01 / GENE OVERVIEW
基因總覽
PRAMEF11 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 PRAME family member 11。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 1p36.21。
Official symbol
PRAMEF11
Gene name
PRAME family member 11
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14086
UniProt
O60813
02 / NOMENCLATURE
基因異名與舊稱
Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
03 / GENOMIC CONTEXT
染色體位置與基因結構
Chromosome 11p36.21
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr1:12,824,605–12,831,410
Gene span
6,806 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000619922 ★ | 12,824,605–12,831,410 | 4 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
04 / BIOLOGICAL FUNCTION
分子功能與生物學過程
目前匯入的來源未提供可採用的功能敘述。這不代表此基因缺乏生物學作用；有新的可用註解時可再補充。
05 / GENE REGULATION
Promoter 與基因調控
依所選 TSS 來源，取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算；調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>PRAMEF11 ENST00000619922 GRCh38 chr1:12831310-12832410 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ATTAAATTTATAAACTTTAGAGATGTGGTTTCAATTTCTTCCAAAGAAGCCTTAACCTAAGCCCTGAGAC CACTCACGCCCTCAGTGGCACCTCTCCTCCACCAGAACGAGCATGTAATCTGCTACCTTAGGTTACACAA AATCCCAAAAACCATTCAATACATTGAGATTTTTATTCTGATTTCGTAGGGATGACTCCTCTGTTTTTAT AAAGCTTTTTAAAGTAGAAAGCATTTTTATATTTTGATGTGGCCAAAGATCTCCTAACAACACTACTTTC AGATTTTATTTTTCTGTCTAATGTCGTAACAGATCAAATCCGTCCCTGCCTCACACTCAAGACTATGAAG TTCACATATTAGTAAAATGCCATCAGTGTTTCTGGAGTTCATGAATGAATGATTTTTTTATTTTTTGACA GAATCTCCCTCTGTCACCCAGACTGGAGTGCAGTGGCACAATTCTGGCTCACTGCAACCATTGCCTCCTG GGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGTTTCAGGTGCCTGCCATCATGCCCAGCT AATTTTTGTATTTTTGTATTTTTGTAGAGACAGGGTTTCACCTTTTTGACCTGGCTCGTCTTGAACCCCT GACATCAGGTGATCTACTCACCTTGTCCTTCCCAAGTGCTGGAATTACAGCTATGAGCCACCTCACCCAC CCTTGAATGAATGTATTCTTGACTTCTACCCTATCCCTAACACTGTCAATTTCTTGCTTCACGAACTGAA TATAGATATGTGATATGAACGGATATCTGACTCAATCCATTAATCTGGGGAGAGCCAAAAACCCAATCAG GATTAACTGGATGGAGCTTCACAAATGCAATCAGATATTGCTTTTTGATTGGAAGCTAGCAGTGCAAACG TGGAAGGGCATGGGTGGGAGTTGTGATTAGAAAGGTCAATAAAATCTTCTAAAGACCCACAGGAGAGACC CAAAGTCTTCAAGCCTGGAGTTCCTGCTTGGTTCTTCCTGAGGTCTGAGCACCTTCTAGACTACATCCAG ATCTGGTAAGTCACTAATTTCTGTAAGGACACTCCCATCTGACCTACAGTC
PRAMEF11 位於負股。上下游依轉錄方向計算，序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示；負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算；該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：478 aa
PRAME family member 11 長 478 個胺基酸，屬於 PRAME family。蛋白質序列註解出九個 leucine-rich repeat（LRR），其中前四個為退化型重複；這些重複區段分布於序列第 99 至 403 個胺基酸之間。
重複區LRR 1; degenerate99–126 aa
重複區LRR 2; degenerate181–205 aa
重複區LRR 3; degenerate206–232 aa
重複區LRR 4; degenerate233–268 aa
重複區LRR 5269–294 aa
重複區LRR 6295–326 aa
重複區LRR 7327–347 aa
重複區LRR 8351–378 aa
重複區LRR 9379–403 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY
蛋白質三維結構
自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · O60813…
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX
Contextual Functional Evidence Matrix
功能證據與細胞情境矩陣
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
0 筆功能證據／註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預／量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」，空白實驗欄位不以推測補齊。
情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 0 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀，不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識；未逐篇核對原始方法的紀錄，不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER
核酸與蛋白質序列
完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
完整拼接轉錄本，保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1
TTCCTGCTTGGTTCTTCCTGAGGTCTGAGCACCTTCTAGA4041
CTACATCCAGATCTGTTTTCCCTGCAGATTCATGAAGATG8081
AGCATCCGGATTCCACCCAGACTCCTGGAGCTTGCGGGGC120121
GGAGCCTGCTGAGGGACCAAGCCTTGGCCGTCTCCACCCT160161
GGAGGAGCTGCCCACGGAACTTTTCCCCCCACTGTTCATG200201
GAGGCCTTCAGCAGGAGACGCTGTGAGGCCCTGAAGCTGA240241
TGGTGCAGGCCTGGCCCTTCCGCCGCCTCCCTCTGAGGCC280281
TCTGATAAAGATGCCTTGTCTGGAGGCCTTCCAAGCTGTG320321
CTCGATGGGCTGGATGCACTGCTTACCCAAGGGGTTCGTC360361
CCAGGAGATGGAAACTTCAAGTGCTGGATTTACAGGATGT400401
CTGTGAGAACTTCTGGATGGTTTGGTCTGAAGCTATGGCC440441
CATGGGTGCTTCCTCAATGCCAAGAGGAACAAAAAACCAG480481
TGCAGGACTGTCCAAGGATGAGAGGACGGCAGCCCTTGAC520521
TGTGTTTGTAGAACTTTGGCTCAAGAACAGGACTCTGGAT560561
GAATACCTCACCTGCCTCCTTCTATGGGTCAAGCAGAGGA600601
GAGATTTACTACACCTGTGCTGTAAGAAGCTGAAAATTTT640641
GGGAATGCCCTTCCGCAATATCAGAAGCATCCTGAAAATG680681
GTGAACCTAGACTGTATCCAGGAGGTGGAAGTGAATTGCA720721
AGTGGATACTGCCCATCCTGACACAGTTTACCCCATACCT760761
GGGCCACTTGAGGAATCTTCAGAAGCTCGTTCTCTCCCAC800801
ATGGATGTCTCTCGCTACGTTTCCCCAGAGCAGAAGAAGG840841
AGATTGTTACCCAGTTCACCACTCAGTTCCTCAAGCTGCG880881
CTGCCTCCAAAAGCTTTATATGAACTCTGTTTCTTTCCTC920921
GAAGGCCACCTGGACCAGCTGCTCAGCTGTCTGAAGACCT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。
13 / DATA PROVENANCE