基因總覽
PLA2G2E 的正式名稱為 phospholipase A2 group IIE,屬於蛋白質編碼基因,其產物為 phospholipase A2 家族成員。這是一種分泌型、依賴鈣離子的磷脂酶,主要作用對象是細胞外磷脂。其分子作用涉及磷脂脂肪酸鏈的水解,並可釋出多種不飽和脂肪酸及溶血磷脂。這些特性使 PLA2G2E 與細胞膜脂質重塑及脂質介質生成相關;其在皮膚與毛囊中的功能也與脂質調節有關。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000375116 ★ | 19,920,009–19,923,617 | 4 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
PLA2G2E 可水解磷脂 sn-2 位置脂肪酸鏈的酯鍵,產生脂肪酸與溶血磷脂。它能作用於含磷脂醯乙醇胺及磷脂醯膽鹼的底物,釋出油酸、亞麻油酸、花生四烯酸與二十二碳六烯酸等不飽和脂肪酸;相較於溶血磷脂醯膽鹼,它較偏好釋出溶血磷脂醯乙醇胺。此酵素亦可處理磷脂醯甘油,反映其底物涵蓋不同種類的膜磷脂。
Promoter 與基因調控
>PLA2G2E ENST00000375116 GRCh38 chr1:19923517-19924617 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GGTGGGATGGTACTGGTTTTTCTCCTACTTTTATAAGAAAGTAACACATTCTGTTGGGGTTAAAAGTAGT ATGGCTGCTAGGCACCACCTCCACTTCGTGCTGGATGAGTTGGCCCAGGTGAAGCCCTTTATGTTGCCTG GGTTTAAATTCTAGCTCATCACTTATGCATGTGCCTCAGTTTCCCTCCTCTGTAAGATGGGGATGACTGC AGCACCCACGTGATGGGGCTGTGGTCCTGCTTGAAAGGGGCTTGGCACAGCGCCTGGTGCATAGCAAGTA CTTGGTGAGGGCTGGCTGCCTGGTTGCGTGTGAGTTTTCCATCCTCCTGTGCGGGAGGCAAGAGGGACAC CTTCTATCCTCATAATACAGGCAGGAAAACTGAGGTTCCAAGCAAGGGAAAGGACCTGCCCACGGCCGCC TAATACGCAGTGGAACCAGGACTCCAAGGCCACAGACCCAGCGACTCCCAGGCCCTGAACGGTGACGGAG GTGCAGGGTCAGTGATCCCAGTCACAGACCAGAGCAGGAGGGTCGGGGAGGGGAAGCGCCAGGCCAGGCC AGGGCCTCCTGCCTCCGGTTCTGCCCGGGTGGAAACTCTGAAACAGGACGGACTTGGCCCTGGGCACCTC CAGGCTGTGAGAACTGAGGTTTTTCAGTCTCTCTGAGTCTCAGTCAAGTGGAGATGAGGAAAAGATACCA AGAATGACAAGCACCTGGCACAGCCCGCGCCTCACAGCGTGGTCAATGGATGATTTTTTGGAAAGGGTGG GTGATGGGAAGGGTGTGAGTAGAAAGAGCCACGAGATTGCCCGCCATCCCCCACACTGCCTGGAAGCAGA GCCCACAGGCCCCAGCTGGCCCCTCCCCGGGGACTTGGCCAAAGTGTCAGACCTGGAAGAATCGTTGCAT CACTGGGCACTCACGGGTTAATGACAGGGAGTGGACAGGACCTGGGTATTTAACTAATTAGGAGGCTCCC TGAGATCAGAGGTGGCCCTGCTGCTTTCTTCTGCTGCCTTTTATGCTCCTTGTGCACCTCCCTTCCCCCC AACCTGGGATGAAATCTCCCCACGTGCTGGTGTTCCTTTGCCTCCTGGGTA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR1_99WGK · enhancer · 19918767–19919163 · regulatory
ENSR1_B5XQQ · enhancer · 19925270–19925792 · regulatory
ENSR1_99WJT · enhancer · 19926654–19926948 · regulatory
發炎細胞激素 IL1B 可上調 PLA2G2E。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:142 aa
PLA2G2E 蛋白質長 142 個胺基酸,屬於 phospholipase A2 家族。其序列註解包含位於第 1 至 19 個胺基酸的訊號肽區段。
蛋白質三維結構
細胞內定位
PLA2G2E 可分泌至細胞外,也可見於細胞質。 它與 heparan sulfate proteoglycan 結合後,可能定位於富含陰離子磷脂的細胞質區室;此定位描述帶有可能性。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- MALLQ13021 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 15 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | PLA2G2E 是分泌型、依賴鈣離子的磷脂酶,主要作用於細胞外磷脂,切割 sn-2 脂肪酸鏈並釋出多種不飽和脂肪酸,且偏好生成溶血磷脂醯乙醇胺。它也與膜脂質重塑、病原體清除相關脂質介質生成及毛囊穩態有關;高脂飲食、皮膚調節與過敏反應等部分作用標示為相似性推論或可能性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Secretory calcium-dependent phospholipase A2 that primarily targets extracellular phospholipids. Hydrolyzes the ester bond of the fatty acyl group attached at sn-2 position of phospholipids (phospholipase A2 activity), releasing various unsaturated fatty acids including oleoate, linoleoate, arachidonate, docosahexaenoate and lysophosphatidylethanolamines in preference to lysophosphatidylcholines. In response to high-fat diet, hydrolyzes minor lipoprotein phospholipids including phosphatidylserines, phosphatidylinositols and phosphatidylglycerols, altering lipoprotein composition and fat storage in adipose tissue and liver (By similarity). May act in an autocrine and paracrine manner. Contributes to lipid remodeling of cellular membranes