演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

PRM3

protamine 3

PRM3 編碼 protamine 3,屬於 protamine P3 家族;在精子染色質中可取代 histones。

Homo sapiens16p13.13UniProt Q9NNZ6
OFFICIAL SYMBOL
PRM3
CHROMOSOME
16
UNIPROT
Q9NNZ6
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

PRM3 是蛋白質編碼基因,其正式名稱為 protamine 3。其產物屬於 protamine P3 家族,與精子染色質有關;在精子形成的單倍體階段,protamines 可取代染色質中的 histones。來源將其作用描述為相似性推定,因此此處不將相關功能表述為已獨立證實。

Official symbol
PRM3
Gene name
protamine 3
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13732
UniProt
Q9NNZ6
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1616p13.13
chr16 · 90,338,345 bp · GRCh38chr16p13.3 · 1–7800000 · gnegchr16p13.2 · 7800001–10400000 · gpos50chr16p13.13 · 10400001–12500000 · gnegchr16p13.12 · 12500001–14700000 · gpos50chr16p13.11 · 14700001–16700000 · gnegchr16p12.3 · 16700001–21200000 · gpos50chr16p12.2 · 21200001–24200000 · gnegchr16p12.1 · 24200001–28500000 · gpos50chr16p11.2 · 28500001–35300000 · gnegchr16p11.1 · 35300001–36800000 · acenchr16q11.1 · 36800001–38400000 · acenchr16q11.2 · 38400001–47000000 · gvarchr16q12.1 · 47000001–52600000 · gnegchr16q12.2 · 52600001–56000000 · gpos50chr16q13 · 56000001–57300000 · gnegchr16q21 · 57300001–66600000 · gpos100chr16q22.1 · 66600001–70800000 · gnegchr16q22.2 · 70800001–72800000 · gpos50chr16q22.3 · 72800001–74100000 · gnegchr16q23.1 · 74100001–79200000 · gpos75chr16q23.2 · 79200001–81600000 · gnegchr16q23.3 · 81600001–84100000 · gpos50chr16q24.1 · 84100001–87000000 · gnegchr16q24.2 · 87000001–88700000 · gpos25chr16q24.3 · 88700001–90338345 · gnegPRM3pq1 bp90,338,345 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr16:11,273,199–11,273,629
Gene span
431 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000327157 ★11,273,199–11,273,6291

顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

在精子形成的單倍體階段,protamines 可取代精子染色質中的 histones。這項描述指出 protamines 參與精子染色質的組成變化;來源標示此功能為相似性推定,並未提供 PRM3 的直接實驗細節。

來源亦指出,protamines 會使精子 DNA 緊密包裝,形成高度凝縮、穩定且不活躍的複合體。這描述了 DNA 包裝狀態及其穩定性與活性特徵,但沒有進一步說明具體分子作用方式或其他生物學過程。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 11273629 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>PRM3 ENST00000327157 GRCh38 chr16:11273529-11274629 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TCCTATGTTCAACTGATTCTCCTCCCTAACCTCCTGAGTAGCTGAAGGAGCTAAACAAATTTTTTTTTTT
TTTTTTTTTTGGTATTTTTAGTAAAGACATGGTTTCACGATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTTCTGAC
CTCAGATGATCTGCCTGCCTCGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCTGGCCTC
AAAAAATTTATATTTAAAAAATACCATTGCAGTGTACAAACGACTCATTTCAATGTATAAAAGACAAAGT
CCTAAACCCCCTCCCCCCATGCTGAAATTGTGCTGCACAGATGTGGAACCTTGCCAAGGGGCAGCTCCAT
GATGTCTTCTCTGTGGCCCCAAAACACTTAAGAGGATGTCACTCCACCCTGACCTGGGTAGAGTGGCCTC
TGGTTGGTGGTGTCCATCTTGCATCAGTCAGGGACAAAGCAACCCCTTGTTCATCCCAGCTTGGTTTCTG
GCCTGTTCCCATGCCTTGGACAAACAAACAATGCTTAGGAGCCATTGCCTTTCAAGAAGATTTCACACTT
TCAGGCCCCCGAAGGAAGACTTCCAAGGGTTCCTGAGTTTTATGAGCTTACAGAGTGCATACATTTTAAG
CACACAGCTTGATGATTTATTTCCAAGGGTTAACAGTCAAGAAACTCAACAGAGACAGCTCTCTCTGGCT
GGCGATTTCTGGGATGTGGGGAGGAGTCTGTGTGTGCCCCTCCTGCTTCTAGAAATTCAATCCCTAACTC
CCATCCCAGCTACAAGGGAAACTTTCTCCAGGGCAAATGAGGACTATGGTGTGGCATCCGAACTGGCCCC
AGTGCTCAGCCTTGCAGACCTCCCCTGTGGGGGCTGGGAGCTGCCAGTGGCTGAGGTGTGAGTTAACTGT
TGGCTCAGACCCAGGTTCCCAAGTGGGGATGGGCTCCCTTTGTGATGTCAGCATCCTGCCCCCACTCGCA
GCCCCTTCACCCACCGCCTCACCTCCTTGCCCAGAGAGACAGGCAACGTAGACCATGGGTTCCCGCTGTG
CCAAGCTCAACACAGGCCAGAGCCCAGGCCACAGCCCAGGCCACAGCACGG
PRM3 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR16_8BXM8 · enhancer · 11273792–11273969 · regulatory

· motif · 11277025–11277034 · motif

· motif · 11277025–11277034 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:103 aa

1 aa103 aa功能區域
依 Q9NNZ6 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

protamine 3 屬於 protamine P3 家族。蛋白質長度為 103 個胺基酸;序列註解將第 1 至第 103 個胺基酸整段標示為無序區域。

功能區域Disordered1–103 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9NNZ6…

AlphaFold · Q9NNZ6

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus;Chromosome

protamine 3 的定位記錄包括細胞核與染色體。 來源未描述定位變化的條件或不同異構型之間的差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Chromosome。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
PRM3PRM3
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能在精子形成的單倍體階段,protamines 會取代精子染色質中的 histones,並使精子 DNA 緊密包裝成高度凝縮、穩定且不活躍的複合體。此功能標示為相似性推定。推論支持
證據與來源

Protamines substitute for histones in the chromatin of sperm during the haploid phase of spermatogenesis. They compact sperm DNA into a highly condensed, stable and inactive complex (By similarity)

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位此筆定位註記將蛋白質定位於細胞核及染色體。推論支持
證據與來源

Nucleus; Chromosome

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000327157 · 431 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACCTCCTTGCCCAGAGAGACAGGCAACGTAGACCATGGGT40
41TCCCGCTGTGCCAAGCTCAACACAGGCCAGAGCCCAGGCC80
81ACAGCCCAGGCCACAGCACGGGCCATGGCCGGGGCCACGA120
121ATCCTCCATGAAAAAGCTCATGGCCTGTGTGAGTCAGGAT160
161AACTTCTCCTTGTCATCAGCGGGCGAGGAAGAGGAGGAAG200
201AGGAGGAGGAGGGGGAAGAGGAGGAGAAAGAAGAGCTGCC240
241GGTGCAGGGCAAGCTGCTGCTGCTGGAGCCTGAGCGGCAG280
281GAGGAGGGCCACAAGGACAACGCCGAGGCCCAGCAGAGCC320
321CCGAGCCCAAGCGGACACCCTCCTGACCCGCAACGAAGGC360
361CCAGGAAGGGACGCCCACTGCTGCTCCGGCGACAGTGTTC400
401AGAGAAGAGTCAATAAAAAGTCTCTGAGGAA431

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。