基因總覽
PRDM15（PR/SET domain 15）是蛋白質編碼基因，其產物為具序列專一性 DNA 結合能力的轉錄調節因子。蛋白質含有 SET 結構域與多個 C2H2 型鋅指，並歸屬於 class V-like SAM-binding methyltransferase 超家族。來源資料將其描述為胚胎發育與細胞命運調控轉錄網絡中的分子節點；其具體轉錄調節作用見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000398548 ★ | 41,798,225–41,879,344 | 24 |
| ENST00000422911 | 41,798,225–41,879,482 | 25 |
| ENST00000269844 | 41,798,225–41,879,482 | 31 |
| ENST00000927550 | 41,798,225–41,878,717 | 25 |
| ENST00000491486 | 41,821,191–41,835,518 | 5 |
顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
PRDM15 是序列專一性 DNA 結合轉錄調節因子，在調控胚胎發育與細胞命運決定的轉錄網絡中扮演分子節點。它可刺激 Wnt/β-catenin 與 MAPK/ERK 路徑上游關鍵轉錄調節因子的表現：前者是轉錄活化因子，後者是轉錄抑制因子。這些調節因子與胚胎幹細胞的初始多能性及自我更新維持有關。
PRDM15 也能直接辨識並結合特定 DNA 序列，促進 SPRY1 與 RSPO1 啟動子區域的轉錄活化。這些作用顯示 PRDM15 可透過調節特定基因轉錄，參與相關訊息路徑的上游調控；來源並未進一步說明其對各路徑的直接分子作用方式。
依序列相似性推定，PRDM15 也參與早期胚胎發育；此外，已有資料指出它在誘導多能幹細胞（iPSCs）重編程中具有作用。這些功能描述涵蓋發育、幹細胞狀態維持及細胞命運轉換，但來源未提供其在各情境中的具體作用機制或效應細節。
Promoter 與基因調控
>PRDM15 ENST00000398548 GRCh38 chr21:41879244-41880344 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ACCCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGAGACTACGGGCACGTGCCACCGAGCCCAGCTAAGTTTTTT AGAGACAAGGTCTGGCTATGTTGCCCAGGTTGTATTAAACGTTTTAAAAAATCTTTGCTAATCTAATAAA AATGATCCCACTGCGACTTTTTTTCTCTTATTGCAGCGTAGTTGAATAGCTTCTCATATGCTTAAGAACC ATTGAATTTCCTACGAACTGTCCATCCACACACTTTGCTCATTTTTCTATATACATATATATTTTTATTG GTTCACAAGAGTTTCACGTACATGAGGGAAACGAGCCCTTTTGTGGCATCAATTTAAAATCATTTTCCCC GGTTCATCACTTCTCTTTATGAATGTAGGTTTTTGCCAGGCAGCAATGAACAAGACAGTCGGCCTCTCTG AATATGGGCGGCCAGGACTAAGGTGAAAAGTCTGTCCCTTCTCCGTCTCACGTTTTGTGATGGCACACAC ACTTGGTGGAGGGGGTCAAGAGAGGCCACACAGGCCCCCGGGGAAGAATGGAGAGCCAGGTCCGCGGCTG GCCCGGTGCTCACCGGTAGCGTGGCGGAGCCCGCCAGGCCAGACTCCCCTCGCGGGCACAGAGCTCGTGT CCCAGGGCCCCGCCGGCCAAATCCAGAGGTCACCGTGAGTGGGGGCAAGTCCCAGGCCTGTTCTAGAGAA AAACTCGACCCACCCACCGCCACCACTCCCCAACTCCGCAAGAAACGCGTCCGAGGAGAGGTGGAGAGGG AGCTGCCCGCGCGCGTGGGCGGCAGGGCCGTGCCACGTGGGAGGGGGGCCGCGCGCGGAATTCCCTCCGG CCAGACCCGCCCCGCGCGCGCCCGCTGCCCCGTCCACGCCGCCCGCGCCCCGCAGTCCCACCCGCAGGAC CCCCGGCCGCGCCAGGGTCTCGCCTGCGCCCCCCGCGCCCGCCCGCGGACTACAAGTCCCGCCATGCCCC GCCGCCGCCCCCCGGCTTCCGGTGCTGCGCAGTTTCCGGAGCGGATCGCAACCCGGAGTCCGGATCCGAT CCCGCTCTGCACATTCCAAAGGCAGGTAAAGCTCCGGGCCCTGCGCCCGCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| PRDM15_2 ↗ | 21:41,863,315 | 負股 | 41,863,305–41,863,364 |
| PRDM15_1 ↗ | 21:41,879,510 | 負股 | 41,879,500–41,879,559 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR21_8388KF · enhancer · 41877017–41877192 · regulatory
ENSR21_5CSXL3 · CTCF_binding_site · 41877217–41877238 · regulatory
ENSR21_66WZBB · CTCF_binding_site · 41877328–41877380 · regulatory
ENSR21_74GH6H · promoter · 41877603–41877703 · regulatory
ENSR21_C667F · enhancer · 41877761–41879333 · regulatory
ENSR21_5CSXTF · CTCF_binding_site · 41878806–41878827 · regulatory
ENSR21_BBBDZ · promoter · 41879334–41879972 · regulatory
· motif · 41877219–41877235 · motif
· motif · 41877330–41877346 · motif
· motif · 41877361–41877377 · motif
· motif · 41878216–41878224 · motif
· motif · 41878265–41878274 · motif
· motif · 41878265–41878274 · motif
· motif · 41878349–41878360 · motif
· motif · 41878400–41878415 · motif
· motif · 41878605–41878618 · motif
· motif · 41878741–41878757 · motif
· motif · 41878741–41878757 · motif
· motif · 41878786–41878799 · motif
· motif · 41878786–41878799 · motif
· motif · 41878787–41878800 · motif
· motif · 41878787–41878800 · motif
