基因總覽
PPP2R3B 是位於 X 染色體與 Y 染色體相關區域的蛋白質編碼基因,產物名稱為 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''beta。它屬於 PP2A 的 B'' 調節次單元家族;PP2A 的核心由催化次單元與固定調節次單元組成,並可與不同種類的調節次單元相結合。來源指出,PPP2R3B 的調節次單元可能影響 PP2A 的底物選擇性、催化活性,以及催化酵素在細胞內的定位。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000390665 ★ | 333,933–386,907 | 13 |
| ENST00000936620 | 333,933–386,942 | 12 |
| ENST00000936621 | 333,933–386,942 | 13 |
| ENST00000936623 | 333,933–386,942 | 13 |
| ENST00000936624 | 333,933–386,942 | 13 |
| ENST00000936625 | 333,933–386,942 | 12 |
| ENST00001132554 | 333,933–386,942 | 13 |
| ENST00000936622 | 334,235–386,942 | 13 |
| ENST00000381625 | 347,611–374,044 | 3 |
顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
PPP2R3B 編碼 PP2A 的 B'' 調節次單元。PP2A 的核心酵素由催化次單元與固定調節次單元構成,並可與不同調節次單元結合;B'' 是其中一類調節次單元。來源以可能性描述此類 B 調節次單元的作用,因此相關功能不應視為已確定的作用結果。
B 調節次單元可能調節 PP2A 的底物選擇性,也可能影響其催化活性。換言之,這類次單元可能參與決定催化酵素作用的底物範圍,並調整其催化表現;來源未進一步指定 PPP2R3B 所影響的特定底物或催化反應。
此外,B 調節次單元也可能引導催化酵素前往特定的細胞內區室。這項定位調節與底物選擇性及催化活性的調節並列,但來源未說明 PPP2R3B 對應的特定區室或其作用條件。整體而言,現有資料支持 PPP2R3B 作為 PP2A 調節次單元的角色,以及可能參與調整酵素活性、底物選擇與細胞內定位;但各項作用均以可能性表述。
Promoter 與基因調控
>PPP2R3B ENST00000390665 GRCh38 chrX:386807-387907 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TTACTTATTGAGTCTGGCTCGATTTATGCAGCTCAGAAGTAGGAGAACCTGGCTCATAAAAGACCTTGAA ATTACTCTCTAACAGGGTGCAACACCAGGTGAAACCCTATTTTGATAAAAAATGAATAAAAAGCGGGGCA AGATGTAAAGGAAACAGGTGCATGTGTGCCAGACAGATGATAATGCAGTGTTTTTATGGATACTGTTAAA AGCAGAAACAAAAACGACCATTGGGTAAAGTTATTTAACTAATGTCACCTCCCTGGACGTGGATGATTTT TGCAATTTTCAACGCACTTCACGCTCATCCCTGAACACCAACGTTTAAAGGGGTCCAACTCCTCCAACCT GTCTCTACTGTTTGATAAGCAAAGCTAAAGTAAACGGGGCCCTTTGGGTCCCAGGTAGCCCGCTGTTATT GAAAAGTTTGATCTTTTCCTCGCGCGCTCCCGTAGGACGCACGCTCGCTCCCGAGCTCGGCGGGCGCGCA CCCCGCATGCTCGCTCGTTCCCGGTGCCTCCCACTGCGCAGGCGCACTCCCGTCCTCCAGCCCCACCCGC TCACACACCTCCCAGCCTCTGGCTTGCGCCCCGCGGGCAGCCATTGCGCACGCTCACCCGACCGGCCTCC CGAACTCCGCTCCTCCACCGCTATGCACGGCGCATGCTCCATGCGGAGGTTCCACCCTCTCCTCGCTCTG GCAGGCACGCATTGCGCATGCTCGCATTTCCGCAGCTCTAGGACTGCCACGCCGCCATGGGCCGCGCCTC TAAAAATCCTAAACGCAGAAAGAGCTCGGGCGGTACGGCCGCCACAGCCCCTCCCTCGTCCTCACCGCAG CCGCTCGGCCCCACCAAAGCCTCCTGCAAAAGCTCCGAGGGCCGCGGGGCGCGCGTGGCTAGCGGCGGCG TCGCCTCGTGATGACATCGTCGCGATGACGCGACGCAGTGACGTGAACGCGGGCGCCCTTGTTTGGGAGC GCGGCCGGCGCGCCCGTTTTGAAGCTGCCCTGAGCAGCGCGGGCCGGACCGCGCCCCCTCCTCGGTCCCC GCGCCCCGCGAGTCCGCGCAGTTCCCGAGGCGCGGGCCCTGTTCCCTGCGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSRX_8B9X · promoter · 386897–387045 · regulatory
ENSRX_54GCM · CTCF_binding_site · 386983–387004 · regulatory
ENSRX_B443 · enhancer · 387046–387966 · regulatory
· motif · 386985–387001 · motif
· motif · 387148–387158 · motif
· motif · 387172–387183 · motif
· motif · 387184–387195 · motif
· motif · 387184–387195 · motif
· motif · 387238–387249 · motif
· motif · 387238–387249 · motif
· motif · 387292–387303 · motif
· motif · 387292–387303 · motif
· motif · 387372–387383 · motif
· motif · 387372–387383 · motif
· motif · 387405–387416 · motif
· motif · 387405–387416 · motif
