基因總覽
PMEPA1（prostate transmembrane protein, androgen induced 1）是蛋白質編碼基因，產物屬於 PMEPA1 family，為單次跨膜蛋白。其蛋白質具有朝向腔面的 N 端區段、跨膜螺旋，以及較長的細胞質區段；細胞質區段含有多個序列基序，提供分子互動的區域。這些基本特徵與其參與細胞內訊號調節的角色相符。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000341744 ★ | 57,648,396–57,710,015 | 4 |
| ENST00000395816 | 57,648,392–57,710,569 | 4 |
| ENST00000347215 | 57,648,392–57,710,600 | 4 |
| ENST00000395814 | 57,648,392–57,691,830 | 4 |
| ENST00000265626 | 57,648,392–57,711,536 | 4 |
| ENST00001047869 | 57,648,392–57,710,003 | 4 |
| ENST00001132429 | 57,648,392–57,710,015 | 4 |
| ENST00001047868 | 57,648,397–57,710,036 | 4 |
| ENST00000414037 | 57,652,208–57,690,624 | 4 |
| ENST00000395819 | 57,652,407–57,709,760 | 5 |
顯示 10/10 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
PMEPA1 是 TGF-beta 訊號的負向調節因子。典型 TGF-beta 訊號傳遞中，ZFYVE9/SARA 會將訊號轉導及轉錄調節蛋白 SMAD2、SMAD3 招募至 TGF-beta 受體；受體使 SMAD2 與 SMAD3 磷酸化後，兩者再與 SMAD4 形成異源複合體，並移入細胞核調控轉錄。
PMEPA1 可與 SMAD2、SMAD3 互動，並可能藉此與 ZFYVE9 及 SMAD4 競爭，阻止訊號在細胞內繼續傳遞。此作用使 PMEPA1 能調節 TGF-beta 路徑的訊號強度；來源指出，它因此可能參與細胞增殖、分化、凋亡、細胞移動、細胞外基質生成及免疫抑制等過程，但這些生物學角色以「可能」表述。
PMEPA1 也參與雄激素受體（AR）的下調。它會促進 AR 的泛素化及由蛋白酶體介導的降解，而此作用可能是透過招募 NEDD4 達成。來源將 NEDD4 的招募描述為可能機制，並未將其表述為已確定的唯一途徑。
Promoter 與基因調控
>PMEPA1 ENST00000341744 GRCh38 chr20:57709915-57711015 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TATTCGGCCACACTGAGTCGGTGTCAGGTTGAGTTAATATTTGGAGAGTTTCTGGCACAGGTAGGTGCTC CTTAAGTGCCTGTTAAATAAGTGAAGCTTTGAGAAAGTGTCTAAAAGGCGACACACTAAATTTTTAAGAG GCTGGAGGTGGGCCAGGGAGGGGAGGTCTCTTATGTAATATTTTAATATCTTTTTAAACCTGAAGAATGT GTTCTTGTAGCACTCCTGTAATTAAAACTTAATGAACTAAAAGTACACCCCTCCTGCTCATACCCCTTTT GAACTCCGCAGCCGCGCCCCCCAGCCGGAGGCCCCTTGGGCAGCAGACAATGGGTGTGGATTCGCCCCAG GTCCCGCCGGCTGGGGCGGCGACAATACACCAGTCCCCGACAGCTATTTACATGACAAGGGCTTCCGGGC GTGTCTACGCGAGTTCCCGTCTTTCCTGGTCGTCCTCCTTGGGTTCGGGTGAAAGCGCTTGGGGGTTCAG TGGGCCATGATCCCCGAGCTGCTGGAGAACTGAAGGCGGACAGTCTCCTGCGAAACCAGGCAATGGGTGA TCCATCTTGGGGGCTTCCTCCCCCTTTCTCCAATTTCTCTTCCCTGAGCCCCCAGGGACCTTGTGCTCCT CAGAAGATAGGCTAGCCCCAAGAGCCTGGGTCAAGGACCCCAGGGACGGGGGCGAGGGGAGGGCGCACCA GCAACCCGCCCGGGTGCGGCTGGCACCGAGTTCGGCTCCCCGGCCCCGGGCGTGCGCCGGGCAGGCGTTC CAAGCTGACCGCCGTTGGGGAGAGGGCACAGCGCCCCTCCTCCGTTGCGCGGGTGCCGGGTCTACGTGGG CCGCCTAGCTCTGGCCCTTTAAGAGCCCGCCCCGTTTCCCGTCACCCCGCCCCCCGGCTCGGGGAGGGGG TGCGGGGGAACCTCGGCGGGGATTGGCGCAGCGCGCGCCCCCTCCCCGGCCCCCGCGCGGTGGGAACCGG CAGCCCCGTCTAGCGCTGACGTCAGACCGTCTGCCTGCCTCCGACCGCGGTCTCGGAGCGAAACCCGATC TCCTTGGACTTGAATGAGGAGGAGGAGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGAG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| PMEPA1_1 ↗ | 20:57,710,015 | 負股 | 57,710,005–57,710,064 |
| PMEPA1_2 ↗ | 20:57,710,577 | 負股 | 57,710,567–57,710,626 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR20_9SWF5 · enhancer · 57705102–57705421 · regulatory
