演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

PIGQhGPI1

phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class Q

PIGQ 編碼 GPI-GnT 複合體的組成蛋白,參與 GPI 生合成的第一步。

Homo sapiens16p13.3UniProt Q9BRB3
OFFICIAL SYMBOL
PIGQ
CHROMOSOME
16
UNIPROT
Q9BRB3
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

PIGQ 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class Q。其產物屬於 PIGQ family,並是 glycosylphosphatidylinositol-N-acetylglucosaminyltransferase(GPI-GnT)複合體的組成部分。這項基本定位將 PIGQ 與 GPI 生合成的起始階段連結;其具體分子作用見功能說明。

Official symbol
PIGQ
Gene name
phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class Q
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14135
UniProt
Q9BRB3
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
hGPI1GPI1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1616p13.3
chr16 · 90,338,345 bp · GRCh38chr16p13.3 · 1–7800000 · gnegchr16p13.2 · 7800001–10400000 · gpos50chr16p13.13 · 10400001–12500000 · gnegchr16p13.12 · 12500001–14700000 · gpos50chr16p13.11 · 14700001–16700000 · gnegchr16p12.3 · 16700001–21200000 · gpos50chr16p12.2 · 21200001–24200000 · gnegchr16p12.1 · 24200001–28500000 · gpos50chr16p11.2 · 28500001–35300000 · gnegchr16p11.1 · 35300001–36800000 · acenchr16q11.1 · 36800001–38400000 · acenchr16q11.2 · 38400001–47000000 · gvarchr16q12.1 · 47000001–52600000 · gnegchr16q12.2 · 52600001–56000000 · gpos50chr16q13 · 56000001–57300000 · gnegchr16q21 · 57300001–66600000 · gpos100chr16q22.1 · 66600001–70800000 · gnegchr16q22.2 · 70800001–72800000 · gpos50chr16q22.3 · 72800001–74100000 · gnegchr16q23.1 · 74100001–79200000 · gpos75chr16q23.2 · 79200001–81600000 · gnegchr16q23.3 · 81600001–84100000 · gpos50chr16q24.1 · 84100001–87000000 · gnegchr16q24.2 · 87000001–88700000 · gpos25chr16q24.3 · 88700001–90338345 · gnegPIGQpq1 bp90,338,345 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr16:566,995–584,121
Gene span
17,127 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000321878 ★569,968–584,10911
ENST00000293874566,995–574,5193
ENST00000409527567,009–583,03512
ENST00000854221569,651–584,12011
ENST00000968575569,651–584,12011
ENST00000989018569,651–584,12010
ENST00000989021569,651–577,5964
ENST00000422307569,930–577,2344
ENST00000026218569,930–584,12010
ENST00000470411569,930–577,2173
ENST00000854222569,930–584,12012
ENST00000854223569,930–584,12010

顯示 12/30 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

PIGQ 參與 glycosylphosphatidylinositol(GPI)生合成,並與 glycolipid 生合成相關。它是 GPI-GnT 複合體的一部分;此複合體催化 N-acetylglucosamine 從 UDP-N-acetylglucosamine 轉移至 phosphatidylinositol,這項反應構成 GPI 生合成的第一步。

