演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

PRMT5SKB1Hs

protein arginine methyltransferase 5

PRMT5 編碼 protein arginine methyltransferase 5,可催化蛋白質精胺酸殘基甲基化,參與 RNA 剪接、轉錄調控及多種訊息傳遞過程。

Homo sapiens14q11.2UniProt O14744
OFFICIAL SYMBOL
PRMT5
CHROMOSOME
14
UNIPROT
O14744
PDB / ALPHAFOLD
4GQB
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

PRMT5 是蛋白質編碼基因,產物 protein arginine methyltransferase 5 屬於 Protein arginine N-methyltransferase family,並歸入 class I-like SAM-binding methyltransferase superfamily。這類酵素以蛋白質精胺酸殘基為修飾對象,能催化單甲基化或對稱性雙甲基化;其底物涵蓋多種蛋白質,因此可參與不同細胞活動的調節。蛋白質全長為 637 個胺基酸,包含 SAM-dependent MTase PRMT-type 結構域,並有 TIM barrel 與 beta barrel 區域;其中另註有二聚化區段。

Official symbol
PRMT5
Gene name
protein arginine methyltransferase 5
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10894
UniProt
O14744
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
SKB1HsHRMT1L5SKB1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1414q11.2
chr14 · 107,043,718 bp · GRCh38chr14p13 · 1–3600000 · gvarchr14p12 · 3600001–8000000 · stalkchr14p11.2 · 8000001–16100000 · gvarchr14p11.1 · 16100001–17200000 · acenchr14q11.1 · 17200001–18200000 · acenchr14q11.2 · 18200001–24100000 · gnegchr14q12 · 24100001–32900000 · gpos100chr14q13.1 · 32900001–34800000 · gnegchr14q13.2 · 34800001–36100000 · gpos50chr14q13.3 · 36100001–37400000 · gnegchr14q21.1 · 37400001–43000000 · gpos100chr14q21.2 · 43000001–46700000 · gnegchr14q21.3 · 46700001–50400000 · gpos100chr14q22.1 · 50400001–53600000 · gnegchr14q22.2 · 53600001–55000000 · gpos25chr14q22.3 · 55000001–57600000 · gnegchr14q23.1 · 57600001–61600000 · gpos75chr14q23.2 · 61600001–64300000 · gnegchr14q23.3 · 64300001–67400000 · gpos50chr14q24.1 · 67400001–69800000 · gnegchr14q24.2 · 69800001–73300000 · gpos50chr14q24.3 · 73300001–78800000 · gnegchr14q31.1 · 78800001–83100000 · gpos100chr14q31.2 · 83100001–84400000 · gnegchr14q31.3 · 84400001–89300000 · gpos100chr14q32.11 · 89300001–91400000 · gnegchr14q32.12 · 91400001–94200000 · gpos25chr14q32.13 · 94200001–95800000 · gnegchr14q32.2 · 95800001–100900000 · gpos50chr14q32.31 · 100900001–102700000 · gnegchr14q32.32 · 102700001–103500000 · gpos50chr14q32.33 · 103500001–107043718 · gnegPRMT5pq1 bp107,043,718 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr14:22,920,108–22,929,458
Gene span
9,351 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000324366 ★22,920,529–22,929,37617
ENST0000039744122,920,108–22,929,40117
ENST0000039744022,920,108–22,929,35613
ENST0000021635022,920,108–22,929,39116
ENST0000055389722,920,108–22,929,45816
ENST0000090353522,920,108–22,929,45817
ENST0000090353622,920,108–22,929,45817
ENST0000094838622,920,108–22,929,45816
ENST0000105467822,920,108–22,929,45817
ENST0000106609522,920,108–22,929,45817
ENST0000111013922,920,108–22,929,45814
ENST0000111274622,920,108–22,929,45817

顯示 12/25 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

PRMT5 是精胺酸甲基轉移酶,可在蛋白質精胺酸上形成 omega-N 單甲基精胺酸(MMA)或對稱性二甲基精胺酸(sDMA),且偏好形成 MMA。其修飾對象多元,影響 RNA 處理、轉錄、訊息傳遞與細胞活動;不同底物上的甲基化結果也不盡相同。

