演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

PLEKHA2TAPP2

pleckstrin homology domain containing A2

PLEKHA2 是一種含有兩個 pleckstrin homology domain 的蛋白質,可專一性結合特定磷脂,並可能協助其他蛋白質移至細胞膜。

Homo sapiens8p11.22UniProt Q9HB19
OFFICIAL SYMBOL
PLEKHA2
CHROMOSOME
8
UNIPROT
Q9HB19
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

PLEKHA2(pleckstrin homology domain containing A2)是人類的蛋白質編碼基因,其產物為 425 個胺基酸的蛋白質。蛋白質序列含有兩個 pleckstrin homology domain,分別位於第 7–113 與第 198–298 個胺基酸;此外,序列註解指出其部分區域具有無序特性。這些結構特色構成辨識此蛋白質的基本特徵。現有資料將其描述為可與特定磷脂互動的蛋白質,並記載其與 MPDZ、PTPN13 結合;更具體的分子作用方式見功能與交互作用內容。

Official symbol
PLEKHA2
Gene name
pleckstrin homology domain containing A2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14336
UniProt
Q9HB19
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
TAPP2

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 88p11.22
chr8 · 145,138,636 bp · GRCh38chr8p23.3 · 1–2300000 · gnegchr8p23.2 · 2300001–6300000 · gpos75chr8p23.1 · 6300001–12800000 · gnegchr8p22 · 12800001–19200000 · gpos100chr8p21.3 · 19200001–23500000 · gnegchr8p21.2 · 23500001–27500000 · gpos50chr8p21.1 · 27500001–29000000 · gnegchr8p12 · 29000001–36700000 · gpos75chr8p11.23 · 36700001–38500000 · gnegchr8p11.22 · 38500001–39900000 · gpos25chr8p11.21 · 39900001–43200000 · gnegchr8p11.1 · 43200001–45200000 · acenchr8q11.1 · 45200001–47200000 · acenchr8q11.21 · 47200001–51300000 · gnegchr8q11.22 · 51300001–51700000 · gpos75chr8q11.23 · 51700001–54600000 · gnegchr8q12.1 · 54600001–60600000 · gpos50chr8q12.2 · 60600001–61300000 · gnegchr8q12.3 · 61300001–65100000 · gpos50chr8q13.1 · 65100001–67100000 · gnegchr8q13.2 · 67100001–69600000 · gpos50chr8q13.3 · 69600001–72000000 · gnegchr8q21.11 · 72000001–74600000 · gpos100chr8q21.12 · 74600001–74700000 · gnegchr8q21.13 · 74700001–83500000 · gpos75chr8q21.2 · 83500001–85900000 · gnegchr8q21.3 · 85900001–92300000 · gpos100chr8q22.1 · 92300001–97900000 · gnegchr8q22.2 · 97900001–100500000 · gpos25chr8q22.3 · 100500001–105100000 · gnegchr8q23.1 · 105100001–109500000 · gpos75chr8q23.2 · 109500001–111100000 · gnegchr8q23.3 · 111100001–116700000 · gpos100chr8q24.11 · 116700001–118300000 · gnegchr8q24.12 · 118300001–121500000 · gpos50chr8q24.13 · 121500001–126300000 · gnegchr8q24.21 · 126300001–130400000 · gpos50chr8q24.22 · 130400001–135400000 · gnegchr8q24.23 · 135400001–138900000 · gpos75chr8q24.3 · 138900001–145138636 · gnegPLEKHA2pq1 bp145,138,636 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr8:38,901,024–38,973,912
Gene span
72,889 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000617275 ★38,901,346–38,973,91212
ENST0000052174638,901,024–38,971,7799
ENST0000113649238,901,024–38,973,91212
ENST0000061692738,901,279–38,970,22711
ENST0000051964038,901,344–38,946,2216
ENST0000090301038,901,560–38,971,79712
ENST0000061683438,901,803–38,971,95610

顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

PLEKHA2 可專一性結合 phosphatidylinositol 3,4-diphosphate(PtdIns3,4P2);資料指出,這種結合具有選擇性,並不延伸至其他 phosphoinositides。這表示其磷脂辨識特性與 PtdIns3,4P2 相對特定,而非對多種磷脂皆有相同結合能力。

依相似性推定(By similarity),PLEKHA2 可能藉由辨識 PtdIns3,4P2,協助招募其他蛋白質至 plasma membrane。這項描述的語氣是可能參與招募,而非已確立其對所有相關蛋白質的作用;資料也未指出被招募的蛋白質種類、招募步驟或其後續效應。因此,較適合將其理解為一種與特定磷脂相關、可能影響蛋白質膜定位的功能。