and generation of lipid mediators involved in pathogen clearance. Cleaves sn-2 fatty acyl chains of phosphatidylglycerols and phosphatidylethanolamines, which are major components of membrane phospholipids in bacteria. Acts as a hair follicle phospholipase A2. Selectively releases lysophosphatidylethanolamines (LPE) and various unsaturated fatty acids in skin to regulate hair follicle homeostasis (By similarity). May regulate the inflammatory response by releasing arachidonate, a precursor of prostaglandins and leukotrienes. Upon allergen exposure, may participate in allergic inflammatory response by enhancing leukotriene C4 synthesis and degranulation in mast cells (By similarity) PMID 10681567 ↗ · PMID 11922621 ↗ · PMID 28883454 ↗ |
| 分子活性 | a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine + H2O = a 1-acyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine + a fatty acid + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine + H2O = a 1-acyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine + a fatty acid + H(+) PMID 10681567 ↗ |
| 分子活性 | 1-hexadecanoyl-2-(9Z-octadecenoyl)-sn-glycero-3-phosphoethanolamine + H2O = 1-hexadecanoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine + (9Z)-octadecenoate + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源1-hexadecanoyl-2-(9Z-octadecenoyl)-sn-glycero-3-phosphoethanolamine + H2O = 1-hexadecanoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine + (9Z)-octadecenoate + H(+) PMID 10681567 ↗ |
| 分子活性 | 1-hexadecanoyl-2-(9Z,12Z-octadecadienoyl)-sn-glycero-3-phosphoethanolamine + H2O = 1-hexadecanoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine + (9Z,12Z)-octadecadienoate + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源1-hexadecanoyl-2-(9Z,12Z-octadecadienoyl)-sn-glycero-3-phosphoethanolamine + H2O = 1-hexadecanoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine + (9Z,12Z)-octadecadienoate + H(+) PMID 10681567 ↗ |
| 分子活性 | 1-hexadecanoyl-2-(5Z,8Z,11Z,14Z-eicosatetraenoyl)-sn-glycero-3-phosphoethanolamine + H2O = 1-hexadecanoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine + (5Z,8Z,11Z,14Z)-eicosatetraenoate + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源1-hexadecanoyl-2-(5Z,8Z,11Z,14Z-eicosatetraenoyl)-sn-glycero-3-phosphoethanolamine + H2O = 1-hexadecanoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine + (5Z,8Z,11Z,14Z)-eicosatetraenoate + H(+) PMID 10681567 ↗ · PMID 11922621 ↗ |
| 分子活性 | 1,2-dihexadecanoyl-sn-glycero-3-phospho-(1'-sn-glycerol) + H2O = 1-hexadecanoyl-sn-glycero-3-phospho-(1'-sn-glycerol) + hexadecanoate + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源1,2-dihexadecanoyl-sn-glycero-3-phospho-(1'-sn-glycerol) + H2O = 1-hexadecanoyl-sn-glycero-3-phospho-(1'-sn-glycerol) + hexadecanoate + H(+) PMID 10681567 ↗ |
| 分子活性 | 1-hexadecanoyl-2-(9Z-octadecenoyl)-sn-glycero-3-phosphoglycerol + H2O = 1-hexadecanoyl-sn-glycero-3-phosphoglycerol + (9Z)-octadecenoate + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源1-hexadecanoyl-2-(9Z-octadecenoyl)-sn-glycero-3-phosphoglycerol + H2O = 1-hexadecanoyl-sn-glycero-3-phosphoglycerol + (9Z)-octadecenoate + H(+) PMID 10681567 ↗ |