在小核核糖核蛋白方面,PRMT5 對 Sm D1(SNRPD1)與 Sm D3(SNRPD3)進行對稱性二甲基化,此修飾是 snRNP 核心顆粒組裝與生成所必需。它也能對 SNRPB 進行相同類型的修飾,並與 TDRD6 的作用相關,參與前期第一減數分裂精母細胞中的剪接體成熟及 mRNA 剪接。對 POLR2A 的對稱性甲基化則有助於 SMN1/SMN2 與 SETX 等蛋白質被募集,並支持 RNA 聚合酶 II 轉錄末端形成的 RNA-DNA 雜合結構(R-loop)解決,這是正常轉錄終止的重要步驟。

PRMT5 也參與基因表現調控。它可甲基化組蛋白 H2A、H4 與 H3;其中 H3 Arg-8 的修飾可能抑制轉錄,H4R3 二甲基化則參與 CRY1 對 PER1 的轉錄共抑制。在生殖細胞發育期間,它會修飾組蛋白 H2A 與 H4 的 Arg-3。PRMT5 與 LYAR 一同結合 HBG1/HBG2 啟動子並抑制其表現;此外也會甲基化 HOXA9、NCL、RPS10、TP53 等蛋白質。TP53 甲基化可能影響其標的基因選擇性,但此作用仍以可能性描述。PRMT5 對 cyclin E1 啟動子活性的負向調節,亦伴隨細胞增殖受抑。

在訊息傳遞與細胞結構調節上,PRMT5 透過兩個層次減弱 EGF 經 MAPK1/MAPK3 傳遞的訊號:它單甲基化 EGFR,促進 EGFR Tyr-1197 磷酸化及 PTPN6 募集,最終降低 SOS1 磷酸化;另會甲基化 RAF1,並可能甲基化 BRAF,使這些蛋白不穩定且催化活性降低。PRMT5 也會甲基化並調節與細胞遷移、分化有關的 SRGAP2,修飾 GM130/GOLGA2 以調節 Golgi ribbon 形成,並在發炎部位的內皮細胞表面 E-selectin 與 VCAM-1 誘導中具有必要作用。它還能甲基化 CGAS、阻止其 DNA 結合能力,因而負向調節 cGAS-STING 訊號。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 22929376 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>PRMT5 ENST00000324366 GRCh38 chr14:22929276-22930376 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GTCTCTTGTACCGTGTTCTCCTCTCCATCCTTGCTGCCGAGCCCTCAACACCAGTGGGCCCCCTGCCTTC
TGGAGTTCCCATTTACCTCCCTATGTCTTTCCTTGCTTCCTTCCTTTCCATCTCTAGCAGCTAATGACAT
GAGAAAATGTAGATTCTCTCTGGCCTCCATGCCAGCCAATTTCATGACTGCTGCCCACTGTAATTAATGA
ATTCCTTTTCTCTATCTTGAGGTGTGTGTGTGTGTTTAGGCGTTTATTTACACCTTTTGTGTTTGAAACA
CAAAACACTACTTCCTAGAATCACTAGGAAGTAGTAGCTGAGTTAGCAGTTTATTTTAATATGTAACATA
GTAAGGTGACAAAGCTCATTTTAATAGCACCAGCCATTAACCCAGTTTTCTCAGTGTTCATATGGACGTA
AATAATGACACAAGAAAAACACTTTTGAGGGTAGTTACGGGAAAAGCTGACATTACATGGCTGCATAACC
CAACCGACTCAGGATCTGATAATGAAAGCGTGAAGATAATAAAGAAGCATCAAGCTGCGAAAGGAAAGGA
AAATTACAAAATGCTCACGCAGCGAAGCTGCGAGGAACCCCACCGAGCCAGCCAGGAGTCGAACCTGGAA
TCTTCTGATCCGTAGTCAGACGCGTTATCCATTGCGCCACTGGCCCTGAGATGGCACTGTTTCTCTCCGT
GATGGTACTTCAAGGTTATACTGCAGGGTTTCATGGGCGGTGTAGTCTCTCAACGGCGTTCTTCAGATAG
ACTAAGCATTCTGGGAGATTGAAGTTCGTCAGGAACCAGACCCTGAGATTGGTGGATCCATGCCGTACGC
CACTGTGCAGCCCGCGGATTGGCAGGAAAAGCCACTCCCCATCCCTCCTGTTCGGGAGCTGTGGCAGACG
CTCTGGTTGTTAAGGCGACTCGTCCCGCCTTCTGGGGCACTAGTTTGACTTTGTGATTGGCTACTAGTAT
CAAGGAATCCCGGCGTGGACAGCGCGAGGAGAAAGATGGCGGCGATGGCGGTCGGGGGTGCTGGTGGGAG
CCGCGTGTCCAGCGGGAGGGACCTGAATTGCGTCCCCGAAATAGCTGACAC
PRMT5 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
PRMT5_1 ↗14:22,929,376負股22,929,366–22,929,425

