_9GJTM · promoter · 31620988–31621488 · regulatory
ENSR6_59FS2H · CTCF_binding_site · 31621198–31621219 · regulatory
ENSR6_9GJW3 · promoter · 31622284–31622784 · regulatory
· motif · 31615846–31615859 · motif
· motif · 31616142–31616153 · motif
· motif · 31616274–31616287 · motif
· motif · 31616276–31616287 · motif
· motif · 31616276–31616287 · motif
· motif · 31616509–31616529 · motif
· motif · 31619966–31619979 · motif
· motif · 31619979–31619992 · motif
· motif · 31620074–31620087 · motif
· motif · 31620081–31620094 · motif
· motif · 31620081–31620094 · motif
· motif · 31620107–31620117 · motif
· motif · 31620367–31620389 · motif
· motif · 31620425–31620435 · motif
· motif · 31620427–31620440 · motif
· motif · 31620464–31620474 · motif
· motif · 31620514–31620527 · motif
· motif · 31620529–31620540 · motif
· motif · 31620613–31620623 · motif
· motif · 31620622–31620635 · motif
· motif · 31620635–31620645 · motif
· motif · 31620668–31620678 · motif
· motif · 31620681–31620694 · motif
· motif · 31620766–31620782 · motif
· motif · 31620783–31620796 · motif
· motif · 31620787–31620797 · motif
· motif · 31620923–31620936 · motif
· motif · 31620926–31620939 · motif
· motif · 31620929–31620942 · motif
· motif · 31620976–31620986 · motif
· motif · 31621012–31621022 · motif
· motif · 31621046–31621055 · motif
· motif · 31621048–31621057 · motif
· motif · 31621170–31621180 · motif
· motif · 31621200–31621216 · motif
· motif · 31621426–31621437 · motif
· motif · 31621680–31621691 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：2157 aa
PRRC2A 蛋白質長 2,157 個胺基酸，屬於 PRRC2 family。序列含多組重複區域，包括四組 type A、兩組 type B 與三組 type C 重複；另有數段區域被註解為無序區。來源未提供這些區域各自的具體分子作用。
蛋白質三維結構
細胞內定位
在生殖細胞中，除延長型精子細胞外，各類生殖細胞均有細胞質定位；來源並指出它可見於 chromatoid bodies。 生殖細胞定位與 chromatoid bodies 的描述標示為相似性推論。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- ATXN1P54253 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- JUNP05412 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | PRRC2A 可辨識並結合含 N6-methyladenosine（m6A）的 mRNA。它透過結合 OLIG2 mRNA 並促進其穩定性，調控少突膠質細胞譜系指定與髓鞘形成；也藉由結合、穩定小膠質細胞發育及功能所需轉錄本，支持其成熟與增殖。它促進核糖體略過上游 ORF 起始密碼子的 leaky scanning，提升下游主要 ORF 的轉譯效率；在精子生成時，促進目標基因轉譯以完成減數分裂 I。另可能參與前體 mRNA 剪接調控。部分功能依相似性推論。 | 含實驗來源 | 證據與來源Recognizes and binds to N6-methyladenosine (m6A)-containing mRNAs (By similarity). Controls oligodendroglial specification and myelination by binding to oligodendrocyte transcription factor OLIG2 mRNA and promoting its stability (By similarity). Required for microglial maturation and proliferation by binding to and stabilizing essential developmental and functional transcripts of microglia (By similarity). Promotes leaky scanning, allowing ribosomes to bypass the translation start codons of upstream open reading frames (ORFs) in mRNAs and facilitating efficient translation of the downstream main ORF. Required for meiosis I completion during spermatogenesis by promoting the translation of target genes (By similarity). May play a role in the regulation of pre-mRNA splicing PMID 14667819 ↗ · PMID 36869665 ↗ |
| 細胞定位 | PRRC2A 位於細胞質與細胞核；在生殖細胞中，除延長型精子細胞外，各類生殖細胞均有細胞質定位。它也被描述為存在於 chromatoid bodies。生殖細胞中的定位與 chromatoid bodies 相關描述標示為依相似性推論。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm; Nucleus; Localizes to the cytoplasm in all types of germ cells except elongated spermatids (By similarity). Found in chromatoid bodies (By similarity) PMID 15752841 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGTCGGGGCTCAGCCGCGGAGTGAGCGAGGGAGACGGGAG40GAGCCGAACCCGGCGCCATCCGCCGCCATCCTCCCCCGCC80CCACCGCCATCCCGTCCCGGGGAGCCCCTAGGCCCGGGTC120CCGGATCCCCGCGCACCCGGCCAGGGGACAGAGACTGAGA160CACTTGCTGTCTGGCCCACAGGCTCTGGCACGTTTTGGGG200GAGGTGCCTGCAGGACCCAACATACTCAATGAGCTTCCAG240CGCAATGTCCGATCGCTCGGGGCCGACTGCCAAGGGAAAG280GATGGAAAGAAGTATTCCTCGCTCAACCTGTTTGATACGT320ATAAGGGCAAGTCCTTAGAGATCCAGAAACCCGCTGTTGC360CCCTCGCCATGGCCTGCAGAGTCTCGGGAAAGTTGCCATT400GCCCGGCGTATGCCACCTCCAGCCAACCTTCCAAGCCTGA440AAGCCGAGAACAAAGGCAATGACCCCAATGTCTCACTAGT480GCCAAAAGACGGAACAGGATGGGCAAGCAAACAGGAGCAG520TCCGACCCCAAGAGTTCCGATGCCTCAACCGCTCAGCCGC560CGGAATCGCAGCCACTGCCGGCTTCACAGACGCCTGCCTC600CAACCAGCCGAAACGACCCCCAGCAGCCCCCGAGAACACT640CCTTTGGTTCCAAGCGGGGTAAAGTCCTGGGCACAAGCCA680GCGTCACCCATGGAGCACATGGAGATGGTGGAAGGGCATC720AAGCCTACTGTCACGATTCTCTCGAGAGGAATTTCCGACC760CTGCAGGCGGCTGGCGACCAGGACAAGGCTGCCAAGGAAA800GGGAGTCTGCCGAACAGTCGTCTGGGCCCGGACCAAGCCT840CCGCCCCCAAAATTCTACAACTTGGAGGGACGGAGGTGGG880CGTGGCCCTGATGAGCTGGAGGGCCCGGACTCCAAACTTC920ATCATGGTCATGATCCCCGGGGTGGGCTACAGCCTTCAGG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。