基因總覽
POLE3 是蛋白質編碼基因，其產物正式名稱為 DNA polymerase epsilon 3, accessory subunit。這種蛋白質是 DNA polymerase epsilon 複合體的輔助次單元；該複合體另含催化次單元 POLE，以及輔助次單元 POLE2、POLE4。POLE3 也可與 CHRAC1 形成異源二聚體，並是 CHRAC ISWI 染色質重塑複合體的組成成分。來源所述的功能涉及 DNA 修復、染色體 DNA 複製及染色質相關活動；具體分子作用見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000374171 ★ | 113,407,235–113,410,675 | 5 |
| ENST00000374169 | 113,407,232–113,410,619 | 4 |
| ENST00000858453 | 113,407,232–113,410,619 | 4 |
| ENST00000940582 | 113,407,232–113,410,723 | 5 |
| ENST00001135612 | 113,407,232–113,410,723 | 5 |
| ENST00001056332 | 113,407,235–113,410,619 | 4 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
POLE3 是 DNA polymerase epsilon 複合體的輔助成分，並被指出參與 DNA 修復與染色體 DNA 複製；這兩項功能的依據標示為相似性推論。現有資料也描述了 POLE3 在染色質相關活動中的作用，但沒有提供足以詳述其如何直接促進 DNA 修復或複製的機制，因此不宜將這些角色延伸為更具體的反應步驟。
POLE3 與 CHRAC1 形成複合體並結合裸露 DNA。這些 DNA 隨後被納入染色質；此過程有 ISWI/SNF2H 與 ACF1 的核小體重塑活性協助。此描述支持 POLE3–CHRAC1 參與 DNA 染色質化，但沒有指出 POLE3 本身具有核小體重塑活性。
POLE3 所在的 CHRAC ISWI 染色質重塑複合體具有 ATP 依賴性的核小體重塑活性。研究描述中，CHRAC1–POLE3 異源二聚體偏好透過自身結合 DNA，連結複合體與 DNA；其中該異源二聚體與 SMARCA5/SNF2H、BAZ1A/ACF1 的互作，與核小體滑動活動相關。不過，POLE3 並非所有核小體滑動反應都會增強：資料指出，它不會提高 ACF-5 ISWI 染色質重塑複合體的核小體滑動活性。這項限制應與其在 CHRAC 複合體中的作用分開理解。
Promoter 與基因調控
>POLE3 ENST00000374171 GRCh38 chr9:113410575-113411675 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TAAATAAAATCAGTGGGAGTGAGAATTTCTACGAACTTAATATAAAAATAACTTAAAAACAACTTAAAAC ACCATTGCGCCGGGCGCGGTGACTGGCGCCTGTAATCCCTGCACTTTGGGAGACCGAGGCGGGCGGATCA CGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCTTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAA TTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCGTCTGTAGTCCCAGCTACTAAGGAGGCTGAGGTAGGAGAATGGCGTGA ACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAAATCGGCGCCACTGCACTCCAACCTGGGCGACAGAGTGAG ACTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAGAAACGCCATTGCAAAACCTTGAGAATGGTTTTAACTGGAAAAAATG TATGATGAACAATTTAACTGAAAAATAAATACAATTTTAACACGGTTTGTTTTTGAAAGCGAATGTGACG TTGCATTCTTCATACAGTGAAAAGGCTGCTTCTCGCCCTTTCGTTACCTGCCCAGTCCGAATTGACTCCT GAGACCTAATCAGGCGCATCTCTATATGGCCAGCATTATCCCTGGGCTGCCTAAATAGTTCGCGTTAAAC ACAAACAACAACAATAAAATCTAAATAACACTCAGTCTTAGTACCATTATTACAAAAGCGTGAGGGGCGA AAAGATTAAAAATGAACATCAACTTCGGTAGAGATGGAAAAAGACTGCCCACTCCATTCCAGGAAAGAAA AAAGAAAGTGGGAGAATCTGATCACGACGGGCTGAGGTCCTGTGAGAGCAAAGCAGATTCCAAACCGCTT AGGGTTGCTAAATCAAGTGGTAAAACGTGGCCCCTTGCGGCGCGGTGAGATTAACGGACCCGGCGGGCCC AGAGCCTGCCTCGGGTCCTAAAGGGATCCGCCCCGCCGAGTCAGCCACGCCTTCGTCTCCCACGCGCTGC GCCCGGCCGCGCCGTCACCCAGCAGCGGCGCAGGGCACCATGGGAAACGGACGGAAGCTCCATTGAGCCA AATAAGTTGGTGAGAAGGTTCCCGACGCGGCGATGGCGAGAAGCAGAGAAA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| POLE3_1 ↗ | 9:113,410,346 | 負股 | 113,410,336–113,410,395 |
