演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

PPP2R3BPPP2R3LY

protein phosphatase 2 regulatory subunit B''beta

PPP2R3B 編碼 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''beta,屬 PP2A 調節次單元;其調節作用可能影響底物選擇性、催化活性及酵素定位。

Homo sapiensXp22.3 and Yp11.3UniProt Q9Y5P8
OFFICIAL SYMBOL
PPP2R3B
CHROMOSOME
X
UNIPROT
Q9Y5P8
PDB / ALPHAFOLD
4I5L
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

PPP2R3B 是位於 X 染色體與 Y 染色體相關區域的蛋白質編碼基因,產物名稱為 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''beta。它屬於 PP2A 的 B'' 調節次單元家族;PP2A 的核心由催化次單元與固定調節次單元組成,並可與不同種類的調節次單元相結合。來源指出,PPP2R3B 的調節次單元可能影響 PP2A 的底物選擇性、催化活性,以及催化酵素在細胞內的定位。

Official symbol
PPP2R3B
Gene name
protein phosphatase 2 regulatory subunit B''beta
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13417
UniProt
Q9Y5P8
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
PPP2R3LYPR48PR70PPP2R3L

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome XXp22.3 and Yp11.3
chrX · 156,040,895 bp · GRCh38chrXp22.33 · 1–4400000 · gnegchrXp22.32 · 4400001–6100000 · gpos50chrXp22.31 · 6100001–9600000 · gnegchrXp22.2 · 9600001–17400000 · gpos50chrXp22.13 · 17400001–19200000 · gnegchrXp22.12 · 19200001–21900000 · gpos50chrXp22.11 · 21900001–24900000 · gnegchrXp21.3 · 24900001–29300000 · gpos100chrXp21.2 · 29300001–31500000 · gnegchrXp21.1 · 31500001–37800000 · gpos100chrXp11.4 · 37800001–42500000 · gnegchrXp11.3 · 42500001–47600000 · gpos75chrXp11.23 · 47600001–50100000 · gnegchrXp11.22 · 50100001–54800000 · gpos25chrXp11.21 · 54800001–58100000 · gnegchrXp11.1 · 58100001–61000000 · acenchrXq11.1 · 61000001–63800000 · acenchrXq11.2 · 63800001–65400000 · gnegchrXq12 · 65400001–68500000 · gpos50chrXq13.1 · 68500001–73000000 · gnegchrXq13.2 · 73000001–74700000 · gpos50chrXq13.3 · 74700001–76800000 · gnegchrXq21.1 · 76800001–85400000 · gpos100chrXq21.2 · 85400001–87000000 · gnegchrXq21.31 · 87000001–92700000 · gpos100chrXq21.32 · 92700001–94300000 · gnegchrXq21.33 · 94300001–99100000 · gpos75chrXq22.1 · 99100001–103300000 · gnegchrXq22.2 · 103300001–104500000 · gpos50chrXq22.3 · 104500001–109400000 · gnegchrXq23 · 109400001–117400000 · gpos75chrXq24 · 117400001–121800000 · gnegchrXq25 · 121800001–129500000 · gpos100chrXq26.1 · 129500001–131300000 · gnegchrXq26.2 · 131300001–134500000 · gpos25chrXq26.3 · 134500001–138900000 · gnegchrXq27.1 · 138900001–141200000 · gpos75chrXq27.2 · 141200001–143000000 · gnegchrXq27.3 · 143000001–148000000 · gpos100chrXq28 · 148000001–156040895 · gnegPPP2R3Bpq1 bp156,040,895 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chrX:333,933–387,213
Gene span
53,281 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000390665 ★333,933–386,90713
ENST00000936620333,933–386,94212
ENST00000936621333,933–386,94213
ENST00000936623333,933–386,94213
ENST00000936624333,933–386,94213
ENST00000936625333,933–386,94212
ENST00001132554333,933–386,94213
ENST00000936622334,235–386,94213
ENST00000381625347,611–374,0443

顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

PPP2R3B 編碼 PP2A 的 B'' 調節次單元。PP2A 的核心酵素由催化次單元與固定調節次單元構成,並可與不同調節次單元結合;B'' 是其中一類調節次單元。來源以可能性描述此類 B 調節次單元的作用,因此相關功能不應視為已確定的作用結果。

B 調節次單元可能調節 PP2A 的底物選擇性,也可能影響其催化活性。換言之,這類次單元可能參與決定催化酵素作用的底物範圍,並調整其催化表現;來源未進一步指定 PPP2R3B 所影響的特定底物或催化反應。

