演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

PDIA2PDA2

protein disulfide isomerase family A member 2

PDIA2 是蛋白質二硫鍵異構酶家族成員,具有雌激素結合特性,可能參與調節胰臟中的雌激素,並可能協助抑制錯誤摺疊蛋白質聚集。

Homo sapiens16p13.3UniProt Q13087
OFFICIAL SYMBOL
PDIA2
CHROMOSOME
16
UNIPROT
Q13087
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

PDIA2(protein disulfide isomerase family A member 2)是由蛋白質編碼基因產生的蛋白質,屬於 protein disulfide isomerase family。它具有細胞內雌激素結合蛋白的性質,並被描述為可能與胰臟中雌激素的細胞內含量及生物功能調節有關。其蛋白質序列包含兩個 Thioredoxin 結構域,分別位於序列前段與後段;此外也有訊號序列、部分無序區,以及與避免自內質網分泌相關的短基序。這些特徵概述了 PDIA2 的家族歸屬與結構組成;其具體分子作用另於功能段落說明。

Official symbol
PDIA2
Gene name
protein disulfide isomerase family A member 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14180
UniProt
Q13087
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
PDA2PDIPDIRPDIP

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1616p13.3
chr16 · 90,338,345 bp · GRCh38chr16p13.3 · 1–7800000 · gnegchr16p13.2 · 7800001–10400000 · gpos50chr16p13.13 · 10400001–12500000 · gnegchr16p13.12 · 12500001–14700000 · gpos50chr16p13.11 · 14700001–16700000 · gnegchr16p12.3 · 16700001–21200000 · gpos50chr16p12.2 · 21200001–24200000 · gnegchr16p12.1 · 24200001–28500000 · gpos50chr16p11.2 · 28500001–35300000 · gnegchr16p11.1 · 35300001–36800000 · acenchr16q11.1 · 36800001–38400000 · acenchr16q11.2 · 38400001–47000000 · gvarchr16q12.1 · 47000001–52600000 · gnegchr16q12.2 · 52600001–56000000 · gpos50chr16q13 · 56000001–57300000 · gnegchr16q21 · 57300001–66600000 · gpos100chr16q22.1 · 66600001–70800000 · gnegchr16q22.2 · 70800001–72800000 · gpos50chr16q22.3 · 72800001–74100000 · gnegchr16q23.1 · 74100001–79200000 · gpos75chr16q23.2 · 79200001–81600000 · gnegchr16q23.3 · 81600001–84100000 · gpos50chr16q24.1 · 84100001–87000000 · gnegchr16q24.2 · 87000001–88700000 · gpos25chr16q24.3 · 88700001–90338345 · gnegPDIA2pq1 bp90,338,345 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr16:283,152–287,215
Gene span
4,064 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000219406 ★283,164–287,21511
ENST00000404312283,152–287,21511
ENST00000851624283,152–287,2159
ENST00000964532283,152–287,21511
ENST00000964533283,152–287,2159
ENST00000964534283,152–287,21510
ENST00000964535283,152–287,21510
ENST00001132989283,152–287,21511
ENST00000456379283,180–285,1405
ENST00000435833285,680–287,2155

顯示 10/10 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

PDIA2 可催化蛋白質中二硫鍵(-S-S-)的重排。此作用涉及蛋白質內二硫鍵連結的重新安排,是來源所列出的酵素活性;資料未進一步說明其底物範圍、反應條件或特定細胞過程,因此不宜延伸推定其在個別蛋白質摺疊路徑中的作用細節。

除二硫鍵重排活性外,PDIA2 被描述為細胞內雌激素結合蛋白,並可能參與調節胰臟中的雌激素細胞內含量及其生物功能。這項作用以可能性表述,來源沒有指出其調節方向或具體分子機制,也未說明該作用是否由雌激素結合直接造成。