· motif · 387441–387452 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:575 aa
protein phosphatase 2 regulatory subunit B''beta 長 575 個胺基酸。序列註解標示第 388 至 423 位具有 EF-hand 結構域;第 41 至 131 位則被註記為無序區域。這些是序列特徵註解,來源未提供其對 PPP2R3B 功能的進一步說明。
蛋白質三維結構
細胞內定位
資料將 PPP2R3B 的定位記為細胞核。 來源未提供定位變化的條件、異構型差異或動態資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
- DUSP12Q9UNI6 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- HGSO14964 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NAA10P41227 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NOD2Q9HC29 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
PP2A 核心酵素可與多類調節次單元、病毒蛋白及細胞訊號分子結合;B''(R3)是列出的調節次單元家族之一。另有資料指出,PPP2R3B 與 CDC6 的 N 端區域及 NOD2 互作。來源未進一步說明這些互作是否構成同一複合體,或其功能後果。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | B 調節次單元可能調整底物選擇性與催化活性,也可能引導催化酵素定位至特定細胞內區室;來源以可能性描述這些作用。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源The B regulatory subunit might modulate substrate selectivity and catalytic activity, and might also direct the localization of the catalytic enzyme to a particular subcellular compartment |
| 交互作用 | PP2A 核心由 36 kDa 催化次單元與 65 kDa 固定調節次單元構成,並可結合多種調節次單元、病毒蛋白及細胞訊號分子;PPP2R3B 另與 CDC6 的 N 端區域及 NOD2 互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源PP2A consists of a common heterodimeric core enzyme, composed of a 36 kDa catalytic subunit (subunit C) and a 65 kDa constant regulatory subunit (PR65 or subunit A), that associates with a variety of regulatory subunits. Proteins that associate with the core dimer include three families of regulatory subunits B (the R2/B/PR55/B55, R3/B''/PR72/PR130/PR59 and R5/B'/B56 families), the 48 kDa variable regulatory subunit, viral proteins, and cell signaling molecules. Interacts with N-terminal region of CDC6. Interacts with NOD2 PMID 10629059 ↗ · PMID 27812135 ↗ |
| 細胞定位 | PPP2R3B 的細胞內定位記錄為細胞核。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GAAGCTGCCCTGAGCAGCGCGGGCCGGACCGCGCCCCCTC40CTCGGTCCCCGCGCCCCGCGAGTCCGCGCAGTTCCCGAGG80CGCGGGCCCTGTTCCCTGCGCCGCGCCCCCTCAGCGGGCC120GTGCTCGCATCACCGAGGTCGGTCCGGGGCGGACCGAAGC160CCCCGGGGCGGGGCGGGGCGCGGGCGTCCGGGGGCGCCGC200GGGCCCAGCCCCCGCCATGCCGCCCGGCAAAGTGCTGCAG240CCGGTCCTGAAGATGAAGGTGGACGAGCTGTTCCTGTACT280GGCTCAGCGAGGCCAGCACGCAGCGGATGCTGCAGGACTG320CCTGCGCCGGATCAAGGCGCCCGGGCGGGACCAGCCGACC360CCGGGGGACGGGGAGCAGCCCGGGGCCTGGCCCACAGCCC400CGCTCGCCGCCCCCCGGCCCAGCGGGCTCGAACCCCCGGG440AACCCCCGGGCCGGGCCCTGCGCTGCCCCTGGGCGCCGCC480TCCAGCCCCAGGAACGCGCCCCACGTTCGAGGCACCCGTA520GATCCGCAGGGACGAGAGTAGTTCAGACACGGAAAGAAGA560GCCTCTGCCCCCGGCCACGAGCCAAAGCATTCCGACCTTC600TACTTCCCCAGAGGACGCCCGCAGGACTCCGTCAACGTGG640ATGCCGTCATCAGCAAGATCGAGAGCACCTTCGCCCGGTT680CCCCCACGAGAGGGCCACCATGGATGACATGGGCCTGGTG720GCCAAGGCCTGCGGCTGCCCCCTCTACTGGAAGGGGCCGC760TCTTCTATGGCGCCGGCGGGGAGCGCACGGGCTCCGTGTC800CGTCCACAAGTTCGTCGCCATGTGGAGAAAAATCCTCCAG840AACTGCCACGACGACGCGGCCAAGTTCGTCCATCTGCTCA880TGAGCCCCGGCTGCAACTACCTGGTGCAGGAGGACTTTGT920CCCCTTCTTGCAGGACGTGGTGAACACGCACCCGGGGCTG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。