| POLE3_2 ↗ | 9:113,410,675 | 負股 | 113,410,665–113,410,724 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR9_BSHN8 · enhancer · 113406548–113407389 · regulatory
ENSR9_5ZN7MS · CTCF_binding_site · 113407082–113407103 · regulatory
ENSR9_5ZN7SF · CTCF_binding_site · 113408075–113408096 · regulatory
ENSR9_5ZN86Q · CTCF_binding_site · 113410086–113410107 · regulatory
ENSR9_93N2DK · promoter · 113410372–113410757 · regulatory
ENSR9_BSHNT · enhancer · 113410758–113411615 · regulatory
ENSR9_5ZN8B2 · CTCF_binding_site · 113410792–113410813 · regulatory
· motif · 113407084–113407100 · motif
· motif · 113408077–113408093 · motif
· motif · 113410088–113410104 · motif
· motif · 113410095–113410105 · motif
· motif · 113410205–113410218 · motif
· motif · 113410285–113410295 · motif
· motif · 113410320–113410333 · motif
· motif · 113410461–113410471 · motif
· motif · 113410463–113410476 · motif
· motif · 113410542–113410557 · motif
· motif · 113410553–113410563 · motif
· motif · 113410558–113410568 · motif
· motif · 113410609–113410620 · motif
· motif · 113410698–113410711 · motif
· motif · 113410712–113410722 · motif
· motif · 113410719–113410733 · motif
· motif · 113410719–113410733 · motif
· motif · 113410794–113410810 · motif
· motif · 113411291–113411301 · motif
· motif · 113412002–113412013 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：147 aa
DNA polymerase epsilon 3, accessory subunit 長 147 個胺基酸。序列註解指出，其第 93 至 147 位胺基酸區域為無序區；資料未提供其他結構域或功能區域註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
POLE3 的細胞定位註記為細胞核；來源未提供定位變化條件或不同異構型間的差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
- CHRAC1Q9NRG0 · UniProt INTERACTION · 15 experiments
- DKFZp666G145Q658N3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DR1Q01658 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- DRAP1Q14919 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- POLE4Q9NR33 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- ORFQ9Q2G4 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
POLE3 是 DNA polymerase epsilon 複合體的成分；與 POLE4 的互作是後續結合 POLE 和 POLE2 的先決條件。POLE3 也與 CHRAC1 形成可結合 DNA 的異源二聚體，並參與 CHRAC ISWI 染色質重塑複合體。該異源二聚體與 SMARCA5/SNF2H 及 BAZ1A/ACF1 有直接互作；相關複合體具有 ATP 依賴性的核小體重塑活性。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | POLE3 是 DNA polymerase epsilon 複合體的輔助成分，並被描述為參與 DNA 修復與染色體 DNA 複製；這兩項作用依相似性推論。POLE3 與 CHRAC1 組成複合體後可結合裸露 DNA，並在 ISWI/SNF2H、ACF1 的核小體重塑活性協助下，使 DNA 納入染色質。此外，POLE3 不會增強 ACF-5 ISWI 染色質重塑複合體的核小體滑動活性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Accessory component of the DNA polymerase epsilon complex. Participates in DNA repair and in chromosomal DNA replication (By similarity). Forms a complex with CHRAC1 and binds naked DNA, which is then incorporated into chromatin, aided by the nucleosome-remodeling activity of ISWI/SNF2H and ACF1. Does not enhance nucleosome sliding activity of the ACF-5 ISWI chromatin remodeling complex PMID 10801849 ↗ · PMID 14759371 ↗ |