PDIA2 也可能作為分子伴護蛋白,抑制錯誤摺疊蛋白質的聚集。此項描述同樣屬可能功能;現有資料未提供其作用條件或所涉及蛋白質種類。就來源支持的範圍而言,PDIA2 的功能涵蓋蛋白質二硫鍵重排、可能的雌激素調節,以及可能抑制錯誤摺疊蛋白聚集,三者不應被視為已證實具有單一連結機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 283164 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>PDIA2 ENST00000219406 GRCh38 chr16:282164-283264 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CTGCACCCCTGAGTTCCGAGCCCTGGGCCATCACAGTCGCACACCTCATGGGTACCACACCCTACGTGGG
GGCTCCTGGAGCAGGTCTCAGCCTGTAGGGGAGTTCCGACCCTAGCTGAGGTTTCCCCAATAGGGGACCT
GGCTGTTCTGAAGGACCAGGTGTTTGTCCTGAAGGAAGGTGTTGATTACAGAGTGAAGATCTCCTTCAAG
GTGAGAGCCGGGGCAATGGGCGGAGGGGATGGGGGTGGGGGCAACAGCCAGAGGCCTGGCCCCCAGAGGA
ACCCCTAATGCCTCTGTTCCCAGGTCCACAGGGAGATTGTCAGCGGCCTCAAGTGTCTGCACCACACCTA
CCGCCGGGGCCTGCGCGGTGAGGGCAGCGGTGGGGGGAACGGGGCGGGGGGGGGAAGCGGGGGCAGACAG
AGGACAGCTCTGATGCCCTCGCCCTCCCTAGTGGACAAGACCGTCTACATGGTGGGCAGCTATGGCCCGA
GCGCCCAGGAGTATGAGTTTGTGACTCCGGTGGAGGAAGCGCCGAGGGGTGCGCTGGTGCGGGGCCCCTA
TCTGGTGGTGTCCCTCTTCACCGACGATGACAGGACGCACCACCTGTCCTGGGAGTGGGGTCTCTGCATC
TGCCAGGACTGGAAGGACTGAACCCCCAGTCCGTGTCTCCCCTACCTCCCTCAGTTGTTGCACAGGGACC
CCCAAGCATCCCCAGCACCCCCCGTGAGTGACCAGACCCTCCCCTGCTGCCCCTGCTGCCCCTGCTGCCC
CTGCTCTGTCCCGGGACCCCCTGGCCTGGCGCTGTCCCCTGAGCTGTCCCATTAAACATGGCCCTGTCTC
TCTCGGTGCCCTGGGTGTCGTCTCTTTCTGCCTCCCCTCCCCTGGGGGCCGGGGGCGGCCGCATGGGCCT
TGTCTTTGCTGGGACTGGGCCTGTGTGCCACGTGGCAGCTGCTGCTTGGCTTCTGGCCCCCTTATCTGCC
CCCGCCCCACGCGCCCTGGCAGCACCATGAGCCGCCAGCTTCTGCCTGTACTGCTGCTGCTGCTGCTCAG
GGCTTCGTGCCCATGGGGTCAGGAACAGGGAGCGAGGAGCCCCTCGGAGGA
PDIA2 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
PDIA2_1 ↗16:283,164正股283,115–283,174

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR16_B3HD · enhancer · 278741–279374 · regulatory

ENSR16_9524 · enhancer · 280016–280424 · regulatory

ENSR16_7G2P · promoter · 280501–280601 · regulatory

ENSR16_B3HM · enhancer · 280602–281449 · regulatory

ENSR16_7G5N · promoter · 283063–283175 · regulatory

ENSR16_53S93 · CTCF_binding_site · 287278–287299 · regulatory

ENSR16_53SBW · CTCF_binding_site · 287682–287703 · regulatory

· motif · 279116–279130 · motif

· motif · 284816–284831 · motif

· motif · 284932–284944 · motif

· motif · 284936–284949 · motif

· motif · 285733–285746 · motif

· motif · 285739–285746 · motif

· motif · 287280–287296 · motif

· motif · 287684–287700 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:525 aa

1 aa525 aa結構域功能區域基序訊號胜肽
依 Q13087 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

PDIA2 蛋白質長 525 個胺基酸,屬於 protein disulfide isomerase family。序列含有位於第 1–21 位的訊號序列,以及分別位於第 27–152 位和第 367–496 位的 Thioredoxin 1、Thioredoxin 2 結構域。第 492–525 位註記為無序區;第 522–525 位則有與避免自內質網分泌相關的基序。

訊號胜肽1–21 aa
結構域Thioredoxin 127–152 aa
結構域Thioredoxin 2367–496 aa
功能區域Disordered492–525 aa
基序Prevents secretion from ER522–525 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q13087…

AlphaFold · Q13087

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Endoplasmic reticulum lumen

PDIA2 位於內質網腔。 來源未提供其定位隨條件改變或異構型之間差異的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 3 個夥伴 · 最多顯示 50 個
PDA2PDIA2KRTAP12-1KRTAP6-1NCK1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