此外,B 調節次單元也可能引導催化酵素前往特定的細胞內區室。這項定位調節與底物選擇性及催化活性的調節並列,但來源未說明 PPP2R3B 對應的特定區室或其作用條件。整體而言,現有資料支持 PPP2R3B 作為 PP2A 調節次單元的角色,以及可能參與調整酵素活性、底物選擇與細胞內定位;但各項作用均以可能性表述。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 386907 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>PPP2R3B ENST00000390665 GRCh38 chrX:386807-387907 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TTACTTATTGAGTCTGGCTCGATTTATGCAGCTCAGAAGTAGGAGAACCTGGCTCATAAAAGACCTTGAA
ATTACTCTCTAACAGGGTGCAACACCAGGTGAAACCCTATTTTGATAAAAAATGAATAAAAAGCGGGGCA
AGATGTAAAGGAAACAGGTGCATGTGTGCCAGACAGATGATAATGCAGTGTTTTTATGGATACTGTTAAA
AGCAGAAACAAAAACGACCATTGGGTAAAGTTATTTAACTAATGTCACCTCCCTGGACGTGGATGATTTT
TGCAATTTTCAACGCACTTCACGCTCATCCCTGAACACCAACGTTTAAAGGGGTCCAACTCCTCCAACCT
GTCTCTACTGTTTGATAAGCAAAGCTAAAGTAAACGGGGCCCTTTGGGTCCCAGGTAGCCCGCTGTTATT
GAAAAGTTTGATCTTTTCCTCGCGCGCTCCCGTAGGACGCACGCTCGCTCCCGAGCTCGGCGGGCGCGCA
CCCCGCATGCTCGCTCGTTCCCGGTGCCTCCCACTGCGCAGGCGCACTCCCGTCCTCCAGCCCCACCCGC
TCACACACCTCCCAGCCTCTGGCTTGCGCCCCGCGGGCAGCCATTGCGCACGCTCACCCGACCGGCCTCC
CGAACTCCGCTCCTCCACCGCTATGCACGGCGCATGCTCCATGCGGAGGTTCCACCCTCTCCTCGCTCTG
GCAGGCACGCATTGCGCATGCTCGCATTTCCGCAGCTCTAGGACTGCCACGCCGCCATGGGCCGCGCCTC
TAAAAATCCTAAACGCAGAAAGAGCTCGGGCGGTACGGCCGCCACAGCCCCTCCCTCGTCCTCACCGCAG
CCGCTCGGCCCCACCAAAGCCTCCTGCAAAAGCTCCGAGGGCCGCGGGGCGCGCGTGGCTAGCGGCGGCG
TCGCCTCGTGATGACATCGTCGCGATGACGCGACGCAGTGACGTGAACGCGGGCGCCCTTGTTTGGGAGC
GCGGCCGGCGCGCCCGTTTTGAAGCTGCCCTGAGCAGCGCGGGCCGGACCGCGCCCCCTCCTCGGTCCCC
GCGCCCCGCGAGTCCGCGCAGTTCCCGAGGCGCGGGCCCTGTTCCCTGCGC
PPP2R3B 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSRX_8B9X · promoter · 386897–387045 · regulatory

ENSRX_54GCM · CTCF_binding_site · 386983–387004 · regulatory

ENSRX_B443 · enhancer · 387046–387966 · regulatory

· motif · 386985–387001 · motif

· motif · 387148–387158 · motif

· motif · 387172–387183 · motif

· motif · 387184–387195 · motif

· motif · 387184–387195 · motif

· motif · 387238–387249 · motif

· motif · 387238–387249 · motif

· motif · 387292–387303 · motif

· motif · 387292–387303 · motif

· motif · 387372–387383 · motif

· motif · 387372–387383 · motif

· motif · 387405–387416 · motif

· motif · 387405–387416 · motif

· motif · 387441–387452 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:575 aa

1 aa575 aa結構域功能區域
依 Q9Y5P8 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

protein phosphatase 2 regulatory subunit B''beta 長 575 個胺基酸。序列註解標示第 388 至 423 位具有 EF-hand 結構域;第 41 至 131 位則被註記為無序區域。這些是序列特徵註解,來源未提供其對 PPP2R3B 功能的進一步說明。

結構域EF-hand388–423 aa
功能區域Disordered41–131 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 4I5L…