ENSR20_9SWG3 · promoter · 57708194–57708694 · regulatory
ENSR20_C7PLK · enhancer · 57708695–57710004 · regulatory
ENSR20_83NRX3 · promoter · 57710005–57710193 · regulatory
ENSR20_9SWGL · enhancer · 57710194–57710558 · regulatory
ENSR20_BFG8C · promoter · 57710559–57711079 · regulatory
ENSR20_9SWGZ · promoter · 57711526–57711814 · regulatory
ENSR20_83NRZ5 · enhancer · 57711867–57712101 · regulatory
ENSR20_9SWHD · enhancer · 57712874–57713258 · regulatory
ENSR20_9SWHK · enhancer · 57713547–57713843 · regulatory
ENSR20_9SWHR · enhancer · 57714286–57714766 · regulatory
ENSR20_83NS2X · enhancer · 57714990–57715234 · regulatory
· motif · 57705702–57705717 · motif
· motif · 57705703–57705716 · motif
· motif · 57705910–57705925 · motif
· motif · 57709512–57709528 · motif
· motif · 57709512–57709528 · motif
· motif · 57709916–57709929 · motif
· motif · 57709928–57709941 · motif
· motif · 57710009–57710022 · motif
· motif · 57710009–57710022 · motif
· motif · 57710031–57710045 · motif
· motif · 57710047–57710060 · motif
· motif · 57710100–57710110 · motif
· motif · 57710122–57710132 · motif
· motif · 57710338–57710351 · motif
· motif · 57710338–57710351 · motif
· motif · 57710396–57710409 · motif
· motif · 57710396–57710409 · motif
· motif · 57710518–57710533 · motif
· motif · 57712375–57712389 · motif
· motif · 57712969–57712983 · motif
· motif · 57713152–57713159 · motif
· motif · 57713222–57713234 · motif
· motif · 57713224–57713231 · motif
· motif · 57713224–57713239 · motif
· motif · 57713232–57713239 · motif
· motif · 57713257–57713270 · motif
在蛋白質層級，雄激素與 TGF-beta 都會上調 PMEPA1。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：287 aa
PMEPA1 蛋白長 287 個胺基酸。第 1–40 位為腔面區，第 41–63 位為螺旋狀跨膜區，第 64–287 位位於細胞質。細胞質區段含兩個 PPxY motif（第 158–161 位及第 229–232 位），以及 SMAD interaction motif（SIM，第 186–189 位）；第 239–258 位另註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
PMEPA1 定位於早期胞內體膜與 Golgi apparatus 膜，兩處皆為單次跨膜蛋白。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
- EPN2O95208-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- OTUB2Q96DC9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SGTAO43765 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UBASH3AP57075-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UBQLN2Q9UHD9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