PDIA2 可形成由二硫鍵連結的同源二聚體;在還原條件下則主要以單體存在。它也被列為大型分子伴護多蛋白複合體的一員,該複合體包含 DNAJB11、HSP90B1、HSPA5、HYOU、PDIA2、PDIA4、PDIA6、PPIB、SDF2L1 與 UGGT1,並含極少量 ERP29;CALR 與 CANX 不在其中,或僅以極低量存在。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能PDIA2 是細胞內雌激素結合蛋白,可能參與調節胰臟中的雌激素細胞內含量及其生物功能;此外,它也可能作為分子伴護蛋白,抑制錯誤摺疊蛋白質聚集。含實驗來源
證據與來源

Acts as an intracellular estrogen-binding protein. May be involved in modulating cellular levels and biological functions of estrogens in the pancreas. May act as a chaperone that inhibits aggregation of misfolded proteins

PMID 19150607 ↗ · PMID 19429457 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性PDIA2 可催化蛋白質中二硫鍵(-S-S-)的重排。資料庫紀錄
證據與來源

Catalyzes the rearrangement of -S-S- bonds in proteins.

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用PDIA2 在還原條件下主要以單體存在,也可形成由二硫鍵連結的同源二聚體。它是大型分子伴護多蛋白複合體的成員,複合體包含 DNAJB11、HSP90B1、HSPA5、HYOU、PDIA2、PDIA4、PDIA6、PPIB、SDF2L1、UGGT1,另有極少量 ERP29;CALR 與 CANX 不存在或僅有極低量。含實驗來源
證據與來源

Monomer; predominantly as monomer under reducing conditions. Homodimer; disulfide-linked. Part of a large chaperone multiprotein complex comprising DNAJB11, HSP90B1, HSPA5, HYOU, PDIA2, PDIA4, PDIA6, PPIB, SDF2L1, UGGT1 and very small amounts of ERP29, but not, or at very low levels, CALR nor CANX

PMID 19150607 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位PDIA2 位於內質網腔。推論支持
證據與來源

Endoplasmic reticulum lumen

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000219406 · 1,686 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1AGCACCATGAGCCGCCAGCTTCTGCCTGTACTGCTGCTGC40
41TGCTGCTCAGGGCTTCGTGCCCATGGGGTCAGGAACAGGG80
81AGCGAGGAGCCCCTCGGAGGAGCCTCCAGAGGAGGAAATC120
121CCCAAGGAGGATGGGATCTTGGTGCTGAGCCGCCACACCC160
161TGGGCCTGGCCCTGCGGGAGCACCCTGCCCTGCTGGTGGA200
201ATTCTATGCCCCGTGGTGTGGGCACTGCCAGGCCCTGGCC240
241CCCGAGTACAGCAAGGCAGCTGCCGTGCTCGCGGCCGAGT280
281CAATGGTGGTCACGCTGGCCAAGGTGGATGGGCCCGCGCA320
321GCGCGAGCTGGCTGAGGAGTTTGGTGTGACGGAGTACCCT360
361ACGCTCAAGTTCTTCCGCAATGGGAACCGCACGCACCCGG400
401AGGAGTACACAGGACCACGGGACGCTGAGGGCATTGCCGA440
441GTGGCTGCGACGGCGGGTGGGGCCCAGTGCCATGCGGCTG480
481GAGGACGAGGCGGCCGCCCAGGCGCTGATCGGTGGCCGGG520
521ACCTAGTGGTCATTGGCTTCTTCCAGGACCTGCAGGACGA560
561GGACGTGGCCACCTTCTTGGCCTTGGCCCAGGACGCCCTG600
601GACATGACCTTTGGCCTCACAGACCGGCCGCGGCTCTTTC640
641AGCAGTTTGGCCTCACCAAGGACACTGTGGTTCTCTTCAA680
681GAAGTTTGATGAGGGGCGGGCAGACTTCCCCGTGGACGAG720
721GAGCTTGGCCTGGACCTGGGGGATCTGTCGCGCTTCCTGG760
761TCACACACAGCATGCGCCTGGTCACGGAGTTCAACAGCCA800
801GACGTCTGCCAAGATCTTCGCGGCCAGGATCCTCAACCAC840
841CTGCTGCTGTTTGTCAACCAGACGCTGGCTGCGCACCGGG880
881AGCTCCTAGCGGGCTTTGGGGAGGCAGCTCCCCGCTTCCG920
921GGGGCAGGTGCTGTTCGTGGTGGTGGACGTGGCGGCCGAC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。