PDB · 4I5L

X-ray · 2.43 A · B/E=120-490

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

資料將 PPP2R3B 的定位記為細胞核。 來源未提供定位變化的條件、異構型差異或動態資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 4 個夥伴 · 最多顯示 50 個
PPP2R3LYPPP2R3BDUSP12HGSNAA10NOD2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

PP2A 核心酵素可與多類調節次單元、病毒蛋白及細胞訊號分子結合;B''(R3)是列出的調節次單元家族之一。另有資料指出,PPP2R3B 與 CDC6 的 N 端區域及 NOD2 互作。來源未進一步說明這些互作是否構成同一複合體,或其功能後果。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能B 調節次單元可能調整底物選擇性與催化活性,也可能引導催化酵素定位至特定細胞內區室;來源以可能性描述這些作用。資料庫紀錄
證據與來源

The B regulatory subunit might modulate substrate selectivity and catalytic activity, and might also direct the localization of the catalytic enzyme to a particular subcellular compartment

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用PP2A 核心由 36 kDa 催化次單元與 65 kDa 固定調節次單元構成,並可結合多種調節次單元、病毒蛋白及細胞訊號分子;PPP2R3B 另與 CDC6 的 N 端區域及 NOD2 互作。含實驗來源
證據與來源

PP2A consists of a common heterodimeric core enzyme, composed of a 36 kDa catalytic subunit (subunit C) and a 65 kDa constant regulatory subunit (PR65 or subunit A), that associates with a variety of regulatory subunits. Proteins that associate with the core dimer include three families of regulatory subunits B (the R2/B/PR55/B55, R3/B''/PR72/PR130/PR59 and R5/B'/B56 families), the 48 kDa variable regulatory subunit, viral proteins, and cell signaling molecules. Interacts with N-terminal region of CDC6. Interacts with NOD2

PMID 10629059 ↗ · PMID 27812135 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位PPP2R3B 的細胞內定位記錄為細胞核。含實驗來源
證據與來源

Nucleus

PMID 10629059 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000390665 · 2,378 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GAAGCTGCCCTGAGCAGCGCGGGCCGGACCGCGCCCCCTC40
41CTCGGTCCCCGCGCCCCGCGAGTCCGCGCAGTTCCCGAGG80
81CGCGGGCCCTGTTCCCTGCGCCGCGCCCCCTCAGCGGGCC120
121GTGCTCGCATCACCGAGGTCGGTCCGGGGCGGACCGAAGC160
161CCCCGGGGCGGGGCGGGGCGCGGGCGTCCGGGGGCGCCGC200
201GGGCCCAGCCCCCGCCATGCCGCCCGGCAAAGTGCTGCAG240
241CCGGTCCTGAAGATGAAGGTGGACGAGCTGTTCCTGTACT280
281GGCTCAGCGAGGCCAGCACGCAGCGGATGCTGCAGGACTG320
321CCTGCGCCGGATCAAGGCGCCCGGGCGGGACCAGCCGACC360
361CCGGGGGACGGGGAGCAGCCCGGGGCCTGGCCCACAGCCC400
401CGCTCGCCGCCCCCCGGCCCAGCGGGCTCGAACCCCCGGG440
441AACCCCCGGGCCGGGCCCTGCGCTGCCCCTGGGCGCCGCC480
481TCCAGCCCCAGGAACGCGCCCCACGTTCGAGGCACCCGTA520
521GATCCGCAGGGACGAGAGTAGTTCAGACACGGAAAGAAGA560
561GCCTCTGCCCCCGGCCACGAGCCAAAGCATTCCGACCTTC600
601TACTTCCCCAGAGGACGCCCGCAGGACTCCGTCAACGTGG640
641ATGCCGTCATCAGCAAGATCGAGAGCACCTTCGCCCGGTT680
681CCCCCACGAGAGGGCCACCATGGATGACATGGGCCTGGTG720
721GCCAAGGCCTGCGGCTGCCCCCTCTACTGGAAGGGGCCGC760
761TCTTCTATGGCGCCGGCGGGGAGCGCACGGGCTCCGTGTC800
801CGTCCACAAGTTCGTCGCCATGTGGAGAAAAATCCTCCAG840
841AACTGCCACGACGACGCGGCCAAGTTCGTCCATCTGCTCA880
881TGAGCCCCGGCTGCAACTACCTGGTGCAGGAGGACTTTGT920
921CCCCTTCTTGCAGGACGTGGTGAACACGCACCCGGGGCTG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。