演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

PLEKHA1TAPP1

pleckstrin homology domain containing A1

PLEKHA1 編碼 pleckstrin homology domain containing A1,具有辨識特定磷脂的能力,並可能協助其他蛋白質移至細胞膜。

Homo sapiens10q26.13UniProt Q9HB21
OFFICIAL SYMBOL
PLEKHA1
CHROMOSOME
10
UNIPROT
Q9HB21
PDB / ALPHAFOLD
1EAZ
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

PLEKHA1 是人類的蛋白質編碼基因,正式名稱為 pleckstrin homology domain containing A1。其蛋白質含有兩個 pleckstrin homology(PH)結構域,具備辨識特定磷脂的能力;來源指出,這項特性可能與協助其他蛋白質移至細胞膜有關。

Official symbol
PLEKHA1
Gene name
pleckstrin homology domain containing A1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14335
UniProt
Q9HB21
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
TAPP1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1010q26.13
chr10 · 133,797,422 bp · GRCh38chr10p15.3 · 1–3000000 · gnegchr10p15.2 · 3000001–3800000 · gpos25chr10p15.1 · 3800001–6600000 · gnegchr10p14 · 6600001–12200000 · gpos75chr10p13 · 12200001–17300000 · gnegchr10p12.33 · 17300001–18300000 · gpos75chr10p12.32 · 18300001–18400000 · gnegchr10p12.31 · 18400001–22300000 · gpos75chr10p12.2 · 22300001–24300000 · gnegchr10p12.1 · 24300001–29300000 · gpos50chr10p11.23 · 29300001–31100000 · gnegchr10p11.22 · 31100001–34200000 · gpos25chr10p11.21 · 34200001–38000000 · gnegchr10p11.1 · 38000001–39800000 · acenchr10q11.1 · 39800001–41600000 · acenchr10q11.21 · 41600001–45500000 · gnegchr10q11.22 · 45500001–48600000 · gpos25chr10q11.23 · 48600001–51100000 · gnegchr10q21.1 · 51100001–59400000 · gpos100chr10q21.2 · 59400001–62800000 · gnegchr10q21.3 · 62800001–68800000 · gpos100chr10q22.1 · 68800001–73100000 · gnegchr10q22.2 · 73100001–75900000 · gpos50chr10q22.3 · 75900001–80300000 · gnegchr10q23.1 · 80300001–86100000 · gpos100chr10q23.2 · 86100001–87700000 · gnegchr10q23.31 · 87700001–91100000 · gpos75chr10q23.32 · 91100001–92300000 · gnegchr10q23.33 · 92300001–95300000 · gpos50chr10q24.1 · 95300001–97500000 · gnegchr10q24.2 · 97500001–100100000 · gpos50chr10q24.31 · 100100001–101200000 · gnegchr10q24.32 · 101200001–103100000 · gpos25chr10q24.33 · 103100001–104000000 · gnegchr10q25.1 · 104000001–110100000 · gpos100chr10q25.2 · 110100001–113100000 · gnegchr10q25.3 · 113100001–117300000 · gpos75chr10q26.11 · 117300001–119900000 · gnegchr10q26.12 · 119900001–121400000 · gpos50chr10q26.13 · 121400001–125700000 · gnegchr10q26.2 · 125700001–128800000 · gpos50chr10q26.3 · 128800001–133797422 · gnegPLEKHA1pq1 bp133,797,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr10:122,374,222–122,434,367
Gene span
60,146 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000368990 ★122,374,708–122,432,34512
ENST00000878213122,374,222–122,434,36712
ENST00000878215122,374,222–122,434,36714
ENST00000878216122,374,222–122,434,36714
ENST00000878219122,374,222–122,434,36711
ENST00000878220122,374,222–122,434,36715
ENST00000878221122,374,222–122,434,36714
ENST00000919448122,374,222–122,434,3675
ENST00000919449122,374,222–122,434,36711
ENST00000919450122,374,222–122,434,36713
ENST00000949908122,374,222–122,434,36713
ENST00000949910122,374,222–122,434,36713

顯示 12/55 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

PLEKHA1 蛋白可特異性結合磷脂醯肌醇 3,4-二磷酸(PtdIns3,4P2)。來源指出,這種結合具有選擇性:PLEKHA1 不會結合其他磷脂醯肌醇類分子。

