基因總覽
PPP1R15A 是蛋白質編碼基因，產物為 protein phosphatase 1 regulatory subunit 15A，屬於 PPP1R15 家族。這種蛋白質具有多段重複序列，並含有多個被註記為無序的區域；其 N 端區域與內質網定位相關。這些特徵構成其基本分子與結構背景。其生物學角色涵蓋細胞壓力應答、蛋白質合成調節、自噬，以及感染情境下對病毒複製的不同影響；具體作用方式依生理或感染情境而異。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000200453 ★ | 48,872,421–48,876,058 | 3 |
| ENST00000600406 | 48,872,212–48,876,036 | 2 |
| ENST00000704026 | 48,872,212–48,879,061 | 4 |
| ENST00000859687 | 48,872,212–48,879,061 | 3 |
| ENST00000955399 | 48,872,212–48,876,058 | 3 |
| ENST00001140561 | 48,872,212–48,879,061 | 3 |
| ENST00000955400 | 48,872,877–48,879,061 | 3 |
| ENST00000704027 | 48,873,067–48,879,061 | 2 |
顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
在細胞壓力反應中，PPP1R15A 招募 serine/threonine-protein phosphatase PPP1CA，使翻譯起始因子 EIF2S1 不致過度磷酸化。這有助於逆轉壓力誘導激酶所啟動的蛋白質合成關閉，並促進細胞從壓力中恢復。此作用將磷酸酶調節與翻譯恢復連結起來。
PPP1R15A 也參與其他細胞過程。它可藉由促進 PP1 去磷酸化 TGFB1，下調 TGF-beta 訊息傳遞路徑；另有資料指出，它可能透過促使 p53/TP53 的 Ser-15 磷酸化而促進細胞凋亡。飢餓期間，它透過調節翻譯參與自噬，支持溶酶體生合成及持續的自噬通量。
在病毒感染中，PPP1R15A 的影響依病毒而異。它可限制 HIV-1 與 influenza A virus 複製；對 HIV-1 的作用涉及抑制由病毒 TAR RNA 介導的翻譯，對 influenza A virus 則涉及抑制病毒 RNA 聚合酶。相對地，在 enterovirus 71 感染時，PPP1R15A 會藉由介導病毒 5′-UTR 的內部核糖體進入位點（IRES）活性，促進病毒複製。因此，它在感染中的功能並非一概抑制病毒，而取決於所涉及的病毒及其相關分子過程。
Promoter 與基因調控
>PPP1R15A ENST00000200453 GRCh38 chr19:48871421-48872521 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GCTTGAACCCGGAAGATGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCATTGCACTCCAGCCTCGGTGACAGA GCGAGACTCCATCTCAAAAAAAAATAAAAAAATAAAAAATAACAAATAAATAAATAGGCCTGGAGTGGTG GCTCACGCCTGCAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCAGAACACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGA CCAGCCTAGCAAACATGGTGAAATCCCGTCTCAGAAAAATAAATAATGAATAAATAAATAAATAAATAGG CCGGGCGCGGTGACTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGAGGATCCCCTGACGTC GGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACTACGTCTCTACTAAACAAATACAAAATTAGCCGG GCGTGGCGGCACATGCCTGCAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGAGGATCCCCTGACGTCGGGA GTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACTACGTCTCTACTAAACAAATACAAAATTAGCCGGGCGT GGCGGCACATGCCTGCAATCCCAGATACTCGGGATGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCCGAAGGCG GAGGTTGCGGTGAGCCGAGATCGCCCCTTTGCATTCCAGCCTGAGCAACAAGAGCAAAACTCCGCCTCAA AATAACTAACTAAATAAATAAATAAATTGGGGTGGGAAGGCATTGACCCTGAGCTGAGAGAGAACTGGCT CGCTGTTGAAGCAGGGCCACGCATTTGATTGACAGTTCGTTTGTTGGAGGGGCGTGGTCACGCTCGGAAA CTCCGCCGTGACGTTGCAAAAGCTGGAATCTCCGCGAGAAGTCCTGTCTTACTTCCACTTCCCACCCTTC GGGTTGCGGTCTCGAAACCCCGCCTCTCTTCGTGACGTCAGCACGCCGGGCGCGGTAGGCTATAAAAGCC TAGTGGCCATTGTGTTCGTTGCTCTTATCGGTTCCCATCCCAGTTGTTGATCTTATGCAAGACGCTGCAC GACCCCGCGCCCGCTTGTCGCCACGGCACTTGAGGCAGCCGGAGATACTCT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| PPP1R15A_1 ↗ | 19:48,872,421 | 正股 | 48,872,372–48,872,431 |
| PPP1R15A_2 ↗ | 19:48,873,158 | 正股 | 48,873,109–48,873,168 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR19_C6SWZ · enhancer · 48866793–48868443 · regulatory
ENSR19_BCNT5 · promoter · 48868444–48869107 · regulatory
ENSR19_BCNTL · promoter · 48871722–48872431 · regulatory
ENSR19_9PDQF · promoter · 48872577–48873077 · regulatory
· motif · 48868377–48868391 · motif
· motif · 48872014–48872028 · motif
