基因總覽
PHTF2 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 putative homeodomain transcription factor 2。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 7q11.23-q21.11。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000422959 ★ | 77,798,773–77,957,225 | 19 |
| ENST00000416283 | 77,798,652–77,957,503 | 20 |
| ENST00000307305 | 77,798,652–77,957,503 | 18 |
| ENST00000424760 | 77,798,652–77,940,459 | 12 |
| ENST00000415251 | 77,798,652–77,923,392 | 9 |
| ENST00000275575 | 77,798,652–77,957,503 | 17 |
| ENST00000888882 | 77,798,652–77,957,503 | 17 |
| ENST00000888883 | 77,798,652–77,957,503 | 17 |
| ENST00000888884 | 77,798,652–77,957,503 | 17 |
| ENST00000888885 | 77,798,652–77,957,503 | 19 |
| ENST00000888887 | 77,798,652–77,957,503 | 17 |
| ENST00000937835 | 77,798,652–77,957,503 | 16 |
顯示 12/29 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>PHTF2 ENST00000422959 GRCh38 chr7:77797773-77798873 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ATTTCCCTTCTCTCGCCACTGCCAGTAGTCTACCAAGTGAACCTGCCTCATCCCAAAGATAATTTTGCTT CATGAGCCCACATATTTATTCTTCTTCATAATGAGTCGCTTTTGAAAAGCCCGTGCAGCAACAGCCTTGG CCAAAGGAACAGCGTTCTGCTTACAACTTAGCTCATCTGGGGGCCTATTTGCCCCTGGAACTTCAGGACG CTCCTAAACTATACTTGCCCTTCTGCAAACACCGACAGTCGGCTCGCGGCGCCCCACCGGGACGCTCCCC TTTCATGGGCTGTAAGCCCAGCACATGCTGGAGTTTAACACGGTTCCTGCTGGATGCGCACAGAAGCCCT GGAGCCAAGCAGGCGTGTGCGCGTTTGGGGCTGGCTGTGTGATGGGTTGAGGGTCGGCCGCACAGCCCAC GGAAGCATCAGGAGACCAGCGCCGGCGTACGGTGCGGGCTAGGGCAGAGCCCCAGACTCACCTGGCAGCG CTGCCGGCCGGAAAGCGGAGAGGGACGCGAAGATCAGCAAATTCGCCAGTTTGGATCCTTGTCCTTTTCC GCCCTTTTCCCCCCATTAAATCCAGAACCCGTCACATGATAATTAAGAAAAAACTTCAGTTCCGCCTCCT CAAACGACTGCGGTAGAGGATCTCTCAGTTCTACCTCAGTGCCGCGCCCACATCCGGGGCTGGTTCTCAC CGCCCCTGAGCCTACCCTATAGGTAGAGAGGACGCCAATCTGGATTCAGAGGTCCCTTTTCCGCGGTAAT TGGACCATTTGTCCGCCAGTGCAAACCAACCGACCTTTCCTTACTTTCGGGTTCGACAGAAAGGCGGCAA TAAAAAGACCCATTGGTCCCGCCTCTCTACTGTCACGGGTTAGTAGGGAAGTCAGTCCAAGATCAGCCTG GAGTTTCCGTGCTCCCATTGGGCCCACAGATGTTAATCAGAGCAGCCGGCGCTCAGCTCCGCCCTCTCGG GACGCCCCGCCCCTCCTCCCATCCTCCCTGCCCGCGCGCAGTGACTGCAGGCTCCGGCGCAAAATCCTGC GGGAGAGGGGGTGGGGCAACCCTCTGGAGGCAGCGCGCCCGCGGGCAGCCT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| PHTF2_2 ↗ | 7:77,798,773 | 正股 | 77,798,724–77,798,783 |
| PHTF2_1 ↗ | 7:77,798,878 | 正股 | 77,798,829–77,798,888 |
| PHTF2_3 ↗ | 7:77,840,130 | 正股 | 77,840,081–77,840,140 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR7_C9PFP · enhancer · 77796966–77798423 · regulatory
ENSR7_935TQ7 · promoter · 77798424–77798911 · regulatory
ENSR7_C9PFT · enhancer · 77798912–77799960 · regulatory