PLEKHA1 可能藉由辨識 PtdIns3,4P2,協助招募其他蛋白質至細胞膜。此作用的描述帶有可能性,來源未進一步說明被招募的蛋白質種類或其後續作用,因此不宜延伸推論其參與的具體細胞過程。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 122374708 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>PLEKHA1 ENST00000368990 GRCh38 chr10:122373708-122374808 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GGAGAGGAAAGGAAGAAGCACACAAAAAGAACAAATATTTATTAAGAGCCTAGAGTGGCATGCGCTGTGA
AAGGCGTGGCATGTAATTCTTTCCCAGTTCTTTGCCTGTCTGAATATTTCTCATTCTTCAGGTTTCAGCT
CAGATATCACATCCTCAGAGAACTTGCCTTGCCACTCTCTCTGAAGAGCCTCCCCCCGTCCCCGCCACCG
CTACTGTCTCTTGAACTTTCTCAGTCTGGCCATTCTATTAAAATCTGGAACGATTTTGCTAGTTTGCGGA
CGAGTTTCCCCCAAGCTGCAGGCTCCATAAGGGCAGTGACAGTGTCTCTTTCTCAGATGAATGCCGGGTT
GCCTATCGCGTACTTGGCACACAGTTAAGTGCTCGAGAAATTGCTAAACACTCAACGAATATTTACCAGA
ATACATATTTATGCTCCACCGTTGCTGAAAGAATTTCGACTAACCCTTCTTTAAGTCTCTCTTACCCTCC
TGTACTATTAACACCATTGTAAGTAGGCAGTGGAGCTACATTTGCAGGGAGAGAGAAGAGCGAAAAATTG
GCGCGCAGAGCTGTAAAGCGTTTTTCTCCAGGTCACACCGCAGCCTGTAAATTTGTGACACTTGGACCGA
TTATGGGACAGCTTGCAAACAAATTATCTGCAAACTAACGAAGCCTATTTTTAAAGATCCCTGTTCCTCG
CAGCTCTAGGCGATGACATCAGAGAACCCGGAGTTCTACCTCCGAGCCAAGCCCAGTGGTGGTCAAAAAC
TACGAATACCAGGAAGCACCGCGGCGCGGCGGCCCAGAGCTCCGCGCGCAGGCCTCCCCGGCGCGCCGAG
GCCGCCGCCGCTGGAACCAGGAAGACGCCAGAAACTCGGCCCGCCACGCCGCAGGGACCCGCGCGGGGCC
TGCCGGGACTCGTAGTCTCTGCGGGCTGGGAGCGCCCGCTCCGGAATCTCAGCCGCCGTCTGAGGGCTGA
GGCAGCGTGGGGACGCGTGCGCAGTGCGCGGGCTGGCCGTCGCGGACGCCGCTCCGGGCAGCCGAGCCTC
TGTGGGAGCCGGGGCCGCGGCGGCGCGGGTGCTCCGGGCCGAGGCCGCGGT
PLEKHA1 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
PLEKHA1_2 ↗10:122,374,529正股122,374,480–122,374,539
PLEKHA1_1 ↗10:122,374,708正股122,374,659–122,374,718

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR10_BW9PM · promoter · 122374218–122374770 · regulatory

ENSR10_CG5TD · enhancer · 122374771–122376053 · regulatory

ENSR10_533R6CB · CTCF_binding_site · 122374861–122374882 · regulatory

ENSR10_533R6D8 · CTCF_binding_site · 122375055–122375076 · regulatory

ENSR10_533R6KR · CTCF_binding_site · 122376261–122376282 · regulatory

· motif · 122373291–122373305 · motif

· motif · 122374418–122374431 · motif

· motif · 122374484–122374495 · motif

· motif · 122374562–122374573 · motif

· motif · 122374627–122374644 · motif

· motif · 122374699–122374710 · motif

· motif · 122374699–122374710 · motif

· motif · 122374863–122374879 · motif

· motif · 122374991–122375007 · motif

· motif · 122374991–122375007 · motif

· motif · 122375057–122375073 · motif

· motif · 122375455–122375467 · motif

· motif · 122375522–122375530 · motif

· motif · 122375548–122375563 · motif

· motif · 122375555–122375563 · motif

· motif · 122375578–122375590 · motif

· motif · 122375581–122375588 · motif

· motif · 122375887–122375900 · motif

· motif · 122375887–122375900 · motif

· motif · 122376263–122376279 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:404 aa

1 aa404 aa結構域功能區域
依 Q9HB21 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

PLEKHA1 蛋白長 404 個胺基酸,含有兩個 PH 結構域:第一個位於第 7–112 位,第二個位於第 191–289 位。序列註解另標示第 291–332 位及第 355–404 位為無序區域。

