基因總覽
POM121L2 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 POM121 transmembrane nucleoporin like 2。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 6p22.1。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000444565 ★ | 27,308,377–27,312,273 | 1 |
| ENST00000429945 | 27,285,903–27,311,312 | 2 |
顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>POM121L2 ENST00000444565 GRCh38 chr6:27312173-27313273 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TTCTTTGGCGGGGTTTCTGTTTAAATATTTTGCCCATTAATTTTTTACCTTATTATGAGTTTTAACATTC TATGTATATTTTGTATACCAGTGCTTCAGCAGATACATACGTATTATGCAAATATTTTCTCCAGTCTGTG GCGTGTCTTTTCATTCTCTTAACAGTGTCTTTCACAGAGCAGAAGAGAACAGGAGGTGGCCTGAGCAAGG GACTGAGCCAAGTGCTTGTGGAGGGCTCAGGTTCTGGGCCGTAAGATGCGATTTCCCATTCGCCCACTCC GGATCTCTGAGGCCACTCCTGACGGCAATCTGCATGAGTTCTCCAAGTGCGAATAGGAAGGAAACCTGGA TTCGGCCGCTGGGAGACACAGGTGGATCTCAAAGGTGGCTGTGCGGCAAATGACTGACACCTACTGGCGG CGTCACGATCTGCAAAAAAAGAGAAACGCGGAAATCCTCAATCAGCTGCTTTCCCGACTGCTAGTGCCAC AAATGCCATCCGGGCGGCACAGCCACCGGTCCAGATCTCCAGTCCTGAGCACCTGCGAAAGCCGCCCGCA CTCACTCTACGGGGTGCGGATAGTGCTCCCCACTCAGACTCCGGGGATCCCGCGGGCCGACAGATCTGCG CCGGGGCCCTGAGCCGCCTGAGCCTGTACCTTCGAGGCCAGTAATAGTCGGAGCCTGGAAACTGTGCACC CACTCGATTCCAGCTCTGCGCCACTTGGTGAATCCGGACCACAGGGTCCCAGACAGCCGCTGCCGACGCC AGGGGCGAGGCGCAGTGAGCTTCCTCTCGAGTTCCTCTCCCCGCGCCAAGTACTGCAACTCGCTGCGGAG ACAGCAGAGGTCTGACCGCCCCGCTGAGGTCTCAGAACAGCAAAGCAAGTTACTGGGACTGCCGAAGTCC CGCGTGTCCCCCGTTCCCGCGGGTGCCGGGCCTGGAGAGTGCTAAGCACCCTGAGACTCGCGCTTTCCTA GCGCGTGAATCCCAACCGTCAACCGAACACTGCGCTCTTCGACTCTGTCCGATTCTGCAGACGTCCGAAA CCTCGGAAGCCAAAACCGTGCTTGAACTCACTGCCCGCGCCTCATCTCTCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR6_9DSNX · promoter · 27312263–27312763 · regulatory
ENSR6_58FG9F · CTCF_binding_site · 27312853–27312874 · regulatory
· motif · 27311960–27311969 · motif
· motif · 27311960–27311969 · motif
· motif · 27312692–27312707 · motif
· motif · 27312818–27312829 · motif
· motif · 27312818–27312829 · motif
· motif · 27312855–27312871 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1035 aa
POM121-like protein 2 長 1,035 個胺基酸，屬於 POM121 family。序列中有六段區域註解為無序區，分別位於胺基酸 1–37、177–213、286–343、415–508、754–791 與 972–1,035；此註解依序列分析提供。
蛋白質三維結構
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
AACCGAACACTGCGCTCTTCGACTCTGTCCGATTCTGCAG40ACGTCCGAAACCTCGGAAGCCAAAACCGTGCTTGAACTCA80CTGCCCGCGCCTCATCTCTCCTCATGGGCAGTTTCCTGAG120CAAACTGGAACTTTCGCCCTCGTCCCCAGCCCAGGTGCGC160ACCGACTTGCCCGAGAGGCCCACGAAACGCCGGCCACCTC200AGCCCCTTCACCAAGTTCATCGGGTTCAGTTCGTCCACCG240CGCCCACCCTGCCCCACGGTATAGACCTGTGAGGAGGCGG280CCAAACCTGGATCCTGCCAATCCAACCACGTGGCTGGCCA320ACGAGGCCTGGAGGCGCTTTCCCATGAAGAAGTCCCAGAA360TTCCCCCCTGGGGCCTCTCCCTTCAGACTGGTGGGAAAGT400TACTTAAAGCGGACTATTTGGTCTCTTCGACATCCCAGGC440CAATTTGGAGCCCAGTGACCATCAGGATCACTCCTCCTGA480CCAGAGAGTGCCCCCTTCCACTTCTCCTGAAGATGTAATT520GCCCTTGCAGGACTCCCGCCCTCTGAGGAGCTCGCAGATC560CATGTTCAAAGGAGACAGTGTTGAGGGCCCTCAGAGAGTG600CAGAAAAGGGAAAGGGAGGTTGGAAGAACCACTATTCCCT640GAGAGTCTGGACAGTAAGAGAAGGAGTCCAGAGACCAGAC680CATCGGCATTTAAGCCCCTGATGAAAAATGGAACCCTCAC720TTCTTTTGTGCCCAGGCCTGGGCCGCTGAAGAGAAGTCTC760CACTCCTGGGGCTCAGATCACAGCTTGACTAAGAGGCCCA800ATTGCTCCTCCATGAGCTCCTTGGCCAGCATATACAGAGG840TGGCACCCTCAGCTCCAAAAGGAATGCTATTGGCAGCTCT880TACAGCTCTTGCAGAAATTTCTCAGACCCTTGGAAGAGAA920GTGTTCCCAGTGTATCATTCGAGACACCAGAGTGGCCAAT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。