演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

POF1BPOF

POF1B actin binding protein

POF1B actin binding protein 是由 POF1B 編碼的蛋白質,參與上皮細胞單層的組織,並與肌肉非特異性 actin 互作;也可能參與卵巢發育。

Homo sapiensXq21.1UniProt Q8WVV4
OFFICIAL SYMBOL
POF1B
CHROMOSOME
X
UNIPROT
Q8WVV4
PDB / ALPHAFOLD
3BH9
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

POF1B 是位於 X 染色體的蛋白質編碼基因,其正式名稱為 POF1B actin binding protein。其產物是具有 actin 結合特性的蛋白質,與細胞骨架的組織相關。現有資料將它的主要角色連結至上皮細胞單層的組織,並指出它可能參與卵巢發育;這項卵巢發育關聯仍以「可能」描述。來源未提供蛋白質長度、結構域或更細部的結構資訊。

Official symbol
POF1B
Gene name
POF1B actin binding protein
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13711
UniProt
Q8WVV4
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
POFFLJ22792

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome XXq21.1
chrX · 156,040,895 bp · GRCh38chrXp22.33 · 1–4400000 · gnegchrXp22.32 · 4400001–6100000 · gpos50chrXp22.31 · 6100001–9600000 · gnegchrXp22.2 · 9600001–17400000 · gpos50chrXp22.13 · 17400001–19200000 · gnegchrXp22.12 · 19200001–21900000 · gpos50chrXp22.11 · 21900001–24900000 · gnegchrXp21.3 · 24900001–29300000 · gpos100chrXp21.2 · 29300001–31500000 · gnegchrXp21.1 · 31500001–37800000 · gpos100chrXp11.4 · 37800001–42500000 · gnegchrXp11.3 · 42500001–47600000 · gpos75chrXp11.23 · 47600001–50100000 · gnegchrXp11.22 · 50100001–54800000 · gpos25chrXp11.21 · 54800001–58100000 · gnegchrXp11.1 · 58100001–61000000 · acenchrXq11.1 · 61000001–63800000 · acenchrXq11.2 · 63800001–65400000 · gnegchrXq12 · 65400001–68500000 · gpos50chrXq13.1 · 68500001–73000000 · gnegchrXq13.2 · 73000001–74700000 · gpos50chrXq13.3 · 74700001–76800000 · gnegchrXq21.1 · 76800001–85400000 · gpos100chrXq21.2 · 85400001–87000000 · gnegchrXq21.31 · 87000001–92700000 · gpos100chrXq21.32 · 92700001–94300000 · gnegchrXq21.33 · 94300001–99100000 · gpos75chrXq22.1 · 99100001–103300000 · gnegchrXq22.2 · 103300001–104500000 · gpos50chrXq22.3 · 104500001–109400000 · gnegchrXq23 · 109400001–117400000 · gpos75chrXq24 · 117400001–121800000 · gnegchrXq25 · 121800001–129500000 · gpos100chrXq26.1 · 129500001–131300000 · gnegchrXq26.2 · 131300001–134500000 · gpos25chrXq26.3 · 134500001–138900000 · gnegchrXq27.1 · 138900001–141200000 · gpos75chrXq27.2 · 141200001–143000000 · gnegchrXq27.3 · 143000001–148000000 · gpos100chrXq28 · 148000001–156040895 · gnegPOF1Bpq1 bp156,040,895 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chrX:85,276,746–85,379,755
Gene span
103,010 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000262753 ★85,277,396–85,379,66517
ENST0000087167285,276,746–85,379,75516
ENST0000087167385,276,746–85,379,75516
ENST0000087167485,276,746–85,379,75517
ENST0000087167585,276,746–85,379,75516
ENST0000087167685,276,746–85,379,75518
ENST0000087167785,276,746–85,379,75514
ENST0000087167885,276,746–85,379,75515
ENST0000087167985,276,746–85,379,75516
ENST0000087168085,276,746–85,379,75516
ENST0000087168185,276,746–85,379,58116
ENST0000087168285,276,746–85,379,75517

顯示 12/17 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

POF1B actin binding protein 的主要功能線索,是它透過調節 actin 細胞骨架,參與上皮細胞單層的組織。上皮細胞單層需要維持細胞間的排列與整體組織狀態;來源將 POF1B 的作用定位在細胞骨架調節與這類組織安排之間,但沒有進一步說明其分子步驟或調節方向。