PMEPA1 與 NEDD4、AR 及 LDLRAD4 互動；其 PPxY motifs 參與與 NEDD4 的互動，SMAD interaction motif 則參與與 SMAD2、SMAD3 的互動。來源未將這些互動一概描述為同一複合體；其中 NEDD4 與 AR 的互動關係，亦與 PMEPA1 可能促進 AR 降解的功能敘述相連。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | PMEPA1 是 TGF-beta 訊號的負向調節因子，可能影響細胞增殖、分化、凋亡、移動、細胞外基質生成與免疫抑制。在典型路徑中，ZFYVE9/SARA 招募 SMAD2、SMAD3 至受體；兩者磷酸化後與 SMAD4 形成複合體並移入細胞核調控轉錄。PMEPA1 與 SMAD2、SMAD3 互動，可能競爭 ZFYVE9 和 SMAD4、阻止訊號傳遞；它也可能招募 NEDD4，促進 AR 泛素化及蛋白酶體介導的降解。 | 含實驗來源 | 證據與來源Functions as a negative regulator of TGF-beta signaling and thereby probably plays a role in cell proliferation, differentiation, apoptosis, motility, extracellular matrix production and immunosuppression. In the canonical TGF-beta pathway, ZFYVE9/SARA recruits the intracellular signal transducer and transcriptional modulators SMAD2 and SMAD3 to the TGF-beta receptor. Phosphorylated by the receptor, SMAD2 and SMAD3 then form a heteromeric complex with SMAD4 that translocates to the nucleus to regulate transcription. Through interaction with SMAD2 and SMAD3, LDLRAD4 may compete with ZFYVE9 and SMAD4 and prevent propagation of the intracellular signal. Also involved in down-regulation of the androgen receptor (AR), enhancing ubiquitination and proteasome-mediated degradation of AR, probably by recruiting NEDD4 PMID 18703514 ↗ · PMID 20129061 ↗ · PMID 24627487 ↗ |
| 交互作用 | PMEPA1 透過 PPxY motifs 與 NEDD4 互動，也與 AR 和 LDLRAD4 互動；其 SMAD interaction motif 參與與 SMAD2、SMAD3 的互動。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with NEDD4 (via PPxY motifs). Interacts with AR. Interacts with LDLRAD4. Interacts (via the SMAD interaction motif) with SMAD2 and SMAD3 PMID 12907594 ↗ · PMID 18703514 ↗ · PMID 20129061 ↗ · PMID 24627487 ↗ |
| 細胞定位 | PMEPA1 是單次跨膜蛋白，定位於早期胞內體膜及 Golgi apparatus 膜。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Early endosome membrane / Single-pass membrane protein; Golgi apparatus membrane / Single-pass membrane protein |
| 調控 | 雄激素與 TGF-beta 會在蛋白質層級上調 PMEPA1。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GTCAGACCGTCTGCCTGCCTCCGACCGCGGTCTCGGAGCG40AAACCCGATCTCCTTGGACTTGAATGAGGAGGAGGAGGCG80GCGGCGGCGGCGGCGGCGGAGGCGCTCGGCTGGGGAAAGC120TAGCGGCAGAGGCTCAGCCCCGGCGGCAGCGCGCGCCCCG160CTGCCAGCCCATTTTCCGGACGCCACCCGCGGGCACTGCC200GACGCCCCCGGGGCTGCCGAGGGGAGGCCGGGGGGGCGCA240GCGGAGCGCGGTCCCGCGCACTGAGCCCCGCGGCGCCCCG280GGAACTTGGCGGCGACCCGAGCCCGGCGAGCCGGGGCGCG320CCTCCCCCGCCGCGCGCCTCCTGCATGCGGGGCCCCAGCT360CCGGGCGCCGGCCGGAGCCCCCCCCGGCCGCCCCCGAGCC400CCCCGCGCCCCGCGCCGCGCCGCCGCGCCGTCCATGCACC440GCTTGATGGGGGTCAACAGCACCGCCGCCGCCGCCGCCGG480GCAGCCCAATGTCTCCTGCACGTGCAACTGCAAACGCTCT520TTGTTCCAGAGCATGGAGATCACGGAGCTGGAGTTTGTTC560AGATCATCATCATCGTGGTGGTGATGATGGTGATGGTGGT600GGTGATCACGTGCCTGCTGAGCCACTACAAGCTGTCTGCA640CGGTCCTTCATCAGCCGGCACAGCCAGGGGCGGAGGAGAG680AAGATGCCCTGTCCTCAGAAGGATGCCTGTGGCCCTCGGA720GAGCACAGTGTCAGGCAACGGAATCCCAGAGCCGCAGGTC760TACGCCCCGCCTCGGCCCACCGACCGCCTGGCCGTGCCGC800CCTTCGCCCAGCGGGAGCGCTTCCACCGCTTCCAGCCCAC840CTATCCGTACCTGCAGCACGAGATCGACCTGCCACCCACC880ATCTCGCTGTCAGACGGGGAGGAGCCCCCACCCTACCAGG920GCCCCTGCACCCTCCAGCTTCGGGACCCCGAGCAGCAGCT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。