因此,PIGQ 的功能與 GPI 合成起始反應密切相關:複合體執行糖基轉移,而 PIGQ 作為其組成蛋白參與此過程。來源未進一步說明 PIGQ 單獨的催化活性或其在該反應中的具體分子機制;可支持的結論是它參與 GPI-GnT 複合體所執行的起始步驟。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 569968 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>PIGQ ENST00000321878 GRCh38 chr16:568968-570068 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGCTTCTCTGGGCCTGGCAGAGGTAAGGGGGAGGCAACCCTGGAGTGTCTGGAGGCCCATGGCTGGCTGA
ACCCTGGATGCCTTTTCTTCCGCGTCCCCATGAATGAAAGCTGTCTGGGCCTTCATTCTGCAGACAGGGA
CAAACAGCTCCATGCTGTTTGTCCTCCCAGTGCAGCCGTGCTGGGAGGGTCTGGGGGAGCTTCCTACAAG
GAGAGACTCCTGCTGCTTTGGAAAACTGAGAAAAAATAGGGGTCTAACCCTCTCCTCCCATTTTACAAGT
GGGGAAATGAGGCGTGAAAGGAGAGGCGTCTGGGTTACTCCGTGGGTCTGGGGTCCAGGGAAGGGCCTGT
ATGGGGGAGGGAGCTGGGAGGGGACGGTGTCTGGCTCTACCCCTGTGGGGTGGGGAGGTGGGGCTCCCCT
GTATCACAGGACATCCCCCCTGAGAGGTCCCTCATATGTCTGGGTCCTGTGGGTGGGGGACTAACTGCGC
AATGTAGTTAGGTGCTCAATAAACGGAGTTGCCGCTGAGGTCTGGGCTGGGGTCTTGTTCCTGGGATCGG
GAGGGGCTGGACGCCTGTGTGTTCTCTCCTGACGATCGCTGGCGGCAGCCTCTGGGCTGGTCCTACCAGG
GCTCAAAATTCCCGGCACCACTGGCCTTGGGGATCTGGGGGCGGCCCCTCTGCAGACAACAGAGTGACGG
GGGCGGGACCGGGCTGGGGCTGGGGCCTTCCTGGAATCCCGCAGGGCCTGGGGACCTGTTCACTTGGGGA
GGCTGGGAGCCAGGCGGGGTCCGGGTTCCACGAAGGCCAGGTCCAGTCAGTTTCTCAGGTGAGGAAACCG
AGCTGACGCGGGGCTGGCGGCCCGGAGGCAGGCTCGGGAGGTCCGGGCCTGGGGACTGGGCGGGCACGCT
GCGCCGCGGAACGCTCGGGTCGGGCGGGCGGGCGGGCAGCCCGGGCGCCTTTGGGGGCCGGACCGTCGCG
CGGCAACGCGCGGAGCCGGCGGAAGTGGGGCTCGGGTCCCGCGGCGGGGCTGGAGGCAGCGAGCGCCGTC
GTCTGCCCGGGCCCGCCCATCGGGGTCCCCAACCCCATCCGGACCCCGCCG
PIGQ 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
PIGQ_2 ↗16:568,939正股568,890–568,949
PIGQ_1 ↗16:569,981正股569,932–569,991

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR16_983Z · promoter · 566515–567019 · regulatory

ENSR16_B534 · enhancer · 567020–567867 · regulatory

ENSR16_984P · promoter · 568971–569471 · regulatory

ENSR16_984S · enhancer · 569472–569829 · regulatory

ENSR16_8G7S · promoter · 569830–570072 · regulatory

ENSR16_C3JB · enhancer · 570073–571691 · regulatory

· motif · 566884–566897 · motif

· motif · 567138–567160 · motif

· motif · 567138–567160 · motif

· motif · 567261–567267 · motif

· motif · 569965–569974 · motif

· motif · 570081–570092 · motif

· motif · 570083–570092 · motif

· motif · 570932–570947 · motif

· motif · 570932–570947 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:760 aa

1 aa760 aa功能區域跨膜區
依 Q9BRB3 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

PIGQ family 蛋白長 760 個胺基酸。序列註解標示五段螺旋型跨膜區,分別位於 278–298、349–371、378–400、446–468 及 475–497;另有一段預測為無序的區域,位於 696–748。

跨膜區Helical278–298 aa
跨膜區Helical349–371 aa
跨膜區Helical378–400 aa
跨膜區Helical446–468 aa
跨膜區Helical475–497 aa
功能區域Disordered696–748 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9BRB3…

AlphaFold · Q9BRB3

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Membrane

PIGQ 被註記為多次跨膜蛋白,定位於膜。 來源未提供更精確的膜區室、定位變化條件或異構型差異。

未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 4 個夥伴 · 最多顯示 50 個
hGPI1PIGQDPM2PIGAPIGCPIGH
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

PIGQ 是 GPI-GnT 複合體的組成部分;該複合體至少包含 PIGA、PIGC、PIGH、PIGP、PIGQ、PIGY 與 DPM2。另有資料指出 PIGQ 與 PIGA、PIGH 及 PIGC 互作,未進一步界定這些互作的性質。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

影響 PIGQ 的基因變異可造成 Multiple congenital anomalies-hypotonia-seizures syndrome 4(MCAHS4),屬常染色體隱性疾病。症狀包括出生後數月內開始的難治性癲癇、嚴重全域發展遲緩、特殊面容,以及骨骼、腎臟與眼部異常;細胞層次的病因是 GPI 合成缺陷。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

5 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 5 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能PIGQ 是 GPI-GnT 複合體的組成部分;該複合體催化 N-acetylglucosamine 從 UDP-N-acetylglucosamine 轉移至 phosphatidylinositol,並參與 GPI 生合成的第一步。含實驗來源
證據與來源

Part of the glycosylphosphatidylinositol-N-acetylglucosaminyltransferase (GPI-GnT) complex that catalyzes the transfer of N-acetylglucosamine from UDP-N-acetylglucosamine to phosphatidylinositol and participates in the first step of GPI biosynthesis