POF1B 與肌肉非特異性 actin 互作,為其和 actin 細胞骨架相關的功能提供了具體線索。這項互作可與其在上皮細胞單層組織中的角色並列理解;然而,現有資料並未指出 POF1B 如何結合 actin、是否透過其他分子協同作用,或其作用對細胞形態及組織穩定性的具體影響,因此不宜將這些細節延伸為已確立的機制。

此外,POF1B 可能參與卵巢發育。來源以可能性描述這項角色,並未交代其在發育過程中的作用階段、作用細胞或分子途徑。這項線索與 POF1B 在上皮細胞單層組織中的主要功能敘述不同,應保留其推測性質,不應據此推定更具體的生殖生物學機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 85379665 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>POF1B ENST00000262753 GRCh38 chrX:85379565-85380665 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GGTGGTAGTATACTAGGTCCTATTGCACATATACACATTAGGAAGATACTTTTTACTAAAGTCACTTTGA
ATGAGAGTATTCTGGATTTAAGTGGTGCTGAAGTATATTGCATAGCAAAATCTGAGGGTAAGTAGGCATT
ATGATCAAAATTTCAAGTAGTAATAAATGTAAGTTGTAAACACATTTAAATCTCATTATGTCAGTTAAGG
CATCTTTCAGGACTTGCAGCTCCCTTAATAACTAGATATTAAAAAGTCAATCAAACTCAGTGTTTCCTAG
GGCACATATAAGGGCAGGAGAAATTCCCTTGCATAAATGAAAAACAACAAATGTGAATGCCAAAATGCAA
AGCATTTGTGGAATCTTTAGGTTTTTCTTGACCATCCACCTTTCTATACAGCAATTCAATCATTTAGACA
AATTTCCTTCAACAAATGATAGAAAAGAATACGAGGCTTTGAGTAAGATAAACAAGTCCATATATTAGAC
AGAGTCACTAGAAAGAGACCCCTTAGTAATCTTCCTTAACTGCAATTATCAGATGGGTTTTGCAAAGAAT
GCAAATTTATCTGTGAAAATTGGTGTATTCCTAGACTAATACTCATTATTTTAGTCTGGGAATCTGGAAT
AATAATACTTATGCTGGTAACTACCTTTGCTAAACTTAAGAACCATAAAAAGACACTTTCATATAACATG
TGTGACTTTTTTTCTCTAGCAAGTTTTTTGCATTTTCATGTCTTTGTGAATTTTTAAGCCCATGTGCTTG
GAAACTCTGGCTTCATCCCTGACATTCTACATTTCTGCTCTTCACAGACTCCTTTACCTGCTGGGCAGCC
TTGTAGCTATCTCCGTGGCAAGGCAGGGCCTCTCCTGGCATGTAAACCTGCTAAGTGAATCCGCCCCTAA
GGGCGTGTCAGTACCATTTCCTGGAGCAATGTCACAGGGTGGCTCCATTTTCCATTTGAGCTCAAATATT
TTGCTGCTTCCTCTGTAGCTGCCAGACCTGCTCTTGCTGCTGCTCAGGTAGCTTTCTTCTCTTCCCGGCA
CCACTATTGGCAGAGGTTTTGATAAGCGGTTTCCACACGTGTGTCGTGTGT
POF1B 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
POF1B_1 ↗X:85,379,665負股85,379,655–85,379,714

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSRX_938TXK · enhancer · 85375340–85375717 · regulatory

ENSRX_84HQZK · promoter · 85379655–85379892 · regulatory

· motif · 85374995–85375004 · motif

· motif · 85374995–85375006 · motif

· motif · 85375568–85375581 · motif

· motif · 85375568–85375581 · motif

· motif · 85375597–85375608 · motif

· motif · 85378974–85378985 · motif

· motif · 85378974–85378985 · motif

· motif · 85378976–85378985 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:589 aa

目前未取得此類註解。
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 3BH9…

PDB · 3BH9

X-ray · 1.70 A · C=53-62

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell junction, tight junction

POF1B 的定位資料將其列於細胞連接處,並特別標示緊密連接。 來源未提供定位改變的條件、不同異構型之間的差異或細胞狀態相關的動態資訊。

未繪示構造:Cell junction, tight junction。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 13 個夥伴 · 最多顯示 50 個
POFPOF1BARL4ABCL6COL8A1FAM90A1FRS3GEMIGFN1KCTD9KLHL38LGALS14PPLRFPL3SYT17
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 13 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