這種磷脂選擇性結合與可能的膜招募作用,提供了 PLEKHA2 參與細胞膜相關調控的功能線索。不過,現有資料未進一步說明此作用涉及哪些生物過程,也未提供其在特定生理情境中的下游結果;因此不宜據此延伸推論更具體的機制或生物學效應。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 38901346 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>PLEKHA2 ENST00000617275 GRCh38 chr8:38900346-38901446 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TCCTCACCGTGAACCGGACTGGTACCCATAGGTTGCGGCGTGGATCAAATGAGATAGCGCAGGGGCGGGA
CCCGCGCACAGCAGCTCTCTTAGTTCCTCTTGGCGAGGTTTACGTAGTAACACATGCTTGTCTGTTTCCC
ATTTTTTCCCAGAGCACCCTCATGCTCTGGGGGCAGGAAGGGAGTCTTCGCATCACACCGAAAAAGTCCC
AACGGGCACGGTGTAGGCGCCTGTGGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGGGGCAGAAGGATCGCTGGACCCA
GGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCTATGACTGCGCCACCGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCCAGACCCTG
TCTTGATTAAAAAATAAAATAAAATAAAGAAATTAAAGTCCTTATAACCCTGGTTAGAGCGTTCCCGCCC
ACTGGTCTCTTAGGGCACATTTAGGACAACCTGAAGAAGCCACTCTTCTTGGGACCCTAACCCTTACCCC
AACTCCTCGGTCCCCAAAGGCTAAGGGCTCGGGATCCGAAGGAGGCCCAGCTGAGGTCGCTGGGTGGGGC
TCTGGGAGGAGGAAATGGGGTTCTTGAGGGAGCTCGCGCTCCAGCTCGCCTCCTCCTGCGAGGACGCCCC
CTGCCCGGACACCTGCTGCCCGAGCGAGCGTCGGGGCCGGGCCTCCCCGCGGGGCAGTCTCGGCGCGCAG
GTCCCACCTGCCAGGCGCGGAACGCGGGCGGCCTCGGGCGCAGCCTCCGGGCGCCCCGCCCCCGCCTCCC
CCGCGCGGCCCCGGCGCCCGGCCGCACCCCCTCCCAGCCCGCGGCGCCCCGGCACCCCTCTCCCTCCCCG
GCGGGCTCCGCGGAGCATTGTACTCACATCCGGGGCTGGGTTTTGCTTTAATGCGAAACGTAATTAACCC
GGAAAAAAGAGCCGAGGGACGGGAGAGAAGGAGGGGGCACTGGGGGAGACCAGAGCGAGGGGAGCGAGAG
GCGCGGAGAGTTTGGCAGGCAGACCCAGAAATCCCTGGAGCGCGGCGGACCCGGCGGCCGGAGGGGCGAC
CCCGCCCGATGTAACGCGCCCCGCCCGAGCCCCGGCCCCTGCACGGGGGGG
PLEKHA2 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR8_B9PFR · enhancer · 38899058–38899744 · regulatory

ENSR8_C5T83 · promoter · 38900745–38901813 · regulatory

ENSR8_5C63BK · CTCF_binding_site · 38901278–38901299 · regulatory

ENSR8_5C63DJ · CTCF_binding_site · 38901708–38901729 · regulatory

ENSR8_D3X54 · enhancer · 38901814–38904031 · regulatory

ENSR8_5C63HW · CTCF_binding_site · 38902432–38902453 · regulatory

ENSR8_B9PGK · enhancer · 38904377–38905166 · regulatory

ENSR8_835TTR · enhancer · 38905455–38905687 · regulatory

ENSR8_B9PGR · enhancer · 38906005–38906728 · regulatory

· motif · 38899449–38899471 · motif

· motif · 38899791–38899806 · motif

· motif · 38899796–38899808 · motif

· motif · 38899863–38899871 · motif

· motif · 38899958–38899973 · motif

· motif · 38900006–38900028 · motif

· motif · 38900006–38900028 · motif

· motif · 38900229–38900242 · motif

· motif · 38900229–38900242 · motif

· motif · 38900464–38900473 · motif

· motif · 38900464–38900473 · motif

· motif · 38900464–38900475 · motif

· motif · 38900536–38900558 · motif

· motif · 38900536–38900558 · motif

· motif · 38900823–38900836 · motif

· motif · 38900983–38900992 · motif

· motif · 38901048–38901057 · motif

· motif · 38901100–38901113 · motif

· motif · 38901109–38901122 · motif

· motif · 38901210–38901219 · motif

· motif · 38901251–38901262 · motif

· motif · 38901280–38901296 · motif

· motif · 38901494–38901507 · motif

· motif · 38901621–38901636 · motif

· motif · 38901710–38901726 · motif

· motif · 38901750–38901763 · motif

· motif · 38901764–38901775 · motif

· motif · 38901780–38901792 · motif

· motif · 38901798–38901808 · motif

· motif · 38901896–38901909 · motif

· motif · 38901896–38901909 · motif

· motif · 38901976–38901989 · motif

· motif · 38901976–38901989 · motif

· motif · 38902116–38902127 · motif

· motif · 38902434–38902450 · motif

· motif · 38903734–38903742 · motif

· motif · 38903751–38903766 · motif

· motif · 38903844–38903857 · motif

· motif · 38904921–38904933 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:425 aa