· motif · 48872014–48872028 · motif
· motif · 48872238–48872248 · motif
· motif · 48872246–48872262 · motif
· motif · 48872327–48872342 · motif
· motif · 48872334–48872342 · motif
· motif · 48872360–48872373 · motif
· motif · 48872360–48872373 · motif
· motif · 48872677–48872690 · motif
· motif · 48872677–48872690 · motif
· motif · 48872985–48872995 · motif
· motif · 48873044–48873050 · motif
· motif · 48873071–48873081 · motif
· motif · 48873151–48873159 · motif
· motif · 48873160–48873176 · motif
· motif · 48875101–48875112 · motif
· motif · 48875436–48875444 · motif
· motif · 48875609–48875618 · motif
· motif · 48875812–48875825 · motif
· motif · 48876434–48876442 · motif
· motif · 48876455–48876467 · motif
PPP1R15A 會在壓力下產生；無壓力時，轉錄本的部分上游開放閱讀框（uORF）先被翻譯，因而抑制該轉錄本的翻譯。甲基甲磺酸酯與游離輻射也與其誘導相關。黑色素瘤細胞中，IL24 可誘導 PPP1R15A；病毒感染時，NF-kappa-B 轉錄因子 p65/RELA 亦可活化其表現。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：674 aa
protein phosphatase 1 regulatory subunit 15A 長 674 個胺基酸，屬於 PPP1R15 家族。其 N 端第 1–60 位胺基酸區域與內質網定位相關；第 337–510 位包含四個約 34 個胺基酸的重複序列，並被註記為與 SMAD7 互作的區域。另有與 KMT2A/MLL1 及 SMARCB1 互作的區域註記。蛋白質多處區段被預測為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
PPP1R15A 是位於膜周邊的蛋白質，分布於內質網膜及粒線體外膜的細胞質側。 其 N 端兩親性膜內區域有助於與膜結合；來源未提供不同異構型或定位變化條件的資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
- CTBP2P56545 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PPP1CAP62136 · UniProt INTERACTION · 12 experiments
- PPP1R1AQ13522 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- TARDBPQ13148 · UniProt INTERACTION · 10 experiments
PPP1R15A 與 PPP1CA、EIF2S1、LYN、KMT2A/MLL1、PPP1R1A、SMARCB1、SMAD7、BAG1 及 NOX4 有互作註記；與 PCNA 的互作則標示為依相似性推定。感染 enterovirus 71 時，PPP1R15A 會與病毒非結構蛋白前驅物 3CD 互作，此互作與病毒複製促進相關。這些資料描述互作關係，並不表示各互作均構成同一複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 6 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | PPP1R15A 招募磷酸酶 PPP1CA，避免翻譯起始因子 EIF2S1 過度磷酸化，協助逆轉壓力誘導激酶造成的蛋白質合成關閉並促進細胞恢復。它也透過促進 PP1 去磷酸化 TGFB1 下調 TGF-beta 訊息傳遞，可能藉由 p53/TP53 Ser-15 磷酸化促進凋亡；飢餓時調節翻譯以支持溶酶體生合成和持續自噬通量。此外，它抑制 HIV-1 TAR RNA 介導的翻譯及 influenza A virus RNA 聚合酶，限制這兩種病毒複製。 | 含實驗來源 | 證據與來源Recruits the serine/threonine-protein phosphatase PPP1CA to prevents excessive phosphorylation of the translation initiation factor eIF-2A/EIF2S1, thereby reversing the shut-off of protein synthesis initiated by stress-inducible kinases and facilitating recovery of cells from stress. Down-regulates the TGF-beta signaling pathway by promoting dephosphorylation of TGFB1 by PP1. May promote apoptosis by inducing p53/TP53 phosphorylation on 'Ser-15'. Plays an essential role in autophagy by tuning translation during starvation, thus enabling lysosomal biogenesis and a sustained autophagic flux. Also acts a viral restriction factor by attenuating HIV-1 and influenza A virus replication. Mechanistically, mediates the inhibition of HIV-1 TAR RNA-mediated translation. Mediates the inhibition of influenza A virus RNA polymerase PMID 11564868 ↗ · PMID 12556489 ↗ · PMID 14635196 ↗ · PMID 14718519 ↗ · PMID 26095357 ↗ · PMID 26742780 ↗ · PMID 31778897 ↗ · PMID 41747053 ↗ · PMID 8139541 ↗ |