POF1B 與肌肉非特異性 actin 互作,這是來源明確記載的分子互作。資料未指出兩者是否構成特定複合體,也未列出其他結合夥伴;其與上皮細胞單層組織的功能關係不等同於額外的實體結合證據。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

POF1B 與 Premature ovarian failure 2B 有疾病關聯。此卵巢疾病指 40 歲以前卵巢功能停止,特徵包括月經稀發或閉經、血清促性腺激素升高及雌二醇偏低。來源指出,影響 POF1B 的變異會造成此疾病;此處不提供特定變異或其作用機制。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能POF1B actin binding protein 透過調節 actin 細胞骨架,對上皮細胞單層的組織具有重要作用;此外,該蛋白質可能參與卵巢發育,但此項角色仍以可能性描述。含實驗來源
證據與來源

Plays a key role in the organization of epithelial monolayers by regulating the actin cytoskeleton. May be involved in ovary development

PMID 16773570 ↗ · PMID 21940798 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用POF1B actin binding protein 與肌肉非特異性 actin 互作;來源未提供互作方式或其他相關分子。含實驗來源
證據與來源

Interacts with nonmuscle actin

PMID 16773570 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位POF1B actin binding protein 的細胞定位包括細胞連接處,並特別標示為緊密連接。含實驗來源
證據與來源

Cell junction, tight junction

PMID 21940798 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯Premature ovarian failure 2B 是一種在 40 歲以前卵巢功能停止的疾病,常見特徵為月經稀發或閉經、血清促性腺激素升高及雌二醇偏低。來源指出,影響 POF1B 的變異會造成此疾病。含實驗來源
證據與來源

Premature ovarian failure 2B POF2B An ovarian disorder defined as the cessation of ovarian function under the age of 40 years. It is characterized by oligomenorrhea or amenorrhea, in the presence of elevated levels of serum gonadotropins and low estradiol. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 300604

PMID 16773570 ↗ · PMID 21940798 ↗ · PMID 34707299 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000262753 · 3,863 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCCAGACCTGCTCTTGCTGCTGCTCAGGTAGAACATCTGG40
41GAGGTCCCTTGCTGACCACTGGAAGAAGATGAGCTCGAGC80
81TATTGGAGTGAGACGAGCAGCAGCAGCTGTGGAACCCAGC120
121AGCTCCCAGAGGTGCTGCAGTGCCAGCCCCAGCATTACCA160
161CTGCTACCATCAGTCAAGCCAAGCCCAGCAGCCTCCAGAA200
201AAAAATGTAGTGTATGAGCGAGTGAGGACCTACAGTGGGC240
241CCATGAACAAGGTGGTGCAGGCCTTGGACCCCTTCAACTC280
281ACGGGAAGTGCTCTCCCCTCTCAAAACCACCTCCTCCTAC320
321CAAAATTTGGTTTGGAGCGACCATTCTCAGGAACTCCATT360
361CTCCAACTTTAAAAATATCTACATGTGCCCCAAGTACTCT400
401ACATATAACCCAAAATACTGAACAGGAACTTCATTCTCCA440
441ACAGTGAAACTTACTACATATCCACAGACCACTATTAGGA480
481AATATGTAGTACAAAATCCTGAACAGGAACCACTGTCTCA520
521ATTCCTAAGAGGAAGCCATTTCTTCCCAGGAAACAATGTT560
561ATTTATGAAAAAACAATAAGAAAAGTGGAGAAGCTAAATA600
601CTGATCAGGGGTGCCATCCTCAGGCTCAATGCCATCATCA640
641CATTATCCAACAGCCCCAGGTCATCCACTCTGCACACTGG680
681CAACAACCTGATTCTAGCCAGCAAATCCAAGCCATCACAG720
721GAAATAATCCAATTTCTACACATATTGGAAATGAACTGTG760
761CCATAGTGGATCAAGCCAGATTTGTGAGCAGGTGATAATT800
801CAGGATGATGGCCCTGAAAAATTGGACCCCAGATATTTTG840
841GAGAGTTGCTTGCTGATCTGAGCCGTAAGAATACGGATCT880
881ATATCACTGCTTATTAGAACATTTGCAGAGAATTGGAGGA920
921AGCAAACAGGACTTTGAGTCTACAGATGAGTCGGAAGACA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。