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR14_9C4PN · promoter · 22929346–22929623 · regulatory

ENSR14_C49FQ · enhancer · 22929624–22931363 · regulatory

ENSR14_73CF26 · enhancer · 22931515–22931621 · regulatory

· motif · 22927270–22927284 · motif

· motif · 22927276–22927290 · motif

· motif · 22927406–22927420 · motif

· motif · 22929154–22929169 · motif

· motif · 22929320–22929336 · motif

· motif · 22929320–22929336 · motif

· motif · 22929343–22929360 · motif

· motif · 22929344–22929354 · motif

· motif · 22929353–22929363 · motif

· motif · 22929447–22929462 · motif

· motif · 22929447–22929462 · motif

· motif · 22929496–22929506 · motif

· motif · 22929508–22929519 · motif

· motif · 22929707–22929716 · motif

· motif · 22929782–22929804 · motif

· motif · 22929782–22929804 · motif

· motif · 22929792–22929806 · motif

· motif · 22929792–22929806 · motif

· motif · 22929811–22929831 · motif

· motif · 22930048–22930062 · motif

· motif · 22930048–22930062 · motif

· motif · 22930099–22930121 · motif

· motif · 22930099–22930121 · motif

· motif · 22930111–22930123 · motif

· motif · 22930113–22930128 · motif

· motif · 22930423–22930437 · motif

· motif · 22930423–22930437 · motif

· motif · 22930509–22930523 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:637 aa

1 aa637 aa結構域功能區域
依 O14744 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

protein arginine methyltransferase 5 全長 637 個胺基酸,屬於 class I-like SAM-binding methyltransferase superfamily 及 Protein arginine N-methyltransferase family。其 SAM-dependent MTase PRMT-type 結構域位於胺基酸 308–615;另有胺基酸 13–292 的 TIM barrel 區域,以及 465–637 的 beta barrel 區域。胺基酸 488–494 被標註為二聚化區段。

結構域SAM-dependent MTase PRMT-type308–615 aa
功能區域TIM barrel13–292 aa
功能區域Beta barrel465–637 aa
功能區域Dimerization488–494 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 4GQB…

PDB · 4GQB

X-ray · 2.06 A · A=1-637

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Nucleus;Chromosome;Golgi apparatus

PRMT5 可見於細胞質、細胞核、染色體及 Golgi apparatus。 它也定位於甲基化染色質,並可到達染色體上目標基因的啟動子區域;來源未說明這些定位之間的動態變化或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Chromosome。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 45 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SKB1HsPRMT5AGTAIRIMBRK1CACNB2CCT2CDC37CDYL2CLNS1ACOMTCOPRSCRY1DNMT3AE2F1EHHADHEIF4A3ELOAEPHB6FAM47EFOSGAS8GRB2GRHL3GTPBP2H4C9HOXA9HSF1KANK2KLKB1LNX1LPLNFE4NTAQ1NUDCD2POLR2ARBM23RIOK1SRGAP2TRIB3UQCRC1VHLWDR77YWHAZZMYND19AjubaN
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 45 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