| 交互作用 | POLE3 是含催化次單元 POLE 及輔助次單元 POLE2、POLE3、POLE4 的 DNA polymerase epsilon 複合體成員；先與 POLE4 互作是後續結合 POLE 和 POLE2 的必要條件。POLE3 也與 CHRAC1 形成結合 DNA 的異源二聚體，並參與 CHRAC ISWI 染色質重塑複合體。該異源二聚體與 SMARCA5/SNF2H、BAZ1A/ACF1 直接互作，相關複合體具有 ATP 依賴性核小體重塑活性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the DNA polymerase epsilon complex consisting of four subunits: the catalytic subunit POLE and the accessory subunits POLE2, POLE3 and POLE4. Interaction with POLE4 is a prerequisite for further binding with POLE and POLE2. Heterodimer with CHRAC1; binds to DNA. Component of the CHRAC ISWI chromatin remodeling complex at least composed of SMARCA5/SNF2H, BAZ1A/ACF1, CHRAC1 and POLE3; the complex preferentially binds DNA through the CHRAC1-POLE3 heterodimer and possesses ATP-dependent nucleosome-remodeling activity. Within the complex, the heterodimer with CHRAC1 interacts with SMARCA5/SNF2H; the interaction is direct and enhances nucleosome sliding activity by the SMARCA5/SNF2H and BAZ1A/ACF1 interaction. Within the complex, the heterodimer with CHRAC1 interacts with BAZ1A/ACF1; the interactions are direct PMID 10801849 ↗ · PMID 10880450 ↗ · PMID 12434153 ↗ · PMID 14759371 ↗ |
| 細胞定位 | POLE3 的細胞定位註記為細胞核；此項資料未說明特定實驗條件、定位改變或異構型差異。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
AGCAGCGGCGCAGGGCACCATGGGAAACGGACGGAAGCTC40CATTGAGCCAAATAAGTTGGCCACGTGGGGCGGAACGGAA80ACCTCGCAGGGTCAGACCGTAGCGACGCGGGAAGTCCGGA120CGCAGTAGCTCCCTGAAGCGGAGGCGAAGGGGAGTTTAAG160CCCCAGCGGCGGCAATGGCGGAGAGGCCCGAGGACCTAAA200CCTGCCCAATGCCGTGATCACCAGGATCATCAAGGAGGCG240CTCCCGGACGGTGTCAACATCTCCAAGGAGGCCCGGAGCG280CCATCTCCCGCGCCGCCAGCGTCTTCGTGCTGTACGCCAC320ATCCTGTGCTAACAACTTTGCAATGAAAGGAAAGCGGAAG360ACGCTGAATGCCAGTGATGTGCTCTCAGCCATGGAAGAGA400TGGAGTTCCAGCGGTTCGTTACCCCATTGAAAGAAGCTCT440GGAAGCATATAGGCGGGAGCAGAAAGGCAAGAAGGAGGCC480TCAGAGCAAAAGAAGAAGGACAAAGACAAAAAAACAGACT520CGGAAGAGCAAGACAAGAGCAGGGATGAGGACAATGATGA560AGACGAAGAAAGGCTGGAAGAAGAAGAACAGAATGAAGAG600GAAGAAGTAGACAACTGAAAAGGGCGGGAGACTGTGGCAC640CTTGGAAGGTACCACTTGAAATGAGACGTGCTACGTGTTT680CTGTGAAGCTTTTCCATGCTGGGCAGAGTAGTCTCAGGCA720AAAGTGCCTGAAAAGATCAGAATAAAAACTGACTAGAAAT760ACCGTCAAAACCAGCACTTACCAAACTCAGAGCATCTGAG800TAGCAGAATCCTGTTTTGCTTCATCAATCTGAAGGTTATG840GCCTTTTGACAAGAGGGATTCTGAACGACTAAATTAGTCA880GTTTGCTCGCTTTTGTTTACTTAAATGTATGGTTAGATGG920TTTTTGATCTGCAGTCTTCCCTAGTCCCCCAAATAAGTAA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。