1 aa425 aa結構域功能區域
依 Q9HB19 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

PLEKHA2 蛋白質長 425 個胺基酸,含有兩個 pleckstrin homology domain:PH 1 位於第 7–113 個胺基酸,PH 2 位於第 198–298 個胺基酸。序列註解另將第 312–332 與第 352–425 個胺基酸區段標示為無序區域。

結構域PH 17–113 aa
結構域PH 2198–298 aa
功能區域Disordered312–332 aa
功能區域Disordered352–425 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9HB19…

AlphaFold · Q9HB19

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Cell membrane;Nucleus

PLEKHA2 記載於細胞質、細胞膜周邊及細胞核。 當處理條件會刺激 PtdIns3,4P2 生成時,PLEKHA2 會定位至 plasma membrane;此定位變化與該脂質生成受到刺激的條件相關。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 36 個夥伴 · 最多顯示 50 個
TAPP2PLEKHA2APBA1APBA2COG6DLG1DLG2DLG3DLG4EGLN3FHL5FRMPD2GIPC1GIPC2GIPC3GOLGA2GRID2IPGRIP1GRIP2HSF2BPIL16KANK2LNX1LNX2M1APMAGI1MAGI2MPDZNHERF4PATJPDZK1SNTA1SNTB1SNTG1TEPSINTJP1TRIM23WHRN
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 36 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

PLEKHA2 被記載會與 MPDZ 和 PTPN13 結合。現有資料支持的是結合關係,未提供這些蛋白質是否共同形成複合體,或其結合對功能造成何種影響的資訊。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能PLEKHA2 專一性結合 phosphatidylinositol 3,4-diphosphate(PtdIns3,4P2),而不結合其他 phosphoinositides。依相似性推定,它可能協助招募其他蛋白質至 plasma membrane;此招募作用仍屬推定。推論支持
證據與來源

Binds specifically to phosphatidylinositol 3,4-diphosphate (PtdIns3,4P2), but not to other phosphoinositides. May recruit other proteins to the plasma membrane (By similarity)

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用PLEKHA2 被記載會與 MPDZ 及 PTPN13 結合;此敘述指出蛋白質結合關係,未提供複合體組成或功能後果。推論支持
證據與來源

Binds MPDZ and PTPN13

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位PLEKHA2 記載位於細胞質、細胞膜周邊及細胞核。經由會刺激 PtdIns3,4P2 生成的處理後,PLEKHA2 會定位至 plasma membrane,顯示其膜定位與該脂質生成受到刺激的條件相關。推論支持
證據與來源

Cytoplasm; Cell membrane / Peripheral membrane protein; Nucleus; Locates to the plasma membrane after treatments that stimulate the production of PtdIns3,4P2

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000617275 · 5,530 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1AGACCCAGAAATCCCTGGAGCGCGGCGGACCCGGCGGCCG40
41GAGGGGCGACCCCGCCCGATGTAACGCGCCCCGCCCGAGC80
81CCCGGCCCCTGCACGGGGGGGGTGATGTGAGCAGAGCCCA120
121GGAATGCCTTATGTGGATCGGCAGAACCGAATCTGTGGGT160
161TTCTGGACATCGAGGAGCATGAGAACAGCGGCAAGTTTCT200
201GCGGAGGTACTTCATTCTGGACACCCAGGCTAACTGCCTC240
241CTCTGGTATATGGACAACCCCCAGAATCTGGCAATGGGGG280
281CAGGAGCTGTTGGAGCTTTGCAGCTGACCTACATCTCGAA320
321GGTGAGCATAGCTACCCCAAAACAGAAACCAAAAACTCCA360
361TTTTGCTTTGTTATCAATGCCCTGTCTCAGAGATATTTCC400
401TTCAAGCCAATGATCAGAAAGATATGAAGGACTGGGTTGA440
441AGCCCTGAACCAAGCCAGCAAGATCACCGTTCCCAAAGGT480
481GGGGGCCTACCCATGACCACTGAAGTTCTCAAGAGCTTAG520
521CAGCTCCTCCAGCCCTGGAGAAGAAGCCACAGGTGGCCTA560
561CAAGACGGAGATCATTGGAGGGGTGGTGGTCCACACACCC600
601ATCAGCCAGAACGGTGGGGATGGGCAGGAAGGGAGTGAGC640
641CCGGGTCCCACACCATCCTTCGAAGGTCTCAGAGTTACAT680
681CCCCACGTCAGGCTGCCGTGCTTCCACTGGGCCTCCCCTC720
721ATTAAGAGTGGTTACTGCGTGAAGCAAGGGAATGTGCGGA760
761AGAGCTGGAAACGTCGCTTCTTTGCACTTGATGACTTTAC800
801CATCTGCTACTTCAAGTGTGAGCAGGACCGAGAACCACTG840
841CGCACCATATTTCTTAAGGATGTTCTGAAGACCCATGAAT880
881GTCTGGTCAAGTCTGGTGATCTCTTAATGAGGGACAACCT920
921GTTTGAAATAATAACAAGCTCCAGGACCTTCTACGTACAG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。