結構域PH 17–112 aa
結構域PH 2191–289 aa
功能區域Disordered291–332 aa
功能區域Disordered355–404 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 1EAZ…

PDB · 1EAZ

X-ray · 1.40 A · A=181-303

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Cell membrane;Nucleus

PLEKHA1 可位於細胞質、細胞膜周邊及細胞核。 當處理條件促使 PtdIns3,4P2 生成時,PLEKHA1 會移至質膜;此定位變化與該磷脂的生成條件相關。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 22 個夥伴 · 最多顯示 50 個
TAPP1PLEKHA1APBA2DLG1DLG2DLG3DLG4FRMPD2GRID2IPGRIP1GRIP2IL16LNX1LNX2MAGI1MAGI2MPDZNHERF4PATJPDZK1SCRIBSH3BP4TJP1WHRN
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 22 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

PLEKHA1 與 MPDZ 及 PTPN13 有交互作用。來源未說明這些關係是否構成特定複合體,也未提供其交互作用對功能的影響。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能PLEKHA1 特異性結合磷脂醯肌醇 3,4-二磷酸(PtdIns3,4P2),但不結合其他磷脂醯肌醇類分子;它也可能協助招募其他蛋白質至細胞膜。含實驗來源
證據與來源

Binds specifically to phosphatidylinositol 3,4-diphosphate (PtdIns3,4P2), but not to other phosphoinositides. May recruit other proteins to the plasma membrane

PMID 11001876 ↗ · PMID 11513726 ↗ · PMID 14516276 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用PLEKHA1 與 MPDZ 及 PTPN13 有交互作用;此項資訊未進一步說明交互作用的條件、形式或功能後果。含實驗來源
證據與來源

Interacts with MPDZ and PTPN13

PMID 11802782 ↗ · PMID 14516276 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位PLEKHA1 可見於細胞質、細胞膜周邊及細胞核;在促使 PtdIns3,4P2 生成的處理條件下,PLEKHA1 會定位至質膜。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm; Cell membrane / Peripheral membrane protein; Nucleus; Locates to the plasma membrane after treatments that stimulate the production of PtdIns3,4P2

PMID 11802782 ↗ · PMID 12101241 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000368990 · 3,741 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1GCAGTGCGCGGGCTGGCCGTCGCGGACGCCGCTCCGGGCA40
41GCCGAGCCTCTGTGGGAGCCGGGGCCGCGGCGGCGCGGGT80
81GCTCCGGGCCGAGGCCGCGTGTAATGTTCAAGCTCAGAAA120
121TGCCTTATGTGGATCGTCAGAATCGCATTTGTGGTTTTCT160
161AGACATTGAAGAAAATGAAAACAGTGGGAAATTTCTTCGA200
201AGGTACTTCATACTGGATACCAGAGAAGATAGTTTCGTGT240
241GGTACATGGATAATCCACAGAACCTACCTTCTGGATCATC280
281ACGTGTTGGAGCCATTAAGCTTACCTACATTTCAAAGGTT320
321AGCGATGCTACTAAGCTAAGGCCAAAGGCGGAGTTCTGTT360
361TTGTTATGAATGCAGGAATGAGGAAGTACTTCCTACAAGC400
401CAATGATCAGCAGGACCTAGTGGAATGGGTAAATGTGTTA440
441AACAAAGCTATAAAAATTACAGTACCAAAGCAGTCAGACT480
481CACAGCCTAATTCTGATAACCTAAGTCGCCATGGTGAATG520
521TGGGAAAAAGCAAGTGTCTTACAGAACTGATATTGTTGGT560
561GGCGTACCCATCATTACTCCCACTCAGAAAGAAGAAGTAA600
601ATGAATGTGGTGAAAGTATTGACAGAAATAATCTGAAACG640
641GTCACAAAGCCATCTTCCTTACTTTACTCCTAAACCACCT680
681CAAGATAGTGCGGTTATCAAAGCTGGATATTGTGTAAAAC720
721AAGGAGCAGTGATGAAAAACTGGAAGAGAAGATATTTTCA760
761ATTGGATGAAAACACAATAGGCTACTTCAAATCTGAACTG800
801GAAAAGGAACCTCTTCGTGTAATACCACTTAAAGAGGTTC840
841ATAAAGTCCAGGAATGTAAGCAAAGCGACATAATGATGAG880
881GGACAACCTCTTTGAAATTGTAACAACGTCTCGAACTTTC920
921TATGTGCAGGCTGATAGCCCTGAAGAGATGCACAGTTGGA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。