| 分子活性 | a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphocholine + H2O = a 1-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine + a fatty acid + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphocholine + H2O = a 1-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine + a fatty acid + H(+) PMID 10681567 ↗ · PMID 28883454 ↗ |
| 分子活性 | 1,2-dihexadecanoyl-sn-glycero-3-phosphocholine + H2O = 1-hexadecanoyl-sn-glycero-3-phosphocholine + hexadecanoate + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源1,2-dihexadecanoyl-sn-glycero-3-phosphocholine + H2O = 1-hexadecanoyl-sn-glycero-3-phosphocholine + hexadecanoate + H(+) PMID 10681567 ↗ |
| 分子活性 | 1-hexadecanoyl-2-(9Z-octadecenoyl)-sn-glycero-3-phosphocholine + H2O = 1-hexadecanoyl-sn-glycero-3-phosphocholine + (9Z)-octadecenoate + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源1-hexadecanoyl-2-(9Z-octadecenoyl)-sn-glycero-3-phosphocholine + H2O = 1-hexadecanoyl-sn-glycero-3-phosphocholine + (9Z)-octadecenoate + H(+) PMID 10681567 ↗ |
| 分子活性 | 1-hexadecanoyl-2-(9Z,12Z-octadecadienoyl)-sn-glycero-3-phosphocholine + H2O = (9Z,12Z)-octadecadienoate + 1-hexadecanoyl-sn-glycero-3-phosphocholine + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源1-hexadecanoyl-2-(9Z,12Z-octadecadienoyl)-sn-glycero-3-phosphocholine + H2O = (9Z,12Z)-octadecadienoate + 1-hexadecanoyl-sn-glycero-3-phosphocholine + H(+) PMID 10681567 ↗ |
| 分子活性 | 1-hexadecanoyl-2-(4Z,7Z,10Z,13Z,16Z,19Z-docosahexaenoyl)-sn-glycero-3-phosphocholine + H2O = (4Z,7Z,10Z,13Z,16Z,19Z)-docosahexaenoate + 1-hexadecanoyl-sn-glycero-3-phosphocholine + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源1-hexadecanoyl-2-(4Z,7Z,10Z,13Z,16Z,19Z-docosahexaenoyl)-sn-glycero-3-phosphocholine + H2O = (4Z,7Z,10Z,13Z,16Z,19Z)-docosahexaenoate + 1-hexadecanoyl-sn-glycero-3-phosphocholine + H(+) PMID 10681567 ↗ |
| 分子活性 | 每個 PLA2G2E 次單元可結合兩個 Ca²⁺。其中一個離子結合於保守的 GCXCG 位點;另一個位於可變動的結合位點,可能作為補充親電體,也可能提供備援作用。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Binds 2 Ca(2+) ions per subunit. One ion binds at a conserved binding site (GCXCG), whereas the second ion binds at a flexible site and may act as a supplemental electrophile as well as a backup. |
| 細胞定位 | PLA2G2E 可分泌至細胞外,也有細胞質定位。透過與 heparan sulfate proteoglycan 結合,它可能進一步定位於富含陰離子磷脂的細胞質區室;此區室定位屬於可能性描述。 | 含實驗來源 | 證據與來源Secreted; Cytoplasm; Through binding to heparan sulfate proteoglycan, may be localized to cytoplasmic compartments enriched in anionic phospholipids PMID 10681567 ↗ · PMID 11922621 ↗ |
| 調控 | 發炎細胞激素 IL1B 可上調 PLA2G2E 的表現。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CTGCTTTCTTCTGCTGCCTTTTATGCTCCTTGTGCACCTC40CCTTCCCCCCAACCTGGGATGAAATCTCCCCACGTGCTGG80TGTTCCTTTGCCTCCTGGTGGCTCTGGTCACCGGGAACCT120GGTTCAGTTTGGGGTGATGATCGAGAAGATGACAGGCAAG160TCCGCCCTGCAGTACAACGACTATGGCTGTTACTGCGGCA200TCGGTGGCTCCCACTGGCCGGTGGACCAGACTGACTGGTG240CTGCCACGCCCACGACTGCTGCTACGGGCGTCTGGAGAAG280CTGGGCTGTGAGCCCAAACTGGAAAAGTATCTTTTCTCTG320TCAGCGAACGTGGCATTTTCTGCGCCGGCAGGACCACCTG360CCAGCGGCTGACCTGCGAGTGTGACAAGAGGGCTGCCCTC400TGCTTTCGCCGCAACCTGGGCACCTACAACCGCAAATATG440CCCATTATCCCAACAAGCTGTGCACCGGGCCCACCCCGCC480CTGCTGAGGCTATGCTCGGCCTCCCCCCCGTCCCTGGAGG520TCCCGCCTCGGGCTGCTGTAGTCCCAGGCCTGGGGAACAT560TGGCACCAAAGGCCCTCCCTTTGGAAAATTCCTTTCCTGC600AAACTCATCCCTCCTTGAGAGCTCAGAGATATGTCCTGGA640CCATCACTAGCCTCCCAGGCTACCCCTTCTCTGTAGAAAG680AACCCTGCCCCAGGAGCCATGGACCCTTCAGCACCCAGAA720GACTGTCACTAGCTTCTGGGATCTCAGCTCCCTCTTCTGA760ATAAGTGAATAATGTTTTCCCATAA785cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。