基因總覽
PRDM11 的正式名稱為 PR/SET domain 11，屬於蛋白質編碼基因。現有資料指出，其產物可能參與轉錄調控，但未提供更具體的調控方式或生物學情境。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000683152 ★ | 45,146,639–45,235,109 | 8 |
| ENST00000530656 | 45,095,806–45,224,908 | 7 |
| ENST00000534751 | 45,146,639–45,214,713 | 7 |
| ENST00000978830 | 45,146,639–45,214,743 | 7 |
| ENST00001051033 | 45,146,639–45,214,744 | 7 |
| ENST00001107164 | 45,146,639–45,225,089 | 7 |
| ENST00001142173 | 45,146,639–45,235,110 | 8 |
| ENST00000424263 | 45,147,299–45,225,087 | 7 |
| ENST00000622142 | 45,147,299–45,235,110 | 8 |
| ENST00001051034 | 45,147,299–45,214,743 | 7 |
| ENST00000959457 | 45,155,331–45,235,110 | 8 |
| ENST00000978831 | 45,180,666–45,214,744 | 7 |
顯示 12/18 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
PRDM11 可能參與轉錄調控。現有資料未進一步說明其作用機制、調控的基因或相關生物學過程，因此目前無法據此描述更具體的功能。
Promoter 與基因調控
>PRDM11 ENST00000683152 GRCh38 chr11:45145639-45146739 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTTGCACAGAGCATCCTCCCTTGGTAGGAGAGACGTCGCCATTGGGCCACAGGACTTGTAGAGGACGCCA CGAGAAAGGGGTTGATTGGGGAATGGTTGTCCTGGTTACGCCACCCTGCAGTGTCCCTTGCCCTCCTCCA AGGCTTCCAGCCCCATCGCAACCTGTCAGTTTTCCAGGCGCTCAGGAAAGCATGTCAAGCACTCAAGCAC TCTGTGACAATTCCACCCCCGGCCCAGTCTTTCCCTCTTCACCCCCTCTCTGTGATGTCGAATCCCATTT CACAGATGGAGAAACTGAGGAATCGAGCAAGTGAATGCCGCTTAAACATCTTTTCCAAGCCAGCCAGGGA CCAGCCCCTCCAGTTCTCAGAATCTCTCTCCCTCTGTAACATATTTTGACTTGAAGAACATGTGCGATTC GTGACTACAAAACCGCAACCCCACATAAAGAGTTAATATTTTTAACGAACCCCAAGCCCCTCACCCTCAG CCTTCGCGGGACGCCTGCGTCTCGCAACTTCAGTTTGTATCTCCAAACTGCTGAGCATTCAAAGGGTTAA ATGGGACCGGGAGGGGGCCAGCCGCGGAGCCCTGAAAGGGTTAAAAATCCAAACGCGTCGACTCCCCCCG ACTATTTGGTTCCAAATGGACAGCCACGCGACCGGGAGAGCCAGGGAGCCCCCCTCACAATGACTTTATT AAAATTTGAGAACTTTTACTTCTGACCCCAAAAAAGTATCCCAGTTCGAAAGTTCTCTCTTAACCTTTTC TTTTTTTCATCTATTTTTTTCTCGATTTCTCCACGGGCTGGATTATAAAACGCTCCCTCTCCCTTTGGGT TTGGAGAGCCGGGTTCCCCCCTCCGGGCAGGGCGCGGGCCTAAGGGGCCCCGGGAGTTTTCTCCGGGGCC GGGTCGGGACGCGGCTGGTGAGTCCCGGCTCCGGCCCCTGAATTGGGGGGTCCGCGTCTGCCCCAAACGC CGCTTTCTTCCGTTTTCCATGTCATTTCCTGTACTAATAAGATGGTGGTCAAAGCAGGGGAGGAGAGCAG CAGCGAGTCGCCGCCGCCGCCGCGCCGAGGCTGGCGCTGAAACTTTGCCTC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR11_9MWR5 · enhancer · 45142588–45142876 · regulatory
ENSR11_9MWS7 · promoter · 45146149–45146649 · regulatory
ENSR11_9MWSD · promoter · 45146853–45147353 · regulatory
ENSR11_BBXWR · enhancer · 45147354–45148250 · regulatory
· motif · 45146623–45146634 · motif
· motif · 45146948–45146961 · motif
· motif · 45146963–45146976 · motif
· motif · 45146989–45147002 · motif
· motif · 45147238–45147248 · motif
· motif · 45147291–45147301 · motif
· motif · 45147443–45147458 · motif
· motif · 45147514–45147522 · motif
· motif · 45147554–45147564 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：511 aa
PRDM11 蛋白質長 511 個胺基酸，屬於 class V-like SAM-binding methyltransferase 超家族。其 SET 結構域位於第 149–260 個胺基酸；第 389–438 個胺基酸區段則註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
PRDM11 的定位資料列出細胞核與細胞質；未提供其定位變化的條件或動態資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- FHL2Q14192 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | PRDM11 可能參與轉錄調控；現有敘述未指出具體機制、作用對象或相關生物學情境。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | PRDM11 的定位資料列出細胞核與細胞質，但未說明定位所依據的條件或是否會隨情境改變。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GTCATTTCCTGTACTAATAAGATGGTGGTCAAAGCAGGGG40AGGAGAGCAGCAGCGAGTCGCCGCCGCCGCCGCGCCGAGG80CTGGCGCTGAAACTTTGCCTCGCCGGGGACCAGCGCGCCC120GCAGCGCGGCCGCTCCCTCCGCGGGGGCCGCCAGCCGAGG160CCGCGCCGCCTCCGCCGAGCCGCCCGCCGGGCCGCTCTCG200CCGCCCGGGCCCCGCGGCTGCCGCAGCATTCCCGGGAAGG240ACAGAATGACCGAGAACATGAAGGAGTGCTTGGCCCAGAC280CAATGCAGCCGTGGGGGATATGGTGACGGTGGTGAAGACG320GAGGTCTGCTCACCACTCCGAGACCAGGAGTATGGCCAGC360CCTGCTCTAGGAGACCGGACTCCTCGGCCATGGAAGTTGA400GCCCAAGAAACTGAAGGGGAAGCGCGACCTCATCGTGCCC440AAAAGCTTCCAGCAAGTGGACTTCTGGTTCTGTGAGTCCT480GCCAGGAGTACTTCGTGGATGAATGCCCAAACCATGGCCC520CCCGGTGTTTGTGTCTGACACACCGGTGCCCGTGGGCATC560CCAGACCGGGCGGCGCTCACCATCCCACAGGGCATGGAGG600TGGTCAAGGACACTAGTGGAGAGAGTGACGTGCGATGTGT640AAACGAGGTCATCCCCAAGGGCCACATCTTCGGCCCCTAT680GAGGGGCAGATCTCCACCCAGGACAAATCAGCTGGCTTCT720TCTCCTGGCTGATTGTGGACAAGAACAACCGCTATAAGTC760CATAGATGGCTCAGACGAGACCAAAGCCAACTGGATGAGG800TACGTGGTCATCTCCCGGGAGGAGAGGGAGCAGAACCTGC840TGGCGTTCCAGCACAGTGAGCGCATCTACTTCCGGGCGTG880CAGGGACATCCGGCCTGGGGAGTGGCTGCGGGTCTGGTAC920AGCGAGGACTACATGAAGCGCCTGCACAGCATGTCCCAGG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。