· motif · 41878808–41878824 · motif
· motif · 41878980–41878993 · motif
· motif · 41879153–41879163 · motif
· motif · 41879189–41879202 · motif
· motif · 41879342–41879351 · motif
· motif · 41879354–41879367 · motif
· motif · 41879463–41879476 · motif
· motif · 41879552–41879565 · motif
· motif · 41879679–41879691 · motif
· motif · 41879833–41879845 · motif
· motif · 41879836–41879843 · motif
· motif · 41879856–41879871 · motif
· motif · 41879856–41879871 · motif
· motif · 41881000–41881011 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1141 aa
PRDM15 蛋白質長 1,141 個胺基酸，含有位於第 49–159 位的 SET 結構域，以及 16 個 C2H2 型鋅指。另有數段區域被註記為無序區。蛋白質家族分類將其列入 class V-like SAM-binding methyltransferase 超家族；此分類本身不代表來源已證實其具體酵素活性。
蛋白質三維結構
細胞內定位
PRDM15 的細胞內定位記載於細胞核；來源未提供定位隨條件或異構型改變的資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
PRDM15 與 Zincore 複合體成分 QRICH1 和 SEPHS1 有互作。這些互作可能有助於 PRDM15 在全基因組 DNA 結合位點的穩定，但此穩定作用在來源中以推測方式描述。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | PRDM15 是具序列專一性的 DNA 結合轉錄調節因子，參與胚胎發育及細胞命運調控網絡。它促進 Wnt/β-catenin 路徑上游轉錄活化因子與 MAPK/ERK 路徑上游轉錄抑制因子的表現；這些因子與胚胎幹細胞初始多能性及自我更新維持相關。PRDM15 亦直接辨識並結合 SPRY1、RSPO1 啟動子中的特定 DNA 序列以促進轉錄活化；其早期胚胎發育作用為依序列相似性推定，另參與 iPSCs 重編程。 | 含實驗來源 | 證據與來源Sequence-specific DNA-binding transcriptional regulator. Plays a role as a molecular node in a transcriptional network regulating embryonic development and cell fate decision. Stimulates the expression of upstream key transcriptional activators and repressors of the Wnt/beta-catenin and MAPK/ERK pathways, respectively, that are essential for naive pluripotency and self-renewal maintenance of embryonic stem cells (ESCs). Specifically promotes SPRY1 and RSPO1 transcription activation through recognition and direct binding of a specific DNA sequence in their promoter regions. Involved in early embryo development (By similarity). Also plays a role in induced pluripotent stem cells (iPSCs) reprogramming PMID 28740264 ↗ |
| 交互作用 | PRDM15 與 Zincore 複合體成分 QRICH1 和 SEPHS1 有互作；這些互作可能使 PRDM15 在全基因組的 DNA 結合位點保持穩定，該穩定作用仍屬推測。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with Zincore complex components QRICH1 and SEPHS1; probably stabilizing PRDM15 at DNA-binding sites across the genome PMID 40608935 ↗ |
| 細胞定位 | PRDM15 的細胞內定位為細胞核。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GGTGCTGCGCAGTTTCCGGAGCGGATCGCAACCCGGAGTC40CGGATCCGATCCCGCTCTGCACATTCCAAAGGCAGGTGTC80AGAGATGGCTGAAGATGGGAGCGAAGAGATCATGTTCATC120TGGTGTGAAGACTGCAGCCAGTACCACGACTCCGAATGTC160CCGAGCTGGGCCCAGTGGTCATGGTCAAAGACTCCTTTGT200GTTAAGCAGGGCAAGGTCATCCCTTCCTCCCAACTTGGAG240ATCAGACGACTGGAAGATGGAGCCGAGGGGGTGTTCGCCA280TCACTCAGCTCGTCAAGCGGACACAGTTCGGTCCCTTTGA320GTCCAGGAGGGTCGCCAAATGGGAAAAGGAGTCTGCATTT360CCCCTGAAGGTGTTCCAGAAGGACGGGCACCCCGTGTGCT400TCGACACCTCCAACGAGGATGACTGCAACTGGATGATGCT440GGTGCGGCCAGCGGCGGAGGCCGAGCACCAGAACCTGACG480GCCTACCAGCACGGCAGCGACGTGTACTTCACCACCTCCA520GAGACATCCCCCCGGGTACCGAGCTGCGCGTGTGGTATGC560GGCCTTCTATGCCAAGAAGATGGACAAGCCCATGCTGAAG600CAGGCCGGCTCTGGCGTCCACGCTGCAGGCACCCCAGAAA640ACAGCGCCCCCGTGGAGTCGGAGCCCAGCCAGTGGGCGTG680TAAAGTGTGTTCTGCCACCTTCCTGGAGCTGCAGCTCCTC720AATGAACATCTGTTGGGCCACTTAGAACAAGCCAAAAGCC760TTCCTCCAGGCAGCCAAAGCGAGGCAGCAGCTCCCGAGAA800GGAGCAGGACACACCCCGGGGGGAACCCCCTGCAGTGCCC840GAGAGCGAGAATGTTGCCACCAAAGAACAGAAGAAAAAGC880CTCGAAGGGGGAGAAAACCCAAAGTGTCCAAAGCTGAGCA920GCCTCTAGTCATCGTGGAAGACAAGGAACCCACAGAGCAA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。