ENSR7_5NB42B · CTCF_binding_site · 77798936–77798957 · regulatory
ENSR7_5NB45R · CTCF_binding_site · 77799686–77799707 · regulatory
ENSR7_935TQN · enhancer · 77800163–77800579 · regulatory
ENSR7_935TRH · enhancer · 77803064–77803320 · regulatory
· motif · 77796284–77796295 · motif
· motif · 77797164–77797173 · motif
· motif · 77797164–77797173 · motif
· motif · 77798177–77798194 · motif
· motif · 77798337–77798348 · motif
· motif · 77798389–77798400 · motif
· motif · 77798443–77798453 · motif
· motif · 77798451–77798460 · motif
· motif · 77798756–77798766 · motif
· motif · 77798761–77798771 · motif
· motif · 77798827–77798837 · motif
· motif · 77798829–77798839 · motif
· motif · 77798938–77798954 · motif
· motif · 77798967–77798984 · motif
· motif · 77799688–77799704 · motif
· motif · 77799741–77799752 · motif
· motif · 77799938–77799950 · motif
· motif · 77803499–77803514 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：785 aa
putative homeodomain transcription factor 2 長 785 個胺基酸。序列註解包含位於第 46–191 位的 PHTF domain；另有兩段預測為無序區域，分別位於第 190–239 位與第 304–401 位。蛋白質中註解出七段螺旋型跨膜區，位於第 136–156、164–184、497–517、553–573、634–654、668–688 與 760–780 位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
PHTF2 被註解為多次跨膜蛋白，表示其序列具有多段跨膜區域；現有資料未提供更具體的細胞內位置或定位變化資訊。
未繪示構造：Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 細胞定位 | PHTF2 被註解為膜蛋白，且屬於多次跨膜型；此項描述指出其膜相關性及跨膜特徵，但未提供更細的細胞內定位或定位條件。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
ATCCTCCCTGCCCGCGCGCAGTGACTGCAGGCTCCGGCGC40AAAATCCTGCGGGAGAGGGGGTGGGGCAACCCTCTGGAGG80CAGCGCGCCCGCGGGCAGCCTCGTTGTGGCTCCTTGGGCT120CTGTTGGCGGCGGCGCTAGCTTCGGAGTCTCCCGCGCGCA160CCTCAGCCGCCTCCTAGCGGCGCGGCGCTCGCTCCTACGC200CTAAAATGACCAATGTGTGATTTCAGTGGAATAAATGGCG240TCCAAAGTCACAGATGCTATAGTCTGGTATCAAAAGAAGA280TTGGAGCATATGATCAACAAATATGGGAAAAATCTGTTGA320ACAGAGAGAAATCAAGTTTATTAAACTGGGGCTAAGGAAT360AAACCAAAGAAAACAGCACATGTGAAACCAGACCTCATAG400ATGTTGATCTTGTAAGAGGGTCTGCATTTGCAAAGGCAAA440GCCTGAAAGTCCTTGGACTTCTCTGACCAGAAAGGGAATT480GTTCGAGTTGTATTTTTCCCCTTTTTCTTCCGGTGGTGGT520TACAAGTAACATCAAAGGTCATCTTTTTCTGGCTTCTTGT560CCTTTATCTTCTTCAAGTTGCTGCAATAGTATTATTCTGC600TCCACTTCTAGCCCACACAGCATACCTCTGACAGAGGTGA640TTGGGCCGATATGGCTGATGCTGCTCCTGGGAACTGTGCA680TTGCCAGATTGTTTCCACAAGAACACCCAAACCTCCTCTA720AGTACAGGGGGTAAAAGAAGAAGGAAATTAAGAAAAGCAG760CCCATTTGGAAGTACATAGGGAAGGAGATGGTTCTAGTAC800CACAGATAACACACAAGAGGGAGCAGTTCAGAACCACGGT840ACAAGCACCTCTCACAGCGTTGGCACTGTCTTCAGAGATC880TCTGGCATGCTGCTTTCTTTTTATCAGGATCAAAGAAAGC920AAAGAATTCAATTGATAAATCAACTGAAACTGACAATGGC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。