PRMT5 至少可形成同源二聚體與同源四聚體,也參與由 PRMT5、WDR77 和 CLNS1A 組成的 methylosome。它另可與 WDR77、RIOK1 形成複合體;RIOK1 與 CLNS1A 以互斥方式結合 PRMT5,分別促進不同底物(如 NCL 與 Sm 蛋白)的募集。PRMT5 亦出現在包含 CLNS1A/pICln 與 Sm 蛋白的複合體中,並與多種蛋白質直接或以未特定方式互作。部分互作具有明確條件,例如 DNA 損傷時 TTC5/STRAP 促進 PRMT5 與 TP53 的互作;FAM47E 則可直接結合 PRMT5,促進其定位至染色質,且不破壞其與 WDR77 或 STUB1 的關聯。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能PRMT5 可催化蛋白質精胺酸形成單甲基化 MMA 或對稱性雙甲基化 sDMA,且偏好 MMA。它修飾 Sm 蛋白以支持 snRNP 核心顆粒生成,也參與剪接、轉錄與訊息傳遞調節;其底物還包括組蛋白、EGFR、RAF1、CGAS 等。部分作用標註為可能或依相似性推定,例如 H3 Arg-8 修飾可能抑制轉錄,TP53 甲基化可能改變標的基因選擇性。含實驗來源
證據與來源

Arginine methyltransferase that can both catalyze the formation of omega-N monomethylarginine (MMA) and symmetrical dimethylarginine (sDMA), with a preference for the formation of MMA. Specifically mediates the symmetrical dimethylation of arginine residues in the small nuclear ribonucleoproteins Sm D1 (SNRPD1) and Sm D3 (SNRPD3); such methylation being required for the assembly and biogenesis of snRNP core particles. Methylates SUPT5H and may regulate its transcriptional elongation properties. May methylate the N-terminal region of MBD2. Mono- and dimethylates arginine residues of myelin basic protein (MBP) in vitro. May play a role in cytokine-activated transduction pathways. Negatively regulates cyclin E1 promoter activity and cellular proliferation. Methylates histone H2A and H4 'Arg-3' during germ cell development (By similarity). Methylates histone H3 'Arg-8', which may repress transcription (By similarity). Methylates the Piwi proteins (PIWIL1, PIWIL2 and PIWIL4), methylation of Piwi proteins being required for the interaction with Tudor domain-containing proteins and subsequent localization to the meiotic nuage (By similarity). Methylates RPS10. Attenuates EGF signaling through the MAPK1/MAPK3 pathway acting at 2 levels. First, monomethylates EGFR; this enhances EGFR 'Tyr-1197' phosphorylation and PTPN6 recruitment, eventually leading to reduced SOS1 phosphorylation. Second, methylates RAF1 and probably BRAF, hence destabilizing these 2 signaling proteins and reducing their catalytic activity. Required for induction of E-selectin and VCAM-1, on the endothelial cells surface at sites of inflammation. Methylates HOXA9. Methylates and regulates SRGAP2 which is involved in cell migration and differentiation. Acts as a transcriptional corepressor in CRY1-mediated repression of the core circadian component PER1 by regulating the H4R3 dimethylation at the PER1 promoter (By similarity). Methylates GM130/GOLGA2, regulating Golgi ribbon formation. Methylates H4R3 in genes involved in glioblastomagenesis in a CHTOP- and/or TET1-dependent manner. Symmetrically methylates POLR2A, a modification that allows the recruitment to POLR2A of proteins including SMN1/SMN2 and SETX. This is required for resolving RNA-DNA hybrids created by RNA polymerase II, that form R-loop in transcription terminal regions, an important step in proper transcription termination. Along with LYAR, binds the promoter of gamma-globin HBG1/HBG2 and represses its expression. Symmetrically methylates NCL. Methylates p53/TP53; methylation might possibly affect p53/TP53 target gene specificity. Involved in spliceosome maturation and mRNA splicing in prophase I spermatocytes through the catalysis of the symmetrical arginine dimethylation of SNRPB (small nuclear ribonucleoprotein-associated protein) and the interaction with tudor domain-containing protein TDRD6 (By similarity). Acts as a negative regulator of cGAS-STING signaling by mediating methylation of CGAS, preventing DNA-binding ability of CGAS