| 功能 | 在 enterovirus 71 感染期間，PPP1R15A 透過介導病毒 5′-UTR 的內部核糖體進入位點（IRES）活性，促進病毒複製。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Promotes enterovirus 71 replication by mediating the internal ribosome entry site (IRES) activity of viral 5'-UTR PMID 34985336 ↗ |
| 交互作用 | PPP1R15A 與 PPP1CA、EIF2S1、LYN、KMT2A/MLL1、PPP1R1A、SMARCB1、SMAD7、BAG1 及 NOX4 有互作註記；與 PCNA 的互作為依相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with PPP1CA. Interacts with EIF2S1. Interacts with PCNA (By similarity). Interacts with LYN and KMT2A/MLL1. Interacts with PPP1R1A and SMARCB1. Interacts with SMAD7. Interacts with BAG1. Interacts with NOX4 PMID 10490642 ↗ · PMID 11517336 ↗ · PMID 11564868 ↗ · PMID 12016208 ↗ · PMID 12724406 ↗ · PMID 14718519 ↗ · PMID 15705855 ↗ · PMID 26095357 ↗ · PMID 26742780 ↗ |
| 交互作用 | 在 enterovirus 71 感染時，PPP1R15A 與病毒非結構蛋白前驅物 3CD 互作；此互作促進 enterovirus 71 複製。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Interacts with enterovirus 71/EV71 non-structural protein precursor 3CD; this interaction promotes EV71 replication PMID 34985336 ↗ |
| 細胞定位 | PPP1R15A 位於內質網膜及粒線體外膜的細胞質側，屬於膜周邊蛋白質；它透過 N 端兩親性膜內區域與膜結合。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Endoplasmic reticulum membrane / Peripheral membrane protein / Cytoplasmic side; Mitochondrion outer membrane / Peripheral membrane protein / Cytoplasmic side; Associates with membranes via an N-terminal amphipathic intramembrane region |
| 調控 | PPP1R15A 會在壓力下產生；無壓力時，轉錄本部分上游開放閱讀框的翻譯會阻止其自身翻譯。甲基甲磺酸酯、游離輻射及黑色素瘤細胞中的 IL24 均與其誘導相關；病毒感染時，NF-kappa-B 轉錄因子 p65/RELA 可活化 PPP1R15A。 | 含實驗來源 | 證據與來源Specifically produced in response to stress: in absence of stress, some upstream open reading frame (uORF) of this transcript is translated, thereby preventing its translation. By methyl methanesulfonate and ionizing irradiation. By IL24/interleukin-24 in melanoma cells; which induces apoptosis. Activated by NF-kappa-B transcription factor p65/RELA in response to viral infection, such as enterovirus 71/EV71, Influenza A virus or HIV-1 PMID 10490642 ↗ · PMID 12114539 ↗ · PMID 19131336 ↗ · PMID 31778897 ↗ · PMID 34985336 ↗ · PMID 41747053 ↗ · PMID 9153226 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GCTCTTATCGGTTCCCATCCCAGTTGTTGATCTTATGCAA40GACGCTGCACGACCCCGCGCCCGCTTGTCGCCACGGCACT80TGAGGCAGCCGGAGATACTCTGAGTTACTCGGAGCCCGAC120GCCTGAGGGTGAGATGAACGCGCTGGCCTCCCTAACCGTC160CGGACCTGTGATCGCTTCTGGCAGACCGAACCGGCGCTCC200TGCCCCCGGGGTGACGCGCAGCTCCCAGCCGCCCAGACAC240ATGGCCCCAGGCCAAGCACCCCATCAGGCTACCCCGTGGA280GGGATGCCCACCCTTTCTTCCTCCTGTCCCCAGTGATGGG320CCTCCTCAGCCGCGCCTGGAGCCGCCTGAGGGGCCTGGGA360CCTCTAGAGCCCTGGCTGGTGGAAGCAGTAAAAGGAGCAG400CTCTGGTAGAAGCTGGCCTGGAGGGAGAAGCTAGGACTCC440TCTGGCAATCCCCCATACCCCTTGGGGCAGACGCCCTGAA480GAGGAGGCTGAAGACAGTGGAGGCCCTGGAGAGGACAGAG520AAACACTGGGGCTGAAAACCAGCAGTTCCCTTCCTGAAGC560CTGGGGACTTTTGGATGATGATGATGGCATGTATGGTGAG600CGAGAGGCAACCAGTGTCCCTAGAGGGCAGGGAAGTCAAT640TTGCAGATGGCCAGCGTGCTCCCCTGTCTCCCAGCCTTCT680GATAAGGACACTGCAAGGTTCTGATAAGAACCCAGGGGAG720GAGAAAGCCGAGGAAGAGGGAGTTGCTGAAGAGGAGGGAG760TTAACAAGTTCTCTTATCCACCATCACACCGGGAGTGTTG800TCCAGCCGTGGAGGAGGAGGACGATGAAGAAGCTGTAAAG840AAAGAAGCTCACAGAACCTCTACTTCTGCCTTGTCTCCAG880GATCCAAGCCCAGCACTTGGGTGTCTTGCCCAGGGGAGGA920AGAGAATCAAGCCACGGAGGATAAAAGAACAGAAAGAAGT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。