PMID 16162815 ↗ · PMID 9463366 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性PIGQ 的相關生物合成活動包括 glycolipid 生合成,以及 glycosylphosphatidylinositol anchor 生合成。資料庫紀錄
證據與來源

Glycolipid biosynthesis; glycosylphosphatidylinositol-anchor biosynthesis

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用PIGQ 是 GPI-GnT 複合體的組成部分;該複合體至少含 PIGA、PIGC、PIGH、PIGP、PIGQ、PIGY 與 DPM2。另有資料指出 PIGQ 與 PIGA、PIGH 及 PIGC 互作。含實驗來源
證據與來源

Component of the glycosylphosphatidylinositol-N-acetylglucosaminyltransferase (GPI-GnT) complex composed at least by PIGA, PIGC, PIGH, PIGP, PIGQ, PIGY and DPM2. Interacts with PIGA, PIGH and PIGC

PMID 16162815 ↗ · PMID 9463366 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位PIGQ 被註記為多次跨膜蛋白,定位於膜;此項資料未指出更精確的膜區室或定位條件。推論支持
證據與來源

Membrane / Multi-pass membrane protein

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯影響 PIGQ 的基因變異可造成常染色體隱性疾病 MCAHS4,患者可於出生後數月出現難治性癲癇,並有嚴重全域發展遲緩、特殊面容及骨骼、腎臟與眼部異常;細胞層次病因為 GPI 合成缺陷。含實驗來源
證據與來源

Multiple congenital anomalies-hypotonia-seizures syndrome 4 MCAHS4 An autosomal recessive syndrome characterized by onset of refractory seizures in the first months of life. Additional clinical features include severe global developmental delay, dysmorphic facial features, and skeletal, renal and ophthalmic anomalies. At the cellular level, the disorder is caused by a defect in the synthesis of glycosylphosphatidylinositol (GPI). The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 618548

PMID 24463883 ↗ · PMID 25558065 ↗ · PMID 27513193 ↗ · PMID 31148362 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 5 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000321878 · 2,958 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GGAAGTGGGGCTCGGGTCCCGCGGCGGGGCTGGAGGCAGC40
41GAGCGCCGTCGTCTGCCCGGGCCCGCCCATCGGGGTCCCC80
81AACCCCATCCGGACCCCGCCGCCCGAGCGCGCGGCCCCGG120
121AAGCACCCGCCTCCCGGCATGGTGCTCAAGGCCTTCTTCC160
161CCACGTGCTGCGTCTCGACGGACAGCGGGCTGCTGGTGGG200
201ACGGTGGGTGCCGGAGCAGAGCAGCGCCGTGGTCCTGGCG240
241GTCCTGCACTTTCCCTTCATCCCCATCCAGGTCAAGCAGC280
281TCCTGGCCCAGGTGCGGCAGGCCAGCCAGGTGGGCGTGGC320
321CGTGCTGGGCACCTGGTGCCACTGCCGGCAGGAGCCCGAG360
361GAGAGCCTGGGCCGCTTCCTGGAGAGCCTGGGTGCTGTCT400
401TCCCCCATGAGCCCTGGCTGCGGCTGTGCCGGGAGAGAGG440
441CGGCACGTTCTGGAGCTGCGAGGCCACCCACCGGCAAGCG480
481CCCACTGCCCCCGGTGCCCCTGGTGAGGACCAGGTCATGC520
521TCATCTTCTATGACCAGCGCCAGGTGTTGCTGTCACAGCT560
561ACACCTGCCCACCGTCCTGCCCGACCGCCAGGCTGGAGCC600
601ACCACTGCCAGCACGGGGGGCCTGGCTGCCGTCTTCGACA640
641CGGTAGCACGCAGTGAGGTGCTCTTCCGCAGTGACCGCTT680
681TGATGAGGGCCCCGTGCGGCTGAGCCACTGGCAGTCGGAG720
721GGCGTGGAGGCCAGCATCCTCGCGGAGCTGGCCAGGCGAG760
761CCTCGGGACCCATTTGCCTGCTGTTGGCCAGCCTGCTGTC800
801GCTGGTCTCAGCTGTCAGTGCCTGCCGAGTGTTCAAGCTC840
841TGGCCCCTGTCCTTCCTCGGGAGCAAACTCTCCACGTGCG880
881AACAGCTCCGGCACCGGCTGGAGCACCTCACGCTAATCTT920
921CAGTACACGGAAGGCGGAGAACCCTGCCCAGCTGATGAGG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。