PMID 10531356 ↗ · PMID 11152681 ↗ · PMID 11747828 ↗ · PMID 12411503 ↗ · PMID 12718890 ↗ · PMID 15737618 ↗ · PMID 16428440 ↗ · PMID 17709427 ↗ · PMID 19011621 ↗ · PMID 20159986 ↗ · PMID 20421892 ↗ · PMID 20810653 ↗ · PMID 21081503 ↗ · PMID 21258366 ↗ · PMID 21917714 ↗ · PMID 22269951 ↗ · PMID 25092918 ↗ · PMID 25284789 ↗ · PMID 26700805 ↗ · PMID 33762328 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-arginyl-[protein] + 2 S-adenosyl-L-methionine = N(omega),N(omega)'-dimethyl-L-arginyl-[protein] + 2 S-adenosyl-L-homocysteine + 2 H(+)含實驗來源
證據與來源

L-arginyl-[protein] + 2 S-adenosyl-L-methionine = N(omega),N(omega)'-dimethyl-L-arginyl-[protein] + 2 S-adenosyl-L-homocysteine + 2 H(+)

PMID 19011621 ↗ · PMID 21081503 ↗ · PMID 23071334 ↗ · PMID 33762328 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用PRMT5 可形成同源二聚體及四聚體,並參與由 PRMT5、WDR77、CLNS1A 組成的 methylosome,也能與 RIOK1 形成複合體;RIOK1 與 CLNS1A 對 PRMT5 的結合互斥,並對應不同底物募集。來源另列出多種互作與複合體關係。DNA 損傷時,TTC5/STRAP 促進 PRMT5 與 TP53 的互作;FAM47E 可直接結合 PRMT5,促進其至染色質定位,且不破壞其與 WDR77 或 STUB1 的關聯。含實驗來源
證據與來源

Forms, at least, homodimers and homotetramers. Component of the methylosome complex, composed of PRMT5, WDR77 and CLNS1A. Found in a complex composed of PRMT5, WDR77 and RIOK1. RIOK1 and CLNS1A associate with PRMT5 in a mutually exclusive fashion, which allows the recruitment of distinct methylation substrates, such as nucleolin/NCL and Sm proteins, respectively. Interacts with PRDM1 (By similarity). Identified in a complex composed of methylosome and PRMT1 and ERH. Interacts with EGFR; methylates EGFR and stimulates EGFR-mediated ERK activation. Interacts with HOXA9. Interacts with SRGAP2. Found in a complex with COPRS, RUNX1 and CBFB. Interacts with CHTOP; the interaction symmetrically methylates CHTOP, but seems to require the presence of PRMT1. Interacts with EPB41L3; this modulates methylation of target proteins. Component of a high molecular weight E2F-pocket protein complex, CERC (cyclin E1 repressor complex). Associates with SWI/SNF remodeling complexes containing SMARCA2 and SMARCA4. Interacts with JAK2, SSTR1, SUPT5H, BRAF and with active RAF1. Interacts with LSM11, PRMT7 and SNRPD3. Interacts with COPRS; promoting its recruitment on histone H4. Interacts with CLNS1A/pICln. Identified in a complex with CLNS1A/pICln and Sm proteins. Interacts with RPS10. Interacts with WDR77. Interacts with IWS1. Interacts with CRY1. Interacts with POLR2A. Interacts with SMN1/SMN2. Interacts with LYAR; this interaction is direct. Interacts with TTC5/STRAP; this interaction is DNA damage-dependent and promotes PRMT5 interaction with p53/TP53. Interacts with p53/TP53 in response to DNA damage; the interaction is TTC5/STRAP dependent. Interacts with FAM47E; the interaction is direct, promotes PRMT5 localization to chromatin, and does not disrupt its association with WDR77 or STUB1. Interacts with TDRD6 (By similarity). Interacts with STUB1. Interacts with MBD2. Does not interact with MBD3

PMID 10531356 ↗ · PMID 10734105 ↗ · PMID 11152681 ↗ · PMID 12411503 ↗ · PMID 12718890 ↗ · PMID 15485929 ↗ · PMID 15737618 ↗ · PMID 16087681 ↗ · PMID 16428440 ↗ · PMID 17184735 ↗ · PMID 17709427 ↗ · PMID 18404153 ↗ · PMID 18984161 ↗ · PMID 19011621 ↗ · PMID 20159986 ↗ · PMID 20810653 ↗ · PMID 21081503 ↗ · PMID 21258366 ↗ · PMID 21917714 ↗ · PMID 22269951 ↗ · PMID 23071334 ↗ · PMID 25092918 ↗ · PMID 25284789 ↗ · PMID 26700805 ↗ · PMID 33376131 ↗ · PMID 9556550 ↗

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細胞定位PRMT5 定位於細胞質、細胞核、染色體及 Golgi apparatus,也可位於甲基化染色質。另有資料指出它會到達染色體上目標基因的啟動子區域;此項定位描述未提供其他條件或異構型差異。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm; Nucleus; Chromosome; Golgi apparatus; Localizes to promoter regions of target genes on chromosomes. Localizes to methylated chromatin

PMID 21081503 ↗ · PMID 21917714 ↗ · PMID 22269951 ↗ · PMID 18404153 ↗ · PMID 16428440 ↗ · PMID 33376131 ↗ · PMID 20421892 ↗

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情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000324366 · 2,304 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGCGCGAGGAGAAAGATGGCGGCGATGGCGGTCGGGGGTG40
41CTGGTGGGAGCCGCGTGTCCAGCGGGAGGGACCTGAATTG80
81CGTCCCCGAAATAGCTGACACACTAGGGGCTGTGGCCAAG120
121CAGGGGTTTGATTTCCTCTGCATGCCTGTCTTCCATCCGC160
161GTTTCAAGAGGGAGTTCATTCAGGAACCTGCTAAGAATCG200
201GCCCGGTCCCCAGACACGATCAGACCTACTGCTGTCAGGA240
241AGGGACTGGAATACGCTAATTGTGGGAAAGCTTTCTCCAT280
281GGATTCGTCCAGACTCAAAAGTGGAGAAGATTCGCAGGAA320
321CTCCGAGGCGGCCATGTTACAGGAGCTGAATTTTGGTGCA360
361TATTTGGGTCTTCCAGCTTTCCTGCTGCCCCTTAATCAGG400
401AAGATAACACCAACCTGGCCAGAGTTTTGACCAACCACAT440
441CCACACTGGCCATCACTCTTCCATGTTCTGGATGCGGGTA480
481CCCTTGGTGGCACCAGAGGACCTGAGAGATGATATAATTG520
521AGAATGCACCAACTACACACACAGAGGAGTACAGTGGGGA560
561GGAGAAAACGTGGATGTGGTGGCACAACTTCCGGACTTTG600
601TGTGACTATAGTAAGAGGATTGCAGTGGCTCTTGAAATTG640
641GGGCTGACCTCCCATCTAATCATGTCATTGATCGCTGGCT680
681TGGGGAGCCCATCAAAGCAGCCATTCTCCCCACTAGCATT720
721TTCCTGACCAATAAGAAGGGATTTCCTGTTCTTTCTAAGA760
761TGCACCAGAGGCTCATCTTCCGGCTCCTCAAGTTGGAGGT800
801GCAGTTCATCATCACAGGCACCAACCACCACTCAGAGAAG840
841GAGTTCTGCTCCTACCTCCAATACCTGGAATACTTAAGCC880
881AGAACCGTCCTCCACCTAATGCCTATGAACTCTTTGCCAA920
921GGGCTATGAAGACTATCTGCAGTCCCCGCTTCAGCCACTG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。